More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mevan_0512 on replicon NC_009634
Organism: Methanococcus vannielii SB



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009634  Mevan_0512  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  100 
 
 
253 aa  492  9.999999999999999e-139  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0444  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  81.82 
 
 
253 aa  410  1e-114  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0393  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  83 
 
 
253 aa  412  1e-114  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0876322  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1476  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  82.61 
 
 
253 aa  412  1e-114  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0992  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  70.47 
 
 
254 aa  363  2e-99  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1076  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  53.57 
 
 
269 aa  273  2.0000000000000002e-72  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.406887  normal  0.454808 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0736  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  56.85 
 
 
253 aa  254  8e-67  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.417563  normal  0.341407 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0377  hypothetical protein  49.41 
 
 
253 aa  232  4.0000000000000004e-60  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0573  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  46.3 
 
 
277 aa  229  3e-59  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0521  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40 
 
 
239 aa  183  2.0000000000000003e-45  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2132  ABC nitrate/sulfonate/bicarbonate transporter, inner membrane subunit  37.76 
 
 
262 aa  182  4.0000000000000006e-45  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1031  sulfonate ABC transporter, permease protein  37.04 
 
 
261 aa  177  1e-43  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0464  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.3 
 
 
288 aa  176  3e-43  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.349721  hitchhiker  0.00645779 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0850  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.68 
 
 
258 aa  176  4e-43  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  hitchhiker  0.00204788  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6545  ABC transporter permease  37.89 
 
 
269 aa  174  1.9999999999999998e-42  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.276106 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0397  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  44 
 
 
285 aa  170  2e-41  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.987071 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7932  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.04 
 
 
283 aa  166  2.9999999999999998e-40  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4051  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.59 
 
 
273 aa  165  5e-40  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.395379 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1211  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.6 
 
 
273 aa  164  1.0000000000000001e-39  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.132759  normal  0.452833 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_16930  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport system, permease component  39.75 
 
 
322 aa  164  2.0000000000000002e-39  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.327  normal  0.410158 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2085  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.9 
 
 
319 aa  163  2.0000000000000002e-39  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.0787698 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4641  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.27 
 
 
277 aa  163  2.0000000000000002e-39  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.750363  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1848  ABC transporter permease  44.28 
 
 
273 aa  160  1e-38  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1957  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  44.28 
 
 
273 aa  160  1e-38  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0154  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.08 
 
 
264 aa  160  1e-38  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1422  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.81 
 
 
273 aa  160  2e-38  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1261  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.81 
 
 
273 aa  160  2e-38  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.306936 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0086  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.35 
 
 
261 aa  160  3e-38  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2935  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.4 
 
 
252 aa  159  5e-38  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0483  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.29 
 
 
275 aa  157  1e-37  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3869  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  43.72 
 
 
274 aa  157  1e-37  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0735  nitrate/sulfonate/bicarbonate ABC transporter inner membrane protein  36.82 
 
 
273 aa  157  1e-37  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.714635  normal 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6154  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.72 
 
 
295 aa  156  2e-37  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3065  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.42 
 
 
280 aa  156  3e-37  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.228654 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2152  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  39.22 
 
 
271 aa  155  4e-37  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.529987 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0153  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.09 
 
 
277 aa  155  4e-37  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.589472  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0145  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.9 
 
 
266 aa  154  1e-36  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1108  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.86 
 
 
255 aa  154  1e-36  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.135552 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0509  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.04 
 
 
289 aa  153  2e-36  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.085274 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4564  taurine transporter subunit  35.74 
 
 
279 aa  153  2.9999999999999998e-36  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.746145 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4201  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.21 
 
 
305 aa  152  4e-36  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1982  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  38.83 
 
 
266 aa  152  4e-36  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.187248  normal 
 
 
-
 
NC_004311  BRA1188  taurine ABC transporter, permease protein  37.86 
 
 
250 aa  152  5e-36  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0612406  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1171  taurine ABC transporter permease  36.87 
 
 
272 aa  152  5e-36  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.104716  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4185  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  42.11 
 
 
283 aa  151  8e-36  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.321257  normal 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0697  taurine ABC transporter, permease protein  36.16 
 
 
283 aa  151  1e-35  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1580  taurine ABC transporter, permease protein  36.16 
 
 
253 aa  150  1e-35  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.477521  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3346  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  42.33 
 
 
291 aa  151  1e-35  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.252204  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3671  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  42.33 
 
 
287 aa  151  1e-35  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0347715  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0620  permease component of taurine ABC transporter  36.16 
 
 
253 aa  150  1e-35  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  decreased coverage  0.00192231  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1473  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  40 
 
 
306 aa  150  1e-35  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0411979  normal 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2019  taurine ABC transporter, permease protein  36.16 
 
 
285 aa  151  1e-35  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.484134  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2220  taurine ABC transporter, permease protein  36.16 
 
 
283 aa  151  1e-35  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.215273  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2133  taurine ABC transporter, permease protein  36.16 
 
 
283 aa  151  1e-35  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.186654  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2953  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.87 
 
 
294 aa  151  1e-35  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4207  ABC taurine transporter, inner membrane subunit  38.4 
 
 
289 aa  149  4e-35  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2218  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.16 
 
 
290 aa  149  5e-35  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.484673 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2216  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.45 
 
 
314 aa  149  6e-35  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.82677  normal  0.484673 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3240  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.13 
 
 
275 aa  148  7e-35  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1998  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.54 
 
 
283 aa  148  8e-35  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.894639  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1127  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.38 
 
 
267 aa  148  8e-35  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2837  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  44 
 
 
266 aa  148  9e-35  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.115716  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00317  taurine transporter subunit  36.13 
 
 
275 aa  147  1.0000000000000001e-34  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00321  hypothetical protein  36.13 
 
 
275 aa  147  1.0000000000000001e-34  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3261  taurine transporter subunit  36.13 
 
 
275 aa  147  1.0000000000000001e-34  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3936  taurine transporter subunit  36.02 
 
 
284 aa  148  1.0000000000000001e-34  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3693  taurine transporter subunit  36.02 
 
 
284 aa  148  1.0000000000000001e-34  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0260  taurine transporter subunit  36.02 
 
 
284 aa  148  1.0000000000000001e-34  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1974  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  41.33 
 
 
261 aa  146  2.0000000000000003e-34  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000000226251  normal 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_5063  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40 
 
 
257 aa  146  2.0000000000000003e-34  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.104049  normal  0.0459168 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0442  taurine transporter subunit  35.71 
 
 
275 aa  146  3e-34  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0391  taurine transporter subunit  35.71 
 
 
275 aa  146  3e-34  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0431  taurine transporter subunit  35.71 
 
 
275 aa  146  3e-34  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3891  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.02 
 
 
269 aa  146  3e-34  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0403  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.67 
 
 
256 aa  146  3e-34  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2882  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.15 
 
 
268 aa  146  4.0000000000000006e-34  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.80309  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3750  ABC nitrate/sulfonate/bicarbonate transporter, inner membrane subunit  36.64 
 
 
269 aa  146  4.0000000000000006e-34  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3807  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.02 
 
 
269 aa  145  5e-34  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0802  taurine ABC transporter, permease protein  35.71 
 
 
283 aa  145  5e-34  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.207449  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_12960  taurine ABC transporter permease  37.37 
 
 
272 aa  145  5e-34  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.299757  normal  0.321121 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5321  taurine ABC transporter, permease protein  38.38 
 
 
285 aa  145  6e-34  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3160  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  39.9 
 
 
274 aa  145  6e-34  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.913146  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5146  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.22 
 
 
277 aa  145  6e-34  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0887356  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0722  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.04 
 
 
272 aa  145  8.000000000000001e-34  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0102858  normal  0.0961586 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0040  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.55 
 
 
259 aa  145  9e-34  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.832577  normal  0.34867 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0231  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.96 
 
 
279 aa  144  1e-33  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.33405  hitchhiker  0.000710194 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4568  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  43.5 
 
 
286 aa  144  1e-33  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0208  nitrate ABC transporter, permease protein, putative  40.62 
 
 
260 aa  143  2e-33  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.473726 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4981  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.68 
 
 
279 aa  143  2e-33  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.588836 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0254  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  37.02 
 
 
279 aa  144  2e-33  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.57663 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4508  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.22 
 
 
277 aa  144  2e-33  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.854714  normal  0.909107 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0840  taurine transporter subunit  37.13 
 
 
275 aa  143  3e-33  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.276647 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6203  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  42.33 
 
 
284 aa  143  3e-33  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.780444  normal  0.280504 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2324  nitrate ABC transporter, inner membrane subunit  35.56 
 
 
293 aa  143  3e-33  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3299  putative sulfonate ABC transporter, permease protein  35.12 
 
 
286 aa  143  3e-33  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.201269  normal  0.262094 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0280  taurine transporter subunit  35.29 
 
 
275 aa  142  4e-33  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2621  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.2 
 
 
281 aa  142  4e-33  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000218671  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6082  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.65 
 
 
296 aa  142  4e-33  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.201741 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0085  taurine ABC transporter inner membrane protein  36.29 
 
 
283 aa  142  4e-33  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.664827  normal  0.135193 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2803  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.8 
 
 
259 aa  142  4e-33  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00122675  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>