More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bxe_B0692 on replicon NC_007952
Organism: Burkholderia xenovorans LB400



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007952  Bxe_B0692  ABC taurine transporter, inner membrane subunit  100 
 
 
306 aa  607  9.999999999999999e-173  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00000000618741  normal  0.0440204 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4371  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  95.42 
 
 
306 aa  536  1e-151  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.17867  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3505  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  73.03 
 
 
275 aa  372  1e-102  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.197989  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4861  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  71.64 
 
 
275 aa  365  1e-100  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.0877464 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4207  ABC taurine transporter, inner membrane subunit  60.74 
 
 
289 aa  303  3.0000000000000004e-81  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1470  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  61.71 
 
 
301 aa  301  9e-81  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0509  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  58.3 
 
 
289 aa  300  1e-80  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.085274 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0049  ABC taurine transporter, binding protein inner membrane component  62.31 
 
 
330 aa  298  1e-79  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.0656508 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0085  taurine ABC transporter inner membrane protein  59.7 
 
 
283 aa  296  4e-79  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.664827  normal  0.135193 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0047  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  62.69 
 
 
306 aa  293  3e-78  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2883  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  60.22 
 
 
289 aa  292  4e-78  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2477  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  60.45 
 
 
289 aa  292  5e-78  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0948255  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6082  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  58.74 
 
 
296 aa  289  5.0000000000000004e-77  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.201741 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1763  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  64.11 
 
 
282 aa  284  1.0000000000000001e-75  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5321  taurine ABC transporter, permease protein  60 
 
 
285 aa  282  4.0000000000000003e-75  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3844  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  66.8 
 
 
293 aa  282  5.000000000000001e-75  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0254  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  54.48 
 
 
279 aa  280  2e-74  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.57663 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6225  nitrate/sulfonate/bicarbonate ABC transporter inner membrane protein  55.36 
 
 
320 aa  280  2e-74  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4284  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  62.5 
 
 
272 aa  279  4e-74  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0949532  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0231  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  52.27 
 
 
279 aa  279  5e-74  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.33405  hitchhiker  0.000710194 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0421  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  55.6 
 
 
321 aa  274  1.0000000000000001e-72  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.905374 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0246  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  57.46 
 
 
279 aa  273  4.0000000000000004e-72  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0570948  normal  0.0921514 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4981  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  55.93 
 
 
279 aa  272  5.000000000000001e-72  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.588836 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3693  taurine transporter subunit  56.28 
 
 
284 aa  271  8.000000000000001e-72  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0260  taurine transporter subunit  56.28 
 
 
284 aa  271  8.000000000000001e-72  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3936  taurine transporter subunit  56.28 
 
 
284 aa  271  8.000000000000001e-72  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2269  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  57.04 
 
 
321 aa  268  1e-70  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2894  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  56.67 
 
 
321 aa  267  2e-70  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.438311 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0255  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  56.6 
 
 
279 aa  265  8.999999999999999e-70  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.796344  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0802  taurine ABC transporter, permease protein  51.21 
 
 
283 aa  265  8.999999999999999e-70  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.207449  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2884  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  57.09 
 
 
269 aa  265  8.999999999999999e-70  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4564  taurine transporter subunit  51.5 
 
 
279 aa  263  3e-69  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.746145 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00317  taurine transporter subunit  56.35 
 
 
275 aa  261  1e-68  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00321  hypothetical protein  56.35 
 
 
275 aa  261  1e-68  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3261  taurine transporter subunit  56.35 
 
 
275 aa  261  1e-68  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1171  taurine ABC transporter permease  56.14 
 
 
272 aa  260  2e-68  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.104716  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0442  taurine transporter subunit  55.95 
 
 
275 aa  259  3e-68  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3240  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  55.56 
 
 
275 aa  258  7e-68  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0391  taurine transporter subunit  55.56 
 
 
275 aa  258  7e-68  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0280  taurine transporter subunit  55.16 
 
 
275 aa  255  6e-67  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0431  taurine transporter subunit  55.16 
 
 
275 aa  255  6e-67  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2535  putative taurine ABC transporter, permease protein  49.62 
 
 
282 aa  255  7e-67  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.254862  normal 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2133  taurine ABC transporter, permease protein  52.19 
 
 
283 aa  254  1.0000000000000001e-66  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.186654  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2220  taurine ABC transporter, permease protein  52.19 
 
 
283 aa  254  1.0000000000000001e-66  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.215273  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2019  taurine ABC transporter, permease protein  52.65 
 
 
285 aa  254  1.0000000000000001e-66  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.484134  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0396  taurine transporter subunit  56.35 
 
 
275 aa  254  2.0000000000000002e-66  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1580  taurine ABC transporter, permease protein  52.19 
 
 
253 aa  253  2.0000000000000002e-66  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.477521  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0620  permease component of taurine ABC transporter  51.74 
 
 
253 aa  254  2.0000000000000002e-66  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  decreased coverage  0.00192231  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0697  taurine ABC transporter, permease protein  52.65 
 
 
283 aa  254  2.0000000000000002e-66  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0840  taurine transporter subunit  57.39 
 
 
275 aa  253  3e-66  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.276647 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_12960  taurine ABC transporter permease  56.14 
 
 
272 aa  249  3e-65  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.299757  normal  0.321121 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0761  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  43.89 
 
 
412 aa  247  1e-64  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5576  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  49.62 
 
 
284 aa  227  2e-58  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1488  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  44.69 
 
 
280 aa  224  2e-57  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.106569  normal  0.790334 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7166  taurine uptake ABC transporter permease protein  48.84 
 
 
261 aa  223  4e-57  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3947  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  51.77 
 
 
430 aa  209  4e-53  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  hitchhiker  0.00472137  normal  0.430362 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1402  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.71 
 
 
257 aa  196  3e-49  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1800  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.32 
 
 
257 aa  192  5e-48  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1108  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.87 
 
 
255 aa  189  5e-47  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.135552 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1503  taurine ABC transporter, permease protein  37.15 
 
 
288 aa  182  6e-45  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1323  binding-protein-dependent transporter inner membrane component  40.24 
 
 
260 aa  181  1e-44  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.0560082 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3138  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.13 
 
 
286 aa  173  1.9999999999999998e-42  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.453695  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6203  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40 
 
 
284 aa  170  2e-41  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.780444  normal  0.280504 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4844  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.08 
 
 
288 aa  167  2e-40  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6162  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.49 
 
 
262 aa  167  2.9999999999999998e-40  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.577279 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3058  taurine ABC transporter, permease protein  35.46 
 
 
274 aa  162  6e-39  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2559  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.14 
 
 
283 aa  160  2e-38  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3788  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.79 
 
 
276 aa  160  3e-38  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.374556  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2748  sulfonate/taurine ABC transporter permease  39.71 
 
 
274 aa  157  2e-37  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.947189  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0040  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.01 
 
 
259 aa  157  2e-37  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.832577  normal  0.34867 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3060  taurine ABC transporter, permease protein  39.23 
 
 
274 aa  156  4e-37  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0244271  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0154  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.2 
 
 
264 aa  156  4e-37  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0992  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.91 
 
 
254 aa  154  2e-36  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1575  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.61 
 
 
266 aa  154  2e-36  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0981  nitrate/sulfonate/bicarbonate ABC transporter inner membrane protein  36.02 
 
 
279 aa  154  2e-36  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0512  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.16 
 
 
253 aa  154  2e-36  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3869  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.23 
 
 
274 aa  152  7e-36  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0483  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.71 
 
 
275 aa  150  3e-35  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_21990  ABC transporter, inner membrane permease component  35.95 
 
 
273 aa  149  5e-35  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3255  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.38 
 
 
294 aa  149  6e-35  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.106321 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4060  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  36.02 
 
 
256 aa  149  7e-35  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1575  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.2 
 
 
254 aa  148  1.0000000000000001e-34  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0747147  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1900  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  36.02 
 
 
252 aa  147  1.0000000000000001e-34  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.128113  hitchhiker  0.000000000000910228 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4641  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.61 
 
 
277 aa  148  1.0000000000000001e-34  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.750363  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4051  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.79 
 
 
273 aa  147  2.0000000000000003e-34  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.395379 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3299  putative sulfonate ABC transporter, permease protein  33.74 
 
 
286 aa  147  2.0000000000000003e-34  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.201269  normal  0.262094 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1380  binding-protein-dependent transporter inner membrane component  34.45 
 
 
277 aa  147  2.0000000000000003e-34  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.153307 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2638  ABC sulfonate transporter, inner membrane subunit  34.85 
 
 
279 aa  147  2.0000000000000003e-34  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0950643  hitchhiker  0.0000361652 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0403  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.2 
 
 
256 aa  147  3e-34  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1974  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  35.54 
 
 
261 aa  147  3e-34  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000000226251  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0104  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.71 
 
 
286 aa  147  3e-34  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.424876  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0113  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.71 
 
 
286 aa  147  3e-34  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0961261 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1848  ABC transporter permease  38.24 
 
 
273 aa  146  5e-34  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1957  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.24 
 
 
273 aa  146  5e-34  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0094  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.71 
 
 
286 aa  145  6e-34  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.062918 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0423  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.93 
 
 
297 aa  145  8.000000000000001e-34  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.283538  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5517  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.82 
 
 
256 aa  144  2e-33  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.16627  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6360  putative sulfonate ABC transporter, permease protein  32.68 
 
 
267 aa  144  2e-33  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.821284  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0521  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.2 
 
 
292 aa  144  2e-33  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.367955 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1453  alkanesulfonate transporter permease subunit  32.91 
 
 
263 aa  144  2e-33  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>