More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mbur_2132 on replicon NC_007955
Organism: Methanococcoides burtonii DSM 6242



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007955  Mbur_2132  ABC nitrate/sulfonate/bicarbonate transporter, inner membrane subunit  100 
 
 
262 aa  520  1e-146  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1031  sulfonate ABC transporter, permease protein  64.12 
 
 
261 aa  359  2e-98  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0850  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  64.83 
 
 
258 aa  302  5.000000000000001e-81  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  hitchhiker  0.00204788  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0086  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  61.02 
 
 
261 aa  299  4e-80  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0521  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  58.82 
 
 
239 aa  294  1e-78  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0992  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.91 
 
 
254 aa  185  6e-46  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0512  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.76 
 
 
253 aa  182  4.0000000000000006e-45  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0444  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.08 
 
 
253 aa  175  8e-43  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1476  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.25 
 
 
253 aa  171  1e-41  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1076  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.83 
 
 
269 aa  170  2e-41  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.406887  normal  0.454808 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0393  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.42 
 
 
253 aa  169  4e-41  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0876322  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4641  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.25 
 
 
277 aa  157  2e-37  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.750363  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0464  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.6 
 
 
288 aa  155  7e-37  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.349721  hitchhiker  0.00645779 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6545  ABC transporter permease  39.59 
 
 
269 aa  153  2.9999999999999998e-36  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.276106 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0153  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.82 
 
 
277 aa  153  2.9999999999999998e-36  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.589472  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0377  hypothetical protein  35.48 
 
 
253 aa  149  4e-35  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2935  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.28 
 
 
252 aa  148  9e-35  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2803  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.25 
 
 
259 aa  147  2.0000000000000003e-34  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00122675  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0735  nitrate/sulfonate/bicarbonate ABC transporter inner membrane protein  36.13 
 
 
273 aa  147  2.0000000000000003e-34  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.714635  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1974  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  34.98 
 
 
261 aa  145  8.000000000000001e-34  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000000226251  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1734  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.63 
 
 
252 aa  144  1e-33  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7932  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.37 
 
 
283 aa  144  2e-33  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4051  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.16 
 
 
273 aa  143  3e-33  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.395379 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0736  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.4 
 
 
253 aa  142  4e-33  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.417563  normal  0.341407 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1900  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  36.02 
 
 
252 aa  142  6e-33  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.128113  hitchhiker  0.000000000000910228 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2803  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.46 
 
 
279 aa  141  9.999999999999999e-33  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0573  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.34 
 
 
277 aa  141  9.999999999999999e-33  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1998  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.95 
 
 
283 aa  140  1.9999999999999998e-32  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.894639  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0436  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37 
 
 
255 aa  140  3e-32  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0448966  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1211  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.85 
 
 
273 aa  139  3.9999999999999997e-32  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.132759  normal  0.452833 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1422  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.85 
 
 
273 aa  139  4.999999999999999e-32  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1261  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.85 
 
 
273 aa  139  4.999999999999999e-32  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.306936 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6203  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.09 
 
 
284 aa  139  4.999999999999999e-32  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.780444  normal  0.280504 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0483  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.68 
 
 
275 aa  139  4.999999999999999e-32  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3346  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.71 
 
 
291 aa  139  7e-32  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.252204  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0208  nitrate ABC transporter, permease protein, putative  34.45 
 
 
260 aa  137  2e-31  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.473726 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1982  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  34.08 
 
 
266 aa  137  2e-31  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.187248  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4564  taurine transporter subunit  38.39 
 
 
279 aa  137  2e-31  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.746145 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0213  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.51 
 
 
252 aa  136  3.0000000000000003e-31  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3869  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.22 
 
 
274 aa  136  4e-31  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3671  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40 
 
 
287 aa  136  4e-31  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0347715  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4185  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.27 
 
 
283 aa  136  4e-31  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.321257  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0397  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39 
 
 
285 aa  135  6.0000000000000005e-31  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.987071 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1489  nitrate transport permease  36.51 
 
 
278 aa  135  9e-31  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2712  sulfonate ABC transporter permease  34.62 
 
 
282 aa  134  9.999999999999999e-31  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2920  sulfonate ABC transporter permease protein  34.62 
 
 
282 aa  134  9.999999999999999e-31  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2621  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.32 
 
 
281 aa  133  1.9999999999999998e-30  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000218671  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2216  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.47 
 
 
314 aa  134  1.9999999999999998e-30  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.82677  normal  0.484673 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0145  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.78 
 
 
266 aa  134  1.9999999999999998e-30  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0766  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.6 
 
 
260 aa  134  1.9999999999999998e-30  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004311  BRA1188  taurine ABC transporter, permease protein  31.84 
 
 
250 aa  132  3.9999999999999996e-30  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0612406  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2148  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.28 
 
 
267 aa  132  3.9999999999999996e-30  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1026  nitrate transport permease  34.87 
 
 
279 aa  132  5e-30  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.174596 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3526  nitrate ABC transporter, inner membrane subunit  35.08 
 
 
280 aa  132  6e-30  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.471487 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0231  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.33 
 
 
279 aa  132  7.999999999999999e-30  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.33405  hitchhiker  0.000710194 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1127  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.79 
 
 
267 aa  132  7.999999999999999e-30  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4395  nitrate ABC transporter, inner membrane subunit  34.29 
 
 
277 aa  131  9e-30  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4458  nitrate ABC transporter, inner membrane subunit  34.29 
 
 
277 aa  131  9e-30  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.698055  normal  0.534513 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0442  taurine transporter subunit  37.38 
 
 
275 aa  131  1.0000000000000001e-29  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0431  taurine transporter subunit  36.92 
 
 
275 aa  130  2.0000000000000002e-29  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4924  nitrate ABC transporter, inner membrane subunit  34.92 
 
 
280 aa  130  2.0000000000000002e-29  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.815767 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3240  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.38 
 
 
275 aa  130  3e-29  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_16930  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport system, permease component  39.15 
 
 
322 aa  130  3e-29  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.327  normal  0.410158 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0254  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  31.62 
 
 
279 aa  130  3e-29  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.57663 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0391  taurine transporter subunit  36.92 
 
 
275 aa  129  3e-29  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0182  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.46 
 
 
253 aa  129  3e-29  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0246  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.06 
 
 
279 aa  130  3e-29  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0570948  normal  0.0921514 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00317  taurine transporter subunit  36.92 
 
 
275 aa  129  4.0000000000000003e-29  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3936  taurine transporter subunit  33.87 
 
 
284 aa  129  4.0000000000000003e-29  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0260  taurine transporter subunit  33.87 
 
 
284 aa  129  4.0000000000000003e-29  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00321  hypothetical protein  36.92 
 
 
275 aa  129  4.0000000000000003e-29  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3160  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  34.87 
 
 
274 aa  129  4.0000000000000003e-29  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.913146  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3693  taurine transporter subunit  33.87 
 
 
284 aa  129  4.0000000000000003e-29  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3261  taurine transporter subunit  36.92 
 
 
275 aa  129  4.0000000000000003e-29  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1704  nitrate ABC transporter, inner membrane subunit  37.65 
 
 
311 aa  129  4.0000000000000003e-29  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4847  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.6 
 
 
250 aa  128  7.000000000000001e-29  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1145  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.27 
 
 
279 aa  128  8.000000000000001e-29  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.208956  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4371  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.6 
 
 
250 aa  128  9.000000000000001e-29  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.249078 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2597  nitrate ABC transporter, inner membrane subunit  35.98 
 
 
280 aa  128  9.000000000000001e-29  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2313  putative sulfonate ABC transporter, permease protein  33.21 
 
 
282 aa  128  9.000000000000001e-29  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.797662  hitchhiker  0.00000011817 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3520  nitrate ABC transporter, inner membrane subunit  35.98 
 
 
280 aa  127  1.0000000000000001e-28  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2152  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  36.76 
 
 
271 aa  128  1.0000000000000001e-28  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.529987 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1171  taurine ABC transporter permease  35.38 
 
 
272 aa  127  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.104716  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2566  ABC transporter, membrane subunit  32.34 
 
 
252 aa  127  1.0000000000000001e-28  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.345232 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1848  ABC transporter permease  38.54 
 
 
273 aa  127  2.0000000000000002e-28  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0981  nitrate/sulfonate/bicarbonate ABC transporter inner membrane protein  31.1 
 
 
279 aa  127  2.0000000000000002e-28  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1957  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.54 
 
 
273 aa  127  2.0000000000000002e-28  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1369  ABC transporter membrane protein  30.16 
 
 
272 aa  127  2.0000000000000002e-28  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.0458182 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_5063  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.91 
 
 
257 aa  127  2.0000000000000002e-28  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.104049  normal  0.0459168 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2930  putative sulfonate ABC transporter, permease protein  32.82 
 
 
282 aa  127  3e-28  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0280  taurine transporter subunit  36.45 
 
 
275 aa  126  3e-28  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1473  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  33.61 
 
 
306 aa  126  3e-28  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0411979  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4981  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.19 
 
 
279 aa  126  3e-28  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.588836 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4201  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.75 
 
 
305 aa  126  4.0000000000000003e-28  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1210  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.04 
 
 
315 aa  126  4.0000000000000003e-28  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3058  taurine ABC transporter, permease protein  33.48 
 
 
274 aa  126  4.0000000000000003e-28  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4677  nitrate ABC transporter, inner membrane subunit  34.74 
 
 
279 aa  125  5e-28  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3643  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.62 
 
 
252 aa  125  9e-28  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000799696  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1238  nitrate transport permease  38.38 
 
 
279 aa  124  1e-27  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0396  taurine transporter subunit  37.38 
 
 
275 aa  124  2e-27  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>