More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dole_0213 on replicon NC_009943
Organism: Desulfococcus oleovorans Hxd3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009943  Dole_0213  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  100 
 
 
252 aa  490  1e-137  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1714  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  54.39 
 
 
250 aa  241  7.999999999999999e-63  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1982  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  38.52 
 
 
266 aa  153  2e-36  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.187248  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1974  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  35.68 
 
 
261 aa  153  2.9999999999999998e-36  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000000226251  normal 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7932  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.82 
 
 
283 aa  153  2.9999999999999998e-36  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0735  nitrate/sulfonate/bicarbonate ABC transporter inner membrane protein  34.55 
 
 
273 aa  147  1.0000000000000001e-34  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.714635  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0231  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.92 
 
 
279 aa  144  1e-33  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.33405  hitchhiker  0.000710194 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0153  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.31 
 
 
277 aa  144  1e-33  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.589472  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0246  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.18 
 
 
279 aa  144  2e-33  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0570948  normal  0.0921514 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1380  binding-protein-dependent transporter inner membrane component  36.05 
 
 
277 aa  143  2e-33  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.153307 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0355  putative ABC aliphatic sulfonates transporter, permease subunit  37.34 
 
 
264 aa  143  2e-33  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0423  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.34 
 
 
264 aa  143  2e-33  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2803  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.78 
 
 
259 aa  143  2e-33  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00122675  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00317  taurine transporter subunit  37.34 
 
 
275 aa  142  5e-33  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00321  hypothetical protein  37.34 
 
 
275 aa  142  5e-33  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0464  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.35 
 
 
288 aa  142  5e-33  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.349721  hitchhiker  0.00645779 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3261  taurine transporter subunit  37.34 
 
 
275 aa  142  5e-33  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1369  ABC transporter membrane protein  33.88 
 
 
272 aa  142  5e-33  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.0458182 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0676  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.68 
 
 
279 aa  142  6e-33  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.30868 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0254  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  33.05 
 
 
279 aa  141  8e-33  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.57663 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1108  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.78 
 
 
255 aa  141  8e-33  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.135552 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3240  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.51 
 
 
275 aa  141  9.999999999999999e-33  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2787  ABC transporter, permease protein  37.24 
 
 
282 aa  141  9.999999999999999e-33  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0328614  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4981  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.04 
 
 
279 aa  141  9.999999999999999e-33  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.588836 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0431  taurine transporter subunit  36.1 
 
 
275 aa  140  1.9999999999999998e-32  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0512  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.25 
 
 
253 aa  140  1.9999999999999998e-32  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2515  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  37.24 
 
 
282 aa  139  3.9999999999999997e-32  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.313862  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0391  taurine transporter subunit  36.1 
 
 
275 aa  139  3.9999999999999997e-32  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0840  taurine transporter subunit  37.44 
 
 
275 aa  139  4.999999999999999e-32  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.276647 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0442  taurine transporter subunit  36.1 
 
 
275 aa  139  6e-32  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3693  taurine transporter subunit  34.84 
 
 
284 aa  138  7e-32  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3295  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  37.39 
 
 
279 aa  138  7e-32  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0260  taurine transporter subunit  34.84 
 
 
284 aa  138  7e-32  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3936  taurine transporter subunit  34.84 
 
 
284 aa  138  7e-32  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0483  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.26 
 
 
275 aa  137  1e-31  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4306  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.36 
 
 
278 aa  137  1e-31  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0649738  hitchhiker  0.00238236 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4937  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.56 
 
 
287 aa  137  2e-31  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0773955  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3438  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.55 
 
 
301 aa  137  2e-31  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0255  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.62 
 
 
279 aa  136  3.0000000000000003e-31  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.796344  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2132  ABC nitrate/sulfonate/bicarbonate transporter, inner membrane subunit  32.51 
 
 
262 aa  136  3.0000000000000003e-31  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1453  alkanesulfonate transporter permease subunit  34.62 
 
 
263 aa  136  3.0000000000000003e-31  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1171  taurine ABC transporter permease  33.8 
 
 
272 aa  136  3.0000000000000003e-31  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.104716  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0280  taurine transporter subunit  35.68 
 
 
275 aa  136  4e-31  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3299  putative sulfonate ABC transporter, permease protein  33.89 
 
 
286 aa  136  4e-31  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.201269  normal  0.262094 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4564  taurine transporter subunit  34.91 
 
 
279 aa  136  4e-31  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.746145 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_21600  aliphatic sulfonates ABC transporter, inner membrane component  34.05 
 
 
284 aa  135  5e-31  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1899  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.56 
 
 
275 aa  135  6.0000000000000005e-31  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0393  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.24 
 
 
253 aa  135  8e-31  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0876322  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5321  taurine ABC transporter, permease protein  31.74 
 
 
285 aa  135  9e-31  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0397  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.36 
 
 
285 aa  134  9.999999999999999e-31  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.987071 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6545  ABC transporter permease  36.11 
 
 
269 aa  134  9.999999999999999e-31  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.276106 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1679  ABC transporter permease  36.84 
 
 
274 aa  134  9.999999999999999e-31  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.451747  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1736  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.62 
 
 
264 aa  133  1.9999999999999998e-30  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.440066  normal  0.144233 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0444  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.05 
 
 
253 aa  133  1.9999999999999998e-30  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1673  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.38 
 
 
263 aa  134  1.9999999999999998e-30  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_19510  ABC transporter permease  36.84 
 
 
274 aa  134  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0396  taurine transporter subunit  36.51 
 
 
275 aa  133  1.9999999999999998e-30  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0024  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.32 
 
 
264 aa  133  3e-30  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0030  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.32 
 
 
264 aa  133  3e-30  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.050552  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1642  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.22 
 
 
263 aa  132  3.9999999999999996e-30  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5130  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.54 
 
 
272 aa  132  5e-30  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.612608  normal  0.0470724 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0846  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.05 
 
 
255 aa  132  6e-30  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.185051 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1476  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.4 
 
 
253 aa  131  7.999999999999999e-30  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1642  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35 
 
 
231 aa  132  7.999999999999999e-30  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0324285  normal  0.0160388 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0154  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.58 
 
 
264 aa  131  7.999999999999999e-30  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4641  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.3 
 
 
277 aa  130  2.0000000000000002e-29  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.750363  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1076  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.96 
 
 
269 aa  130  2.0000000000000002e-29  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.406887  normal  0.454808 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2304  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.2 
 
 
278 aa  129  3e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.37818 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0772  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.02 
 
 
302 aa  130  3e-29  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0528102 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0992  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.84 
 
 
254 aa  129  3e-29  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0765  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.9 
 
 
265 aa  130  3e-29  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_12960  taurine ABC transporter permease  33.8 
 
 
272 aa  129  4.0000000000000003e-29  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.299757  normal  0.321121 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3459  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.61 
 
 
283 aa  129  5.0000000000000004e-29  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.703735  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1796  sulfonate ABC transporter, permease protein, putative  33.64 
 
 
285 aa  128  8.000000000000001e-29  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5516  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.22 
 
 
262 aa  128  8.000000000000001e-29  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1692  putative ABC transporter membrane protein  35.5 
 
 
281 aa  128  9.000000000000001e-29  Thermobifida fusca YX  Bacteria  hitchhiker  0.00465779  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3598  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  33.64 
 
 
285 aa  127  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.330128 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3884  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.8 
 
 
258 aa  128  1.0000000000000001e-28  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3035  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.74 
 
 
298 aa  127  1.0000000000000001e-28  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.30367  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5005  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.78 
 
 
289 aa  128  1.0000000000000001e-28  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2553  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.78 
 
 
275 aa  127  1.0000000000000001e-28  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1822  aliphatic sulfonates ABC transporter, permease protein  36.32 
 
 
269 aa  127  1.0000000000000001e-28  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1127  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.85 
 
 
267 aa  127  2.0000000000000002e-28  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4677  nitrate ABC transporter, inner membrane subunit  34.68 
 
 
279 aa  127  2.0000000000000002e-28  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1145  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.91 
 
 
279 aa  127  2.0000000000000002e-28  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.208956  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2621  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.48 
 
 
281 aa  127  2.0000000000000002e-28  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000218671  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2837  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  35.85 
 
 
266 aa  127  2.0000000000000002e-28  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.115716  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4568  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.73 
 
 
286 aa  127  2.0000000000000002e-28  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_19350  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport system, permease component  35.44 
 
 
293 aa  127  2.0000000000000002e-28  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.449157  normal  0.837307 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5517  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.49 
 
 
256 aa  127  2.0000000000000002e-28  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.16627  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4330  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.94 
 
 
276 aa  125  4.0000000000000003e-28  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.936191 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1837  aliphatic sulfonates ABC transporter, permease protein  35.9 
 
 
269 aa  126  4.0000000000000003e-28  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.669476  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1238  aliphatic sulfonate ABC transporter, permease protein  35.37 
 
 
273 aa  125  5e-28  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.466833  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1990  aliphatic sulfonates ABC transporter, permease protein  35.37 
 
 
273 aa  125  5e-28  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.088895  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0403  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.47 
 
 
256 aa  125  5e-28  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3150  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.4 
 
 
273 aa  125  5e-28  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_44530  Binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.75 
 
 
259 aa  125  5e-28  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0634098  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0780  aliphatic sulfonate ABC transporter, permease protein  35.37 
 
 
273 aa  125  5e-28  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.175921  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1724  aliphatic sulfonate ABC transporter, permease protein  35.37 
 
 
273 aa  125  5e-28  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0381  aliphatic sulfonate ABC transporter, permease protein  35.37 
 
 
273 aa  125  5e-28  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.410212  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>