More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpe_A0924 on replicon NC_008825
Organism: Methylibium petroleiphilum PM1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008825  Mpe_A0924  ABC transporter permease protein  100 
 
 
258 aa  516  1.0000000000000001e-145  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.175022  normal 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6154  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  48.02 
 
 
295 aa  207  1e-52  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4201  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  44.44 
 
 
305 aa  206  2e-52  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2218  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  43.07 
 
 
290 aa  198  7.999999999999999e-50  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.484673 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2085  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  46.46 
 
 
319 aa  195  6e-49  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.0787698 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1473  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  40.89 
 
 
306 aa  193  3e-48  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0411979  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2216  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.06 
 
 
314 aa  190  2e-47  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.82677  normal  0.484673 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0673  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  43.65 
 
 
275 aa  180  2e-44  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0666321  normal  0.331074 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0208  nitrate ABC transporter, permease protein, putative  44.67 
 
 
260 aa  176  3e-43  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.473726 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3346  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  45 
 
 
291 aa  176  3e-43  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.252204  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3671  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  45 
 
 
287 aa  175  6e-43  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0347715  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6102  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.8 
 
 
291 aa  168  7e-41  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1975  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.8 
 
 
291 aa  168  7e-41  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.690359  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4185  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  44.44 
 
 
283 aa  166  4e-40  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.321257  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5010  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  44.22 
 
 
260 aa  162  5.0000000000000005e-39  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3160  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  41.62 
 
 
274 aa  162  5.0000000000000005e-39  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.913146  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1999  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.8 
 
 
291 aa  162  7e-39  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4641  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.8 
 
 
277 aa  161  1e-38  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.750363  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6545  ABC transporter permease  38.76 
 
 
269 aa  159  6e-38  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.276106 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3787  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.44 
 
 
314 aa  155  7e-37  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1295  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  42 
 
 
290 aa  155  8e-37  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0425684  normal  0.379949 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7932  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.89 
 
 
283 aa  151  1e-35  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0153  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.5 
 
 
277 aa  151  1e-35  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.589472  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1108  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.34 
 
 
255 aa  149  4e-35  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.135552 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0735  nitrate/sulfonate/bicarbonate ABC transporter inner membrane protein  36.5 
 
 
273 aa  149  6e-35  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.714635  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0464  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.37 
 
 
288 aa  146  3e-34  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.349721  hitchhiker  0.00645779 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0926  nitrate ABC transporter, permease protein, putative  39.3 
 
 
274 aa  146  4.0000000000000006e-34  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1422  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.32 
 
 
273 aa  143  3e-33  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4051  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.82 
 
 
273 aa  143  3e-33  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.395379 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1211  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.82 
 
 
273 aa  143  3e-33  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.132759  normal  0.452833 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1261  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.32 
 
 
273 aa  143  3e-33  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.306936 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4879  putative ABC transporter, permease protein  34.54 
 
 
263 aa  141  9.999999999999999e-33  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.132635 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0992  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.33 
 
 
254 aa  140  9.999999999999999e-33  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA1188  taurine ABC transporter, permease protein  36.68 
 
 
250 aa  140  1.9999999999999998e-32  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0612406  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2935  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.1 
 
 
252 aa  140  3e-32  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0397  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.46 
 
 
285 aa  135  5e-31  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.987071 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3065  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.27 
 
 
280 aa  135  6.0000000000000005e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.228654 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0765  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.71 
 
 
281 aa  135  9e-31  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4458  nitrate ABC transporter, inner membrane subunit  35.79 
 
 
277 aa  134  9.999999999999999e-31  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.698055  normal  0.534513 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4395  nitrate ABC transporter, inner membrane subunit  35.79 
 
 
277 aa  134  9.999999999999999e-31  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1127  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.68 
 
 
267 aa  134  9.999999999999999e-31  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4060  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  34.34 
 
 
256 aa  134  1.9999999999999998e-30  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0512  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.08 
 
 
253 aa  133  3e-30  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3869  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.82 
 
 
274 aa  132  5e-30  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3729  nitrate ABC transporter, inner membrane subunit  32.34 
 
 
280 aa  131  9e-30  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0184404  normal  0.11569 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3675  nitrate ABC transporter, inner membrane subunit  32.34 
 
 
280 aa  131  9e-30  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2152  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  33.33 
 
 
271 aa  131  1.0000000000000001e-29  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.529987 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2553  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  28.75 
 
 
275 aa  130  2.0000000000000002e-29  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0154  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.75 
 
 
264 aa  130  2.0000000000000002e-29  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1026  nitrate transport permease  33.33 
 
 
279 aa  129  3e-29  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.174596 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0697  taurine ABC transporter, permease protein  34.36 
 
 
283 aa  129  3e-29  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1580  taurine ABC transporter, permease protein  34.36 
 
 
253 aa  129  4.0000000000000003e-29  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.477521  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2019  taurine ABC transporter, permease protein  34.36 
 
 
285 aa  129  4.0000000000000003e-29  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.484134  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3526  nitrate ABC transporter, inner membrane subunit  30.49 
 
 
280 aa  129  5.0000000000000004e-29  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.471487 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3744  nitrate ABC transporter, inner membrane subunit  35.6 
 
 
288 aa  129  7.000000000000001e-29  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.441454  normal  0.10243 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5321  taurine ABC transporter, permease protein  32.82 
 
 
285 aa  128  8.000000000000001e-29  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2953  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.59 
 
 
294 aa  128  8.000000000000001e-29  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2133  taurine ABC transporter, permease protein  34.02 
 
 
283 aa  128  9.000000000000001e-29  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.186654  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0620  permease component of taurine ABC transporter  34.02 
 
 
253 aa  128  9.000000000000001e-29  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  decreased coverage  0.00192231  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2220  taurine ABC transporter, permease protein  34.02 
 
 
283 aa  128  9.000000000000001e-29  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.215273  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4571  nitrate ABC transporter, inner membrane subunit  28.63 
 
 
280 aa  128  9.000000000000001e-29  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3654  nitrate transport permease  32.8 
 
 
273 aa  127  2.0000000000000002e-28  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2837  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  35.61 
 
 
266 aa  127  2.0000000000000002e-28  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.115716  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1076  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.98 
 
 
269 aa  127  2.0000000000000002e-28  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.406887  normal  0.454808 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0231  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.39 
 
 
279 aa  126  3e-28  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.33405  hitchhiker  0.000710194 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4958  nitrate ABC transporter, inner membrane subunit  33.33 
 
 
285 aa  126  4.0000000000000003e-28  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.413837  normal  0.165118 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0521  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33 
 
 
292 aa  126  4.0000000000000003e-28  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.367955 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_19510  ABC transporter permease  31.98 
 
 
274 aa  126  4.0000000000000003e-28  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0640  nitrate ABC transporter, inner membrane subunit  34.3 
 
 
279 aa  126  4.0000000000000003e-28  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4495  nitrate ABC transporter, inner membrane subunit  33.33 
 
 
285 aa  125  5e-28  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0520  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.5 
 
 
265 aa  125  5e-28  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.231998 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5011  nitrate ABC transporter, inner membrane subunit  33.33 
 
 
286 aa  125  5e-28  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.312092  normal  0.320206 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4471  nitrate ABC transporter, inner membrane subunit  34.22 
 
 
297 aa  125  8.000000000000001e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.5689 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4981  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.04 
 
 
279 aa  125  8.000000000000001e-28  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.588836 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4508  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.61 
 
 
277 aa  125  9e-28  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.854714  normal  0.909107 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3240  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.76 
 
 
275 aa  124  1e-27  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0483  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.09 
 
 
275 aa  124  1e-27  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1679  ABC transporter permease  31.47 
 
 
274 aa  124  1e-27  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.451747  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0246  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.98 
 
 
279 aa  125  1e-27  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0570948  normal  0.0921514 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2819  nitrate transport permease protein (nrtB)  32.98 
 
 
304 aa  124  1e-27  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.233469  normal 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6460  nitrate ABC transporter, inner membrane subunit  33.69 
 
 
297 aa  124  1e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.150998 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2803  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.59 
 
 
259 aa  124  1e-27  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00122675  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4564  taurine transporter subunit  30.62 
 
 
279 aa  124  2e-27  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.746145 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2621  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.21 
 
 
281 aa  124  2e-27  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000218671  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1704  nitrate ABC transporter, inner membrane subunit  28.76 
 
 
311 aa  124  2e-27  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0874  nitrate transport permease  34.48 
 
 
283 aa  123  3e-27  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00348419  hitchhiker  0.00524559 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_16930  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport system, permease component  35.22 
 
 
322 aa  123  3e-27  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.327  normal  0.410158 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1489  nitrate transport permease  31.94 
 
 
278 aa  123  3e-27  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2503  nitrate ABC transporter, inner membrane subunit  34.62 
 
 
298 aa  122  4e-27  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0442  taurine transporter subunit  40.13 
 
 
275 aa  122  5e-27  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1974  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  37.5 
 
 
261 aa  122  5e-27  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000000226251  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00317  taurine transporter subunit  39.49 
 
 
275 aa  122  6e-27  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3261  taurine transporter subunit  39.49 
 
 
275 aa  122  6e-27  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5896  nitrate ABC transporter permease protein  34.03 
 
 
297 aa  122  6e-27  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.149001  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00321  hypothetical protein  39.49 
 
 
275 aa  122  6e-27  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0391  taurine transporter subunit  39.49 
 
 
275 aa  122  7e-27  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0431  taurine transporter subunit  39.49 
 
 
275 aa  122  7e-27  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3693  taurine transporter subunit  32.99 
 
 
284 aa  122  7e-27  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0260  taurine transporter subunit  32.99 
 
 
284 aa  122  7e-27  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3936  taurine transporter subunit  32.99 
 
 
284 aa  122  7e-27  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>