More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Svir_34320 on replicon NC_013159
Organism: Saccharomonospora viridis DSM 43017



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013159  Svir_34320  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport system, permease component  100 
 
 
273 aa  535  1e-151  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5422  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  58.2 
 
 
269 aa  305  7e-82  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1812  ABC transporter, permease protein  49.19 
 
 
257 aa  249  4e-65  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.554956  normal  0.627316 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1818  ABC transporter, permease protein  51.24 
 
 
263 aa  245  4.9999999999999997e-64  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.493092 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4671  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  45.09 
 
 
274 aa  202  4e-51  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2479  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.32 
 
 
258 aa  185  9e-46  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3081  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.22 
 
 
257 aa  171  1e-41  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0826963  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4306  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.29 
 
 
278 aa  152  4e-36  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0649738  hitchhiker  0.00238236 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0286  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.8 
 
 
261 aa  148  9e-35  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.122201  hitchhiker  0.000248355 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0102  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.35 
 
 
263 aa  142  7e-33  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.922239  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1369  ABC transporter membrane protein  36.18 
 
 
272 aa  139  7e-32  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.0458182 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0386  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.47 
 
 
266 aa  133  3e-30  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.314921 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2332  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.44 
 
 
276 aa  132  3.9999999999999996e-30  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8275  ABC-type transporter, permease protein  35.12 
 
 
272 aa  132  5e-30  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.144641 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3540  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.98 
 
 
258 aa  132  5e-30  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.853389  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5985  putative ABC transporter (permease protein)  34.14 
 
 
255 aa  132  6e-30  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.209656 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_18130  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport system, permease component  35.66 
 
 
283 aa  132  6e-30  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4937  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.74 
 
 
287 aa  132  6.999999999999999e-30  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0773955  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1186  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.31 
 
 
257 aa  131  1.0000000000000001e-29  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.409709  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4564  taurine transporter subunit  32.2 
 
 
279 aa  130  2.0000000000000002e-29  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.746145 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5729  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  43.4 
 
 
263 aa  129  6e-29  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5350  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  43.4 
 
 
263 aa  129  6e-29  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5439  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  43.4 
 
 
263 aa  129  6e-29  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.56019 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0397  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.95 
 
 
285 aa  126  3e-28  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.987071 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2621  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.35 
 
 
281 aa  126  3e-28  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000218671  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2566  ABC transporter, membrane subunit  33.72 
 
 
252 aa  124  1e-27  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.345232 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1145  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.27 
 
 
279 aa  124  2e-27  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.208956  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3035  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.81 
 
 
298 aa  124  2e-27  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.30367  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3539  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.34 
 
 
253 aa  123  4e-27  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.158821  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2012  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.73 
 
 
280 aa  122  8e-27  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.338733  normal  0.193625 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0834  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.33 
 
 
264 aa  121  9.999999999999999e-27  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4568  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.91 
 
 
286 aa  120  1.9999999999999998e-26  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1679  ABC transporter permease  35.68 
 
 
274 aa  120  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.451747  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4051  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.86 
 
 
273 aa  120  1.9999999999999998e-26  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.395379 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1455  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.74 
 
 
269 aa  120  1.9999999999999998e-26  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0865715  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1692  putative ABC transporter membrane protein  34.16 
 
 
281 aa  120  3e-26  Thermobifida fusca YX  Bacteria  hitchhiker  0.00465779  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5801  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  31.56 
 
 
290 aa  120  3e-26  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2553  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32 
 
 
275 aa  120  3e-26  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5126  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.25 
 
 
280 aa  119  3.9999999999999996e-26  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3478  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.62 
 
 
291 aa  119  3.9999999999999996e-26  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.466071  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_19510  ABC transporter permease  35.18 
 
 
274 aa  119  4.9999999999999996e-26  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3747  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.63 
 
 
254 aa  119  6e-26  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3818  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.27 
 
 
280 aa  119  6e-26  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.615395  normal  0.42897 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0260  taurine transporter subunit  30.61 
 
 
284 aa  119  7e-26  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0846  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.11 
 
 
255 aa  119  7e-26  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.185051 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3693  taurine transporter subunit  30.61 
 
 
284 aa  119  7e-26  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3936  taurine transporter subunit  30.61 
 
 
284 aa  119  7e-26  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4214  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.83 
 
 
281 aa  118  9e-26  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1076  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.5 
 
 
269 aa  118  9e-26  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.406887  normal  0.454808 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0231  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.86 
 
 
279 aa  118  9.999999999999999e-26  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.33405  hitchhiker  0.000710194 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0735  nitrate/sulfonate/bicarbonate ABC transporter inner membrane protein  31.56 
 
 
273 aa  118  9.999999999999999e-26  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.714635  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0464  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.82 
 
 
273 aa  117  1.9999999999999998e-25  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1432  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.05 
 
 
537 aa  117  1.9999999999999998e-25  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.300396  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1211  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.28 
 
 
273 aa  117  1.9999999999999998e-25  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.132759  normal  0.452833 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0840  taurine transporter subunit  32.44 
 
 
275 aa  117  1.9999999999999998e-25  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.276647 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1422  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.64 
 
 
273 aa  117  3e-25  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1261  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.64 
 
 
273 aa  117  3e-25  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.306936 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2535  putative taurine ABC transporter, permease protein  33.06 
 
 
282 aa  116  3.9999999999999997e-25  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.254862  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0765  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.6 
 
 
265 aa  115  6e-25  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1210  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.92 
 
 
315 aa  115  6e-25  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0483  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.67 
 
 
275 aa  115  6.9999999999999995e-25  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1832  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.65 
 
 
533 aa  115  6.9999999999999995e-25  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00317  taurine transporter subunit  32.52 
 
 
275 aa  115  1.0000000000000001e-24  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3261  taurine transporter subunit  32.52 
 
 
275 aa  115  1.0000000000000001e-24  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4508  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.11 
 
 
277 aa  114  1.0000000000000001e-24  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.854714  normal  0.909107 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00321  hypothetical protein  32.52 
 
 
275 aa  115  1.0000000000000001e-24  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0246  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.26 
 
 
279 aa  114  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0570948  normal  0.0921514 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0210  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  30.48 
 
 
532 aa  113  3e-24  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4981  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.54 
 
 
279 aa  113  3e-24  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.588836 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6203  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.84 
 
 
284 aa  113  3e-24  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.780444  normal  0.280504 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1261  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.52 
 
 
293 aa  112  5e-24  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.113651  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6545  ABC transporter permease  35.75 
 
 
269 aa  112  6e-24  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.276106 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0391  taurine transporter subunit  32.11 
 
 
275 aa  112  6e-24  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1998  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.78 
 
 
283 aa  112  7.000000000000001e-24  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.894639  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0267  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.25 
 
 
276 aa  112  8.000000000000001e-24  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0872978  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3240  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.71 
 
 
275 aa  111  1.0000000000000001e-23  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0442  taurine transporter subunit  31.71 
 
 
275 aa  111  1.0000000000000001e-23  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6387  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.38 
 
 
283 aa  110  2.0000000000000002e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.199649  normal  0.0607956 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0981  nitrate/sulfonate/bicarbonate ABC transporter inner membrane protein  30.5 
 
 
279 aa  110  2.0000000000000002e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5146  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.26 
 
 
277 aa  110  2.0000000000000002e-23  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0887356  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0431  taurine transporter subunit  31.43 
 
 
275 aa  110  3e-23  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0396  taurine transporter subunit  31.71 
 
 
275 aa  110  3e-23  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_44530  Binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.13 
 
 
259 aa  110  3e-23  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0634098  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2152  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  27.31 
 
 
271 aa  110  4.0000000000000004e-23  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.529987 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0772  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  28.63 
 
 
302 aa  109  4.0000000000000004e-23  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0528102 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0255  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.67 
 
 
279 aa  110  4.0000000000000004e-23  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.796344  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3884  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.69 
 
 
258 aa  109  5e-23  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2408  nitrate/sulfonate/bicarbonate ABC transporter inner membrane protein  33.33 
 
 
275 aa  109  5e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.932342  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0280  taurine transporter subunit  31.71 
 
 
275 aa  109  6e-23  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4332  ABC transporter permease  33.04 
 
 
298 aa  108  7.000000000000001e-23  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3413  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.28 
 
 
271 aa  108  7.000000000000001e-23  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0409101  normal  0.884011 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1673  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.29 
 
 
263 aa  108  7.000000000000001e-23  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2304  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.8 
 
 
278 aa  108  9.000000000000001e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.37818 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4541  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.33 
 
 
283 aa  108  9.000000000000001e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.193679 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2985  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.1 
 
 
273 aa  108  1e-22  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1642  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.55 
 
 
263 aa  108  1e-22  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3299  putative sulfonate ABC transporter, permease protein  31.5 
 
 
286 aa  107  2e-22  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.201269  normal  0.262094 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0254  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  29.17 
 
 
279 aa  107  2e-22  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.57663 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0464  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.99 
 
 
288 aa  107  2e-22  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.349721  hitchhiker  0.00645779 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2058  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.27 
 
 
348 aa  107  2e-22  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.911629  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>