More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcenmc03_3503 on replicon NC_010515
Organism: Burkholderia cenocepacia MC0-3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010515  Bcenmc03_3503  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  100 
 
 
280 aa  535  1e-151  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.42159  decreased coverage  0.0001708 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4345  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  98.93 
 
 
280 aa  529  1e-149  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.821403  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4021  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  98.93 
 
 
280 aa  529  1e-149  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2062  nitrate/sulfonate/bicarbonate ABC transporter inner membrane protein  92.5 
 
 
280 aa  452  1.0000000000000001e-126  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.332807  normal  0.624531 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4563  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  89.64 
 
 
280 aa  429  1e-119  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2097  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  78.95 
 
 
286 aa  398  9.999999999999999e-111  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.961582  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7235  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  75.36 
 
 
285 aa  385  1e-106  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.266674  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2159  sulfate ester ABC transporter inner membrane protein  78.6 
 
 
283 aa  371  1e-102  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.514359  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0133  nitrate/sulfonate/bicarbonate ABC transporter inner membrane protein  82.83 
 
 
283 aa  357  9e-98  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.744619  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1911  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  66.54 
 
 
282 aa  332  6e-90  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_22520  ABC transporter inner-membrane protein  55.95 
 
 
277 aa  226  3e-58  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7197  ABC transporter membrane spanning protein (aliphatic sulphonate)  48.9 
 
 
272 aa  215  8e-55  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0116141  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4842  putative ABC transporter (permease protein)  48.78 
 
 
286 aa  204  1e-51  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.395869 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0552  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  45.87 
 
 
286 aa  200  1.9999999999999998e-50  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.973794  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0210  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  44.14 
 
 
532 aa  198  9e-50  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0750  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  44.02 
 
 
284 aa  191  1e-47  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.546304 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0236  ABC sulfate ester transporter, inner membrane subunit  50 
 
 
280 aa  188  1e-46  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0578  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  44.07 
 
 
287 aa  187  1e-46  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1572  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  45.45 
 
 
538 aa  187  2e-46  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1432  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  42.05 
 
 
537 aa  186  3e-46  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.300396  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4334  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  43.35 
 
 
536 aa  185  6e-46  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2642  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  44.64 
 
 
528 aa  184  1.0000000000000001e-45  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0149  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  44.64 
 
 
532 aa  181  1e-44  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1832  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  44.44 
 
 
533 aa  179  4e-44  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2624  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  46.33 
 
 
566 aa  176  3e-43  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0913088  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_08100  ABC transporter, permease component  40.87 
 
 
528 aa  176  4e-43  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3643  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.86 
 
 
252 aa  176  4e-43  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000799696  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0265  ABC transporter permease  44.44 
 
 
538 aa  174  9.999999999999999e-43  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.302657  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3884  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.29 
 
 
258 aa  172  5e-42  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0231  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  47.46 
 
 
534 aa  167  2e-40  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1353  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  45.25 
 
 
564 aa  167  2e-40  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1453  alkanesulfonate transporter permease subunit  35.1 
 
 
263 aa  162  6e-39  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5005  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  46.15 
 
 
528 aa  160  3e-38  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0483  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.68 
 
 
275 aa  159  3e-38  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0981  nitrate/sulfonate/bicarbonate ABC transporter inner membrane protein  37.02 
 
 
279 aa  159  4e-38  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_02340  putative permease of ABC transporter  44.39 
 
 
538 aa  159  4e-38  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00529429  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1736  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.6 
 
 
264 aa  159  5e-38  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.440066  normal  0.144233 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_19510  ABC transporter permease  40.96 
 
 
274 aa  157  3e-37  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2638  ABC sulfonate transporter, inner membrane subunit  33.7 
 
 
279 aa  155  5.0000000000000005e-37  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0950643  hitchhiker  0.0000361652 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0423  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.6 
 
 
264 aa  155  7e-37  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0355  putative ABC aliphatic sulfonates transporter, permease subunit  35.6 
 
 
264 aa  155  7e-37  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7196  sulfate ester transporter permease protein  38.86 
 
 
261 aa  155  1e-36  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0358063  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5412  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  35.06 
 
 
260 aa  154  2e-36  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.210037  hitchhiker  0.00191971 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_19570  ABC transporter permease  35.6 
 
 
262 aa  153  2.9999999999999998e-36  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1684  ABC transporter permease  35.6 
 
 
262 aa  153  2.9999999999999998e-36  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1679  ABC transporter permease  40.16 
 
 
274 aa  153  2.9999999999999998e-36  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.451747  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0263  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.89 
 
 
265 aa  153  4e-36  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.791848  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0254  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.48 
 
 
265 aa  152  4e-36  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.293544  normal  0.0445843 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2515  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  38.18 
 
 
282 aa  152  5e-36  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.313862  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1575  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.87 
 
 
254 aa  152  5e-36  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0747147  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0239  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.07 
 
 
265 aa  152  7e-36  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00756787 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2621  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.12 
 
 
281 aa  151  8.999999999999999e-36  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000218671  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2787  ABC transporter, permease protein  37.04 
 
 
282 aa  151  1e-35  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0328614  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4973  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.86 
 
 
265 aa  151  1e-35  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0722896  normal  0.022026 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0765  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.9 
 
 
265 aa  149  6e-35  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0676  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.44 
 
 
279 aa  148  9e-35  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.30868 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0024  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.8 
 
 
264 aa  148  1.0000000000000001e-34  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5315  aliphatic sulfonates ABC transporter, permease protein  36.36 
 
 
265 aa  147  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0030  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.66 
 
 
264 aa  147  2.0000000000000003e-34  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.050552  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2803  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.19 
 
 
259 aa  146  3e-34  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00122675  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1557  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.32 
 
 
272 aa  147  3e-34  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  decreased coverage  0.00127239  hitchhiker  0.00240392 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4330  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  42.86 
 
 
276 aa  147  3e-34  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.936191 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3350  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.96 
 
 
250 aa  146  4.0000000000000006e-34  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1385  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.56 
 
 
284 aa  146  4.0000000000000006e-34  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0616622  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3299  putative sulfonate ABC transporter, permease protein  35.15 
 
 
286 aa  145  5e-34  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.201269  normal  0.262094 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3295  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  40.55 
 
 
279 aa  145  6e-34  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2610  nitrate/sulfonate/bicarbonate ABC transporter inner membrane protein  40.79 
 
 
271 aa  145  6e-34  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4875  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  35.97 
 
 
265 aa  145  9e-34  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.746085  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1673  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.17 
 
 
263 aa  144  1e-33  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3459  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.02 
 
 
283 aa  144  2e-33  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.703735  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00938  alkanesulfonate transporter subunit  35.46 
 
 
263 aa  143  3e-33  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.028081  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2709  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.46 
 
 
263 aa  143  3e-33  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.753275  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2662  alkanesulfonate transporter permease subunit  35.46 
 
 
263 aa  143  3e-33  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.629834  normal  0.0100847 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1036  alkanesulfonate transporter permease subunit  35.46 
 
 
263 aa  143  3e-33  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0685931  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1043  alkanesulfonate transporter permease subunit  35.46 
 
 
263 aa  143  3e-33  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1380  binding-protein-dependent transporter inner membrane component  36.33 
 
 
277 aa  143  3e-33  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.153307 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00945  hypothetical protein  35.46 
 
 
263 aa  143  3e-33  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0322362  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1642  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.5 
 
 
263 aa  142  5e-33  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2185  alkanesulfonate transporter permease subunit  35.46 
 
 
264 aa  142  6e-33  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.11182  normal  0.890131 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4886  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.04 
 
 
281 aa  142  7e-33  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.479856  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_19350  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport system, permease component  37.29 
 
 
293 aa  141  9e-33  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.449157  normal  0.837307 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1998  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.47 
 
 
283 aa  141  9.999999999999999e-33  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.894639  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1910  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.86 
 
 
270 aa  141  9.999999999999999e-33  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.839759  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3438  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.69 
 
 
301 aa  141  9.999999999999999e-33  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1096  alkanesulfonate transporter permease subunit  35.06 
 
 
263 aa  140  1.9999999999999998e-32  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00432775  normal  0.422148 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_22530  ABC transporter inner-membrane protein  41.42 
 
 
257 aa  140  1.9999999999999998e-32  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3413  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.06 
 
 
271 aa  139  3e-32  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0409101  normal  0.884011 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4321  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.83 
 
 
264 aa  139  6e-32  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.154719 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4841  ABC transporter permease  39.04 
 
 
260 aa  139  6e-32  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.509038 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1216  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.33 
 
 
270 aa  138  1e-31  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.150226 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2882  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.19 
 
 
268 aa  138  1e-31  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.80309  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3464  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.14 
 
 
294 aa  138  1e-31  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.136656  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4139  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  32.38 
 
 
275 aa  137  2e-31  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.00000000314222  normal  0.0106036 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0772  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.78 
 
 
302 aa  137  2e-31  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0528102 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0438  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.86 
 
 
239 aa  137  3.0000000000000003e-31  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.284515 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2712  sulfonate ABC transporter permease  33.92 
 
 
282 aa  136  3.0000000000000003e-31  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0423  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.85 
 
 
297 aa  136  3.0000000000000003e-31  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.283538  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2920  sulfonate ABC transporter permease protein  33.92 
 
 
282 aa  136  3.0000000000000003e-31  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0237  ABC sulfate ester transporter, inner membrane subunit  35.42 
 
 
272 aa  135  5e-31  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4641  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.47 
 
 
277 aa  135  7.000000000000001e-31  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.750363  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>