More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_6360 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009485  BBta_6360  putative sulfonate ABC transporter, permease protein  100 
 
 
267 aa  529  1e-149  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.821284  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4332  ABC transporter permease  43.44 
 
 
298 aa  219  5e-56  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1482  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  38.96 
 
 
253 aa  177  2e-43  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2566  ABC transporter, membrane subunit  41.98 
 
 
252 aa  176  5e-43  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.345232 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1369  ABC transporter membrane protein  37.55 
 
 
272 aa  172  3.9999999999999995e-42  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.0458182 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3058  taurine ABC transporter, permease protein  37.55 
 
 
274 aa  172  3.9999999999999995e-42  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2748  sulfonate/taurine ABC transporter permease  39.72 
 
 
274 aa  169  3e-41  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.947189  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3060  taurine ABC transporter, permease protein  39.07 
 
 
274 aa  169  5e-41  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0244271  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2621  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.04 
 
 
281 aa  164  2.0000000000000002e-39  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000218671  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3035  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.43 
 
 
298 aa  163  2.0000000000000002e-39  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.30367  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1899  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.1 
 
 
275 aa  162  5.0000000000000005e-39  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6162  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.17 
 
 
262 aa  161  1e-38  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.577279 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1692  putative ABC transporter membrane protein  43.6 
 
 
281 aa  160  2e-38  Thermobifida fusca YX  Bacteria  hitchhiker  0.00465779  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1998  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.04 
 
 
283 aa  159  6e-38  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.894639  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1575  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.66 
 
 
254 aa  158  8e-38  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0747147  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5801  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  38.79 
 
 
290 aa  158  9e-38  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2712  sulfonate ABC transporter permease  40.49 
 
 
282 aa  155  6e-37  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2920  sulfonate ABC transporter permease protein  40.49 
 
 
282 aa  155  6e-37  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4937  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.5 
 
 
287 aa  153  2e-36  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0773955  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1108  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.71 
 
 
255 aa  153  2e-36  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.135552 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0403  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.6 
 
 
256 aa  153  2e-36  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4641  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.33 
 
 
277 aa  153  2.9999999999999998e-36  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.750363  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3869  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.08 
 
 
274 aa  153  2.9999999999999998e-36  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5321  taurine ABC transporter, permease protein  36.75 
 
 
285 aa  150  2e-35  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_44530  Binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.02 
 
 
259 aa  150  3e-35  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0634098  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0260  taurine transporter subunit  36.95 
 
 
284 aa  149  5e-35  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1746  putative molybdenum ABC transporter, solute-binding protein  32.19 
 
 
249 aa  149  5e-35  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  hitchhiker  0.000716411  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3693  taurine transporter subunit  36.95 
 
 
284 aa  149  5e-35  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3936  taurine transporter subunit  36.95 
 
 
284 aa  149  5e-35  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8275  ABC-type transporter, permease protein  38.18 
 
 
272 aa  148  1.0000000000000001e-34  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.144641 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0231  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.1 
 
 
279 aa  147  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.33405  hitchhiker  0.000710194 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4306  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.25 
 
 
278 aa  147  2.0000000000000003e-34  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0649738  hitchhiker  0.00238236 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3240  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.12 
 
 
275 aa  146  3e-34  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3818  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.73 
 
 
280 aa  146  4.0000000000000006e-34  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.615395  normal  0.42897 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1171  taurine ABC transporter permease  42.5 
 
 
272 aa  145  5e-34  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.104716  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4564  taurine transporter subunit  34.87 
 
 
279 aa  145  6e-34  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.746145 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0442  taurine transporter subunit  34.71 
 
 
275 aa  145  1e-33  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_12960  taurine ABC transporter permease  42.93 
 
 
272 aa  144  1e-33  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.299757  normal  0.321121 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0464  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.01 
 
 
273 aa  144  1e-33  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00317  taurine transporter subunit  34.3 
 
 
275 aa  143  2e-33  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0483  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.58 
 
 
275 aa  144  2e-33  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3261  taurine transporter subunit  34.3 
 
 
275 aa  143  2e-33  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2919  putative sulfonate ABC transporter, permease protein  40.87 
 
 
282 aa  143  2e-33  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.35916e-18 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00321  hypothetical protein  34.3 
 
 
275 aa  143  2e-33  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0391  taurine transporter subunit  34.3 
 
 
275 aa  143  3e-33  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4981  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.9 
 
 
279 aa  142  4e-33  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.588836 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2803  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.13 
 
 
259 aa  142  5e-33  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00122675  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2663  alkanesulfonates transport system permease; sulfonate ABC transporter, permease  40.98 
 
 
282 aa  142  6e-33  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2640  alkanesulfonates transport system permease; sulfonate ABC transporter, permease  40.98 
 
 
282 aa  142  6e-33  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0254  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  34.96 
 
 
279 aa  142  6e-33  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.57663 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0396  taurine transporter subunit  34.71 
 
 
275 aa  141  9.999999999999999e-33  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1982  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  33.47 
 
 
266 aa  141  9.999999999999999e-33  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.187248  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0246  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.33 
 
 
279 aa  141  9.999999999999999e-33  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0570948  normal  0.0921514 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3413  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.84 
 
 
271 aa  141  9.999999999999999e-33  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0409101  normal  0.884011 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2959  sulfonate ABC transporter, permease protein, putative  40.38 
 
 
284 aa  140  1.9999999999999998e-32  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.132224  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3875  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.64 
 
 
289 aa  140  1.9999999999999998e-32  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0280  taurine transporter subunit  33.88 
 
 
275 aa  140  3e-32  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0431  taurine transporter subunit  33.88 
 
 
275 aa  140  3e-32  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2012  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.32 
 
 
280 aa  139  3e-32  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.338733  normal  0.193625 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2787  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.93 
 
 
272 aa  139  3.9999999999999997e-32  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.334714  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2313  putative sulfonate ABC transporter, permease protein  40.49 
 
 
282 aa  139  3.9999999999999997e-32  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.797662  hitchhiker  0.00000011817 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2930  putative sulfonate ABC transporter, permease protein  40.49 
 
 
282 aa  139  3.9999999999999997e-32  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3807  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.77 
 
 
269 aa  139  3.9999999999999997e-32  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0840  taurine transporter subunit  35.53 
 
 
275 aa  139  4.999999999999999e-32  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.276647 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3891  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.77 
 
 
269 aa  139  4.999999999999999e-32  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0153  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.61 
 
 
277 aa  139  6e-32  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.589472  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3750  ABC nitrate/sulfonate/bicarbonate transporter, inner membrane subunit  35.37 
 
 
269 aa  139  7e-32  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0423  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.29 
 
 
297 aa  138  8.999999999999999e-32  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.283538  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2975  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.81 
 
 
284 aa  138  1e-31  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.27836  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0255  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.74 
 
 
279 aa  137  1e-31  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.796344  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2152  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  32.82 
 
 
271 aa  137  2e-31  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.529987 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1261  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.44 
 
 
273 aa  137  2e-31  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.306936 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1422  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.44 
 
 
273 aa  137  2e-31  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0263  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.84 
 
 
265 aa  136  3.0000000000000003e-31  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.791848  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1127  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.68 
 
 
267 aa  136  4e-31  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4051  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.7 
 
 
273 aa  135  5e-31  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.395379 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3042  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.77 
 
 
292 aa  135  5e-31  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.780897  normal  0.0430449 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0981  nitrate/sulfonate/bicarbonate ABC transporter inner membrane protein  29.92 
 
 
279 aa  135  6.0000000000000005e-31  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1580  taurine ABC transporter, permease protein  37.67 
 
 
253 aa  135  7.000000000000001e-31  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.477521  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0620  permease component of taurine ABC transporter  37.67 
 
 
253 aa  135  7.000000000000001e-31  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  decreased coverage  0.00192231  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2019  taurine ABC transporter, permease protein  37.67 
 
 
285 aa  135  7.000000000000001e-31  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.484134  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2133  taurine ABC transporter, permease protein  37.67 
 
 
283 aa  135  7.000000000000001e-31  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.186654  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0239  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.06 
 
 
265 aa  135  8e-31  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00756787 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0765  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.44 
 
 
265 aa  135  8e-31  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_21990  ABC transporter, inner membrane permease component  33.94 
 
 
273 aa  135  8e-31  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2220  taurine ABC transporter, permease protein  37.67 
 
 
283 aa  135  8e-31  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.215273  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1211  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.82 
 
 
273 aa  135  9e-31  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.132759  normal  0.452833 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2535  putative taurine ABC transporter, permease protein  33.2 
 
 
282 aa  135  9e-31  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.254862  normal 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0697  taurine ABC transporter, permease protein  37.67 
 
 
283 aa  135  9e-31  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1402  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.71 
 
 
257 aa  134  9.999999999999999e-31  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5412  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  35.89 
 
 
260 aa  134  9.999999999999999e-31  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.210037  hitchhiker  0.00191971 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1974  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  35.53 
 
 
261 aa  134  9.999999999999999e-31  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000000226251  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0254  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.36 
 
 
265 aa  134  9.999999999999999e-31  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.293544  normal  0.0445843 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4973  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.89 
 
 
265 aa  133  3e-30  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0722896  normal  0.022026 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3299  putative sulfonate ABC transporter, permease protein  33.46 
 
 
286 aa  132  3.9999999999999996e-30  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.201269  normal  0.262094 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1380  binding-protein-dependent transporter inner membrane component  34.63 
 
 
277 aa  132  3.9999999999999996e-30  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.153307 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1340  aliphatic sulfonate ABC transporter transmembrane protein  41.18 
 
 
264 aa  132  6e-30  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0574559  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4637  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.18 
 
 
283 aa  132  6e-30  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.258867  hitchhiker  0.00000636426 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5146  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.07 
 
 
277 aa  132  6e-30  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0887356  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1145  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.54 
 
 
279 aa  132  6e-30  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.208956  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>