More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bxe_C0085 on replicon NC_007953
Organism: Burkholderia xenovorans LB400



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007953  Bxe_C0085  taurine ABC transporter inner membrane protein  100 
 
 		 283 aa  550  1e-156  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.664827  normal  0.135193 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4207  ABC taurine transporter, inner membrane subunit  82.33 
 
 		 289 aa  438  9.999999999999999e-123  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0509  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  81.27 
 
 		 289 aa  433  1e-120  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.085274 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6082  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  83.33 
 
 		 296 aa  414  9.999999999999999e-116  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.201741 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6225  nitrate/sulfonate/bicarbonate ABC transporter inner membrane protein  79.12 
 
 		 320 aa  406  1.0000000000000001e-112  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2883  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  77.03 
 
 		 289 aa  399  9.999999999999999e-111  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2477  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  77.17 
 
 		 289 aa  397  1e-109  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0948255  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0421  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  78.99 
 
 		 321 aa  395  1e-109  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.905374 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2269  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  81.06 
 
 		 321 aa  382  1e-105  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2894  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  81.06 
 
 		 321 aa  382  1e-105  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.438311 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2884  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  81.06 
 
 		 269 aa  380  1e-104  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1470  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  69.42 
 
 		 301 aa  367  1e-100  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0047  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  76.74 
 
 		 306 aa  364  1e-100  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4371  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  60.82 
 
 		 306 aa  303  2.0000000000000002e-81  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.17867  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0692  ABC taurine transporter, inner membrane subunit  59.7 
 
 		 306 aa  298  5e-80  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00000000618741  normal  0.0440204 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1763  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  62.37 
 
 		 282 aa  298  9e-80  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4284  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  63.77 
 
 		 272 aa  295  6e-79  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0949532  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3844  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  65.37 
 
 		 293 aa  291  6e-78  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4861  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  57.99 
 
 		 275 aa  280  2e-74  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0877464 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3505  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  54.17 
 
 		 275 aa  265  8.999999999999999e-70  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.197989  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4981  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  51.23 
 
 		 279 aa  264  1e-69  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.588836 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0231  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  50 
 
 		 279 aa  260  2e-68  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.33405  hitchhiker  0.000710194 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0254  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  54.4 
 
 		 279 aa  255  5e-67  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.57663 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5321  taurine ABC transporter, permease protein  53.96 
 
 		 285 aa  253  3e-66  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0049  ABC taurine transporter, binding protein inner membrane component  54.05 
 
 		 330 aa  253  3e-66  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.0656508 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0246  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  56.41 
 
 		 279 aa  251  7e-66  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0570948  normal  0.0921514 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3936  taurine transporter subunit  52.73 
 
 		 284 aa  249  4e-65  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0260  taurine transporter subunit  52.73 
 
 		 284 aa  249  4e-65  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3693  taurine transporter subunit  52.73 
 
 		 284 aa  249  4e-65  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4564  taurine transporter subunit  53.44 
 
 		 279 aa  247  1e-64  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.746145 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0255  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  55.23 
 
 		 279 aa  247  1e-64  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.796344  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1580  taurine ABC transporter, permease protein  55.26 
 
 		 253 aa  243  1.9999999999999999e-63  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.477521  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2133  taurine ABC transporter, permease protein  54.78 
 
 		 283 aa  244  1.9999999999999999e-63  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.186654  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0620  permease component of taurine ABC transporter  54.78 
 
 		 253 aa  243  1.9999999999999999e-63  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  decreased coverage  0.00192231  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2220  taurine ABC transporter, permease protein  54.78 
 
 		 283 aa  243  3e-63  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.215273  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0697  taurine ABC transporter, permease protein  55.26 
 
 		 283 aa  243  3e-63  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2019  taurine ABC transporter, permease protein  55.26 
 
 		 285 aa  243  3e-63  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.484134  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0802  taurine ABC transporter, permease protein  53.11 
 
 		 283 aa  242  6e-63  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.207449  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0391  taurine transporter subunit  53.63 
 
 		 275 aa  237  2e-61  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0442  taurine transporter subunit  53.23 
 
 		 275 aa  236  4e-61  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0840  taurine transporter subunit  56.77 
 
 		 275 aa  234  9e-61  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.276647 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00317  taurine transporter subunit  53.23 
 
 		 275 aa  234  1.0000000000000001e-60  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3240  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  52.82 
 
 		 275 aa  234  1.0000000000000001e-60  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3261  taurine transporter subunit  53.23 
 
 		 275 aa  234  1.0000000000000001e-60  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0280  taurine transporter subunit  53.23 
 
 		 275 aa  234  1.0000000000000001e-60  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0396  taurine transporter subunit  53.63 
 
 		 275 aa  234  1.0000000000000001e-60  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0431  taurine transporter subunit  53.23 
 
 		 275 aa  234  1.0000000000000001e-60  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00321  hypothetical protein  53.23 
 
 		 275 aa  234  1.0000000000000001e-60  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1171  taurine ABC transporter permease  52 
 
 		 272 aa  232  5e-60  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.104716  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2535  putative taurine ABC transporter, permease protein  49.62 
 
 		 282 aa  228  6e-59  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.254862  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_12960  taurine ABC transporter permease  52.36 
 
 		 272 aa  222  4.9999999999999996e-57  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.299757  normal  0.321121 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5576  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  50.58 
 
 		 284 aa  208  7e-53  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7166  taurine uptake ABC transporter permease protein  49.22 
 
 		 261 aa  206  3e-52  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1488  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  45.49 
 
 		 280 aa  202  7e-51  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.106569  normal  0.790334 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0761  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  42.57 
 
 		 412 aa  199  3e-50  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1108  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.46 
 
 		 255 aa  188  9e-47  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.135552 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1402  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  43.82 
 
 		 257 aa  186  3e-46  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1800  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  43.43 
 
 		 257 aa  181  2e-44  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4844  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  42.42 
 
 		 288 aa  178  1e-43  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3138  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.79 
 
 		 286 aa  176  4e-43  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.453695  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1323  binding-protein-dependent transporter inner membrane component  41.15 
 
 		 260 aa  174  9.999999999999999e-43  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0560082 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6162  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.57 
 
 		 262 aa  172  3.9999999999999995e-42  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.577279 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6203  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  43.37 
 
 		 284 aa  173  3.9999999999999995e-42  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.780444  normal  0.280504 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3947  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  47.35 
 
 		 430 aa  170  2e-41  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  hitchhiker  0.00472137  normal  0.430362 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4060  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  39.92 
 
 		 256 aa  168  9e-41  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0512  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.29 
 
 		 253 aa  165  1.0000000000000001e-39  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2304  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.84 
 
 		 278 aa  162  8.000000000000001e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.37818 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5517  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.6 
 
 		 256 aa  161  1e-38  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.16627  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0423  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.82 
 
 		 297 aa  159  5e-38  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.283538  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1736  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.33 
 
 		 264 aa  157  1e-37  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.440066  normal  0.144233 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0116  membrane protein  37.86 
 
 		 281 aa  157  3e-37  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0935043  hitchhiker  0.000854026 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1673  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.71 
 
 		 263 aa  155  5.0000000000000005e-37  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0040  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.2 
 
 		 259 aa  155  6e-37  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.832577  normal  0.34867 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0239  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.17 
 
 		 265 aa  155  7e-37  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00756787 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1453  alkanesulfonate transporter permease subunit  37.5 
 
 		 263 aa  155  7e-37  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0254  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.17 
 
 		 265 aa  155  7e-37  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.293544  normal  0.0445843 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0992  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.08 
 
 		 254 aa  155  7e-37  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0403  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.32 
 
 		 256 aa  154  1e-36  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4973  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.17 
 
 		 265 aa  154  1e-36  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0722896  normal  0.022026 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0263  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.17 
 
 		 265 aa  154  2e-36  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.791848  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0024  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.67 
 
 		 264 aa  154  2e-36  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2559  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.07 
 
 		 283 aa  153  2.9999999999999998e-36  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3788  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.55 
 
 		 276 aa  153  2.9999999999999998e-36  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.374556  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_19570  ABC transporter permease  38.14 
 
 		 262 aa  152  4e-36  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1575  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.37 
 
 		 254 aa  152  7e-36  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0747147  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0355  putative ABC aliphatic sulfonates transporter, permease subunit  37.5 
 
 		 264 aa  152  8e-36  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0423  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.5 
 
 		 264 aa  152  8e-36  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1503  taurine ABC transporter, permease protein  39.24 
 
 		 288 aa  151  1e-35  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1684  ABC transporter permease  38.14 
 
 		 262 aa  151  1e-35  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0030  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.25 
 
 		 264 aa  150  2e-35  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.050552  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2719  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  40.54 
 
 		 284 aa  150  3e-35  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1642  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.75 
 
 		 263 aa  150  3e-35  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4875  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  37.92 
 
 		 265 aa  149  4e-35  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.746085  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1575  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.33 
 
 		 266 aa  149  4e-35  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0444  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.86 
 
 		 253 aa  149  6e-35  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0146  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.12 
 
 		 296 aa  149  6e-35  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.159688 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5315  aliphatic sulfonates ABC transporter, permease protein  37.5 
 
 		 265 aa  149  7e-35  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0393  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.4 
 
 		 253 aa  148  9e-35  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0876322  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0765  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.66 
 
 		 265 aa  148  1.0000000000000001e-34  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2858  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.96 
 
 		 291 aa  147  1.0000000000000001e-34  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.582448  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>