More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PCC7424_4677 on replicon NC_011729
Organism: Cyanothece sp. PCC 7424



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011729  PCC7424_4677  nitrate ABC transporter, inner membrane subunit  100 
 
 
279 aa  545  1e-154  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2597  nitrate ABC transporter, inner membrane subunit  74.26 
 
 
280 aa  417  9.999999999999999e-116  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3520  nitrate ABC transporter, inner membrane subunit  74.26 
 
 
280 aa  416  9.999999999999999e-116  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4924  nitrate ABC transporter, inner membrane subunit  73.98 
 
 
280 aa  404  1.0000000000000001e-112  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.815767 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1489  nitrate transport permease  71.06 
 
 
278 aa  391  1e-108  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1026  nitrate transport permease  62.72 
 
 
279 aa  337  9.999999999999999e-92  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.174596 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3526  nitrate ABC transporter, inner membrane subunit  54.12 
 
 
280 aa  298  7e-80  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.471487 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2819  nitrate transport permease protein (nrtB)  54.86 
 
 
304 aa  286  2e-76  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.233469  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4395  nitrate ABC transporter, inner membrane subunit  52.17 
 
 
277 aa  284  1.0000000000000001e-75  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4458  nitrate ABC transporter, inner membrane subunit  52.17 
 
 
277 aa  284  1.0000000000000001e-75  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.698055  normal  0.534513 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4958  nitrate ABC transporter, inner membrane subunit  50.9 
 
 
285 aa  280  2e-74  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.413837  normal  0.165118 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4495  nitrate ABC transporter, inner membrane subunit  50.71 
 
 
285 aa  278  5e-74  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4571  nitrate ABC transporter, inner membrane subunit  56.3 
 
 
280 aa  278  6e-74  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5011  nitrate ABC transporter, inner membrane subunit  53.36 
 
 
286 aa  274  1.0000000000000001e-72  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.312092  normal  0.320206 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0666  nitrate ABC transporter, inner membrane subunit  52.67 
 
 
311 aa  269  2.9999999999999997e-71  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0569164  decreased coverage  0.0039857 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1759  nitrate transport permease  56.03 
 
 
299 aa  269  4e-71  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0568232  normal  0.0125916 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4541  nitrate transport permease  56.52 
 
 
279 aa  264  1e-69  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3744  nitrate ABC transporter, inner membrane subunit  52.99 
 
 
288 aa  256  4e-67  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.441454  normal  0.10243 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5896  nitrate ABC transporter permease protein  51.19 
 
 
297 aa  252  6e-66  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.149001  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2503  nitrate ABC transporter, inner membrane subunit  50.18 
 
 
298 aa  246  2e-64  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6460  nitrate ABC transporter, inner membrane subunit  52.32 
 
 
297 aa  246  2e-64  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.150998 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4471  nitrate ABC transporter, inner membrane subunit  51.67 
 
 
297 aa  247  2e-64  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.5689 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3654  nitrate transport permease  50 
 
 
273 aa  237  1e-61  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1238  nitrate transport permease  49.05 
 
 
279 aa  227  1e-58  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3842  nitrate ABC transporter, inner membrane subunit  46.86 
 
 
331 aa  220  1.9999999999999999e-56  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2273  nitrate transport permease  45.16 
 
 
299 aa  218  1e-55  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0236  nitrate ABC transporter, inner membrane subunit  44.67 
 
 
283 aa  212  3.9999999999999995e-54  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0257  nitrate ABC transporter, inner membrane subunit  44.67 
 
 
283 aa  212  4.9999999999999996e-54  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.738144 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2146  nitrate ABC transporter, inner membrane subunit  42.31 
 
 
315 aa  212  5.999999999999999e-54  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0380  putative nitrate transmembrane ABC transporter protein  45.61 
 
 
287 aa  211  7.999999999999999e-54  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.931268 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1704  nitrate ABC transporter, inner membrane subunit  45.53 
 
 
311 aa  211  1e-53  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1391  NO3-/NO2- ABC transporter  41.11 
 
 
305 aa  208  1e-52  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.36361 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0276  nitrate transport permease  45.11 
 
 
303 aa  207  1e-52  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.21823 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3675  nitrate ABC transporter, inner membrane subunit  43.19 
 
 
280 aa  204  1e-51  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3729  nitrate ABC transporter, inner membrane subunit  43.19 
 
 
280 aa  204  1e-51  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0184404  normal  0.11569 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0326  nitrate transport permease  45.12 
 
 
295 aa  204  2e-51  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0640  nitrate ABC transporter, inner membrane subunit  43.08 
 
 
279 aa  204  2e-51  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2104  nitrate ABC transporter, inner membrane subunit  43.27 
 
 
283 aa  202  5e-51  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0291571  normal  0.0240092 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0329  nitrate transport permease  44.21 
 
 
300 aa  202  5e-51  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3523  nitrate ABC transporter, inner membrane subunit  42.86 
 
 
309 aa  201  9.999999999999999e-51  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.293551  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0874  nitrate transport permease  43.87 
 
 
283 aa  199  3e-50  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00348419  hitchhiker  0.00524559 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2555  nitrate transport permease  44.81 
 
 
314 aa  199  5e-50  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.162104  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2588  nitrate ABC transporter, inner membrane subunit  45.54 
 
 
279 aa  199  6e-50  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00171927 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2321  nitrate ABC transporter, inner membrane subunit  43.03 
 
 
313 aa  198  7.999999999999999e-50  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.539996  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2832  nitrate ABC transporter, inner membrane subunit  43.03 
 
 
313 aa  198  1.0000000000000001e-49  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.442547 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2324  nitrate ABC transporter, inner membrane subunit  42.8 
 
 
293 aa  196  3e-49  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5414  putative nitrate ABC transporter (permease protein) (ntrB-like protein)  45.89 
 
 
279 aa  196  5.000000000000001e-49  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.481789  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0831  nitrate transport permease  42.28 
 
 
312 aa  195  9e-49  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.0203602 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4662  nitrate ABC transporter, inner membrane subunit  46.08 
 
 
279 aa  193  2e-48  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1147  nitrate ABC transporter, inner membrane subunit  46.08 
 
 
279 aa  193  3e-48  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.488584 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1439  nitrate ABC transporter, inner membrane subunit  42.92 
 
 
310 aa  192  5e-48  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.062597  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1413  nitrate ABC transporter, inner membrane subunit  45.22 
 
 
311 aa  192  5e-48  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3268  nitrate transport permease  44.4 
 
 
328 aa  191  8e-48  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.321419  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1306  nitrate ABC transporter, inner membrane subunit  46.08 
 
 
279 aa  192  8e-48  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2618  nitrate ABC transporter, inner membrane subunit  45.54 
 
 
279 aa  191  9e-48  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.234813 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2055  nitrate transport permease  45.59 
 
 
279 aa  191  1e-47  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.562067  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2171  nitrate transport permease  42.41 
 
 
272 aa  191  1e-47  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0149943  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3486  nitrate ABC transporter permease protein  42.17 
 
 
295 aa  191  1e-47  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.236914  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2404  nitrate ABC transporter, inner membrane subunit  45.1 
 
 
279 aa  189  2.9999999999999997e-47  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.105129  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2908  nitrate ABC transporter, inner membrane subunit  44.91 
 
 
298 aa  188  8e-47  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.950821  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2376  nitrate ABC transporter, inner membrane subunit  44.16 
 
 
313 aa  187  2e-46  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1542  nitrate ABC transporter, inner membrane subunit  41.41 
 
 
304 aa  186  4e-46  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.244375  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2732  nitrate ABC transporter, inner membrane subunit  41.41 
 
 
304 aa  184  1.0000000000000001e-45  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0882865  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0055  nitrate ABC transporter, inner membrane subunit  39.92 
 
 
256 aa  184  1.0000000000000001e-45  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0963  nitrate ABC transporter, inner membrane subunit  41.7 
 
 
281 aa  184  2.0000000000000003e-45  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.563275 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0291  nitrate transport permease  42.65 
 
 
287 aa  183  2.0000000000000003e-45  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2591  nitrate ABC transporter, inner membrane subunit  43.64 
 
 
328 aa  183  3e-45  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.0488842 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2205  nitrate ABC transporter, inner membrane subunit  42.79 
 
 
280 aa  182  4.0000000000000006e-45  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3973  nitrate ABC transporter, inner membrane subunit  40.85 
 
 
295 aa  182  4.0000000000000006e-45  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.930991  normal  0.148208 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2337  nitrate ABC transporter, inner membrane subunit  39.6 
 
 
282 aa  182  6e-45  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2496  nitrate ABC transporter, inner membrane subunit  45.25 
 
 
304 aa  181  1e-44  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.546285  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4817  nitrate ABC transporter, inner membrane subunit  40.6 
 
 
279 aa  181  1e-44  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.775678  hitchhiker  0.00263828 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0996  nitrate ABC transporter, inner membrane subunit  43.75 
 
 
286 aa  180  2e-44  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3741  nitrate transport permease  41.67 
 
 
288 aa  181  2e-44  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2106  nitrate transport permease  39.26 
 
 
263 aa  163  4.0000000000000004e-39  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.727969  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1473  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  32.17 
 
 
306 aa  148  1.0000000000000001e-34  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0411979  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2265  2-isopropylmalate synthase  32.88 
 
 
337 aa  146  4.0000000000000006e-34  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.20736  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2818  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.96 
 
 
323 aa  141  9.999999999999999e-33  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0908348  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05589  hypothetical protein  40.2 
 
 
321 aa  140  1.9999999999999998e-32  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001608  nitrate ABC transporter permease protein  40.2 
 
 
321 aa  140  1.9999999999999998e-32  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3315  putative nitrate ABC transporter, permease protein  30.93 
 
 
315 aa  140  3e-32  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.286795  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1116  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.19 
 
 
320 aa  139  3.9999999999999997e-32  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03653  putative nitrate ABC transporter, permease protein  35.75 
 
 
349 aa  137  2e-31  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0397  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.92 
 
 
285 aa  136  4e-31  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.987071 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0673  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  36.6 
 
 
275 aa  134  9.999999999999999e-31  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0666321  normal  0.331074 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0145  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.81 
 
 
266 aa  134  1.9999999999999998e-30  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0464  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.22 
 
 
288 aa  133  3e-30  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.349721  hitchhiker  0.00645779 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0176  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.9 
 
 
330 aa  133  3e-30  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.283757  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0992  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.26 
 
 
254 aa  133  3.9999999999999996e-30  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1083  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.77 
 
 
362 aa  133  3.9999999999999996e-30  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7932  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.85 
 
 
283 aa  132  7.999999999999999e-30  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1154  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  33.88 
 
 
332 aa  131  1.0000000000000001e-29  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2416  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.75 
 
 
329 aa  131  1.0000000000000001e-29  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.941924  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2085  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.96 
 
 
319 aa  130  3e-29  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.0787698 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3041  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.72 
 
 
356 aa  129  4.0000000000000003e-29  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0454985  normal  0.816874 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0512  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.51 
 
 
253 aa  129  4.0000000000000003e-29  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2216  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.96 
 
 
314 aa  129  7.000000000000001e-29  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.82677  normal  0.484673 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0213  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.68 
 
 
252 aa  127  2.0000000000000002e-28  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1031  sulfonate ABC transporter, permease protein  38.38 
 
 
261 aa  126  3e-28  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1664  putative ABC transporter permease protein  34.48 
 
 
360 aa  127  3e-28  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0453487  normal  0.0661868 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>