More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_5422 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013093  Amir_5422  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  100 
 
 
269 aa  524  1e-148  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_34320  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport system, permease component  58.2 
 
 
273 aa  305  7e-82  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1812  ABC transporter, permease protein  52.36 
 
 
257 aa  263  3e-69  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.554956  normal  0.627316 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1818  ABC transporter, permease protein  51.04 
 
 
263 aa  248  5e-65  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.493092 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4671  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  51.37 
 
 
274 aa  228  7e-59  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2479  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  43.1 
 
 
258 aa  184  2.0000000000000003e-45  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3081  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.43 
 
 
257 aa  150  2e-35  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0826963  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1369  ABC transporter membrane protein  36.09 
 
 
272 aa  139  4.999999999999999e-32  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.0458182 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5985  putative ABC transporter (permease protein)  39.25 
 
 
255 aa  137  2e-31  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.209656 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4306  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.98 
 
 
278 aa  135  9e-31  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0649738  hitchhiker  0.00238236 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0102  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.1 
 
 
263 aa  135  9e-31  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.922239  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8275  ABC-type transporter, permease protein  34.14 
 
 
272 aa  133  3.9999999999999996e-30  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.144641 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5350  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.04 
 
 
263 aa  132  6.999999999999999e-30  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5439  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.04 
 
 
263 aa  132  6.999999999999999e-30  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.56019 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5729  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.04 
 
 
263 aa  132  6.999999999999999e-30  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0386  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.24 
 
 
266 aa  127  2.0000000000000002e-28  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.314921 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_18130  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport system, permease component  33.98 
 
 
283 aa  127  3e-28  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2012  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.24 
 
 
280 aa  126  5e-28  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.338733  normal  0.193625 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0286  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.37 
 
 
261 aa  125  9e-28  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.122201  hitchhiker  0.000248355 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4937  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.4 
 
 
287 aa  124  2e-27  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0773955  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3818  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.08 
 
 
280 aa  124  2e-27  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.615395  normal  0.42897 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2332  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.33 
 
 
276 aa  124  2e-27  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2621  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  28.46 
 
 
281 aa  123  4e-27  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000218671  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3643  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.93 
 
 
252 aa  122  9e-27  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000799696  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0467  taurine ABC transporter, permease protein, putative  31.84 
 
 
272 aa  121  1.9999999999999998e-26  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3592  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.39 
 
 
273 aa  120  1.9999999999999998e-26  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1145  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.37 
 
 
279 aa  121  1.9999999999999998e-26  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.208956  normal 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0406  putative taurine ABC transporter, permease protein  31.84 
 
 
272 aa  121  1.9999999999999998e-26  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1186  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.2 
 
 
257 aa  120  1.9999999999999998e-26  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.409709  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3747  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.33 
 
 
254 aa  119  7.999999999999999e-26  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1455  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40 
 
 
269 aa  118  9e-26  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0865715  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_44530  Binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.91 
 
 
259 aa  117  1.9999999999999998e-25  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0634098  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3035  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.54 
 
 
298 aa  117  1.9999999999999998e-25  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.30367  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0834  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.92 
 
 
264 aa  117  3e-25  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1998  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  28.92 
 
 
283 aa  115  5e-25  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.894639  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3540  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.33 
 
 
258 aa  115  6e-25  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.853389  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1076  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.17 
 
 
269 aa  114  1.0000000000000001e-24  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.406887  normal  0.454808 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1575  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  27.72 
 
 
254 aa  114  2.0000000000000002e-24  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0747147  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3875  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.96 
 
 
289 aa  113  3e-24  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0397  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30 
 
 
285 aa  113  4.0000000000000004e-24  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.987071 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2566  ABC transporter, membrane subunit  32.82 
 
 
252 aa  113  4.0000000000000004e-24  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.345232 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4332  ABC transporter permease  33.48 
 
 
298 aa  113  4.0000000000000004e-24  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2511  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.53 
 
 
266 aa  112  9e-24  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4214  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.24 
 
 
281 aa  112  9e-24  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1380  binding-protein-dependent transporter inner membrane component  30.83 
 
 
277 aa  111  1.0000000000000001e-23  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.153307 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5801  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  30.95 
 
 
290 aa  110  2.0000000000000002e-23  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7247  ABC transporter permease  32.23 
 
 
286 aa  110  3e-23  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  decreased coverage  0.00669088  normal  0.643564 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4641  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.49 
 
 
277 aa  110  3e-23  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.750363  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3058  taurine ABC transporter, permease protein  27.2 
 
 
274 aa  110  3e-23  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1679  ABC transporter permease  35.64 
 
 
274 aa  109  5e-23  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.451747  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3034  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.35 
 
 
269 aa  108  7.000000000000001e-23  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0846  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.41 
 
 
255 aa  108  9.000000000000001e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.185051 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1692  putative ABC transporter membrane protein  34.54 
 
 
281 aa  108  1e-22  Thermobifida fusca YX  Bacteria  hitchhiker  0.00465779  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0722  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.59 
 
 
272 aa  108  1e-22  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0102858  normal  0.0961586 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0765  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.4 
 
 
265 aa  108  1e-22  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_19510  ABC transporter permease  35.15 
 
 
274 aa  107  1e-22  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0208  nitrate ABC transporter, permease protein, putative  32.83 
 
 
260 aa  107  2e-22  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.473726 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2515  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  32.84 
 
 
282 aa  107  2e-22  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.313862  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4051  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.13 
 
 
273 aa  107  2e-22  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.395379 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1422  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.53 
 
 
273 aa  107  2e-22  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1261  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.53 
 
 
273 aa  107  2e-22  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.306936 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3413  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.86 
 
 
271 aa  107  2e-22  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0409101  normal  0.884011 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1556  binding-protein-dependent transporter inner membrane component  32.19 
 
 
301 aa  107  2e-22  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2803  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.7 
 
 
259 aa  107  2e-22  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00122675  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_16930  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport system, permease component  31.34 
 
 
322 aa  106  3e-22  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.327  normal  0.410158 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0464  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.39 
 
 
273 aa  107  3e-22  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3781  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.74 
 
 
177 aa  107  3e-22  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.19201  normal  0.101834 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2712  sulfonate ABC transporter permease  28.16 
 
 
282 aa  106  5e-22  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2152  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  29.07 
 
 
271 aa  105  5e-22  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.529987 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2920  sulfonate ABC transporter permease protein  28.16 
 
 
282 aa  106  5e-22  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7502  ABC transporter permease  29.25 
 
 
256 aa  105  6e-22  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.50681 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4139  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  30.56 
 
 
275 aa  105  6e-22  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.00000000314222  normal  0.0106036 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3539  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  28.17 
 
 
253 aa  105  7e-22  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.158821  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0772  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  28.63 
 
 
302 aa  105  7e-22  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0528102 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2337  nitrate ABC transporter, inner membrane subunit  29.84 
 
 
282 aa  105  8e-22  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1211  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  27.73 
 
 
273 aa  105  9e-22  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.132759  normal  0.452833 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1813  ABC transporter membrane protein  37.95 
 
 
256 aa  105  9e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.48548  normal  0.635137 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6460  nitrate ABC transporter, inner membrane subunit  32.6 
 
 
297 aa  104  1e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.150998 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1832  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.15 
 
 
533 aa  104  1e-21  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2748  sulfonate/taurine ABC transporter permease  26.79 
 
 
274 aa  103  2e-21  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.947189  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0254  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  28.79 
 
 
279 aa  104  2e-21  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.57663 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4037  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.96 
 
 
276 aa  104  2e-21  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.960786  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4149  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.96 
 
 
276 aa  104  2e-21  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0377  hypothetical protein  33.5 
 
 
253 aa  103  2e-21  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3884  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.77 
 
 
258 aa  103  3e-21  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2787  ABC transporter, permease protein  32.35 
 
 
282 aa  103  3e-21  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0328614  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3598  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  33.94 
 
 
285 aa  103  3e-21  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.330128 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1210  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.45 
 
 
315 aa  103  3e-21  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4471  nitrate ABC transporter, inner membrane subunit  32.6 
 
 
297 aa  103  3e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.5689 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3350  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.14 
 
 
250 aa  103  3e-21  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1899  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.77 
 
 
275 aa  103  4e-21  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0736  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.95 
 
 
253 aa  103  4e-21  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.417563  normal  0.341407 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1393  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.71 
 
 
254 aa  102  5e-21  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.302994  normal  0.157809 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5423  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.58 
 
 
298 aa  102  5e-21  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0992  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  25.73 
 
 
254 aa  102  6e-21  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2846  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  28.92 
 
 
260 aa  102  6e-21  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.000143494  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5126  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.27 
 
 
280 aa  102  6e-21  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4568  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.05 
 
 
286 aa  102  6e-21  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1796  sulfonate ABC transporter, permease protein, putative  33.94 
 
 
285 aa  102  7e-21  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2553  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  25.89 
 
 
275 aa  102  7e-21  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>