More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ajs_2832 on replicon NC_008782
Organism: Acidovorax sp. JS42



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008782  Ajs_2832  nitrate ABC transporter, inner membrane subunit  100 
 
 
313 aa  613  9.999999999999999e-175  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.442547 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2321  nitrate ABC transporter, inner membrane subunit  98.4 
 
 
313 aa  603  9.999999999999999e-173  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.539996  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2146  nitrate ABC transporter, inner membrane subunit  87.12 
 
 
315 aa  457  1e-127  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2555  nitrate transport permease  74.84 
 
 
314 aa  447  1.0000000000000001e-124  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.162104  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3523  nitrate ABC transporter, inner membrane subunit  72.01 
 
 
309 aa  427  1e-118  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.293551  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2376  nitrate ABC transporter, inner membrane subunit  90.7 
 
 
313 aa  423  1e-117  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1413  nitrate ABC transporter, inner membrane subunit  73.73 
 
 
311 aa  414  9.999999999999999e-116  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1391  NO3-/NO2- ABC transporter  70.19 
 
 
305 aa  412  1e-114  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.36361 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3268  nitrate transport permease  70.91 
 
 
328 aa  410  1e-113  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.321419  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2591  nitrate ABC transporter, inner membrane subunit  74.76 
 
 
328 aa  396  1e-109  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.0488842 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0326  nitrate transport permease  69.06 
 
 
295 aa  373  1e-102  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3842  nitrate ABC transporter, inner membrane subunit  74.9 
 
 
331 aa  370  1e-101  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0831  nitrate transport permease  66 
 
 
312 aa  370  1e-101  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.0203602 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0236  nitrate ABC transporter, inner membrane subunit  70 
 
 
283 aa  366  1e-100  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0257  nitrate ABC transporter, inner membrane subunit  69.49 
 
 
283 aa  365  1e-100  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.738144 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0380  putative nitrate transmembrane ABC transporter protein  68.66 
 
 
287 aa  363  2e-99  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.931268 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0329  nitrate transport permease  72.65 
 
 
300 aa  350  1e-95  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0276  nitrate transport permease  73.49 
 
 
303 aa  350  2e-95  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.21823 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2273  nitrate transport permease  70.45 
 
 
299 aa  346  3e-94  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1439  nitrate ABC transporter, inner membrane subunit  61.87 
 
 
310 aa  342  4e-93  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.062597  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2324  nitrate ABC transporter, inner membrane subunit  70.69 
 
 
293 aa  338  5.9999999999999996e-92  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2104  nitrate ABC transporter, inner membrane subunit  62.68 
 
 
283 aa  333  2e-90  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0291571  normal  0.0240092 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1542  nitrate ABC transporter, inner membrane subunit  60.54 
 
 
304 aa  332  7.000000000000001e-90  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.244375  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2732  nitrate ABC transporter, inner membrane subunit  62.86 
 
 
304 aa  326  3e-88  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0882865  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2908  nitrate ABC transporter, inner membrane subunit  64.48 
 
 
298 aa  318  7e-86  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.950821  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2496  nitrate ABC transporter, inner membrane subunit  70.26 
 
 
304 aa  307  2.0000000000000002e-82  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.546285  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1704  nitrate ABC transporter, inner membrane subunit  50.51 
 
 
311 aa  276  3e-73  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5896  nitrate ABC transporter permease protein  45.96 
 
 
297 aa  251  2e-65  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.149001  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0874  nitrate transport permease  49.6 
 
 
283 aa  243  3.9999999999999997e-63  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00348419  hitchhiker  0.00524559 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1147  nitrate ABC transporter, inner membrane subunit  51.72 
 
 
279 aa  241  1e-62  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.488584 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1306  nitrate ABC transporter, inner membrane subunit  51.29 
 
 
279 aa  239  4e-62  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4662  nitrate ABC transporter, inner membrane subunit  50.86 
 
 
279 aa  238  8e-62  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4395  nitrate ABC transporter, inner membrane subunit  47.66 
 
 
277 aa  238  1e-61  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4458  nitrate ABC transporter, inner membrane subunit  47.66 
 
 
277 aa  238  1e-61  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.698055  normal  0.534513 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0640  nitrate ABC transporter, inner membrane subunit  47.98 
 
 
279 aa  236  3e-61  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0666  nitrate ABC transporter, inner membrane subunit  43.31 
 
 
311 aa  236  3e-61  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0569164  decreased coverage  0.0039857 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3729  nitrate ABC transporter, inner membrane subunit  47.62 
 
 
280 aa  234  1.0000000000000001e-60  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0184404  normal  0.11569 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3675  nitrate ABC transporter, inner membrane subunit  47.62 
 
 
280 aa  234  1.0000000000000001e-60  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3486  nitrate ABC transporter permease protein  50.21 
 
 
295 aa  234  1.0000000000000001e-60  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.236914  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4471  nitrate ABC transporter, inner membrane subunit  48.19 
 
 
297 aa  234  2.0000000000000002e-60  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.5689 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5414  putative nitrate ABC transporter (permease protein) (ntrB-like protein)  48.5 
 
 
279 aa  234  2.0000000000000002e-60  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.481789  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2337  nitrate ABC transporter, inner membrane subunit  47.76 
 
 
282 aa  234  2.0000000000000002e-60  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2404  nitrate ABC transporter, inner membrane subunit  48.71 
 
 
279 aa  232  7.000000000000001e-60  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.105129  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2055  nitrate transport permease  48.71 
 
 
279 aa  232  7.000000000000001e-60  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.562067  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2503  nitrate ABC transporter, inner membrane subunit  47.69 
 
 
298 aa  231  2e-59  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2618  nitrate ABC transporter, inner membrane subunit  47.88 
 
 
279 aa  231  2e-59  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.234813 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4571  nitrate ABC transporter, inner membrane subunit  47.74 
 
 
280 aa  229  4e-59  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0055  nitrate ABC transporter, inner membrane subunit  43.57 
 
 
256 aa  228  8e-59  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2205  nitrate ABC transporter, inner membrane subunit  48.92 
 
 
280 aa  228  1e-58  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2588  nitrate ABC transporter, inner membrane subunit  46.52 
 
 
279 aa  227  2e-58  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00171927 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2819  nitrate transport permease protein (nrtB)  41.57 
 
 
304 aa  226  3e-58  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.233469  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0963  nitrate ABC transporter, inner membrane subunit  49.77 
 
 
281 aa  226  4e-58  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.563275 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6460  nitrate ABC transporter, inner membrane subunit  49.32 
 
 
297 aa  226  5.0000000000000005e-58  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.150998 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2171  nitrate transport permease  44.77 
 
 
272 aa  223  4e-57  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0149943  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4817  nitrate ABC transporter, inner membrane subunit  50.43 
 
 
279 aa  222  7e-57  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.775678  hitchhiker  0.00263828 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3526  nitrate ABC transporter, inner membrane subunit  45.83 
 
 
280 aa  221  9.999999999999999e-57  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.471487 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4958  nitrate ABC transporter, inner membrane subunit  45.53 
 
 
285 aa  221  9.999999999999999e-57  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.413837  normal  0.165118 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3744  nitrate ABC transporter, inner membrane subunit  46.38 
 
 
288 aa  221  9.999999999999999e-57  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.441454  normal  0.10243 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1026  nitrate transport permease  47.03 
 
 
279 aa  221  1.9999999999999999e-56  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.174596 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4495  nitrate ABC transporter, inner membrane subunit  45.53 
 
 
285 aa  220  3e-56  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5011  nitrate ABC transporter, inner membrane subunit  45.96 
 
 
286 aa  220  3e-56  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.312092  normal  0.320206 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3973  nitrate ABC transporter, inner membrane subunit  46.64 
 
 
295 aa  219  3.9999999999999997e-56  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.930991  normal  0.148208 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3654  nitrate transport permease  43.55 
 
 
273 aa  218  8.999999999999998e-56  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4541  nitrate transport permease  47.04 
 
 
279 aa  217  2.9999999999999998e-55  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1238  nitrate transport permease  46.51 
 
 
279 aa  214  9.999999999999999e-55  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1489  nitrate transport permease  43.25 
 
 
278 aa  213  2.9999999999999995e-54  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0291  nitrate transport permease  49.76 
 
 
287 aa  213  2.9999999999999995e-54  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1759  nitrate transport permease  44.68 
 
 
299 aa  211  1e-53  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0568232  normal  0.0125916 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3741  nitrate transport permease  49.05 
 
 
288 aa  211  1e-53  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0996  nitrate ABC transporter, inner membrane subunit  49.05 
 
 
286 aa  211  1e-53  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2597  nitrate ABC transporter, inner membrane subunit  44.54 
 
 
280 aa  206  4e-52  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2106  nitrate transport permease  46.44 
 
 
263 aa  206  4e-52  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.727969  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3520  nitrate ABC transporter, inner membrane subunit  44.54 
 
 
280 aa  206  4e-52  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4677  nitrate ABC transporter, inner membrane subunit  43.03 
 
 
279 aa  206  6e-52  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4924  nitrate ABC transporter, inner membrane subunit  41.42 
 
 
280 aa  204  1e-51  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.815767 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2265  2-isopropylmalate synthase  33.44 
 
 
337 aa  161  2e-38  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.20736  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1116  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.44 
 
 
320 aa  158  1e-37  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001608  nitrate ABC transporter permease protein  33.78 
 
 
321 aa  158  1e-37  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05589  hypothetical protein  33.78 
 
 
321 aa  158  1e-37  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0176  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.23 
 
 
330 aa  156  5.0000000000000005e-37  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.283757  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1083  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.46 
 
 
362 aa  155  1e-36  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3041  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.48 
 
 
356 aa  151  2e-35  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0454985  normal  0.816874 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1664  putative ABC transporter permease protein  30.29 
 
 
360 aa  148  1.0000000000000001e-34  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0453487  normal  0.0661868 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3315  putative nitrate ABC transporter, permease protein  31.99 
 
 
315 aa  147  2.0000000000000003e-34  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.286795  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03653  putative nitrate ABC transporter, permease protein  30.7 
 
 
349 aa  146  4.0000000000000006e-34  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2818  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.21 
 
 
323 aa  145  7.0000000000000006e-34  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0908348  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2935  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.68 
 
 
252 aa  143  3e-33  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2085  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.97 
 
 
319 aa  137  2e-31  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.0787698 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1154  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  32.9 
 
 
332 aa  137  3.0000000000000003e-31  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2416  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.96 
 
 
329 aa  132  5e-30  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.941924  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0145  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.34 
 
 
266 aa  130  4.0000000000000003e-29  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4201  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  28.17 
 
 
305 aa  125  6e-28  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1968  nitrate ABC transporter, permease component  36.5 
 
 
377 aa  125  6e-28  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.52047  normal  0.211755 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6154  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.08 
 
 
295 aa  126  6e-28  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0099  nitrate/nitrite/cyanate ABC transporter inner membrane protein  34.25 
 
 
277 aa  125  7e-28  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.291864  normal  0.355691 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1473  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  29.24 
 
 
306 aa  125  8.000000000000001e-28  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0411979  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6337  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.63 
 
 
275 aa  125  1e-27  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6514  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.26 
 
 
275 aa  124  2e-27  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6748  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.26 
 
 
275 aa  124  2e-27  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.133303 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1642  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.89 
 
 
231 aa  124  3e-27  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0324285  normal  0.0160388 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>