More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SYO3AOP1_0055 on replicon NC_010730
Organism: Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010730  SYO3AOP1_0055  nitrate ABC transporter, inner membrane subunit  100 
 
 		 256 aa  504  9.999999999999999e-143  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2337  nitrate ABC transporter, inner membrane subunit  53.44 
 
 		 282 aa  262  4e-69  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3842  nitrate ABC transporter, inner membrane subunit  47.93 
 
 		 331 aa  247  1e-64  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1704  nitrate ABC transporter, inner membrane subunit  48.54 
 
 		 311 aa  240  1e-62  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2324  nitrate ABC transporter, inner membrane subunit  49.57 
 
 		 293 aa  238  5e-62  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0276  nitrate transport permease  46.99 
 
 		 303 aa  237  1e-61  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.21823 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2146  nitrate ABC transporter, inner membrane subunit  44.4 
 
 		 315 aa  236  3e-61  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0257  nitrate ABC transporter, inner membrane subunit  47.11 
 
 		 283 aa  235  4e-61  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.738144 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0380  putative nitrate transmembrane ABC transporter protein  47.52 
 
 		 287 aa  235  5.0000000000000005e-61  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.931268 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0236  nitrate ABC transporter, inner membrane subunit  47.11 
 
 		 283 aa  235  5.0000000000000005e-61  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1391  NO3-/NO2- ABC transporter  48.64 
 
 		 305 aa  234  1.0000000000000001e-60  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.36361 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1439  nitrate ABC transporter, inner membrane subunit  46.46 
 
 		 310 aa  231  9e-60  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.062597  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0329  nitrate transport permease  48.35 
 
 		 300 aa  231  1e-59  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2273  nitrate transport permease  45.24 
 
 		 299 aa  230  2e-59  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3729  nitrate ABC transporter, inner membrane subunit  45.12 
 
 		 280 aa  229  4e-59  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0184404  normal  0.11569 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0963  nitrate ABC transporter, inner membrane subunit  50.46 
 
 		 281 aa  229  4e-59  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.563275 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3675  nitrate ABC transporter, inner membrane subunit  45.12 
 
 		 280 aa  229  4e-59  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0326  nitrate transport permease  44.59 
 
 		 295 aa  228  1e-58  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0874  nitrate transport permease  44.44 
 
 		 283 aa  226  2e-58  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00348419  hitchhiker  0.00524559 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2104  nitrate ABC transporter, inner membrane subunit  44.59 
 
 		 283 aa  226  4e-58  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0291571  normal  0.0240092 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2205  nitrate ABC transporter, inner membrane subunit  50 
 
 		 280 aa  224  8e-58  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2321  nitrate ABC transporter, inner membrane subunit  44.16 
 
 		 313 aa  224  1e-57  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.539996  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0640  nitrate ABC transporter, inner membrane subunit  44.81 
 
 		 279 aa  224  1e-57  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2496  nitrate ABC transporter, inner membrane subunit  49.35 
 
 		 304 aa  223  2e-57  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.546285  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2832  nitrate ABC transporter, inner membrane subunit  44.16 
 
 		 313 aa  223  2e-57  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.442547 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1413  nitrate ABC transporter, inner membrane subunit  45.89 
 
 		 311 aa  223  3e-57  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2555  nitrate transport permease  43.98 
 
 		 314 aa  222  4e-57  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.162104  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2591  nitrate ABC transporter, inner membrane subunit  46.4 
 
 		 328 aa  221  8e-57  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.0488842 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3268  nitrate transport permease  46.61 
 
 		 328 aa  220  1.9999999999999999e-56  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.321419  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2732  nitrate ABC transporter, inner membrane subunit  47.04 
 
 		 304 aa  220  1.9999999999999999e-56  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0882865  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2908  nitrate ABC transporter, inner membrane subunit  49.54 
 
 		 298 aa  219  3e-56  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.950821  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1542  nitrate ABC transporter, inner membrane subunit  46.64 
 
 		 304 aa  218  5e-56  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.244375  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2376  nitrate ABC transporter, inner membrane subunit  46.85 
 
 		 313 aa  218  7e-56  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3523  nitrate ABC transporter, inner membrane subunit  43.98 
 
 		 309 aa  217  1e-55  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.293551  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5414  putative nitrate ABC transporter (permease protein) (ntrB-like protein)  46.79 
 
 		 279 aa  216  2e-55  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.481789  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0996  nitrate ABC transporter, inner membrane subunit  48.85 
 
 		 286 aa  216  2.9999999999999998e-55  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2171  nitrate transport permease  46.08 
 
 		 272 aa  216  4e-55  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0149943  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3973  nitrate ABC transporter, inner membrane subunit  48.85 
 
 		 295 aa  215  5e-55  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.930991  normal  0.148208 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2618  nitrate ABC transporter, inner membrane subunit  45.66 
 
 		 279 aa  214  9.999999999999999e-55  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.234813 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0831  nitrate transport permease  42.35 
 
 		 312 aa  214  9.999999999999999e-55  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.0203602 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2588  nitrate ABC transporter, inner membrane subunit  43.5 
 
 		 279 aa  214  9.999999999999999e-55  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00171927 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3486  nitrate ABC transporter permease protein  47 
 
 		 295 aa  213  2.9999999999999995e-54  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.236914  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2404  nitrate ABC transporter, inner membrane subunit  46.19 
 
 		 279 aa  212  4.9999999999999996e-54  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.105129  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3526  nitrate ABC transporter, inner membrane subunit  43.39 
 
 		 280 aa  211  7e-54  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.471487 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2055  nitrate transport permease  44.95 
 
 		 279 aa  211  9e-54  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.562067  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3654  nitrate transport permease  41.08 
 
 		 273 aa  211  1e-53  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4662  nitrate ABC transporter, inner membrane subunit  45.87 
 
 		 279 aa  210  2e-53  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4571  nitrate ABC transporter, inner membrane subunit  41.74 
 
 		 280 aa  210  2e-53  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1147  nitrate ABC transporter, inner membrane subunit  46.54 
 
 		 279 aa  209  2e-53  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.488584 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1306  nitrate ABC transporter, inner membrane subunit  46.54 
 
 		 279 aa  208  5e-53  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0291  nitrate transport permease  48.53 
 
 		 287 aa  208  7e-53  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2106  nitrate transport permease  47.35 
 
 		 263 aa  207  2e-52  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.727969  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5896  nitrate ABC transporter permease protein  40.32 
 
 		 297 aa  206  3e-52  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.149001  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3741  nitrate transport permease  46.08 
 
 		 288 aa  206  4e-52  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4958  nitrate ABC transporter, inner membrane subunit  41.13 
 
 		 285 aa  202  3e-51  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.413837  normal  0.165118 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4495  nitrate ABC transporter, inner membrane subunit  41.13 
 
 		 285 aa  202  4e-51  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4471  nitrate ABC transporter, inner membrane subunit  39.76 
 
 		 297 aa  202  6e-51  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.5689 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5011  nitrate ABC transporter, inner membrane subunit  40.89 
 
 		 286 aa  200  1.9999999999999998e-50  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.312092  normal  0.320206 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1026  nitrate transport permease  38.74 
 
 		 279 aa  199  5e-50  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.174596 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0666  nitrate ABC transporter, inner membrane subunit  44.05 
 
 		 311 aa  199  5e-50  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0569164  decreased coverage  0.0039857 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2819  nitrate transport permease protein (nrtB)  38.33 
 
 		 304 aa  198  7e-50  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.233469  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4395  nitrate ABC transporter, inner membrane subunit  40.51 
 
 		 277 aa  196  3e-49  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4458  nitrate ABC transporter, inner membrane subunit  40.51 
 
 		 277 aa  196  3e-49  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.698055  normal  0.534513 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4817  nitrate ABC transporter, inner membrane subunit  44.5 
 
 		 279 aa  196  3e-49  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.775678  hitchhiker  0.00263828 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3744  nitrate ABC transporter, inner membrane subunit  40.09 
 
 		 288 aa  196  4.0000000000000005e-49  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.441454  normal  0.10243 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2503  nitrate ABC transporter, inner membrane subunit  43.81 
 
 		 298 aa  194  1e-48  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6460  nitrate ABC transporter, inner membrane subunit  39.91 
 
 		 297 aa  192  3e-48  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.150998 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1489  nitrate transport permease  40.55 
 
 		 278 aa  192  5e-48  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1238  nitrate transport permease  40.98 
 
 		 279 aa  186  4e-46  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4677  nitrate ABC transporter, inner membrane subunit  39.92 
 
 		 279 aa  184  1.0000000000000001e-45  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4924  nitrate ABC transporter, inner membrane subunit  39.27 
 
 		 280 aa  184  2.0000000000000003e-45  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.815767 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4541  nitrate transport permease  42.4 
 
 		 279 aa  181  1e-44  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2597  nitrate ABC transporter, inner membrane subunit  38.31 
 
 		 280 aa  177  2e-43  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3520  nitrate ABC transporter, inner membrane subunit  38.31 
 
 		 280 aa  176  2e-43  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1759  nitrate transport permease  39.83 
 
 		 299 aa  176  3e-43  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0568232  normal  0.0125916 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3315  putative nitrate ABC transporter, permease protein  33.22 
 
 		 315 aa  161  1e-38  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.286795  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1116  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.9 
 
 		 320 aa  159  5e-38  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001608  nitrate ABC transporter permease protein  41.79 
 
 		 321 aa  155  7e-37  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05589  hypothetical protein  41.79 
 
 		 321 aa  154  9e-37  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03653  putative nitrate ABC transporter, permease protein  39.8 
 
 		 349 aa  152  4e-36  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0176  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.11 
 
 		 330 aa  150  2e-35  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.283757  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2818  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.31 
 
 		 323 aa  149  4e-35  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0908348  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3041  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.61 
 
 		 356 aa  147  1.0000000000000001e-34  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0454985  normal  0.816874 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1664  putative ABC transporter permease protein  36.49 
 
 		 360 aa  147  1.0000000000000001e-34  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0453487  normal  0.0661868 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2416  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.11 
 
 		 329 aa  148  1.0000000000000001e-34  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.941924  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1083  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.41 
 
 		 362 aa  146  3e-34  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1154  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  41.29 
 
 		 332 aa  143  2e-33  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2265  2-isopropylmalate synthase  31.72 
 
 		 337 aa  144  2e-33  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.20736  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0512  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.31 
 
 		 253 aa  133  3e-30  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1076  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.17 
 
 		 269 aa  133  3e-30  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.406887  normal  0.454808 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0145  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  28.97 
 
 		 266 aa  132  3.9999999999999996e-30  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0992  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.03 
 
 		 254 aa  131  1.0000000000000001e-29  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2935  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.85 
 
 		 252 aa  130  3e-29  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0233  ABC transporter, permease protein  33.18 
 
 		 241 aa  127  1.0000000000000001e-28  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0034  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  29.46 
 
 		 276 aa  124  1e-27  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0620  taurine transport system permease protein TauC  31.98 
 
 		 245 aa  124  1e-27  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  hitchhiker  0.00071484  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7932  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.46 
 
 		 283 aa  124  2e-27  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1473  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  27.08 
 
 		 306 aa  124  2e-27  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0411979  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0393  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.46 
 
 		 253 aa  124  2e-27  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0876322  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1129  taurine transport system permease protein TauC  31.19 
 
 		 241 aa  123  2e-27  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.774255  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>