More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mboo_0736 on replicon NC_009712
Organism: Candidatus Methanoregula boonei 6A8



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009712  Mboo_0736  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  100 
 
 		 253 aa  485  1e-136  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.417563  normal  0.341407 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1076  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  65.06 
 
 		 269 aa  331  6e-90  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.406887  normal  0.454808 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0512  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  56.85 
 
 		 253 aa  287  1e-76  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0992  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  56.91 
 
 		 254 aa  286  2e-76  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0444  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  56.05 
 
 		 253 aa  280  2e-74  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0377  hypothetical protein  55.73 
 
 		 253 aa  280  2e-74  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1476  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  55.24 
 
 		 253 aa  277  1e-73  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0393  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  54.84 
 
 		 253 aa  275  4e-73  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0876322  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0573  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  44.36 
 
 		 277 aa  207  2e-52  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0521  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.43 
 
 		 239 aa  174  1.9999999999999998e-42  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2132  ABC nitrate/sulfonate/bicarbonate transporter, inner membrane subunit  38.25 
 
 		 262 aa  168  8e-41  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1422  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.88 
 
 		 273 aa  160  2e-38  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1261  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.88 
 
 		 273 aa  160  2e-38  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.306936 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0464  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.03 
 
 		 288 aa  159  3e-38  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.349721  hitchhiker  0.00645779 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1031  sulfonate ABC transporter, permease protein  38.3 
 
 		 261 aa  159  3e-38  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1211  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.02 
 
 		 273 aa  159  4e-38  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.132759  normal  0.452833 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2085  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.33 
 
 		 319 aa  158  7e-38  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0787698 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4641  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.39 
 
 		 277 aa  156  3e-37  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.750363  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4051  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.26 
 
 		 273 aa  155  6e-37  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.395379 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0483  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.96 
 
 		 275 aa  155  7e-37  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0397  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.69 
 
 		 285 aa  152  2.9999999999999998e-36  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.987071 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1982  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  39.51 
 
 		 266 aa  150  2e-35  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.187248  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0291  nitrate transport permease  45.65 
 
 		 287 aa  150  2e-35  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_16930  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport system, permease component  43.85 
 
 		 322 aa  149  3e-35  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.327  normal  0.410158 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6545  ABC transporter permease  37.5 
 
 		 269 aa  149  6e-35  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.276106 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1489  nitrate transport permease  38.55 
 
 		 278 aa  148  7e-35  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0431  taurine transporter subunit  38.46 
 
 		 275 aa  148  9e-35  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00317  taurine transporter subunit  38.87 
 
 		 275 aa  147  1.0000000000000001e-34  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0391  taurine transporter subunit  38.46 
 
 		 275 aa  147  1.0000000000000001e-34  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3261  taurine transporter subunit  38.87 
 
 		 275 aa  147  1.0000000000000001e-34  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00321  hypothetical protein  38.87 
 
 		 275 aa  147  1.0000000000000001e-34  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0254  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  36.14 
 
 		 279 aa  147  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.57663 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0442  taurine transporter subunit  38.46 
 
 		 275 aa  147  2.0000000000000003e-34  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1147  nitrate ABC transporter, inner membrane subunit  46.89 
 
 		 279 aa  147  2.0000000000000003e-34  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.488584 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0963  nitrate ABC transporter, inner membrane subunit  44.57 
 
 		 281 aa  147  2.0000000000000003e-34  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.563275 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3160  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  43.72 
 
 		 274 aa  145  4.0000000000000006e-34  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.913146  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4662  nitrate ABC transporter, inner membrane subunit  46.89 
 
 		 279 aa  145  5e-34  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5321  taurine ABC transporter, permease protein  36.56 
 
 		 285 aa  145  5e-34  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3526  nitrate ABC transporter, inner membrane subunit  40.2 
 
 		 280 aa  145  6e-34  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.471487 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2220  taurine ABC transporter, permease protein  36.04 
 
 		 283 aa  145  6e-34  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.215273  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1306  nitrate ABC transporter, inner membrane subunit  46.89 
 
 		 279 aa  145  6e-34  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2133  taurine ABC transporter, permease protein  36.04 
 
 		 283 aa  145  6e-34  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.186654  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4201  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.25 
 
 		 305 aa  145  7.0000000000000006e-34  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0697  taurine ABC transporter, permease protein  36.2 
 
 		 283 aa  145  7.0000000000000006e-34  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2055  nitrate transport permease  47.75 
 
 		 279 aa  145  7.0000000000000006e-34  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.562067  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1580  taurine ABC transporter, permease protein  36.2 
 
 		 253 aa  145  8.000000000000001e-34  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.477521  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0620  permease component of taurine ABC transporter  36.04 
 
 		 253 aa  145  8.000000000000001e-34  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  decreased coverage  0.00192231  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2019  taurine ABC transporter, permease protein  36.2 
 
 		 285 aa  145  9e-34  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.484134  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3240  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.06 
 
 		 275 aa  144  1e-33  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2404  nitrate ABC transporter, inner membrane subunit  48.31 
 
 		 279 aa  144  1e-33  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.105129  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2152  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  38.54 
 
 		 271 aa  144  1e-33  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.529987 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0154  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.13 
 
 		 264 aa  144  1e-33  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3643  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.69 
 
 		 252 aa  144  1e-33  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000799696  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2935  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.38 
 
 		 252 aa  144  1e-33  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0280  taurine transporter subunit  38.06 
 
 		 275 aa  144  1e-33  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1108  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.05 
 
 		 255 aa  144  1e-33  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.135552 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3486  nitrate ABC transporter permease protein  45.65 
 
 		 295 aa  144  1e-33  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.236914  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6154  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.24 
 
 		 295 aa  144  2e-33  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4564  taurine transporter subunit  35.48 
 
 		 279 aa  144  2e-33  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.746145 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0850  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.47 
 
 		 258 aa  143  2e-33  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  hitchhiker  0.00204788  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1848  ABC transporter permease  41.5 
 
 		 273 aa  143  3e-33  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3869  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.02 
 
 		 274 aa  143  3e-33  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1957  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.5 
 
 		 273 aa  143  3e-33  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3671  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  42.11 
 
 		 287 aa  142  4e-33  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0347715  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2324  nitrate ABC transporter, inner membrane subunit  36.25 
 
 		 293 aa  142  4e-33  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4458  nitrate ABC transporter, inner membrane subunit  39.91 
 
 		 277 aa  142  4e-33  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.698055  normal  0.534513 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0840  taurine transporter subunit  37.39 
 
 		 275 aa  142  4e-33  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.276647 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4395  nitrate ABC transporter, inner membrane subunit  39.91 
 
 		 277 aa  142  4e-33  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0145  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.44 
 
 		 266 aa  142  4e-33  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6102  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.32 
 
 		 291 aa  142  5e-33  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3346  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  42.11 
 
 		 291 aa  142  5e-33  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.252204  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1975  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.32 
 
 		 291 aa  142  5e-33  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.690359  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0396  taurine transporter subunit  38.06 
 
 		 275 aa  142  6e-33  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5414  putative nitrate ABC transporter (permease protein) (ntrB-like protein)  42.93 
 
 		 279 aa  142  6e-33  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.481789  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3884  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.14 
 
 		 258 aa  142  7e-33  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0231  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.84 
 
 		 279 aa  141  8e-33  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.33405  hitchhiker  0.000710194 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0802  taurine ABC transporter, permease protein  34.73 
 
 		 283 aa  141  9.999999999999999e-33  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.207449  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7932  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.61 
 
 		 283 aa  141  9.999999999999999e-33  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1473  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  42.37 
 
 		 306 aa  141  9.999999999999999e-33  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0411979  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3744  nitrate ABC transporter, inner membrane subunit  40 
 
 		 288 aa  141  9.999999999999999e-33  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.441454  normal  0.10243 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2588  nitrate ABC transporter, inner membrane subunit  39.91 
 
 		 279 aa  141  9.999999999999999e-33  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00171927 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0086  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.27 
 
 		 261 aa  140  1.9999999999999998e-32  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2171  nitrate transport permease  39.25 
 
 		 272 aa  140  1.9999999999999998e-32  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0149943  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0208  nitrate ABC transporter, permease protein, putative  38.84 
 
 		 260 aa  140  3e-32  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.473726 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4677  nitrate ABC transporter, inner membrane subunit  38.83 
 
 		 279 aa  139  3e-32  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3295  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  35.89 
 
 		 279 aa  139  3e-32  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4571  nitrate ABC transporter, inner membrane subunit  40.7 
 
 		 280 aa  139  3.9999999999999997e-32  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4981  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.02 
 
 		 279 aa  139  3.9999999999999997e-32  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.588836 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0996  nitrate ABC transporter, inner membrane subunit  40.28 
 
 		 286 aa  139  4.999999999999999e-32  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1974  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  41.38 
 
 		 261 aa  139  4.999999999999999e-32  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000000226251  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2216  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.62 
 
 		 314 aa  139  4.999999999999999e-32  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.82677  normal  0.484673 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4924  nitrate ABC transporter, inner membrane subunit  39.71 
 
 		 280 aa  139  6e-32  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.815767 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0260  taurine transporter subunit  35.95 
 
 		 284 aa  139  6e-32  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3693  taurine transporter subunit  35.95 
 
 		 284 aa  139  6e-32  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3936  taurine transporter subunit  35.95 
 
 		 284 aa  139  6e-32  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3741  nitrate transport permease  44.02 
 
 		 288 aa  138  7e-32  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1998  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.98 
 
 		 283 aa  138  7.999999999999999e-32  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.894639  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3642  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.81 
 
 		 275 aa  138  7.999999999999999e-32  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.142025  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3818  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.74 
 
 		 280 aa  138  8.999999999999999e-32  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.615395  normal  0.42897 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1171  taurine ABC transporter permease  35.29 
 
 		 272 aa  138  1e-31  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.104716  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>