More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VEA_001608 on replicon NC_013457
Organism: Vibrio sp. Ex25



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009784  VIBHAR_05589  hypothetical protein  99.38 
 
 		 321 aa  640    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001608  nitrate ABC transporter permease protein  100 
 
 		 321 aa  644    Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2818  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  67.44 
 
 		 323 aa  429  1e-119  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0908348  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3315  putative nitrate ABC transporter, permease protein  65.81 
 
 		 315 aa  427  1e-119  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.286795  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03653  putative nitrate ABC transporter, permease protein  66.56 
 
 		 349 aa  429  1e-119  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0176  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  66.56 
 
 		 330 aa  424  1e-117  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.283757  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2416  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  67.33 
 
 		 329 aa  407  1.0000000000000001e-112  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.941924  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1116  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  63.82 
 
 		 320 aa  407  1.0000000000000001e-112  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1154  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  64.4 
 
 		 332 aa  393  1e-108  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2265  2-isopropylmalate synthase  64.31 
 
 		 337 aa  384  1e-105  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.20736  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1083  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  60.84 
 
 		 362 aa  375  1e-103  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3041  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  60.67 
 
 		 356 aa  361  1e-98  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0454985  normal  0.816874 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1664  putative ABC transporter permease protein  57.61 
 
 		 360 aa  352  4e-96  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0453487  normal  0.0661868 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1968  nitrate ABC transporter, permease component  43.49 
 
 		 377 aa  265  7e-70  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.52047  normal  0.211755 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0996  nitrate ABC transporter, inner membrane subunit  36.48 
 
 		 286 aa  176  7e-43  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0291  nitrate transport permease  43.9 
 
 		 287 aa  172  5.999999999999999e-42  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5414  putative nitrate ABC transporter (permease protein) (ntrB-like protein)  33.88 
 
 		 279 aa  171  1e-41  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.481789  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0874  nitrate transport permease  44.98 
 
 		 283 aa  170  3e-41  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00348419  hitchhiker  0.00524559 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2205  nitrate ABC transporter, inner membrane subunit  35.06 
 
 		 280 aa  169  5e-41  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1704  nitrate ABC transporter, inner membrane subunit  35.67 
 
 		 311 aa  169  5e-41  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0640  nitrate ABC transporter, inner membrane subunit  40.85 
 
 		 279 aa  169  6e-41  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3973  nitrate ABC transporter, inner membrane subunit  35.31 
 
 		 295 aa  165  8e-40  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.930991  normal  0.148208 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4458  nitrate ABC transporter, inner membrane subunit  34.38 
 
 		 277 aa  164  2.0000000000000002e-39  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.698055  normal  0.534513 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4395  nitrate ABC transporter, inner membrane subunit  34.38 
 
 		 277 aa  164  2.0000000000000002e-39  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2618  nitrate ABC transporter, inner membrane subunit  39.8 
 
 		 279 aa  164  2.0000000000000002e-39  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.234813 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2324  nitrate ABC transporter, inner membrane subunit  40.87 
 
 		 293 aa  163  3e-39  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0963  nitrate ABC transporter, inner membrane subunit  41.79 
 
 		 281 aa  163  3e-39  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.563275 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2146  nitrate ABC transporter, inner membrane subunit  34.45 
 
 		 315 aa  164  3e-39  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2337  nitrate ABC transporter, inner membrane subunit  37.28 
 
 		 282 aa  162  5.0000000000000005e-39  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3486  nitrate ABC transporter permease protein  41.46 
 
 		 295 aa  162  6e-39  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.236914  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2404  nitrate ABC transporter, inner membrane subunit  35.13 
 
 		 279 aa  162  7e-39  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.105129  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2055  nitrate transport permease  33.33 
 
 		 279 aa  161  1e-38  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.562067  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3675  nitrate ABC transporter, inner membrane subunit  43.35 
 
 		 280 aa  161  2e-38  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3729  nitrate ABC transporter, inner membrane subunit  43.35 
 
 		 280 aa  161  2e-38  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0184404  normal  0.11569 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3741  nitrate transport permease  41.46 
 
 		 288 aa  160  3e-38  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0831  nitrate transport permease  34.32 
 
 		 312 aa  159  4e-38  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.0203602 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2171  nitrate transport permease  40 
 
 		 272 aa  159  4e-38  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0149943  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2588  nitrate ABC transporter, inner membrane subunit  42.49 
 
 		 279 aa  160  4e-38  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00171927 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3526  nitrate ABC transporter, inner membrane subunit  32.75 
 
 		 280 aa  159  5e-38  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.471487 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1026  nitrate transport permease  35.62 
 
 		 279 aa  159  6e-38  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.174596 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3654  nitrate transport permease  32.78 
 
 		 273 aa  159  7e-38  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3842  nitrate ABC transporter, inner membrane subunit  34.58 
 
 		 331 aa  156  4e-37  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1391  NO3-/NO2- ABC transporter  32.77 
 
 		 305 aa  156  4e-37  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.36361 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1238  nitrate transport permease  33.45 
 
 		 279 aa  155  8e-37  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0236  nitrate ABC transporter, inner membrane subunit  33.45 
 
 		 283 aa  154  1e-36  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1489  nitrate transport permease  33.44 
 
 		 278 aa  154  1e-36  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0257  nitrate ABC transporter, inner membrane subunit  33.45 
 
 		 283 aa  154  1e-36  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.738144 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0055  nitrate ABC transporter, inner membrane subunit  41.79 
 
 		 256 aa  155  1e-36  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0380  putative nitrate transmembrane ABC transporter protein  40.78 
 
 		 287 aa  154  2.9999999999999998e-36  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.931268 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2321  nitrate ABC transporter, inner membrane subunit  40.48 
 
 		 313 aa  154  2.9999999999999998e-36  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.539996  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2832  nitrate ABC transporter, inner membrane subunit  40.48 
 
 		 313 aa  154  2.9999999999999998e-36  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.442547 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4662  nitrate ABC transporter, inner membrane subunit  34.25 
 
 		 279 aa  152  7e-36  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1147  nitrate ABC transporter, inner membrane subunit  39 
 
 		 279 aa  152  8e-36  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.488584 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2106  nitrate transport permease  36.27 
 
 		 263 aa  151  1e-35  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.727969  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2555  nitrate transport permease  34.38 
 
 		 314 aa  152  1e-35  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.162104  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2104  nitrate ABC transporter, inner membrane subunit  34.84 
 
 		 283 aa  150  2e-35  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0291571  normal  0.0240092 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1306  nitrate ABC transporter, inner membrane subunit  38.5 
 
 		 279 aa  150  2e-35  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3520  nitrate ABC transporter, inner membrane subunit  35.53 
 
 		 280 aa  151  2e-35  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2597  nitrate ABC transporter, inner membrane subunit  35.53 
 
 		 280 aa  150  2e-35  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0666  nitrate ABC transporter, inner membrane subunit  30.87 
 
 		 311 aa  150  4e-35  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0569164  decreased coverage  0.0039857 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1413  nitrate ABC transporter, inner membrane subunit  42.21 
 
 		 311 aa  149  4e-35  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2273  nitrate transport permease  33.56 
 
 		 299 aa  149  5e-35  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0326  nitrate transport permease  33.9 
 
 		 295 aa  149  9e-35  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0276  nitrate transport permease  41.8 
 
 		 303 aa  147  2.0000000000000003e-34  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.21823 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0329  nitrate transport permease  41.8 
 
 		 300 aa  146  5e-34  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3523  nitrate ABC transporter, inner membrane subunit  33.57 
 
 		 309 aa  145  8.000000000000001e-34  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.293551  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2376  nitrate ABC transporter, inner membrane subunit  40.95 
 
 		 313 aa  145  8.000000000000001e-34  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2908  nitrate ABC transporter, inner membrane subunit  43.79 
 
 		 298 aa  144  1e-33  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.950821  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3268  nitrate transport permease  43.2 
 
 		 328 aa  145  1e-33  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.321419  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4924  nitrate ABC transporter, inner membrane subunit  39.38 
 
 		 280 aa  144  2e-33  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.815767 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4541  nitrate transport permease  34.04 
 
 		 279 aa  144  2e-33  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2591  nitrate ABC transporter, inner membrane subunit  40 
 
 		 328 aa  144  2e-33  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.0488842 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1439  nitrate ABC transporter, inner membrane subunit  40.74 
 
 		 310 aa  144  3e-33  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.062597  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4571  nitrate ABC transporter, inner membrane subunit  39.29 
 
 		 280 aa  143  3e-33  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4817  nitrate ABC transporter, inner membrane subunit  39.3 
 
 		 279 aa  142  7e-33  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.775678  hitchhiker  0.00263828 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4677  nitrate ABC transporter, inner membrane subunit  40.2 
 
 		 279 aa  140  3e-32  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3744  nitrate ABC transporter, inner membrane subunit  38.27 
 
 		 288 aa  137  3.0000000000000003e-31  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.441454  normal  0.10243 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2732  nitrate ABC transporter, inner membrane subunit  42.01 
 
 		 304 aa  135  9.999999999999999e-31  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0882865  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2496  nitrate ABC transporter, inner membrane subunit  40.83 
 
 		 304 aa  134  1.9999999999999998e-30  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.546285  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1542  nitrate ABC transporter, inner membrane subunit  41.42 
 
 		 304 aa  133  3.9999999999999996e-30  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.244375  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2503  nitrate ABC transporter, inner membrane subunit  38.66 
 
 		 298 aa  132  6.999999999999999e-30  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2935  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.29 
 
 		 252 aa  131  1.0000000000000001e-29  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5896  nitrate ABC transporter permease protein  30.9 
 
 		 297 aa  132  1.0000000000000001e-29  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.149001  n/a   
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6460  nitrate ABC transporter, inner membrane subunit  37.31 
 
 		 297 aa  132  1.0000000000000001e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.150998 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4471  nitrate ABC transporter, inner membrane subunit  37.31 
 
 		 297 aa  131  1.0000000000000001e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.5689 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5011  nitrate ABC transporter, inner membrane subunit  37.24 
 
 		 286 aa  130  3e-29  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.312092  normal  0.320206 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4495  nitrate ABC transporter, inner membrane subunit  37.24 
 
 		 285 aa  130  3e-29  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4958  nitrate ABC transporter, inner membrane subunit  37.24 
 
 		 285 aa  130  3e-29  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.413837  normal  0.165118 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2819  nitrate transport permease protein (nrtB)  28.98 
 
 		 304 aa  129  7.000000000000001e-29  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.233469  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1076  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.29 
 
 		 269 aa  123  4e-27  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.406887  normal  0.454808 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1759  nitrate transport permease  27.93 
 
 		 299 aa  119  7.999999999999999e-26  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0568232  normal  0.0125916 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1642  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.32 
 
 		 231 aa  117  1.9999999999999998e-25  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0324285  normal  0.0160388 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1974  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  34.36 
 
 		 261 aa  117  3e-25  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000000226251  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3869  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  28.1 
 
 		 274 aa  116  5e-25  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1455  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.67 
 
 		 269 aa  115  8.999999999999998e-25  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0865715  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1031  sulfonate ABC transporter, permease protein  31.98 
 
 		 261 aa  115  1.0000000000000001e-24  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6545  ABC transporter permease  31.08 
 
 		 269 aa  114  2.0000000000000002e-24  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.276106 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2152  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  30.66 
 
 		 271 aa  114  3e-24  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.529987 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1473  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  34.74 
 
 		 306 aa  113  4.0000000000000004e-24  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0411979  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0924  ABC transporter permease protein  31.96 
 
 		 258 aa  113  4.0000000000000004e-24  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.175022  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>