More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Veis_0765 on replicon NC_008786
Organism: Verminephrobacter eiseniae EF01-2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008786  Veis_0765  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  100 
 
 
281 aa  543  1e-154  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0254  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  36.89 
 
 
279 aa  159  5e-38  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.57663 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0231  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.8 
 
 
279 aa  157  1e-37  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.33405  hitchhiker  0.000710194 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7932  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.36 
 
 
283 aa  152  4e-36  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5321  taurine ABC transporter, permease protein  34.19 
 
 
285 aa  150  2e-35  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4641  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.4 
 
 
277 aa  150  2e-35  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.750363  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4981  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.89 
 
 
279 aa  149  4e-35  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.588836 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0153  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.75 
 
 
277 aa  148  1.0000000000000001e-34  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.589472  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2515  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  38.18 
 
 
282 aa  147  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.313862  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0520  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.65 
 
 
265 aa  147  2.0000000000000003e-34  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.231998 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0154  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.05 
 
 
264 aa  147  2.0000000000000003e-34  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0246  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.65 
 
 
279 aa  145  5e-34  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0570948  normal  0.0921514 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0521  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.09 
 
 
292 aa  144  1e-33  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.367955 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2787  ABC transporter, permease protein  36.12 
 
 
282 aa  143  4e-33  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0328614  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0255  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.62 
 
 
279 aa  142  7e-33  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.796344  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4564  taurine transporter subunit  32.93 
 
 
279 aa  141  9.999999999999999e-33  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.746145 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1171  taurine ABC transporter permease  35.84 
 
 
272 aa  141  9.999999999999999e-33  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.104716  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3295  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  37.27 
 
 
279 aa  140  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0697  taurine ABC transporter, permease protein  33.92 
 
 
283 aa  140  3e-32  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1580  taurine ABC transporter, permease protein  33.92 
 
 
253 aa  140  3e-32  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.477521  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0620  permease component of taurine ABC transporter  33.92 
 
 
253 aa  140  3e-32  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  decreased coverage  0.00192231  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2220  taurine ABC transporter, permease protein  33.92 
 
 
283 aa  139  3e-32  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.215273  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2133  taurine ABC transporter, permease protein  33.92 
 
 
283 aa  140  3e-32  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.186654  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2019  taurine ABC transporter, permease protein  33.92 
 
 
285 aa  140  3e-32  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.484134  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7197  ABC transporter membrane spanning protein (aliphatic sulphonate)  34.89 
 
 
272 aa  138  7.999999999999999e-32  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0116141  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6545  ABC transporter permease  35.53 
 
 
269 aa  138  8.999999999999999e-32  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.276106 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2621  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.68 
 
 
281 aa  138  1e-31  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000218671  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0735  nitrate/sulfonate/bicarbonate ABC transporter inner membrane protein  33.2 
 
 
273 aa  138  1e-31  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.714635  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0483  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.36 
 
 
275 aa  137  2e-31  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4330  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37 
 
 
276 aa  137  2e-31  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.936191 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_12960  taurine ABC transporter permease  35.84 
 
 
272 aa  137  2e-31  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.299757  normal  0.321121 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0464  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.56 
 
 
288 aa  137  2e-31  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.349721  hitchhiker  0.00645779 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00317  taurine transporter subunit  35.22 
 
 
275 aa  136  4e-31  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3261  taurine transporter subunit  35.22 
 
 
275 aa  136  4e-31  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00321  hypothetical protein  35.22 
 
 
275 aa  136  4e-31  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0802  taurine ABC transporter, permease protein  33.61 
 
 
283 aa  135  7.000000000000001e-31  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.207449  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0391  taurine transporter subunit  35.63 
 
 
275 aa  135  9e-31  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0924  ABC transporter permease protein  35.71 
 
 
258 aa  135  9e-31  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.175022  normal 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6162  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.88 
 
 
262 aa  134  9.999999999999999e-31  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.577279 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0442  taurine transporter subunit  35.22 
 
 
275 aa  134  1.9999999999999998e-30  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1108  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.7 
 
 
255 aa  133  3e-30  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.135552 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3936  taurine transporter subunit  31.56 
 
 
284 aa  132  5e-30  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3693  taurine transporter subunit  31.56 
 
 
284 aa  132  5e-30  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0260  taurine transporter subunit  31.56 
 
 
284 aa  132  5e-30  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3240  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.6 
 
 
275 aa  132  6.999999999999999e-30  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0431  taurine transporter subunit  35.22 
 
 
275 aa  132  6.999999999999999e-30  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0280  taurine transporter subunit  35.22 
 
 
275 aa  132  6.999999999999999e-30  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2535  putative taurine ABC transporter, permease protein  32.95 
 
 
282 aa  132  7.999999999999999e-30  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.254862  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0512  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.78 
 
 
253 aa  131  1.0000000000000001e-29  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1557  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.22 
 
 
272 aa  131  1.0000000000000001e-29  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  decreased coverage  0.00127239  hitchhiker  0.00240392 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3643  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.25 
 
 
252 aa  131  1.0000000000000001e-29  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000799696  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1127  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.32 
 
 
267 aa  131  1.0000000000000001e-29  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0396  taurine transporter subunit  34.41 
 
 
275 aa  130  2.0000000000000002e-29  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2216  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.92 
 
 
314 aa  130  2.0000000000000002e-29  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.82677  normal  0.484673 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1998  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.67 
 
 
283 aa  130  3e-29  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.894639  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3459  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.85 
 
 
283 aa  130  3e-29  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.703735  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2712  sulfonate ABC transporter permease  31.36 
 
 
282 aa  129  4.0000000000000003e-29  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2920  sulfonate ABC transporter permease protein  31.36 
 
 
282 aa  129  4.0000000000000003e-29  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0676  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.44 
 
 
279 aa  129  4.0000000000000003e-29  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.30868 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2935  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.75 
 
 
252 aa  129  4.0000000000000003e-29  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1679  ABC transporter permease  37.11 
 
 
274 aa  129  5.0000000000000004e-29  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.451747  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3884  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.36 
 
 
258 aa  129  6e-29  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3065  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.86 
 
 
280 aa  129  6e-29  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.228654 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3478  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.79 
 
 
291 aa  129  7.000000000000001e-29  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.466071  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1385  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.03 
 
 
284 aa  128  9.000000000000001e-29  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0616622  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_19510  ABC transporter permease  37.11 
 
 
274 aa  128  9.000000000000001e-29  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4108  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.56 
 
 
283 aa  128  9.000000000000001e-29  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0024  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.33 
 
 
264 aa  127  1.0000000000000001e-28  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0030  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.88 
 
 
264 aa  128  1.0000000000000001e-28  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.050552  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4458  nitrate ABC transporter, inner membrane subunit  27.64 
 
 
277 aa  128  1.0000000000000001e-28  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.698055  normal  0.534513 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4395  nitrate ABC transporter, inner membrane subunit  27.64 
 
 
277 aa  128  1.0000000000000001e-28  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1982  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  33.33 
 
 
266 aa  127  3e-28  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.187248  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2553  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.08 
 
 
275 aa  126  3e-28  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2152  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  33.64 
 
 
271 aa  126  4.0000000000000003e-28  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.529987 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4035  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.22 
 
 
287 aa  126  4.0000000000000003e-28  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0678072 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0397  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.15 
 
 
285 aa  126  5e-28  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.987071 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0840  taurine transporter subunit  33.62 
 
 
275 aa  126  5e-28  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.276647 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1026  nitrate transport permease  30.2 
 
 
279 aa  125  7e-28  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.174596 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2803  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.33 
 
 
259 aa  125  9e-28  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00122675  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0766  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.83 
 
 
260 aa  125  9e-28  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4051  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.28 
 
 
273 aa  124  1e-27  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.395379 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2304  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.16 
 
 
278 aa  124  1e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.37818 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0552  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.64 
 
 
286 aa  125  1e-27  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.973794  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0464  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.35 
 
 
273 aa  124  1e-27  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3413  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.8 
 
 
271 aa  124  1e-27  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0409101  normal  0.884011 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3299  putative sulfonate ABC transporter, permease protein  33.47 
 
 
286 aa  124  2e-27  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.201269  normal  0.262094 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2566  ABC transporter, membrane subunit  32.48 
 
 
252 aa  124  2e-27  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.345232 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0403  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.25 
 
 
256 aa  124  2e-27  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1642  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.42 
 
 
263 aa  124  2e-27  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0047  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.87 
 
 
306 aa  124  2e-27  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1572  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.08 
 
 
538 aa  124  2e-27  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA1188  taurine ABC transporter, permease protein  32.69 
 
 
250 aa  123  3e-27  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0612406  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6360  putative sulfonate ABC transporter, permease protein  30.68 
 
 
267 aa  123  4e-27  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.821284  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_02450  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport system, permease component  37.02 
 
 
289 aa  123  4e-27  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.458789  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1453  alkanesulfonate transporter permease subunit  32.19 
 
 
263 aa  122  5e-27  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1380  binding-protein-dependent transporter inner membrane component  31.51 
 
 
277 aa  122  6e-27  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.153307 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0545  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.8 
 
 
309 aa  122  6e-27  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.795546  normal  0.61218 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1673  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.49 
 
 
263 aa  122  7e-27  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1369  ABC transporter membrane protein  32.19 
 
 
272 aa  122  7e-27  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.0458182 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2953  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.07 
 
 
294 aa  122  8e-27  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>