More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_8275 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013595  Sros_8275  ABC-type transporter, permease protein  100 
 
 
272 aa  524  1e-148  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.144641 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4306  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  67.77 
 
 
278 aa  327  1.0000000000000001e-88  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0649738  hitchhiker  0.00238236 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4937  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  59.39 
 
 
287 aa  311  7.999999999999999e-84  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0773955  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1369  ABC transporter membrane protein  61.09 
 
 
272 aa  311  1e-83  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.0458182 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3035  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  60.92 
 
 
298 aa  291  1e-77  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.30367  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1692  putative ABC transporter membrane protein  60.08 
 
 
281 aa  287  1e-76  Thermobifida fusca YX  Bacteria  hitchhiker  0.00465779  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_18130  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport system, permease component  61.25 
 
 
283 aa  284  1.0000000000000001e-75  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1145  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  50.83 
 
 
279 aa  239  2.9999999999999997e-62  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.208956  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2012  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  42.58 
 
 
280 aa  225  5.0000000000000005e-58  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.338733  normal  0.193625 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_44530  Binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  56.41 
 
 
259 aa  225  7e-58  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0634098  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3875  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  47.03 
 
 
289 aa  221  7e-57  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1899  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  53.78 
 
 
275 aa  217  1e-55  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4214  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  45.22 
 
 
281 aa  194  1e-48  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5126  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  46.03 
 
 
280 aa  189  5e-47  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6387  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  50.52 
 
 
283 aa  185  6e-46  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.199649  normal  0.0607956 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4541  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  45.13 
 
 
283 aa  184  9e-46  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.193679 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0403  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.5 
 
 
256 aa  167  2.9999999999999998e-40  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2479  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.71 
 
 
258 aa  155  7e-37  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3818  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.82 
 
 
280 aa  154  1e-36  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.615395  normal  0.42897 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4641  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.68 
 
 
277 aa  153  4e-36  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.750363  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2803  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.6 
 
 
259 aa  151  1e-35  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00122675  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0145  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.91 
 
 
266 aa  149  4e-35  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6360  putative sulfonate ABC transporter, permease protein  38.18 
 
 
267 aa  148  1.0000000000000001e-34  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.821284  normal 
 
 
-
 
NC_004311  BRA1188  taurine ABC transporter, permease protein  37.62 
 
 
250 aa  143  2e-33  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0612406  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1127  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.02 
 
 
267 aa  143  2e-33  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0512  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.34 
 
 
253 aa  141  9e-33  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1813  ABC transporter membrane protein  34.02 
 
 
256 aa  141  9.999999999999999e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.48548  normal  0.635137 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3869  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.08 
 
 
274 aa  140  3e-32  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1261  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.93 
 
 
273 aa  139  3.9999999999999997e-32  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.306936 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1422  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.93 
 
 
273 aa  139  3.9999999999999997e-32  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0992  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.68 
 
 
254 aa  138  7.999999999999999e-32  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3299  putative sulfonate ABC transporter, permease protein  34.75 
 
 
286 aa  138  1e-31  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.201269  normal  0.262094 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0397  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.11 
 
 
285 aa  137  1e-31  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.987071 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3058  taurine ABC transporter, permease protein  37.44 
 
 
274 aa  137  2e-31  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3065  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.18 
 
 
280 aa  137  2e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.228654 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2748  sulfonate/taurine ABC transporter permease  37.44 
 
 
274 aa  136  3.0000000000000003e-31  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.947189  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5801  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  35.9 
 
 
290 aa  136  5e-31  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3478  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.07 
 
 
291 aa  135  6.0000000000000005e-31  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.466071  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1211  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.62 
 
 
273 aa  135  7.000000000000001e-31  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.132759  normal  0.452833 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3643  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.93 
 
 
252 aa  135  8e-31  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000799696  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3060  taurine ABC transporter, permease protein  36.97 
 
 
274 aa  135  8e-31  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0244271  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1470  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  38.31 
 
 
301 aa  135  8e-31  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4332  ABC transporter permease  34.5 
 
 
298 aa  135  8e-31  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1076  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.6 
 
 
269 aa  135  8e-31  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.406887  normal  0.454808 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5602  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.33 
 
 
263 aa  134  1.9999999999999998e-30  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4051  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.39 
 
 
273 aa  133  3e-30  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.395379 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2553  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.65 
 
 
275 aa  133  3e-30  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5422  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.14 
 
 
269 aa  133  3.9999999999999996e-30  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1974  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  38.97 
 
 
261 aa  133  3.9999999999999996e-30  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000000226251  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0846  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.2 
 
 
255 aa  133  3.9999999999999996e-30  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.185051 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1210  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.9 
 
 
315 aa  133  3.9999999999999996e-30  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_34320  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport system, permease component  35.12 
 
 
273 aa  132  5e-30  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1746  putative molybdenum ABC transporter, solute-binding protein  33.77 
 
 
249 aa  132  5e-30  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  hitchhiker  0.000716411  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0208  nitrate ABC transporter, permease protein, putative  40.09 
 
 
260 aa  132  6e-30  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.473726 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2657  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.99 
 
 
269 aa  132  6e-30  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.363458 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6102  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.89 
 
 
291 aa  132  6.999999999999999e-30  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1975  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.89 
 
 
291 aa  132  6.999999999999999e-30  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.690359  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2515  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  36.65 
 
 
282 aa  132  9e-30  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.313862  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2566  ABC transporter, membrane subunit  34.54 
 
 
252 aa  130  2.0000000000000002e-29  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.345232 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_34310  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport system, permease component  35.1 
 
 
256 aa  130  2.0000000000000002e-29  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2152  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  31.3 
 
 
271 aa  130  2.0000000000000002e-29  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.529987 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1575  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.98 
 
 
266 aa  130  2.0000000000000002e-29  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1575  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.88 
 
 
254 aa  130  2.0000000000000002e-29  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0747147  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0423  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.25 
 
 
297 aa  130  3e-29  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.283538  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2882  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.22 
 
 
268 aa  129  5.0000000000000004e-29  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.80309  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5423  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.93 
 
 
298 aa  129  5.0000000000000004e-29  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_21990  ABC transporter, inner membrane permease component  32.77 
 
 
273 aa  129  7.000000000000001e-29  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0154  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.87 
 
 
264 aa  129  7.000000000000001e-29  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_21600  aliphatic sulfonates ABC transporter, inner membrane component  32.92 
 
 
284 aa  128  9.000000000000001e-29  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2787  ABC transporter, permease protein  35.29 
 
 
282 aa  128  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0328614  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5517  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.18 
 
 
256 aa  127  1.0000000000000001e-28  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.16627  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2638  ABC sulfonate transporter, inner membrane subunit  33.19 
 
 
279 aa  128  1.0000000000000001e-28  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0950643  hitchhiker  0.0000361652 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1982  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  37.56 
 
 
266 aa  127  2.0000000000000002e-28  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.187248  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0444  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.27 
 
 
253 aa  127  2.0000000000000002e-28  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_16930  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport system, permease component  39.49 
 
 
322 aa  127  2.0000000000000002e-28  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.327  normal  0.410158 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1108  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.66 
 
 
255 aa  127  2.0000000000000002e-28  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.135552 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0254  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  35.32 
 
 
279 aa  126  3e-28  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.57663 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3295  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  34.46 
 
 
279 aa  127  3e-28  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3160  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  41 
 
 
274 aa  126  4.0000000000000003e-28  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.913146  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0772  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.33 
 
 
302 aa  126  4.0000000000000003e-28  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0528102 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0393  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.5 
 
 
253 aa  126  4.0000000000000003e-28  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0876322  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0765  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.48 
 
 
265 aa  125  6e-28  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2621  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.19 
 
 
281 aa  125  6e-28  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000218671  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0735  nitrate/sulfonate/bicarbonate ABC transporter inner membrane protein  30.17 
 
 
273 aa  125  7e-28  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.714635  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0436  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.12 
 
 
255 aa  125  7e-28  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0448966  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5468  ABC transporter membrane spanning protein (aliphatic sulphonate)  36.33 
 
 
284 aa  125  7e-28  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.165676  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1800  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.88 
 
 
257 aa  125  8.000000000000001e-28  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1642  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.6 
 
 
263 aa  125  9e-28  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0981  nitrate/sulfonate/bicarbonate ABC transporter inner membrane protein  32.62 
 
 
279 aa  125  9e-28  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0231  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36 
 
 
279 aa  124  1e-27  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.33405  hitchhiker  0.000710194 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4981  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36 
 
 
279 aa  124  1e-27  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.588836 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1673  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.12 
 
 
263 aa  124  1e-27  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_19570  ABC transporter permease  34.62 
 
 
262 aa  125  1e-27  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0049  ABC taurine transporter, binding protein inner membrane component  34.21 
 
 
330 aa  124  1e-27  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.0656508 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0423  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.02 
 
 
264 aa  124  2e-27  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0085  taurine ABC transporter inner membrane protein  36.89 
 
 
283 aa  124  2e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.664827  normal  0.135193 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0213  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.05 
 
 
252 aa  124  2e-27  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0355  putative ABC aliphatic sulfonates transporter, permease subunit  36.02 
 
 
264 aa  124  2e-27  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0246  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36 
 
 
279 aa  124  2e-27  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0570948  normal  0.0921514 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2712  sulfonate ABC transporter permease  34.42 
 
 
282 aa  123  3e-27  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>