More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfum_2216 on replicon NC_008554
Organism: Syntrophobacter fumaroxidans MPOB



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008554  Sfum_2216  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  100 
 
 
314 aa  636    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.82677  normal  0.484673 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2218  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  42.91 
 
 
290 aa  221  9.999999999999999e-57  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.484673 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2085  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.15 
 
 
319 aa  214  9.999999999999999e-55  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.0787698 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6154  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  43.9 
 
 
295 aa  207  2e-52  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1473  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  41.22 
 
 
306 aa  205  9e-52  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0411979  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4201  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  43.4 
 
 
305 aa  204  2e-51  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6102  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  42.8 
 
 
291 aa  204  2e-51  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1975  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  42.8 
 
 
291 aa  204  2e-51  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.690359  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0208  nitrate ABC transporter, permease protein, putative  41.56 
 
 
260 aa  201  1.9999999999999998e-50  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.473726 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3160  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  41.08 
 
 
274 aa  194  1e-48  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.913146  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3346  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.04 
 
 
291 aa  193  3e-48  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.252204  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1999  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  42.8 
 
 
291 aa  192  6e-48  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0924  ABC transporter permease protein  39.06 
 
 
258 aa  190  2e-47  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.175022  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3671  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  44.7 
 
 
287 aa  189  5.999999999999999e-47  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0347715  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4185  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  42.24 
 
 
283 aa  188  9e-47  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.321257  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5010  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.98 
 
 
260 aa  183  4.0000000000000006e-45  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0926  nitrate ABC transporter, permease protein, putative  38.89 
 
 
274 aa  178  1e-43  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0735  nitrate/sulfonate/bicarbonate ABC transporter inner membrane protein  33.21 
 
 
273 aa  172  5.999999999999999e-42  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.714635  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0673  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  38.74 
 
 
275 aa  172  9e-42  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0666321  normal  0.331074 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1295  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.76 
 
 
290 aa  170  3e-41  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0425684  normal  0.379949 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4879  putative ABC transporter, permease protein  41.45 
 
 
263 aa  167  2e-40  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.132635 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0464  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.21 
 
 
288 aa  166  4e-40  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.349721  hitchhiker  0.00645779 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6545  ABC transporter permease  40.2 
 
 
269 aa  164  2.0000000000000002e-39  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.276106 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7932  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.04 
 
 
283 aa  164  2.0000000000000002e-39  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0397  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.24 
 
 
285 aa  164  3e-39  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.987071 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4641  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.2 
 
 
277 aa  157  2e-37  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.750363  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3787  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.09 
 
 
314 aa  155  6e-37  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0992  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.67 
 
 
254 aa  153  2.9999999999999998e-36  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0512  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.45 
 
 
253 aa  149  8e-35  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0154  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.48 
 
 
264 aa  147  2.0000000000000003e-34  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3526  nitrate ABC transporter, inner membrane subunit  32.79 
 
 
280 aa  147  3e-34  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.471487 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2553  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.63 
 
 
275 aa  145  8.000000000000001e-34  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4568  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.8 
 
 
286 aa  144  2e-33  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4395  nitrate ABC transporter, inner membrane subunit  30.12 
 
 
277 aa  142  6e-33  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4458  nitrate ABC transporter, inner membrane subunit  30.12 
 
 
277 aa  142  6e-33  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.698055  normal  0.534513 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1704  nitrate ABC transporter, inner membrane subunit  30.99 
 
 
311 aa  141  1.9999999999999998e-32  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2803  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.33 
 
 
259 aa  140  3.9999999999999997e-32  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00122675  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0153  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.42 
 
 
277 aa  139  4.999999999999999e-32  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.589472  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2837  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  45.74 
 
 
266 aa  137  2e-31  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.115716  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2953  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  45.21 
 
 
294 aa  136  4e-31  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0049  ABC taurine transporter, binding protein inner membrane component  35.48 
 
 
330 aa  136  4e-31  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.0656508 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1031  sulfonate ABC transporter, permease protein  34.02 
 
 
261 aa  136  5e-31  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4571  nitrate ABC transporter, inner membrane subunit  30.8 
 
 
280 aa  136  6.0000000000000005e-31  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0483  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.8 
 
 
275 aa  135  7.000000000000001e-31  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1476  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36 
 
 
253 aa  135  9.999999999999999e-31  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4051  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.32 
 
 
273 aa  134  1.9999999999999998e-30  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.395379 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0393  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.27 
 
 
253 aa  134  1.9999999999999998e-30  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0876322  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4471  nitrate ABC transporter, inner membrane subunit  31.88 
 
 
297 aa  134  1.9999999999999998e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.5689 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0444  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.2 
 
 
253 aa  134  1.9999999999999998e-30  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3741  nitrate transport permease  36.21 
 
 
288 aa  134  3e-30  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5896  nitrate ABC transporter permease protein  31.38 
 
 
297 aa  133  3e-30  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.149001  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2132  ABC nitrate/sulfonate/bicarbonate transporter, inner membrane subunit  33.47 
 
 
262 aa  134  3e-30  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3973  nitrate ABC transporter, inner membrane subunit  36.81 
 
 
295 aa  133  3e-30  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.930991  normal  0.148208 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0257  nitrate ABC transporter, inner membrane subunit  29.82 
 
 
283 aa  132  5e-30  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.738144 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1026  nitrate transport permease  28.21 
 
 
279 aa  132  6e-30  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.174596 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1261  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.92 
 
 
273 aa  132  6.999999999999999e-30  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.306936 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1422  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.92 
 
 
273 aa  132  6.999999999999999e-30  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0765  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.63 
 
 
265 aa  132  9e-30  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1076  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.18 
 
 
269 aa  132  1.0000000000000001e-29  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.406887  normal  0.454808 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1261  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.35 
 
 
293 aa  132  1.0000000000000001e-29  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.113651  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3675  nitrate ABC transporter, inner membrane subunit  34.57 
 
 
280 aa  132  1.0000000000000001e-29  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3729  nitrate ABC transporter, inner membrane subunit  34.57 
 
 
280 aa  132  1.0000000000000001e-29  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0184404  normal  0.11569 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1211  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.2 
 
 
273 aa  131  1.0000000000000001e-29  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.132759  normal  0.452833 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2503  nitrate ABC transporter, inner membrane subunit  32.55 
 
 
298 aa  130  2.0000000000000002e-29  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0236  nitrate ABC transporter, inner membrane subunit  29.85 
 
 
283 aa  131  2.0000000000000002e-29  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0231  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.64 
 
 
279 aa  130  3e-29  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.33405  hitchhiker  0.000710194 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6203  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.59 
 
 
284 aa  130  3e-29  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.780444  normal  0.280504 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3486  nitrate ABC transporter permease protein  36.21 
 
 
295 aa  130  3e-29  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.236914  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4924  nitrate ABC transporter, inner membrane subunit  35.64 
 
 
280 aa  130  3e-29  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.815767 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0765  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.91 
 
 
281 aa  130  3e-29  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3654  nitrate transport permease  31.71 
 
 
273 aa  130  4.0000000000000003e-29  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2205  nitrate ABC transporter, inner membrane subunit  35.16 
 
 
280 aa  129  5.0000000000000004e-29  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4564  taurine transporter subunit  31.82 
 
 
279 aa  129  6e-29  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.746145 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2588  nitrate ABC transporter, inner membrane subunit  31.11 
 
 
279 aa  129  6e-29  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00171927 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0291  nitrate transport permease  35.26 
 
 
287 aa  129  7.000000000000001e-29  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5414  putative nitrate ABC transporter (permease protein) (ntrB-like protein)  35.2 
 
 
279 aa  129  8.000000000000001e-29  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.481789  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4677  nitrate ABC transporter, inner membrane subunit  29.96 
 
 
279 aa  129  8.000000000000001e-29  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0260  taurine transporter subunit  31.02 
 
 
284 aa  128  1.0000000000000001e-28  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3936  taurine transporter subunit  31.02 
 
 
284 aa  128  1.0000000000000001e-28  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0246  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.51 
 
 
279 aa  128  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0570948  normal  0.0921514 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3693  taurine transporter subunit  31.02 
 
 
284 aa  128  1.0000000000000001e-28  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0521  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.46 
 
 
239 aa  128  1.0000000000000001e-28  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2618  nitrate ABC transporter, inner membrane subunit  33.16 
 
 
279 aa  127  2.0000000000000002e-28  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.234813 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6225  nitrate/sulfonate/bicarbonate ABC transporter inner membrane protein  29.1 
 
 
320 aa  127  2.0000000000000002e-28  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00317  taurine transporter subunit  37.04 
 
 
275 aa  127  3e-28  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3240  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.82 
 
 
275 aa  127  3e-28  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3261  taurine transporter subunit  37.04 
 
 
275 aa  127  3e-28  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00321  hypothetical protein  37.04 
 
 
275 aa  127  3e-28  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3058  taurine ABC transporter, permease protein  31.47 
 
 
274 aa  127  3e-28  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4981  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.51 
 
 
279 aa  127  3e-28  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.588836 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0640  nitrate ABC transporter, inner membrane subunit  33.9 
 
 
279 aa  127  3e-28  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4861  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.11 
 
 
275 aa  126  4.0000000000000003e-28  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.0877464 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1108  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.09 
 
 
255 aa  127  4.0000000000000003e-28  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.135552 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0521  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.98 
 
 
292 aa  126  5e-28  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.367955 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2055  nitrate transport permease  34.64 
 
 
279 aa  126  5e-28  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.562067  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0326  nitrate transport permease  29.49 
 
 
295 aa  126  5e-28  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2597  nitrate ABC transporter, inner membrane subunit  28.97 
 
 
280 aa  126  5e-28  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2404  nitrate ABC transporter, inner membrane subunit  35.2 
 
 
279 aa  126  6e-28  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.105129  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3520  nitrate ABC transporter, inner membrane subunit  28.97 
 
 
280 aa  125  8.000000000000001e-28  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1488  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  33.18 
 
 
280 aa  125  8.000000000000001e-28  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.106569  normal  0.790334 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>