More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Veis_1108 on replicon NC_008786
Organism: Verminephrobacter eiseniae EF01-2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008786  Veis_1108  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  100 
 
 		 255 aa  505  9.999999999999999e-143  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.135552 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5321  taurine ABC transporter, permease protein  39.91 
 
 		 285 aa  197  2.0000000000000003e-49  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0254  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  39.75 
 
 		 279 aa  196  3e-49  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.57663 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4564  taurine transporter subunit  37.94 
 
 		 279 aa  189  4e-47  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.746145 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0391  taurine transporter subunit  40.39 
 
 		 275 aa  186  4e-46  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0231  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.66 
 
 		 279 aa  185  5e-46  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.33405  hitchhiker  0.000710194 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00317  taurine transporter subunit  40.39 
 
 		 275 aa  185  7e-46  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3261  taurine transporter subunit  40.39 
 
 		 275 aa  185  7e-46  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00321  hypothetical protein  40.39 
 
 		 275 aa  185  7e-46  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0442  taurine transporter subunit  40.39 
 
 		 275 aa  185  7e-46  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3240  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.39 
 
 		 275 aa  184  9e-46  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0246  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.09 
 
 		 279 aa  184  9e-46  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0570948  normal  0.0921514 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0280  taurine transporter subunit  40 
 
 		 275 aa  182  3e-45  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0431  taurine transporter subunit  40 
 
 		 275 aa  182  3e-45  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3693  taurine transporter subunit  37.69 
 
 		 284 aa  183  3e-45  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0260  taurine transporter subunit  37.69 
 
 		 284 aa  183  3e-45  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3936  taurine transporter subunit  37.69 
 
 		 284 aa  183  3e-45  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4981  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.46 
 
 		 279 aa  182  5.0000000000000004e-45  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.588836 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4641  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.91 
 
 		 277 aa  179  5.999999999999999e-44  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.750363  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0396  taurine transporter subunit  40.39 
 
 		 275 aa  179  5.999999999999999e-44  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4371  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.87 
 
 		 306 aa  174  9e-43  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.17867  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0255  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.48 
 
 		 279 aa  174  9e-43  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.796344  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1211  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.69 
 
 		 273 aa  174  9.999999999999999e-43  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.132759  normal  0.452833 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6225  nitrate/sulfonate/bicarbonate ABC transporter inner membrane protein  42.69 
 
 		 320 aa  174  9.999999999999999e-43  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2535  putative taurine ABC transporter, permease protein  38.15 
 
 		 282 aa  174  9.999999999999999e-43  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.254862  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0692  ABC taurine transporter, inner membrane subunit  38.87 
 
 		 306 aa  172  3.9999999999999995e-42  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00000000618741  normal  0.0440204 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0840  taurine transporter subunit  40.89 
 
 		 275 aa  171  7.999999999999999e-42  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.276647 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1171  taurine ABC transporter permease  39.04 
 
 		 272 aa  171  9e-42  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.104716  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0085  taurine ABC transporter inner membrane protein  41.46 
 
 		 283 aa  171  1e-41  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.664827  normal  0.135193 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1763  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  42.11 
 
 		 282 aa  171  1e-41  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3869  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.35 
 
 		 274 aa  170  2e-41  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2152  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  37.11 
 
 		 271 aa  170  2e-41  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.529987 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0521  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.52 
 
 		 292 aa  170  2e-41  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.367955 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1261  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.15 
 
 		 273 aa  169  3e-41  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.306936 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1422  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.15 
 
 		 273 aa  169  3e-41  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4051  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.84 
 
 		 273 aa  168  6e-41  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.395379 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1488  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  37.66 
 
 		 280 aa  167  1e-40  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.106569  normal  0.790334 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1380  binding-protein-dependent transporter inner membrane component  39.57 
 
 		 277 aa  167  2e-40  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.153307 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4060  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  36.09 
 
 		 256 aa  167  2e-40  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_12960  taurine ABC transporter permease  38.96 
 
 		 272 aa  167  2e-40  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.299757  normal  0.321121 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7932  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.84 
 
 		 283 aa  167  2e-40  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4207  ABC taurine transporter, inner membrane subunit  42 
 
 		 289 aa  166  4e-40  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5005  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.68 
 
 		 267 aa  166  4e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0464  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.29 
 
 		 273 aa  166  4e-40  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1470  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  39.43 
 
 		 301 aa  166  5e-40  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0421  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  42.13 
 
 		 321 aa  165  5e-40  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.905374 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0735  nitrate/sulfonate/bicarbonate ABC transporter inner membrane protein  38.43 
 
 		 273 aa  166  5e-40  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.714635  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1580  taurine ABC transporter, permease protein  37.5 
 
 		 253 aa  165  8e-40  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.477521  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0620  permease component of taurine ABC transporter  37.5 
 
 		 253 aa  165  8e-40  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  decreased coverage  0.00192231  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4930  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  37.23 
 
 		 267 aa  164  9e-40  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2220  taurine ABC transporter, permease protein  37.5 
 
 		 283 aa  164  9e-40  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.215273  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2019  taurine ABC transporter, permease protein  37.5 
 
 		 285 aa  164  9e-40  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.484134  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2133  taurine ABC transporter, permease protein  37.5 
 
 		 283 aa  164  9e-40  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.186654  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0697  taurine ABC transporter, permease protein  37.5 
 
 		 283 aa  164  9e-40  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4973  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.75 
 
 		 265 aa  164  1.0000000000000001e-39  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0722896  normal  0.022026 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6082  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.43 
 
 		 296 aa  164  2.0000000000000002e-39  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.201741 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0254  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.32 
 
 		 265 aa  163  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.293544  normal  0.0445843 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2269  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.96 
 
 		 321 aa  163  3e-39  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0464  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.93 
 
 		 288 aa  162  4.0000000000000004e-39  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.349721  hitchhiker  0.00645779 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2894  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.52 
 
 		 321 aa  162  4.0000000000000004e-39  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.438311 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2884  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.96 
 
 		 269 aa  162  4.0000000000000004e-39  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0239  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.9 
 
 		 265 aa  162  5.0000000000000005e-39  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00756787 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3505  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.48 
 
 		 275 aa  162  5.0000000000000005e-39  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.197989  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0263  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.32 
 
 		 265 aa  162  5.0000000000000005e-39  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.791848  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_19570  ABC transporter permease  36.02 
 
 		 262 aa  162  6e-39  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3058  taurine ABC transporter, permease protein  33.06 
 
 		 274 aa  162  7e-39  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0802  taurine ABC transporter, permease protein  35.6 
 
 		 283 aa  161  7e-39  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.207449  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3413  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.48 
 
 		 271 aa  162  7e-39  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0409101  normal  0.884011 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4861  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.08 
 
 		 275 aa  161  1e-38  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0877464 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5801  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  36.03 
 
 		 290 aa  160  1e-38  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0509  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.8 
 
 		 289 aa  160  2e-38  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.085274 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1083  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.29 
 
 		 270 aa  160  2e-38  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1539  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.29 
 
 		 270 aa  160  2e-38  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0890555  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1563  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.29 
 
 		 270 aa  160  2e-38  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1684  ABC transporter permease  36.02 
 
 		 262 aa  160  2e-38  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0047  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.76 
 
 		 306 aa  160  2e-38  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0040  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.73 
 
 		 259 aa  160  2e-38  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.832577  normal  0.34867 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1464  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.29 
 
 		 270 aa  159  3e-38  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0183453  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0049  ABC taurine transporter, binding protein inner membrane component  34.25 
 
 		 330 aa  159  4e-38  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.0656508 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4637  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.14 
 
 		 283 aa  159  5e-38  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.258867  hitchhiker  0.00000636426 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1279  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.17 
 
 		 272 aa  159  6e-38  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.88893  normal  0.0504928 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2417  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.29 
 
 		 300 aa  158  6e-38  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0833403  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4284  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.49 
 
 		 272 aa  159  6e-38  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0949532  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5412  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  35.04 
 
 		 260 aa  158  7e-38  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.210037  hitchhiker  0.00191971 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1669  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.86 
 
 		 273 aa  158  7e-38  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.5369  normal  0.169212 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4321  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.47 
 
 		 264 aa  158  8e-38  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.154719 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6162  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.11 
 
 		 262 aa  158  8e-38  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.577279 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1975  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  38.89 
 
 		 267 aa  158  8e-38  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.59364  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1216  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.83 
 
 		 270 aa  158  9e-38  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.150226 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1485  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.86 
 
 		 270 aa  157  1e-37  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0992  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.33 
 
 		 254 aa  157  1e-37  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1974  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  38.94 
 
 		 261 aa  158  1e-37  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000000226251  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2500  aliphatic sulfonate ABC transporter, permease protein  37.29 
 
 		 268 aa  157  1e-37  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2304  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.66 
 
 		 278 aa  157  1e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.37818 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3788  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.16 
 
 		 276 aa  157  1e-37  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.374556  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1736  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.17 
 
 		 264 aa  157  2e-37  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.440066  normal  0.144233 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3807  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.05 
 
 		 269 aa  157  2e-37  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4705  nitrate/sulfonate/bicarbonate ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  36.86 
 
 		 270 aa  157  2e-37  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3750  ABC nitrate/sulfonate/bicarbonate transporter, inner membrane subunit  36.82 
 
 		 269 aa  157  2e-37  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4508  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.3 
 
 		 277 aa  157  2e-37  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.854714  normal  0.909107 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>