More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_3065 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013595  Sros_3065  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  100 
 
 		 280 aa  541  1e-153  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.228654 
 
 
-
 
NC_004311  BRA1188  taurine ABC transporter, permease protein  70.56 
 
 		 250 aa  342  2.9999999999999997e-93  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0612406  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1127  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  62.88 
 
 		 267 aa  318  7e-86  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0403  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  47.69 
 
 		 256 aa  211  2e-53  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4060  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  45.83 
 
 		 256 aa  190  2e-47  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5517  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  42.91 
 
 		 256 aa  181  9.000000000000001e-45  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.16627  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_21990  ABC transporter, inner membrane permease component  43.98 
 
 		 273 aa  181  1e-44  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0154  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.9 
 
 		 264 aa  162  5.0000000000000005e-39  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3058  taurine ABC transporter, permease protein  37.5 
 
 		 274 aa  157  2e-37  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1211  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.55 
 
 		 273 aa  156  3e-37  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.132759  normal  0.452833 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0512  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.42 
 
 		 253 aa  156  4e-37  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1422  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.5 
 
 		 273 aa  154  1e-36  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1261  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.5 
 
 		 273 aa  154  1e-36  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.306936 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4641  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.9 
 
 		 277 aa  154  2e-36  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.750363  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2748  sulfonate/taurine ABC transporter permease  38.73 
 
 		 274 aa  152  4e-36  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.947189  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2152  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  39.35 
 
 		 271 aa  153  4e-36  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.529987 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5146  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  46 
 
 		 277 aa  153  4e-36  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0887356  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3060  taurine ABC transporter, permease protein  38.24 
 
 		 274 aa  152  8e-36  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0244271  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4508  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  46 
 
 		 277 aa  152  8e-36  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.854714  normal  0.909107 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4051  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.71 
 
 		 273 aa  151  1e-35  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.395379 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1078  ABC transporter, nitrate-like  38.33 
 
 		 275 aa  150  2e-35  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.193306  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3869  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.4 
 
 		 274 aa  150  2e-35  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4214  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.2 
 
 		 281 aa  150  3e-35  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2085  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.83 
 
 		 319 aa  150  3e-35  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0787698 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0992  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.54 
 
 		 254 aa  150  3e-35  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1369  ABC transporter membrane protein  34.91 
 
 		 272 aa  149  5e-35  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0458182 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2218  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.35 
 
 		 290 aa  149  7e-35  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.484673 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0464  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.76 
 
 		 288 aa  147  2.0000000000000003e-34  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.349721  hitchhiker  0.00645779 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6545  ABC transporter permease  37.56 
 
 		 269 aa  147  2.0000000000000003e-34  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.276106 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6154  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.25 
 
 		 295 aa  147  3e-34  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2535  putative taurine ABC transporter, permease protein  37.41 
 
 		 282 aa  146  4.0000000000000006e-34  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.254862  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4306  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.91 
 
 		 278 aa  146  4.0000000000000006e-34  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0649738  hitchhiker  0.00238236 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0040  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.33 
 
 		 259 aa  145  5e-34  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.832577  normal  0.34867 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3240  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.12 
 
 		 275 aa  144  2e-33  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2566  ABC transporter, membrane subunit  37.83 
 
 		 252 aa  144  2e-33  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.345232 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4564  taurine transporter subunit  39.55 
 
 		 279 aa  143  3e-33  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.746145 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2220  taurine ABC transporter, permease protein  38.36 
 
 		 283 aa  143  4e-33  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.215273  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1580  taurine ABC transporter, permease protein  38.36 
 
 		 253 aa  142  5e-33  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.477521  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2133  taurine ABC transporter, permease protein  38.36 
 
 		 283 aa  142  5e-33  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.186654  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2019  taurine ABC transporter, permease protein  38.36 
 
 		 285 aa  142  5e-33  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.484134  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0697  taurine ABC transporter, permease protein  38.36 
 
 		 283 aa  142  5e-33  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0620  permease component of taurine ABC transporter  38.36 
 
 		 253 aa  142  6e-33  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  decreased coverage  0.00192231  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0254  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  36.1 
 
 		 279 aa  142  6e-33  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.57663 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4861  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.63 
 
 		 275 aa  142  7e-33  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0877464 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00317  taurine transporter subunit  39.02 
 
 		 275 aa  142  8e-33  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00321  hypothetical protein  39.02 
 
 		 275 aa  142  8e-33  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3261  taurine transporter subunit  39.02 
 
 		 275 aa  142  8e-33  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3936  taurine transporter subunit  36.76 
 
 		 284 aa  141  9.999999999999999e-33  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3693  taurine transporter subunit  36.76 
 
 		 284 aa  141  9.999999999999999e-33  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0260  taurine transporter subunit  36.76 
 
 		 284 aa  141  9.999999999999999e-33  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3875  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.68 
 
 		 289 aa  141  9.999999999999999e-33  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4201  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.93 
 
 		 305 aa  140  1.9999999999999998e-32  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0391  taurine transporter subunit  37.5 
 
 		 275 aa  140  1.9999999999999998e-32  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0444  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.42 
 
 		 253 aa  140  1.9999999999999998e-32  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0231  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.04 
 
 		 279 aa  140  3e-32  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.33405  hitchhiker  0.000710194 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0442  taurine transporter subunit  37.5 
 
 		 275 aa  140  3e-32  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0393  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.42 
 
 		 253 aa  140  3e-32  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0876322  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0802  taurine ABC transporter, permease protein  37.44 
 
 		 283 aa  140  3e-32  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.207449  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0466  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  40.09 
 
 		 262 aa  139  3.9999999999999997e-32  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3505  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.4 
 
 		 275 aa  139  4.999999999999999e-32  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.197989  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1488  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  37.39 
 
 		 280 aa  139  7e-32  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.106569  normal  0.790334 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7197  ABC transporter membrane spanning protein (aliphatic sulphonate)  37.27 
 
 		 272 aa  139  7e-32  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0116141  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0761  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.11 
 
 		 412 aa  138  7.999999999999999e-32  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1848  ABC transporter permease  39.5 
 
 		 273 aa  138  8.999999999999999e-32  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1957  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.5 
 
 		 273 aa  138  8.999999999999999e-32  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0840  taurine transporter subunit  39.09 
 
 		 275 aa  138  1e-31  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.276647 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3255  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  42.08 
 
 		 294 aa  138  1e-31  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.106321 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0431  taurine transporter subunit  40.7 
 
 		 275 aa  137  2e-31  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0280  taurine transporter subunit  37.12 
 
 		 275 aa  137  2e-31  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1076  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.92 
 
 		 269 aa  137  2e-31  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.406887  normal  0.454808 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8275  ABC-type transporter, permease protein  36.18 
 
 		 272 aa  137  2e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.144641 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0246  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.07 
 
 		 279 aa  137  2e-31  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0570948  normal  0.0921514 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5321  taurine ABC transporter, permease protein  39.22 
 
 		 285 aa  136  3.0000000000000003e-31  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7932  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.82 
 
 		 283 aa  137  3.0000000000000003e-31  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1575  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.41 
 
 		 254 aa  137  3.0000000000000003e-31  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0747147  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0397  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.32 
 
 		 285 aa  136  3.0000000000000003e-31  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.987071 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2553  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.18 
 
 		 275 aa  136  3.0000000000000003e-31  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3788  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.4 
 
 		 276 aa  136  3.0000000000000003e-31  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.374556  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1108  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.02 
 
 		 255 aa  137  3.0000000000000003e-31  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.135552 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1476  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.93 
 
 		 253 aa  136  3.0000000000000003e-31  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0396  taurine transporter subunit  39.02 
 
 		 275 aa  136  4e-31  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4981  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.47 
 
 		 279 aa  135  5e-31  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.588836 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6387  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.61 
 
 		 283 aa  135  6.0000000000000005e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.199649  normal  0.0607956 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0924  ABC transporter permease protein  36.27 
 
 		 258 aa  135  7.000000000000001e-31  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.175022  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2935  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.17 
 
 		 252 aa  135  7.000000000000001e-31  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4541  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.61 
 
 		 283 aa  135  9.999999999999999e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.193679 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0255  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.62 
 
 		 279 aa  134  9.999999999999999e-31  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.796344  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0483  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.71 
 
 		 275 aa  134  1.9999999999999998e-30  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_18130  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport system, permease component  38.31 
 
 		 283 aa  134  1.9999999999999998e-30  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1145  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.16 
 
 		 279 aa  134  1.9999999999999998e-30  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.208956  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0094  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.26 
 
 		 286 aa  134  1.9999999999999998e-30  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.062918 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1171  taurine ABC transporter permease  37.88 
 
 		 272 aa  133  3.9999999999999996e-30  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.104716  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3729  nitrate ABC transporter, inner membrane subunit  33.33 
 
 		 280 aa  133  3.9999999999999996e-30  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0184404  normal  0.11569 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3675  nitrate ABC transporter, inner membrane subunit  33.33 
 
 		 280 aa  133  3.9999999999999996e-30  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2621  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.49 
 
 		 281 aa  133  3.9999999999999996e-30  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000218671  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4332  ABC transporter permease  36.57 
 
 		 298 aa  133  3.9999999999999996e-30  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6203  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.33 
 
 		 284 aa  133  3.9999999999999996e-30  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.780444  normal  0.280504 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1473  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  34.43 
 
 		 306 aa  132  5e-30  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0411979  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2719  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  33.56 
 
 		 284 aa  132  6e-30  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0735  nitrate/sulfonate/bicarbonate ABC transporter inner membrane protein  34.31 
 
 		 273 aa  132  6e-30  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.714635  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>