More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphyt_2097 on replicon NC_010681
Organism: Burkholderia phytofirmans PsJN



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010681  Bphyt_2097  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  100 
 
 
286 aa  551  1e-156  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.961582  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2159  sulfate ester ABC transporter inner membrane protein  91.96 
 
 
283 aa  457  1e-127  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.514359  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7235  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  81.55 
 
 
285 aa  410  1e-113  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.266674  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0133  nitrate/sulfonate/bicarbonate ABC transporter inner membrane protein  79.72 
 
 
283 aa  382  1e-105  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.744619  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4345  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  80.35 
 
 
280 aa  379  1e-104  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.821403  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4021  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  80.35 
 
 
280 aa  379  1e-104  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3503  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  78.95 
 
 
280 aa  375  1e-103  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.42159  decreased coverage  0.0001708 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2062  nitrate/sulfonate/bicarbonate ABC transporter inner membrane protein  77.54 
 
 
280 aa  373  1e-102  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.332807  normal  0.624531 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4563  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  77.54 
 
 
280 aa  368  1e-101  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1911  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  67.18 
 
 
282 aa  335  7e-91  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_22520  ABC transporter inner-membrane protein  54.39 
 
 
277 aa  222  4.9999999999999996e-57  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7197  ABC transporter membrane spanning protein (aliphatic sulphonate)  49.78 
 
 
272 aa  217  2e-55  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0116141  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4842  putative ABC transporter (permease protein)  50.81 
 
 
286 aa  211  1e-53  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.395869 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0210  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  45.68 
 
 
532 aa  199  3e-50  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0552  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  46.79 
 
 
286 aa  194  2e-48  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.973794  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1572  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  43.08 
 
 
538 aa  191  1e-47  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0750  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  42.39 
 
 
284 aa  190  2e-47  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.546304 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0578  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  44.07 
 
 
287 aa  189  5e-47  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4334  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  43.04 
 
 
536 aa  188  1e-46  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1432  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  45.75 
 
 
537 aa  186  3e-46  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.300396  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0236  ABC sulfate ester transporter, inner membrane subunit  49.56 
 
 
280 aa  186  3e-46  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0149  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  44.49 
 
 
532 aa  184  2.0000000000000003e-45  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2642  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  45.06 
 
 
528 aa  182  4.0000000000000006e-45  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_08100  ABC transporter, permease component  40.6 
 
 
528 aa  176  5e-43  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1832  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  45.78 
 
 
533 aa  175  7e-43  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2624  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  45.87 
 
 
566 aa  173  2.9999999999999996e-42  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0913088  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0483  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37 
 
 
275 aa  172  6.999999999999999e-42  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3884  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.33 
 
 
258 aa  171  9e-42  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0265  ABC transporter permease  44.26 
 
 
538 aa  167  2e-40  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.302657  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1353  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  45.25 
 
 
564 aa  164  1.0000000000000001e-39  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0231  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  44.77 
 
 
534 aa  162  7e-39  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_02340  putative permease of ABC transporter  44.39 
 
 
538 aa  160  3e-38  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00529429  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_19510  ABC transporter permease  40.89 
 
 
274 aa  159  7e-38  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5005  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  44.87 
 
 
528 aa  157  2e-37  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3350  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.6 
 
 
250 aa  157  2e-37  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3643  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.02 
 
 
252 aa  157  2e-37  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000799696  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1736  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.37 
 
 
264 aa  156  5.0000000000000005e-37  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.440066  normal  0.144233 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0981  nitrate/sulfonate/bicarbonate ABC transporter inner membrane protein  37.5 
 
 
279 aa  155  5.0000000000000005e-37  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1679  ABC transporter permease  40.08 
 
 
274 aa  155  6e-37  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.451747  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0355  putative ABC aliphatic sulfonates transporter, permease subunit  34.69 
 
 
264 aa  153  2.9999999999999998e-36  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0423  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.69 
 
 
264 aa  153  2.9999999999999998e-36  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2621  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.94 
 
 
281 aa  153  2.9999999999999998e-36  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000218671  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7196  sulfate ester transporter permease protein  38.43 
 
 
261 aa  153  4e-36  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0358063  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1453  alkanesulfonate transporter permease subunit  33.47 
 
 
263 aa  152  7e-36  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0676  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.02 
 
 
279 aa  152  8.999999999999999e-36  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.30868 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2638  ABC sulfonate transporter, inner membrane subunit  36.51 
 
 
279 aa  151  1e-35  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0950643  hitchhiker  0.0000361652 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0239  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.51 
 
 
265 aa  149  4e-35  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00756787 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0254  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.51 
 
 
265 aa  149  5e-35  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.293544  normal  0.0445843 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4841  ABC transporter permease  41.23 
 
 
260 aa  149  5e-35  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.509038 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5412  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  35.25 
 
 
260 aa  149  6e-35  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.210037  hitchhiker  0.00191971 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0263  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.89 
 
 
265 aa  149  6e-35  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.791848  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_19570  ABC transporter permease  34.8 
 
 
262 aa  148  8e-35  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4973  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.51 
 
 
265 aa  148  9e-35  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0722896  normal  0.022026 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3299  putative sulfonate ABC transporter, permease protein  36.51 
 
 
286 aa  147  2.0000000000000003e-34  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.201269  normal  0.262094 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2787  ABC transporter, permease protein  38.46 
 
 
282 aa  146  5e-34  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0328614  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2515  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  36.23 
 
 
282 aa  144  1e-33  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.313862  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1684  ABC transporter permease  34 
 
 
262 aa  144  2e-33  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3295  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  38.25 
 
 
279 aa  143  2e-33  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0030  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.86 
 
 
264 aa  144  2e-33  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.050552  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0024  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.14 
 
 
264 aa  144  2e-33  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3459  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.2 
 
 
283 aa  144  2e-33  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.703735  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3464  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.4 
 
 
294 aa  144  2e-33  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.136656  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2610  nitrate/sulfonate/bicarbonate ABC transporter inner membrane protein  40.35 
 
 
271 aa  143  3e-33  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1575  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.19 
 
 
254 aa  143  3e-33  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0747147  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1673  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.19 
 
 
263 aa  143  4e-33  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0237  ABC sulfate ester transporter, inner membrane subunit  34.84 
 
 
272 aa  142  5e-33  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_19350  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport system, permease component  37.71 
 
 
293 aa  142  5e-33  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.449157  normal  0.837307 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4330  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.82 
 
 
276 aa  142  5e-33  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.936191 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1557  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.89 
 
 
272 aa  142  6e-33  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  decreased coverage  0.00127239  hitchhiker  0.00240392 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3413  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.33 
 
 
271 aa  141  9.999999999999999e-33  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0409101  normal  0.884011 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1385  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.55 
 
 
284 aa  140  1.9999999999999998e-32  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0616622  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4886  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.81 
 
 
281 aa  140  1.9999999999999998e-32  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.479856  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1998  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.34 
 
 
283 aa  139  3.9999999999999997e-32  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.894639  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0765  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.78 
 
 
265 aa  139  6e-32  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2882  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.82 
 
 
268 aa  139  6e-32  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.80309  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1210  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.21 
 
 
315 aa  139  6e-32  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1642  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.2 
 
 
263 aa  139  7e-32  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3438  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.85 
 
 
301 aa  138  8.999999999999999e-32  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1910  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.64 
 
 
270 aa  138  8.999999999999999e-32  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.839759  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1380  binding-protein-dependent transporter inner membrane component  35.92 
 
 
277 aa  138  1e-31  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.153307 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7221  ABC transporter membrane spanning protein (nitrate/sulfonates)  31.79 
 
 
282 aa  137  2e-31  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.735165  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2787  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.05 
 
 
272 aa  136  3.0000000000000003e-31  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.334714  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2712  sulfonate ABC transporter permease  34.8 
 
 
282 aa  136  4e-31  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2920  sulfonate ABC transporter permease protein  34.8 
 
 
282 aa  136  4e-31  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4875  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  35.51 
 
 
265 aa  135  7.000000000000001e-31  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.746085  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0545  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.17 
 
 
309 aa  135  9e-31  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.795546  normal  0.61218 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4641  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.89 
 
 
277 aa  135  9.999999999999999e-31  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.750363  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7646  putative sulfonate ABC transporter, permease protein  35.96 
 
 
282 aa  134  9.999999999999999e-31  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0357497  normal  0.620506 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4035  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.25 
 
 
287 aa  134  1.9999999999999998e-30  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0678072 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0438  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.32 
 
 
239 aa  134  1.9999999999999998e-30  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.284515 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_22530  ABC transporter inner-membrane protein  40.16 
 
 
257 aa  134  1.9999999999999998e-30  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2803  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.19 
 
 
259 aa  134  1.9999999999999998e-30  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00122675  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5315  aliphatic sulfonates ABC transporter, permease protein  35.1 
 
 
265 aa  133  3e-30  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1669  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.63 
 
 
273 aa  133  3e-30  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.5369  normal  0.169212 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0772  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.26 
 
 
302 aa  133  3e-30  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0528102 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7234  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.07 
 
 
299 aa  132  5e-30  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.109099  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2304  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.64 
 
 
278 aa  132  5e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.37818 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2709  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.88 
 
 
263 aa  131  1.0000000000000001e-29  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.753275  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1216  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.83 
 
 
270 aa  131  1.0000000000000001e-29  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.150226 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1043  alkanesulfonate transporter permease subunit  33.88 
 
 
263 aa  131  1.0000000000000001e-29  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>