More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcen_1083 on replicon NC_008060
Organism: Burkholderia cenocepacia AU 1054



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008060  Bcen_1083  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  100 
 
 
270 aa  528  1e-149  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1563  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  100 
 
 
270 aa  528  1e-149  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1539  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  99.63 
 
 
270 aa  526  1e-148  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0890555  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4705  nitrate/sulfonate/bicarbonate ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  98.52 
 
 
270 aa  521  1e-147  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1464  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  98.15 
 
 
270 aa  520  1e-147  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0183453  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1485  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  97.78 
 
 
270 aa  474  1e-133  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1669  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  96.51 
 
 
273 aa  465  9.999999999999999e-131  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.5369  normal  0.169212 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1837  aliphatic sulfonates ABC transporter, permease protein  91.16 
 
 
269 aa  424  1e-118  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.669476  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1822  aliphatic sulfonates ABC transporter, permease protein  90.76 
 
 
269 aa  426  1e-118  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1238  aliphatic sulfonate ABC transporter, permease protein  90.76 
 
 
273 aa  423  1e-117  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.466833  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1990  aliphatic sulfonates ABC transporter, permease protein  90.76 
 
 
273 aa  423  1e-117  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.088895  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1724  aliphatic sulfonate ABC transporter, permease protein  90.76 
 
 
273 aa  423  1e-117  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0780  aliphatic sulfonate ABC transporter, permease protein  90.76 
 
 
273 aa  423  1e-117  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.175921  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0381  aliphatic sulfonate ABC transporter, permease protein  90.76 
 
 
273 aa  423  1e-117  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.410212  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2500  aliphatic sulfonate ABC transporter, permease protein  89.52 
 
 
268 aa  418  1e-116  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2492  ABC aliphatic sulfonates transporter, innermembrane subunit  84.8 
 
 
280 aa  410  1e-114  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.773133 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1745  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  80.61 
 
 
280 aa  409  1e-113  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1648  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  83.13 
 
 
283 aa  404  1.0000000000000001e-112  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.189471  normal  0.0804385 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1736  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  67.89 
 
 
264 aa  353  1e-96  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.440066  normal  0.144233 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_19570  ABC transporter permease  67.19 
 
 
262 aa  353  1e-96  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1684  ABC transporter permease  67.19 
 
 
262 aa  352  2.9999999999999997e-96  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5412  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  69.35 
 
 
260 aa  351  7e-96  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.210037  hitchhiker  0.00191971 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0423  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  65.75 
 
 
264 aa  349  3e-95  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0355  putative ABC aliphatic sulfonates transporter, permease subunit  65.75 
 
 
264 aa  349  3e-95  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1453  alkanesulfonate transporter permease subunit  65.85 
 
 
263 aa  348  7e-95  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4973  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  68 
 
 
265 aa  346  2e-94  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0722896  normal  0.022026 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0024  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  65.46 
 
 
264 aa  346  2e-94  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0030  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  65.46 
 
 
264 aa  347  2e-94  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.050552  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0254  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  67.6 
 
 
265 aa  346  3e-94  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.293544  normal  0.0445843 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0263  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  67.6 
 
 
265 aa  345  3e-94  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.791848  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0239  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  67.2 
 
 
265 aa  345  4e-94  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00756787 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1372  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  74 
 
 
268 aa  343  1e-93  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1975  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  73.49 
 
 
267 aa  341  9e-93  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.59364  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1673  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  67.09 
 
 
263 aa  339  2.9999999999999998e-92  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1642  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  66.67 
 
 
263 aa  337  9e-92  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2417  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  72.47 
 
 
300 aa  336  2.9999999999999997e-91  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0833403  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2975  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  68.22 
 
 
284 aa  332  4e-90  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.27836  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0116  membrane protein  75 
 
 
281 aa  331  7.000000000000001e-90  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0935043  hitchhiker  0.000854026 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1210  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  60.67 
 
 
315 aa  328  5.0000000000000004e-89  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4875  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  66.54 
 
 
265 aa  327  2.0000000000000001e-88  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.746085  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5315  aliphatic sulfonates ABC transporter, permease protein  66.02 
 
 
265 aa  325  5e-88  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4321  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  66.67 
 
 
264 aa  325  6e-88  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.154719 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1279  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  66.92 
 
 
272 aa  323  1e-87  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.88893  normal  0.0504928 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1776  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  67.18 
 
 
294 aa  323  2e-87  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1216  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  70.68 
 
 
270 aa  323  2e-87  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.150226 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_30490  aliphatic sulfonate ABC transporter permease protein  69.32 
 
 
264 aa  321  7e-87  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.168678  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2882  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  60.94 
 
 
268 aa  317  2e-85  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.80309  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3042  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  68.83 
 
 
292 aa  315  4e-85  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.780897  normal  0.0430449 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00938  alkanesulfonate transporter subunit  66.26 
 
 
263 aa  314  9e-85  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.028081  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2709  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  66.26 
 
 
263 aa  314  9e-85  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.753275  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2662  alkanesulfonate transporter permease subunit  66.26 
 
 
263 aa  314  9e-85  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.629834  normal  0.0100847 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2185  alkanesulfonate transporter permease subunit  66.26 
 
 
264 aa  314  9e-85  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.11182  normal  0.890131 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00945  hypothetical protein  66.26 
 
 
263 aa  314  9e-85  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0322362  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1043  alkanesulfonate transporter permease subunit  66.26 
 
 
263 aa  314  9e-85  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1036  alkanesulfonate transporter permease subunit  66.26 
 
 
263 aa  314  9e-85  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0685931  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1096  alkanesulfonate transporter permease subunit  66.26 
 
 
263 aa  314  9.999999999999999e-85  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00432775  normal  0.422148 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1340  aliphatic sulfonate ABC transporter transmembrane protein  70.98 
 
 
264 aa  311  9e-84  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0574559  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4637  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  70.56 
 
 
283 aa  310  1e-83  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.258867  hitchhiker  0.00000636426 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5130  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  59.51 
 
 
272 aa  302  3.0000000000000004e-81  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.612608  normal  0.0470724 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0772  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  58.87 
 
 
302 aa  301  7.000000000000001e-81  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0528102 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2787  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  58.33 
 
 
272 aa  297  1e-79  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.334714  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0683  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  59.4 
 
 
268 aa  296  3e-79  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.473028  normal  0.58692 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2304  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  52.83 
 
 
278 aa  294  1e-78  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.37818 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0765  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  59.13 
 
 
265 aa  294  1e-78  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1867  ABC transporter permease  62.1 
 
 
272 aa  293  2e-78  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5468  ABC transporter membrane spanning protein (aliphatic sulphonate)  62.7 
 
 
284 aa  291  8e-78  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.165676  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1338  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  60.82 
 
 
260 aa  289  3e-77  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.011116 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2226  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  62.11 
 
 
259 aa  285  5.999999999999999e-76  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.00307443  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4139  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  57.32 
 
 
275 aa  283  2.0000000000000002e-75  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.00000000314222  normal  0.0106036 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5516  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  60.73 
 
 
262 aa  283  3.0000000000000004e-75  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3715  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  61.22 
 
 
282 aa  280  2e-74  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.0101223 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3406  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  61.22 
 
 
286 aa  280  2e-74  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.316546  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2437  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  60.25 
 
 
278 aa  280  3e-74  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2846  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  56.1 
 
 
260 aa  276  2e-73  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.000143494  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3599  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  60.41 
 
 
292 aa  276  4e-73  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0649453  normal  0.129383 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3299  putative sulfonate ABC transporter, permease protein  55.51 
 
 
286 aa  275  5e-73  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.201269  normal  0.262094 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2638  ABC sulfonate transporter, inner membrane subunit  49.8 
 
 
279 aa  253  2.0000000000000002e-66  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0950643  hitchhiker  0.0000361652 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0981  nitrate/sulfonate/bicarbonate ABC transporter inner membrane protein  51.02 
 
 
279 aa  252  6e-66  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3464  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  51.42 
 
 
294 aa  248  5e-65  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.136656  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1153  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport system, permease component  50.42 
 
 
258 aa  242  3.9999999999999997e-63  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.23101  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2621  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  46.06 
 
 
281 aa  229  3e-59  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000218671  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_21600  aliphatic sulfonates ABC transporter, inner membrane component  45.61 
 
 
284 aa  226  2e-58  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0464  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  48.95 
 
 
273 aa  226  3e-58  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3818  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  48.13 
 
 
280 aa  226  4e-58  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.615395  normal  0.42897 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1380  binding-protein-dependent transporter inner membrane component  45.91 
 
 
277 aa  225  7e-58  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.153307 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0423  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  48.55 
 
 
297 aa  224  9e-58  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.283538  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5005  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  45.61 
 
 
289 aa  223  3e-57  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1385  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  50.41 
 
 
284 aa  217  1e-55  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0616622  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0550  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport system, permease component  50.9 
 
 
231 aa  216  4e-55  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.952669  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1998  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  42.15 
 
 
283 aa  212  3.9999999999999995e-54  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.894639  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1796  sulfonate ABC transporter, permease protein, putative  44.74 
 
 
285 aa  210  2e-53  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2657  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  45.04 
 
 
269 aa  208  6e-53  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.363458 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3598  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  43.86 
 
 
285 aa  207  2e-52  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.330128 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_19510  ABC transporter permease  41.85 
 
 
274 aa  206  2e-52  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2712  sulfonate ABC transporter permease  41.63 
 
 
282 aa  206  3e-52  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2920  sulfonate ABC transporter permease protein  41.63 
 
 
282 aa  206  3e-52  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4420  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  47.74 
 
 
279 aa  206  4e-52  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.25857  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3413  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  43.64 
 
 
271 aa  206  4e-52  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0409101  normal  0.884011 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3400  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  46.56 
 
 
275 aa  205  7e-52  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1679  ABC transporter permease  41.48 
 
 
274 aa  205  7e-52  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.451747  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>