More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avi_7197 on replicon NC_011981
Organism: Agrobacterium vitis S4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011981  Avi_7197  ABC transporter membrane spanning protein (aliphatic sulphonate)  100 
 
 
272 aa  531  1e-150  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0116141  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4842  putative ABC transporter (permease protein)  59.75 
 
 
286 aa  263  2e-69  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.395869 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0552  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  59.46 
 
 
286 aa  261  6.999999999999999e-69  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.973794  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0750  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  48.21 
 
 
284 aa  233  3e-60  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.546304 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1911  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  51.27 
 
 
282 aa  233  3e-60  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_22520  ABC transporter inner-membrane protein  56.44 
 
 
277 aa  228  9e-59  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0210  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  47.58 
 
 
532 aa  217  2e-55  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1572  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  47.97 
 
 
538 aa  213  2.9999999999999995e-54  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7235  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  50.64 
 
 
285 aa  212  4.9999999999999996e-54  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.266674  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4334  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  46.77 
 
 
536 aa  211  7e-54  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0578  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  48.28 
 
 
287 aa  209  5e-53  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1432  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  47.91 
 
 
537 aa  206  2e-52  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.300396  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0149  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  48.68 
 
 
532 aa  205  8e-52  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2097  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  50 
 
 
286 aa  203  3e-51  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.961582  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0236  ABC sulfate ester transporter, inner membrane subunit  50.88 
 
 
280 aa  200  1.9999999999999998e-50  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0133  nitrate/sulfonate/bicarbonate ABC transporter inner membrane protein  49.78 
 
 
283 aa  196  4.0000000000000005e-49  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.744619  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2062  nitrate/sulfonate/bicarbonate ABC transporter inner membrane protein  47.83 
 
 
280 aa  192  4e-48  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.332807  normal  0.624531 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1832  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  49.57 
 
 
533 aa  192  4e-48  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2159  sulfate ester ABC transporter inner membrane protein  48.43 
 
 
283 aa  192  6e-48  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.514359  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0265  ABC transporter permease  47.33 
 
 
538 aa  190  2e-47  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.302657  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_08100  ABC transporter, permease component  42.47 
 
 
528 aa  189  4e-47  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3295  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  48.08 
 
 
279 aa  186  3e-46  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2624  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  47.98 
 
 
566 aa  186  5e-46  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0913088  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4345  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  46.04 
 
 
280 aa  186  5e-46  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.821403  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4021  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  46.04 
 
 
280 aa  186  5e-46  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3503  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  45.66 
 
 
280 aa  184  1.0000000000000001e-45  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.42159  decreased coverage  0.0001708 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_19510  ABC transporter permease  45.45 
 
 
274 aa  184  1.0000000000000001e-45  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2642  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  46.86 
 
 
528 aa  184  2.0000000000000003e-45  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4563  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  46.54 
 
 
280 aa  183  2.0000000000000003e-45  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1679  ABC transporter permease  45.04 
 
 
274 aa  182  6e-45  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.451747  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2621  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.26 
 
 
281 aa  181  9.000000000000001e-45  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000218671  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5005  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  48.57 
 
 
528 aa  181  1e-44  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_02340  putative permease of ABC transporter  46.93 
 
 
538 aa  180  2.9999999999999997e-44  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00529429  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3884  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.33 
 
 
258 aa  179  4e-44  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1353  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  47.32 
 
 
564 aa  178  1e-43  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3350  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  43.28 
 
 
250 aa  177  2e-43  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2515  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  40.38 
 
 
282 aa  175  8e-43  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.313862  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2787  ABC transporter, permease protein  41.98 
 
 
282 aa  173  2.9999999999999996e-42  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0328614  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1557  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.66 
 
 
272 aa  173  2.9999999999999996e-42  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  decreased coverage  0.00127239  hitchhiker  0.00240392 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0231  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  47.7 
 
 
534 aa  172  3.9999999999999995e-42  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3643  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.5 
 
 
252 aa  172  6.999999999999999e-42  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000799696  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0483  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.6 
 
 
275 aa  169  5e-41  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4330  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  45.33 
 
 
276 aa  168  9e-41  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.936191 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1998  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36 
 
 
283 aa  167  2e-40  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.894639  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4035  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.98 
 
 
287 aa  166  4e-40  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0678072 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1575  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.55 
 
 
254 aa  165  8e-40  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0747147  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3459  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.21 
 
 
283 aa  162  8.000000000000001e-39  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.703735  normal 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7196  sulfate ester transporter permease protein  41.13 
 
 
261 aa  160  2e-38  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0358063  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0464  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.01 
 
 
273 aa  159  4e-38  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1736  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.25 
 
 
264 aa  159  6e-38  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.440066  normal  0.144233 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2712  sulfonate ABC transporter permease  37.83 
 
 
282 aa  158  9e-38  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2920  sulfonate ABC transporter permease protein  37.83 
 
 
282 aa  158  9e-38  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0024  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.25 
 
 
264 aa  158  1e-37  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5412  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  37.13 
 
 
260 aa  158  1e-37  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.210037  hitchhiker  0.00191971 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0239  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.29 
 
 
265 aa  157  2e-37  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00756787 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0355  putative ABC aliphatic sulfonates transporter, permease subunit  37.39 
 
 
264 aa  157  2e-37  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0423  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.39 
 
 
264 aa  157  2e-37  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0981  nitrate/sulfonate/bicarbonate ABC transporter inner membrane protein  34.69 
 
 
279 aa  157  2e-37  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0254  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.89 
 
 
265 aa  156  4e-37  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.293544  normal  0.0445843 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2959  sulfonate ABC transporter, permease protein, putative  35.96 
 
 
284 aa  155  5.0000000000000005e-37  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.132224  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4973  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.89 
 
 
265 aa  155  6e-37  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0722896  normal  0.022026 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3413  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.63 
 
 
271 aa  155  6e-37  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0409101  normal  0.884011 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6343  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  42.08 
 
 
285 aa  155  7e-37  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1380  binding-protein-dependent transporter inner membrane component  37.55 
 
 
277 aa  155  8e-37  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.153307 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6520  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  42.5 
 
 
285 aa  155  8e-37  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6754  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  42.5 
 
 
288 aa  155  8e-37  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.622776  normal  0.0653341 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2638  ABC sulfonate transporter, inner membrane subunit  33.97 
 
 
279 aa  155  9e-37  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0950643  hitchhiker  0.0000361652 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0030  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.69 
 
 
264 aa  155  9e-37  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.050552  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_19570  ABC transporter permease  34.92 
 
 
262 aa  155  9e-37  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1453  alkanesulfonate transporter permease subunit  35.86 
 
 
263 aa  154  1e-36  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2919  putative sulfonate ABC transporter, permease protein  34.96 
 
 
282 aa  154  1e-36  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.35916e-18 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0676  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.45 
 
 
279 aa  154  1e-36  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.30868 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2610  nitrate/sulfonate/bicarbonate ABC transporter inner membrane protein  38.76 
 
 
271 aa  154  1e-36  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1684  ABC transporter permease  34.52 
 
 
262 aa  154  1e-36  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0263  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.71 
 
 
265 aa  154  1e-36  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.791848  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4886  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.27 
 
 
281 aa  153  2e-36  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.479856  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4841  ABC transporter permease  40.47 
 
 
260 aa  154  2e-36  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.509038 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1673  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.39 
 
 
263 aa  154  2e-36  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1211  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.41 
 
 
273 aa  153  2.9999999999999998e-36  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.132759  normal  0.452833 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2787  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.82 
 
 
272 aa  151  1e-35  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.334714  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1422  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.24 
 
 
273 aa  150  2e-35  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0545  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.91 
 
 
309 aa  150  2e-35  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.795546  normal  0.61218 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1261  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.24 
 
 
273 aa  150  2e-35  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.306936 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5005  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.02 
 
 
289 aa  149  4e-35  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3438  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.89 
 
 
301 aa  149  6e-35  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3008  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.45 
 
 
280 aa  149  6e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3299  putative sulfonate ABC transporter, permease protein  36.86 
 
 
286 aa  147  2.0000000000000003e-34  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.201269  normal  0.262094 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2663  alkanesulfonates transport system permease; sulfonate ABC transporter, permease  38.1 
 
 
282 aa  147  2.0000000000000003e-34  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4051  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.02 
 
 
273 aa  147  2.0000000000000003e-34  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.395379 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1385  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  42.29 
 
 
284 aa  147  2.0000000000000003e-34  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0616622  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0579  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.68 
 
 
272 aa  147  2.0000000000000003e-34  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.404079  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1642  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.81 
 
 
263 aa  147  2.0000000000000003e-34  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2640  alkanesulfonates transport system permease; sulfonate ABC transporter, permease  38.1 
 
 
282 aa  146  3e-34  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7504  ABC transporter, inner membrane subunit  42.86 
 
 
284 aa  146  3e-34  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.000654979  normal  0.560264 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0765  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.45 
 
 
265 aa  146  4.0000000000000006e-34  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7221  ABC transporter membrane spanning protein (nitrate/sulfonates)  36.51 
 
 
282 aa  146  4.0000000000000006e-34  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.735165  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_19350  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport system, permease component  38.98 
 
 
293 aa  145  5e-34  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.449157  normal  0.837307 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2882  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.64 
 
 
268 aa  144  1e-33  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.80309  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2152  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  34.51 
 
 
271 aa  144  2e-33  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.529987 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1210  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.02 
 
 
315 aa  144  2e-33  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>