More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPA7_0265 on replicon NC_009656
Organism: Pseudomonas aeruginosa PA7



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007492  Pfl01_0210  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  72.49 
 
 
532 aa  652    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0265  ABC transporter permease  100 
 
 
538 aa  1010    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.302657  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_02340  putative permease of ABC transporter  97.77 
 
 
538 aa  845    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00529429  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_08100  ABC transporter, permease component  69.53 
 
 
528 aa  603  1.0000000000000001e-171  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5005  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  70.64 
 
 
528 aa  555  1e-157  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0231  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  73.72 
 
 
534 aa  556  1e-157  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1572  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  58.29 
 
 
538 aa  504  1e-141  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4334  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  54.18 
 
 
536 aa  474  1e-132  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0149  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  53.55 
 
 
532 aa  467  9.999999999999999e-131  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1432  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  55.01 
 
 
537 aa  444  1e-123  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.300396  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1832  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  53.77 
 
 
533 aa  444  1e-123  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1353  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  56.08 
 
 
564 aa  436  1e-121  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2642  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  53.32 
 
 
528 aa  433  1e-120  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2624  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  57.47 
 
 
566 aa  424  1e-117  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0913088  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_22530  ABC transporter inner-membrane protein  52.94 
 
 
257 aa  209  1e-52  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1911  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  43.08 
 
 
282 aa  208  2e-52  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7197  ABC transporter membrane spanning protein (aliphatic sulphonate)  46.96 
 
 
272 aa  201  3e-50  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0116141  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_22520  ABC transporter inner-membrane protein  50.67 
 
 
277 aa  190  5e-47  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7196  sulfate ester transporter permease protein  43.29 
 
 
261 aa  181  2.9999999999999997e-44  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0358063  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0749  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  44.26 
 
 
266 aa  179  9e-44  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.534527 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1998  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.58 
 
 
283 aa  174  3.9999999999999995e-42  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.894639  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0578  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  42.92 
 
 
287 aa  174  3.9999999999999995e-42  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3643  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.08 
 
 
252 aa  172  9e-42  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000799696  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7234  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  43.1 
 
 
299 aa  172  1e-41  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.109099  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0132  nitrate/sulfonate/bicarbonate ABC transporter inner membrane protein  43.91 
 
 
293 aa  170  6e-41  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0552  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  42.59 
 
 
286 aa  169  1e-40  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.973794  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2097  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  44.26 
 
 
286 aa  168  2e-40  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.961582  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7235  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.33 
 
 
285 aa  168  2e-40  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.266674  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0579  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.5 
 
 
272 aa  169  2e-40  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.404079  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0237  ABC sulfate ester transporter, inner membrane subunit  40.59 
 
 
272 aa  167  4e-40  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2158  sulfate ester ABC transporter inner membrane protein  40.87 
 
 
292 aa  167  5e-40  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0339108  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2621  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.13 
 
 
281 aa  167  5e-40  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000218671  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2712  sulfonate ABC transporter permease  39.57 
 
 
282 aa  166  6.9999999999999995e-40  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2920  sulfonate ABC transporter permease protein  39.57 
 
 
282 aa  166  6.9999999999999995e-40  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1557  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40 
 
 
272 aa  166  8e-40  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  decreased coverage  0.00127239  hitchhiker  0.00240392 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2787  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.4 
 
 
272 aa  165  2.0000000000000002e-39  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.334714  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2063  nitrate/sulfonate/bicarbonate ABC transporter inner membrane protein  41.81 
 
 
273 aa  164  4.0000000000000004e-39  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.593403  normal  0.617384 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4345  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  43.28 
 
 
280 aa  164  5.0000000000000005e-39  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.821403  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4021  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  43.28 
 
 
280 aa  164  5.0000000000000005e-39  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4842  putative ABC transporter (permease protein)  44.1 
 
 
286 aa  164  5.0000000000000005e-39  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.395869 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2062  nitrate/sulfonate/bicarbonate ABC transporter inner membrane protein  44.49 
 
 
280 aa  163  7e-39  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.332807  normal  0.624531 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2098  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.57 
 
 
290 aa  161  2e-38  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4841  ABC transporter permease  45.26 
 
 
260 aa  161  4e-38  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.509038 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0551  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  47.84 
 
 
266 aa  160  5e-38  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.917723  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1556  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.76 
 
 
260 aa  160  6e-38  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00657173  hitchhiker  0.00236959 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3503  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  44.44 
 
 
280 aa  159  1e-37  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.42159  decreased coverage  0.0001708 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1910  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  42.37 
 
 
270 aa  158  2e-37  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.839759  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3504  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.24 
 
 
271 aa  158  2e-37  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.334186  hitchhiker  0.000427033 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1679  ABC transporter permease  41.63 
 
 
274 aa  158  2e-37  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.451747  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4346  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.24 
 
 
271 aa  158  3e-37  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.746329  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4020  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.24 
 
 
271 aa  158  3e-37  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.811587  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2959  sulfonate ABC transporter, permease protein, putative  38.93 
 
 
284 aa  157  4e-37  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.132224  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2159  sulfate ester ABC transporter inner membrane protein  45.16 
 
 
283 aa  156  7e-37  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.514359  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_19510  ABC transporter permease  41.22 
 
 
274 aa  156  7e-37  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2919  putative sulfonate ABC transporter, permease protein  38.52 
 
 
282 aa  156  1e-36  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.35916e-18 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1210  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.49 
 
 
315 aa  156  1e-36  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4564  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.36 
 
 
274 aa  155  2e-36  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2313  putative sulfonate ABC transporter, permease protein  39.5 
 
 
282 aa  155  2e-36  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.797662  hitchhiker  0.00000011817 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4563  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  42.8 
 
 
280 aa  155  2e-36  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3299  putative sulfonate ABC transporter, permease protein  35.61 
 
 
286 aa  154  4e-36  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.201269  normal  0.262094 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_21600  aliphatic sulfonates ABC transporter, inner membrane component  36.72 
 
 
284 aa  154  4e-36  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2930  putative sulfonate ABC transporter, permease protein  39.57 
 
 
282 aa  154  4e-36  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2663  alkanesulfonates transport system permease; sulfonate ABC transporter, permease  40 
 
 
282 aa  152  1e-35  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2640  alkanesulfonates transport system permease; sulfonate ABC transporter, permease  40 
 
 
282 aa  152  2e-35  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2304  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.32 
 
 
278 aa  151  2e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.37818 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2638  ABC sulfonate transporter, inner membrane subunit  36.67 
 
 
279 aa  151  3e-35  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0950643  hitchhiker  0.0000361652 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0981  nitrate/sulfonate/bicarbonate ABC transporter inner membrane protein  36.67 
 
 
279 aa  150  4e-35  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0750  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.24 
 
 
284 aa  150  5e-35  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.546304 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0483  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.02 
 
 
275 aa  150  6e-35  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1453  alkanesulfonate transporter permease subunit  37.8 
 
 
263 aa  149  2.0000000000000003e-34  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3350  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.41 
 
 
250 aa  147  4.0000000000000006e-34  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7221  ABC transporter membrane spanning protein (nitrate/sulfonates)  33.45 
 
 
282 aa  147  5e-34  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.735165  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3884  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.56 
 
 
258 aa  147  6e-34  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_19570  ABC transporter permease  36.76 
 
 
262 aa  146  8.000000000000001e-34  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3459  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.75 
 
 
283 aa  146  9e-34  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.703735  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3818  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.55 
 
 
280 aa  146  1e-33  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.615395  normal  0.42897 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0133  nitrate/sulfonate/bicarbonate ABC transporter inner membrane protein  41.94 
 
 
283 aa  146  1e-33  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.744619  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3295  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  34.98 
 
 
279 aa  145  2e-33  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5130  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.43 
 
 
272 aa  145  2e-33  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.612608  normal  0.0470724 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1684  ABC transporter permease  36.76 
 
 
262 aa  145  2e-33  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2846  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.18 
 
 
260 aa  144  3e-33  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.000143494  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5412  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  36 
 
 
260 aa  144  4e-33  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.210037  hitchhiker  0.00191971 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0545  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.66 
 
 
309 aa  142  9.999999999999999e-33  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.795546  normal  0.61218 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2515  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  35.37 
 
 
282 aa  141  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.313862  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3598  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  39.5 
 
 
285 aa  141  3e-32  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.330128 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2787  ABC transporter, permease protein  34.93 
 
 
282 aa  141  3.9999999999999997e-32  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0328614  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1575  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.29 
 
 
254 aa  140  4.999999999999999e-32  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0747147  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0239  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.29 
 
 
265 aa  140  7.999999999999999e-32  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00756787 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0254  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.29 
 
 
265 aa  139  8.999999999999999e-32  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.293544  normal  0.0445843 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4973  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.69 
 
 
265 aa  139  1e-31  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0722896  normal  0.022026 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4886  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.36 
 
 
281 aa  139  1e-31  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.479856  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0236  ABC sulfate ester transporter, inner membrane subunit  38.78 
 
 
280 aa  139  1e-31  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2882  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.77 
 
 
268 aa  138  2e-31  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.80309  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1380  binding-protein-dependent transporter inner membrane component  36.72 
 
 
277 aa  138  2e-31  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.153307 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0765  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.44 
 
 
265 aa  138  2e-31  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0263  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.29 
 
 
265 aa  139  2e-31  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.791848  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0423  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.45 
 
 
297 aa  139  2e-31  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.283538  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0772  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.69 
 
 
302 aa  138  3.0000000000000003e-31  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0528102 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0676  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.71 
 
 
279 aa  138  3.0000000000000003e-31  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.30868 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0355  putative ABC aliphatic sulfonates transporter, permease subunit  36.44 
 
 
264 aa  137  5e-31  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>