More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gmet_1900 on replicon NC_007517
Organism: Geobacter metallireducens GS-15



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007517  Gmet_1900  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  100 
 
 
252 aa  484  1e-136  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.128113  hitchhiker  0.000000000000910228 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1734  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  69.92 
 
 
252 aa  325  4.0000000000000003e-88  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2803  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  49.6 
 
 
259 aa  240  2e-62  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00122675  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1974  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  55.02 
 
 
261 aa  238  9e-62  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000000226251  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0436  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  50.83 
 
 
255 aa  208  8e-53  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0448966  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2935  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  44.35 
 
 
252 aa  202  4e-51  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0164  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  43.37 
 
 
253 aa  188  9e-47  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0159  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  43.37 
 
 
253 aa  188  9e-47  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1129  taurine transport system permease protein TauC  44.44 
 
 
241 aa  186  3e-46  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.774255  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1642  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  44.7 
 
 
231 aa  172  3.9999999999999995e-42  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0324285  normal  0.0160388 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0233  ABC transporter, permease protein  43.42 
 
 
241 aa  170  2e-41  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4641  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.71 
 
 
277 aa  166  5e-40  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.750363  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0802  taurine ABC transporter, permease protein  40.61 
 
 
283 aa  165  5.9999999999999996e-40  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.207449  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3869  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.76 
 
 
274 aa  165  5.9999999999999996e-40  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3058  taurine ABC transporter, permease protein  36.82 
 
 
274 aa  164  1.0000000000000001e-39  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0620  taurine transport system permease protein TauC  39.92 
 
 
245 aa  163  2.0000000000000002e-39  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  hitchhiker  0.00071484  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0397  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.57 
 
 
285 aa  159  3e-38  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.987071 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2748  sulfonate/taurine ABC transporter permease  37.04 
 
 
274 aa  158  8e-38  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.947189  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2019  taurine ABC transporter, permease protein  39.23 
 
 
285 aa  156  3e-37  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.484134  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1580  taurine ABC transporter, permease protein  39.23 
 
 
253 aa  156  3e-37  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.477521  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0620  permease component of taurine ABC transporter  39.23 
 
 
253 aa  156  3e-37  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  decreased coverage  0.00192231  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2220  taurine ABC transporter, permease protein  39.23 
 
 
283 aa  156  3e-37  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.215273  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2133  taurine ABC transporter, permease protein  39.23 
 
 
283 aa  156  3e-37  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.186654  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0697  taurine ABC transporter, permease protein  39.23 
 
 
283 aa  156  3e-37  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2152  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  45.79 
 
 
271 aa  156  4e-37  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.529987 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_16930  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport system, permease component  40.57 
 
 
322 aa  156  4e-37  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.327  normal  0.410158 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4051  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  45.71 
 
 
273 aa  155  4e-37  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.395379 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3060  taurine ABC transporter, permease protein  36.45 
 
 
274 aa  155  5.0000000000000005e-37  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0244271  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2132  ABC nitrate/sulfonate/bicarbonate transporter, inner membrane subunit  36.02 
 
 
262 aa  155  7e-37  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1211  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  45.71 
 
 
273 aa  155  8e-37  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.132759  normal  0.452833 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1261  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  48.12 
 
 
273 aa  154  9e-37  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.306936 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1422  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  48.12 
 
 
273 aa  154  9e-37  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4981  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.71 
 
 
279 aa  153  2.9999999999999998e-36  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.588836 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4568  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.08 
 
 
286 aa  152  4e-36  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0231  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.51 
 
 
279 aa  152  5e-36  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.33405  hitchhiker  0.000710194 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0246  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.68 
 
 
279 aa  152  5.9999999999999996e-36  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0570948  normal  0.0921514 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0992  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  42.93 
 
 
254 aa  152  5.9999999999999996e-36  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1031  sulfonate ABC transporter, permease protein  37.22 
 
 
261 aa  150  1e-35  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1575  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.33 
 
 
254 aa  151  1e-35  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0747147  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0049  ABC taurine transporter, binding protein inner membrane component  36.48 
 
 
330 aa  151  1e-35  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.0656508 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1800  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.73 
 
 
257 aa  150  2e-35  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5321  taurine ABC transporter, permease protein  39.23 
 
 
285 aa  149  3e-35  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0254  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  41.27 
 
 
279 aa  149  4e-35  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.57663 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1402  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.77 
 
 
257 aa  149  4e-35  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3299  putative sulfonate ABC transporter, permease protein  35.47 
 
 
286 aa  149  4e-35  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.201269  normal  0.262094 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1108  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.73 
 
 
255 aa  149  4e-35  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.135552 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1261  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.13 
 
 
293 aa  149  6e-35  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.113651  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0512  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.94 
 
 
253 aa  148  7e-35  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3693  taurine transporter subunit  33.96 
 
 
284 aa  146  2.0000000000000003e-34  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1470  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  35.86 
 
 
301 aa  147  2.0000000000000003e-34  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0280  taurine transporter subunit  36.44 
 
 
275 aa  147  2.0000000000000003e-34  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0260  taurine transporter subunit  33.96 
 
 
284 aa  146  2.0000000000000003e-34  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3936  taurine transporter subunit  33.96 
 
 
284 aa  146  2.0000000000000003e-34  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4371  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.92 
 
 
306 aa  145  5e-34  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.17867  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0464  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.34 
 
 
288 aa  145  6e-34  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.349721  hitchhiker  0.00645779 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4564  taurine transporter subunit  36.75 
 
 
279 aa  145  6e-34  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.746145 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00317  taurine transporter subunit  36.44 
 
 
275 aa  145  8.000000000000001e-34  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00321  hypothetical protein  36.44 
 
 
275 aa  145  8.000000000000001e-34  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6545  ABC transporter permease  41.11 
 
 
269 aa  145  8.000000000000001e-34  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.276106 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0255  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.84 
 
 
279 aa  145  8.000000000000001e-34  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.796344  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3261  taurine transporter subunit  36.44 
 
 
275 aa  145  8.000000000000001e-34  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1171  taurine ABC transporter permease  38.57 
 
 
272 aa  145  9e-34  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.104716  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0391  taurine transporter subunit  36 
 
 
275 aa  144  1e-33  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3240  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.56 
 
 
275 aa  144  2e-33  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1848  ABC transporter permease  35.97 
 
 
273 aa  144  2e-33  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1957  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.97 
 
 
273 aa  144  2e-33  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0442  taurine transporter subunit  35.56 
 
 
275 aa  143  2e-33  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0840  taurine transporter subunit  38.31 
 
 
275 aa  143  3e-33  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.276647 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4508  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  42.86 
 
 
277 aa  142  5e-33  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.854714  normal  0.909107 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0692  ABC taurine transporter, inner membrane subunit  36.02 
 
 
306 aa  142  5e-33  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00000000618741  normal  0.0440204 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2566  ABC transporter, membrane subunit  35.74 
 
 
252 aa  142  5e-33  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.345232 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0735  nitrate/sulfonate/bicarbonate ABC transporter inner membrane protein  35.5 
 
 
273 aa  142  6e-33  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.714635  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0431  taurine transporter subunit  35.56 
 
 
275 aa  141  8e-33  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5146  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.71 
 
 
277 aa  141  9e-33  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0887356  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3807  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.4 
 
 
269 aa  140  9.999999999999999e-33  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0483  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.65 
 
 
275 aa  141  9.999999999999999e-33  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7932  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.92 
 
 
283 aa  141  9.999999999999999e-33  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA1188  taurine ABC transporter, permease protein  36.54 
 
 
250 aa  140  1.9999999999999998e-32  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0612406  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3065  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.8 
 
 
280 aa  140  1.9999999999999998e-32  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.228654 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3750  ABC nitrate/sulfonate/bicarbonate transporter, inner membrane subunit  37.4 
 
 
269 aa  140  1.9999999999999998e-32  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2535  putative taurine ABC transporter, permease protein  35.51 
 
 
282 aa  140  1.9999999999999998e-32  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.254862  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3891  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.99 
 
 
269 aa  139  3e-32  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1127  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.09 
 
 
267 aa  139  3.9999999999999997e-32  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3042  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.36 
 
 
292 aa  139  3.9999999999999997e-32  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.780897  normal  0.0430449 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4495  nitrate ABC transporter, inner membrane subunit  36.63 
 
 
285 aa  139  4.999999999999999e-32  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0396  taurine transporter subunit  35.56 
 
 
275 aa  139  4.999999999999999e-32  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_12960  taurine ABC transporter permease  40.41 
 
 
272 aa  139  4.999999999999999e-32  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.299757  normal  0.321121 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0403  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.9 
 
 
256 aa  139  6e-32  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0153  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.93 
 
 
277 aa  139  6e-32  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.589472  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5011  nitrate ABC transporter, inner membrane subunit  36.63 
 
 
286 aa  138  7e-32  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.312092  normal  0.320206 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0850  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.95 
 
 
258 aa  138  7e-32  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  hitchhiker  0.00204788  n/a   
 
 
-
 
NC_007595  Synpcc7942_B2630  sulfonate ABC transporter, permease protein, putative  37.44 
 
 
266 aa  137  1e-31  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.312135  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4958  nitrate ABC transporter, inner membrane subunit  36.21 
 
 
285 aa  138  1e-31  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.413837  normal  0.165118 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0981  nitrate/sulfonate/bicarbonate ABC transporter inner membrane protein  32.02 
 
 
279 aa  137  1e-31  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4214  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.82 
 
 
281 aa  137  1e-31  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0673  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  37.02 
 
 
275 aa  136  3.0000000000000003e-31  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0666321  normal  0.331074 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0154  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.78 
 
 
264 aa  136  3.0000000000000003e-31  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2638  ABC sulfonate transporter, inner membrane subunit  31.95 
 
 
279 aa  136  3.0000000000000003e-31  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0950643  hitchhiker  0.0000361652 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6360  putative sulfonate ABC transporter, permease protein  34.02 
 
 
267 aa  136  3.0000000000000003e-31  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.821284  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3875  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.26 
 
 
289 aa  136  3.0000000000000003e-31  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>