More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aave_0047 on replicon NC_008752
Organism: Acidovorax citrulli AAC00-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008752  Aave_0047  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  100 
 
 		 306 aa  588  1e-167  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2477  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  69.76 
 
 		 289 aa  369  1e-101  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0948255  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4207  ABC taurine transporter, inner membrane subunit  71.93 
 
 		 289 aa  370  1e-101  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0509  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  71.58 
 
 		 289 aa  367  1e-100  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.085274 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0085  taurine ABC transporter inner membrane protein  74.45 
 
 		 283 aa  366  1e-100  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.664827  normal  0.135193 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2883  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  72.3 
 
 		 289 aa  367  1e-100  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1470  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  69 
 
 		 301 aa  363  2e-99  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6225  nitrate/sulfonate/bicarbonate ABC transporter inner membrane protein  74.13 
 
 		 320 aa  360  2e-98  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0421  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  72.49 
 
 		 321 aa  350  1e-95  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.905374 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6082  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  65.86 
 
 		 296 aa  348  9e-95  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.201741 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2894  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  70.34 
 
 		 321 aa  342  2.9999999999999997e-93  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.438311 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2269  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  69.9 
 
 		 321 aa  341  8e-93  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2884  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  73.21 
 
 		 269 aa  339  4e-92  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3844  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  66.41 
 
 		 293 aa  302  6.000000000000001e-81  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4284  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  64.58 
 
 		 272 aa  301  6.000000000000001e-81  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0949532  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1763  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  69.2 
 
 		 282 aa  298  8e-80  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0692  ABC taurine transporter, inner membrane subunit  62.69 
 
 		 306 aa  297  2e-79  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00000000618741  normal  0.0440204 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4371  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  62.31 
 
 		 306 aa  296  3e-79  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.17867  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0049  ABC taurine transporter, binding protein inner membrane component  57.69 
 
 		 330 aa  277  2e-73  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.0656508 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4861  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  57.03 
 
 		 275 aa  262  6e-69  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0877464 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0231  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  51.45 
 
 		 279 aa  260  2e-68  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.33405  hitchhiker  0.000710194 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5321  taurine ABC transporter, permease protein  55.34 
 
 		 285 aa  258  1e-67  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3505  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  55.13 
 
 		 275 aa  253  3e-66  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.197989  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4981  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  55.83 
 
 		 279 aa  252  6e-66  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.588836 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3693  taurine transporter subunit  52.55 
 
 		 284 aa  251  8.000000000000001e-66  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0260  taurine transporter subunit  52.55 
 
 		 284 aa  251  8.000000000000001e-66  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3936  taurine transporter subunit  52.55 
 
 		 284 aa  251  8.000000000000001e-66  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0254  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  53.54 
 
 		 279 aa  249  6e-65  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.57663 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0246  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  56.96 
 
 		 279 aa  246  2e-64  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0570948  normal  0.0921514 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4564  taurine transporter subunit  53.85 
 
 		 279 aa  245  8e-64  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.746145 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0255  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  55.23 
 
 		 279 aa  241  1e-62  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.796344  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1171  taurine ABC transporter permease  52.88 
 
 		 272 aa  234  2.0000000000000002e-60  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.104716  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2133  taurine ABC transporter, permease protein  53.04 
 
 		 283 aa  228  7e-59  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.186654  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2019  taurine ABC transporter, permease protein  53.04 
 
 		 285 aa  228  8e-59  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.484134  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2220  taurine ABC transporter, permease protein  53.04 
 
 		 283 aa  228  8e-59  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.215273  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0697  taurine ABC transporter, permease protein  53.04 
 
 		 283 aa  228  9e-59  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1580  taurine ABC transporter, permease protein  53.04 
 
 		 253 aa  228  1e-58  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.477521  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0620  permease component of taurine ABC transporter  53.04 
 
 		 253 aa  228  1e-58  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  decreased coverage  0.00192231  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0802  taurine ABC transporter, permease protein  51.06 
 
 		 283 aa  228  1e-58  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.207449  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0442  taurine transporter subunit  53.63 
 
 		 275 aa  228  1e-58  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0391  taurine transporter subunit  53.23 
 
 		 275 aa  227  2e-58  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0840  taurine transporter subunit  55.46 
 
 		 275 aa  226  3e-58  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.276647 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3240  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  53.23 
 
 		 275 aa  226  4e-58  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_12960  taurine ABC transporter permease  52.88 
 
 		 272 aa  225  6e-58  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.299757  normal  0.321121 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2535  putative taurine ABC transporter, permease protein  46.83 
 
 		 282 aa  224  1e-57  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.254862  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0431  taurine transporter subunit  52.82 
 
 		 275 aa  224  2e-57  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0280  taurine transporter subunit  52.82 
 
 		 275 aa  224  2e-57  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00317  taurine transporter subunit  52.42 
 
 		 275 aa  223  4e-57  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3261  taurine transporter subunit  52.42 
 
 		 275 aa  223  4e-57  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00321  hypothetical protein  52.42 
 
 		 275 aa  223  4e-57  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0396  taurine transporter subunit  53.63 
 
 		 275 aa  223  4.9999999999999996e-57  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5576  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  50.58 
 
 		 284 aa  209  3e-53  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0761  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  48.68 
 
 		 412 aa  206  3e-52  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7166  taurine uptake ABC transporter permease protein  47.31 
 
 		 261 aa  195  9e-49  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1488  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  41.9 
 
 		 280 aa  186  3e-46  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.106569  normal  0.790334 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1402  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  44 
 
 		 257 aa  186  4e-46  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3138  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.9 
 
 		 286 aa  185  7e-46  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.453695  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3947  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  48.09 
 
 		 430 aa  179  8e-44  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  hitchhiker  0.00472137  normal  0.430362 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1800  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  43.2 
 
 		 257 aa  178  1e-43  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1108  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.76 
 
 		 255 aa  177  2e-43  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.135552 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4844  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.92 
 
 		 288 aa  171  2e-41  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6162  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.93 
 
 		 262 aa  165  1.0000000000000001e-39  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.577279 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3788  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.08 
 
 		 276 aa  159  6e-38  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.374556  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0992  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.4 
 
 		 254 aa  159  8e-38  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1323  binding-protein-dependent transporter inner membrane component  37.64 
 
 		 260 aa  157  3e-37  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0560082 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4641  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.5 
 
 		 277 aa  156  4e-37  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.750363  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4060  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  36.82 
 
 		 256 aa  155  6e-37  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3478  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.92 
 
 		 291 aa  155  7e-37  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.466071  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2304  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.83 
 
 		 278 aa  154  2e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.37818 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7932  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.5 
 
 		 283 aa  154  2e-36  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1669  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.45 
 
 		 273 aa  153  2.9999999999999998e-36  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.5369  normal  0.169212 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0512  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.75 
 
 		 253 aa  153  4e-36  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0040  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.97 
 
 		 259 aa  153  4e-36  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.832577  normal  0.34867 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3058  taurine ABC transporter, permease protein  38.53 
 
 		 274 aa  152  5e-36  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2858  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.82 
 
 		 291 aa  152  5e-36  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.582448  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1485  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.4 
 
 		 270 aa  152  5.9999999999999996e-36  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1453  alkanesulfonate transporter permease subunit  36.44 
 
 		 263 aa  152  7e-36  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2748  sulfonate/taurine ABC transporter permease  38.6 
 
 		 274 aa  152  8e-36  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.947189  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1464  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.4 
 
 		 270 aa  152  8e-36  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0183453  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3060  taurine ABC transporter, permease protein  38.14 
 
 		 274 aa  151  1e-35  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0244271  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1673  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.32 
 
 		 263 aa  151  1e-35  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1503  taurine ABC transporter, permease protein  38.31 
 
 		 288 aa  151  1e-35  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1539  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.42 
 
 		 270 aa  152  1e-35  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0890555  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0735  nitrate/sulfonate/bicarbonate ABC transporter inner membrane protein  37.95 
 
 		 273 aa  151  1e-35  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.714635  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1083  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.42 
 
 		 270 aa  151  1e-35  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1563  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.42 
 
 		 270 aa  151  1e-35  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5517  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.55 
 
 		 256 aa  150  2e-35  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.16627  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4705  nitrate/sulfonate/bicarbonate ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  34.42 
 
 		 270 aa  150  2e-35  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2975  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.29 
 
 		 284 aa  150  3e-35  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.27836  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2417  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.23 
 
 		 300 aa  150  3e-35  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0833403  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0239  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.3 
 
 		 265 aa  150  4e-35  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00756787 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1575  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.51 
 
 		 254 aa  150  4e-35  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0747147  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0254  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.3 
 
 		 265 aa  150  4e-35  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.293544  normal  0.0445843 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2787  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.21 
 
 		 272 aa  150  4e-35  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.334714  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1776  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.6 
 
 		 294 aa  149  4e-35  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_19570  ABC transporter permease  37.87 
 
 		 262 aa  150  4e-35  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0263  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.46 
 
 		 265 aa  149  5e-35  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.791848  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6203  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.15 
 
 		 284 aa  149  5e-35  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.780444  normal  0.280504 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1642  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.04 
 
 		 263 aa  149  6e-35  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2500  aliphatic sulfonate ABC transporter, permease protein  38.08 
 
 		 268 aa  149  8e-35  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>