More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Reut_A2719 on replicon NC_007347
Organism: Ralstonia eutropha JMP134



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007347  Reut_A2719  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  100 
 
 
284 aa  559  1e-158  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2858  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  89.17 
 
 
291 aa  485  1e-136  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.582448  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0146  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  80.23 
 
 
296 aa  419  1e-116  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.159688 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2968  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  78.33 
 
 
289 aa  400  9.999999999999999e-111  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0761961  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3642  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  76.4 
 
 
275 aa  392  1e-108  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.142025  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1046  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  79.7 
 
 
282 aa  388  1e-107  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.12004  normal  0.278615 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0155  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  80.38 
 
 
292 aa  384  1e-105  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0326  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  74.9 
 
 
257 aa  371  1e-102  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.369486  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2276  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  74.51 
 
 
257 aa  372  1e-102  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.722283  normal  0.0991744 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2644  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  77.22 
 
 
282 aa  369  1e-101  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.285231  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6456  ABC transporter permease  75.69 
 
 
258 aa  353  2e-96  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.405099  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1429  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  70.47 
 
 
257 aa  312  2.9999999999999996e-84  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.214609  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0466  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  47.01 
 
 
262 aa  208  8e-53  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2559  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  42.19 
 
 
283 aa  203  3e-51  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3788  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  43.86 
 
 
276 aa  199  5e-50  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.374556  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0040  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  42.98 
 
 
259 aa  195  6e-49  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.832577  normal  0.34867 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5005  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.46 
 
 
267 aa  191  9e-48  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4930  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  38.83 
 
 
267 aa  185  7e-46  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4887  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  38.95 
 
 
296 aa  164  2.0000000000000002e-39  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0123695  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3255  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.52 
 
 
294 aa  158  1e-37  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.106321 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0058  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.8 
 
 
275 aa  155  9e-37  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1646  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.62 
 
 
259 aa  154  1e-36  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0791  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  42.93 
 
 
320 aa  154  1e-36  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1108  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34 
 
 
255 aa  153  4e-36  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.135552 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1078  ABC transporter, nitrate-like  40.09 
 
 
275 aa  150  2e-35  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.193306  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5226  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  45.05 
 
 
323 aa  148  1.0000000000000001e-34  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.226274  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4060  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  35.51 
 
 
256 aa  147  2.0000000000000003e-34  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1386  nitrate/sulfonate/bicarbonate ABC transporter inner membrane protein  44.51 
 
 
323 aa  146  4.0000000000000006e-34  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.173943  normal  0.101646 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3082  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  47.8 
 
 
319 aa  146  4.0000000000000006e-34  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3907  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  42.31 
 
 
357 aa  145  8.000000000000001e-34  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0334046  normal  0.137928 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1787  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  41.54 
 
 
326 aa  145  9e-34  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3729  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.76 
 
 
353 aa  144  1e-33  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.19574 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4024  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.21 
 
 
353 aa  144  2e-33  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004311  BRA1188  taurine ABC transporter, permease protein  37.55 
 
 
250 aa  143  3e-33  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0612406  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5556  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  42.31 
 
 
324 aa  143  3e-33  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0488095  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6428  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  42.31 
 
 
324 aa  143  3e-33  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5921  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  42.31 
 
 
324 aa  143  3e-33  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1575  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.74 
 
 
254 aa  143  3e-33  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0747147  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1858  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  42.62 
 
 
321 aa  143  4e-33  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1488  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  33.61 
 
 
280 aa  141  9.999999999999999e-33  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.106569  normal  0.790334 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0049  ABC taurine transporter, binding protein inner membrane component  33.47 
 
 
330 aa  141  9.999999999999999e-33  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.0656508 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0080  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  44.81 
 
 
318 aa  139  6e-32  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0403  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.72 
 
 
256 aa  137  3.0000000000000003e-31  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0085  taurine ABC transporter inner membrane protein  40.54 
 
 
283 aa  137  3.0000000000000003e-31  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.664827  normal  0.135193 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0254  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  32.32 
 
 
279 aa  135  5e-31  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.57663 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0231  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.08 
 
 
279 aa  134  9.999999999999999e-31  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.33405  hitchhiker  0.000710194 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4207  ABC taurine transporter, inner membrane subunit  39.78 
 
 
289 aa  134  9.999999999999999e-31  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0421  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.25 
 
 
321 aa  135  9.999999999999999e-31  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.905374 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1402  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.23 
 
 
257 aa  134  1.9999999999999998e-30  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6225  nitrate/sulfonate/bicarbonate ABC transporter inner membrane protein  38.71 
 
 
320 aa  134  1.9999999999999998e-30  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3299  putative sulfonate ABC transporter, permease protein  28.57 
 
 
286 aa  134  1.9999999999999998e-30  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.201269  normal  0.262094 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1800  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.23 
 
 
257 aa  134  1.9999999999999998e-30  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2894  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.71 
 
 
321 aa  133  3e-30  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.438311 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1380  binding-protein-dependent transporter inner membrane component  31.06 
 
 
277 aa  133  3e-30  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.153307 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2883  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.61 
 
 
289 aa  133  3e-30  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2269  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.71 
 
 
321 aa  133  3e-30  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2884  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.71 
 
 
269 aa  133  3.9999999999999996e-30  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0992  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.86 
 
 
254 aa  132  5e-30  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0047  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.86 
 
 
306 aa  132  5e-30  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2477  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.2 
 
 
289 aa  132  6.999999999999999e-30  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0948255  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5321  taurine ABC transporter, permease protein  33.47 
 
 
285 aa  132  7.999999999999999e-30  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0509  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.71 
 
 
289 aa  132  7.999999999999999e-30  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.085274 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6082  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.17 
 
 
296 aa  132  9e-30  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.201741 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1575  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.35 
 
 
266 aa  131  1.0000000000000001e-29  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0512  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.38 
 
 
253 aa  131  2.0000000000000002e-29  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3065  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.59 
 
 
280 aa  131  2.0000000000000002e-29  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.228654 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1470  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  34.95 
 
 
301 aa  130  3e-29  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0250  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.76 
 
 
280 aa  130  3e-29  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4981  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.8 
 
 
279 aa  129  6e-29  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.588836 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0246  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.33 
 
 
279 aa  129  6e-29  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0570948  normal  0.0921514 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0761  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.79 
 
 
412 aa  129  7.000000000000001e-29  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1127  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.71 
 
 
267 aa  129  7.000000000000001e-29  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2787  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.5 
 
 
272 aa  128  8.000000000000001e-29  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.334714  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0483  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.14 
 
 
275 aa  128  9.000000000000001e-29  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3295  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  30.94 
 
 
279 aa  127  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2621  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.02 
 
 
281 aa  127  2.0000000000000002e-28  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000218671  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7932  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  28.69 
 
 
283 aa  127  2.0000000000000002e-28  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4371  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.58 
 
 
306 aa  127  3e-28  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.17867  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3058  taurine ABC transporter, permease protein  29.87 
 
 
274 aa  126  3e-28  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0464  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.47 
 
 
273 aa  126  4.0000000000000003e-28  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2220  taurine ABC transporter, permease protein  33.68 
 
 
283 aa  125  7e-28  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.215273  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0735  nitrate/sulfonate/bicarbonate ABC transporter inner membrane protein  30.74 
 
 
273 aa  125  7e-28  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.714635  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0255  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.68 
 
 
279 aa  125  8.000000000000001e-28  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.796344  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2712  sulfonate ABC transporter permease  31.3 
 
 
282 aa  125  9e-28  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2920  sulfonate ABC transporter permease protein  31.3 
 
 
282 aa  125  9e-28  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0697  taurine ABC transporter, permease protein  34.04 
 
 
283 aa  125  1e-27  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2019  taurine ABC transporter, permease protein  34.04 
 
 
285 aa  125  1e-27  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.484134  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1580  taurine ABC transporter, permease protein  34.04 
 
 
253 aa  124  1e-27  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.477521  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3438  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.7 
 
 
301 aa  124  1e-27  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0620  permease component of taurine ABC transporter  33.68 
 
 
253 aa  124  1e-27  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  decreased coverage  0.00192231  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4641  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.04 
 
 
277 aa  124  1e-27  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.750363  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2133  taurine ABC transporter, permease protein  33.68 
 
 
283 aa  125  1e-27  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.186654  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0692  ABC taurine transporter, inner membrane subunit  35.16 
 
 
306 aa  125  1e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00000000618741  normal  0.0440204 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3413  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.64 
 
 
271 aa  124  1e-27  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0409101  normal  0.884011 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0104  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.97 
 
 
286 aa  124  2e-27  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.424876  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0113  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.97 
 
 
286 aa  124  2e-27  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0961261 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4564  taurine transporter subunit  28.92 
 
 
279 aa  124  3e-27  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.746145 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1171  taurine ABC transporter permease  32.74 
 
 
272 aa  123  3e-27  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.104716  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1998  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.5 
 
 
283 aa  123  3e-27  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.894639  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5005  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.57 
 
 
289 aa  122  6e-27  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>