More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aave_2146 on replicon NC_008752
Organism: Acidovorax citrulli AAC00-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008752  Aave_2146  nitrate ABC transporter, inner membrane subunit  100 
 
 		 315 aa  616  1e-175  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2321  nitrate ABC transporter, inner membrane subunit  79.75 
 
 		 313 aa  466  9.999999999999999e-131  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.539996  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2832  nitrate ABC transporter, inner membrane subunit  79.43 
 
 		 313 aa  466  9.999999999999999e-131  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.442547 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2555  nitrate transport permease  76.73 
 
 		 314 aa  451  1e-125  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.162104  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2376  nitrate ABC transporter, inner membrane subunit  89.81 
 
 		 313 aa  431  1e-120  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3523  nitrate ABC transporter, inner membrane subunit  73.02 
 
 		 309 aa  429  1e-119  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.293551  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1413  nitrate ABC transporter, inner membrane subunit  75.24 
 
 		 311 aa  425  1e-118  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1391  NO3-/NO2- ABC transporter  71.88 
 
 		 305 aa  418  1e-116  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.36361 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3268  nitrate transport permease  74.01 
 
 		 328 aa  416  9.999999999999999e-116  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.321419  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2591  nitrate ABC transporter, inner membrane subunit  82.71 
 
 		 328 aa  398  9.999999999999999e-111  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.0488842 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0257  nitrate ABC transporter, inner membrane subunit  69.31 
 
 		 283 aa  378  1e-104  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.738144 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0236  nitrate ABC transporter, inner membrane subunit  69.68 
 
 		 283 aa  379  1e-104  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0380  putative nitrate transmembrane ABC transporter protein  66.67 
 
 		 287 aa  374  1e-103  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.931268 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0326  nitrate transport permease  67.48 
 
 		 295 aa  374  1e-102  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3842  nitrate ABC transporter, inner membrane subunit  73.28 
 
 		 331 aa  372  1e-102  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0831  nitrate transport permease  66.1 
 
 		 312 aa  363  2e-99  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.0203602 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0276  nitrate transport permease  73.31 
 
 		 303 aa  358  8e-98  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.21823 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0329  nitrate transport permease  71.65 
 
 		 300 aa  350  1e-95  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2273  nitrate transport permease  62.5 
 
 		 299 aa  350  2e-95  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2324  nitrate ABC transporter, inner membrane subunit  70.64 
 
 		 293 aa  348  9e-95  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1439  nitrate ABC transporter, inner membrane subunit  60.51 
 
 		 310 aa  343  2.9999999999999997e-93  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.062597  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2732  nitrate ABC transporter, inner membrane subunit  62.12 
 
 		 304 aa  336  1.9999999999999998e-91  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0882865  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1542  nitrate ABC transporter, inner membrane subunit  62.76 
 
 		 304 aa  337  1.9999999999999998e-91  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.244375  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2104  nitrate ABC transporter, inner membrane subunit  60.57 
 
 		 283 aa  332  4e-90  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0291571  normal  0.0240092 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2908  nitrate ABC transporter, inner membrane subunit  63.18 
 
 		 298 aa  323  3e-87  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.950821  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2496  nitrate ABC transporter, inner membrane subunit  61.54 
 
 		 304 aa  318  9e-86  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.546285  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1704  nitrate ABC transporter, inner membrane subunit  49.67 
 
 		 311 aa  288  8e-77  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5896  nitrate ABC transporter permease protein  43.39 
 
 		 297 aa  247  2e-64  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.149001  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0874  nitrate transport permease  49.38 
 
 		 283 aa  244  9.999999999999999e-64  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00348419  hitchhiker  0.00524559 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0666  nitrate ABC transporter, inner membrane subunit  45.42 
 
 		 311 aa  244  1.9999999999999999e-63  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0569164  decreased coverage  0.0039857 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4471  nitrate ABC transporter, inner membrane subunit  49.37 
 
 		 297 aa  241  1e-62  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.5689 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4395  nitrate ABC transporter, inner membrane subunit  48.09 
 
 		 277 aa  241  2e-62  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4458  nitrate ABC transporter, inner membrane subunit  48.09 
 
 		 277 aa  241  2e-62  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.698055  normal  0.534513 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3675  nitrate ABC transporter, inner membrane subunit  47.37 
 
 		 280 aa  237  2e-61  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3729  nitrate ABC transporter, inner membrane subunit  47.37 
 
 		 280 aa  237  2e-61  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0184404  normal  0.11569 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0055  nitrate ABC transporter, inner membrane subunit  44.4 
 
 		 256 aa  237  2e-61  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0640  nitrate ABC transporter, inner membrane subunit  46.77 
 
 		 279 aa  237  2e-61  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2205  nitrate ABC transporter, inner membrane subunit  48.92 
 
 		 280 aa  236  3e-61  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2503  nitrate ABC transporter, inner membrane subunit  47.25 
 
 		 298 aa  236  3e-61  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2819  nitrate transport permease protein (nrtB)  42.64 
 
 		 304 aa  232  6e-60  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.233469  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0963  nitrate ABC transporter, inner membrane subunit  50.23 
 
 		 281 aa  232  6e-60  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.563275 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6460  nitrate ABC transporter, inner membrane subunit  49.57 
 
 		 297 aa  232  8.000000000000001e-60  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.150998 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1147  nitrate ABC transporter, inner membrane subunit  47.62 
 
 		 279 aa  231  1e-59  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.488584 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4571  nitrate ABC transporter, inner membrane subunit  48.18 
 
 		 280 aa  230  2e-59  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4958  nitrate ABC transporter, inner membrane subunit  43.17 
 
 		 285 aa  231  2e-59  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.413837  normal  0.165118 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3486  nitrate ABC transporter permease protein  47.62 
 
 		 295 aa  230  3e-59  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.236914  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2588  nitrate ABC transporter, inner membrane subunit  46.09 
 
 		 279 aa  229  3e-59  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00171927 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4495  nitrate ABC transporter, inner membrane subunit  43.17 
 
 		 285 aa  229  3e-59  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1306  nitrate ABC transporter, inner membrane subunit  47.19 
 
 		 279 aa  229  4e-59  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4662  nitrate ABC transporter, inner membrane subunit  46.75 
 
 		 279 aa  228  7e-59  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2171  nitrate transport permease  45.78 
 
 		 272 aa  228  1e-58  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0149943  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1026  nitrate transport permease  46.53 
 
 		 279 aa  227  2e-58  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.174596 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3526  nitrate ABC transporter, inner membrane subunit  45.06 
 
 		 280 aa  227  2e-58  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.471487 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5011  nitrate ABC transporter, inner membrane subunit  44.98 
 
 		 286 aa  227  2e-58  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.312092  normal  0.320206 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5414  putative nitrate ABC transporter (permease protein) (ntrB-like protein)  45.06 
 
 		 279 aa  226  3e-58  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.481789  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3744  nitrate ABC transporter, inner membrane subunit  46.81 
 
 		 288 aa  226  3e-58  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.441454  normal  0.10243 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2055  nitrate transport permease  45.89 
 
 		 279 aa  226  3e-58  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.562067  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2618  nitrate ABC transporter, inner membrane subunit  46.67 
 
 		 279 aa  225  6e-58  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.234813 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2337  nitrate ABC transporter, inner membrane subunit  43.58 
 
 		 282 aa  224  1e-57  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2404  nitrate ABC transporter, inner membrane subunit  45.45 
 
 		 279 aa  223  4e-57  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.105129  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1759  nitrate transport permease  42.56 
 
 		 299 aa  222  8e-57  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0568232  normal  0.0125916 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0996  nitrate ABC transporter, inner membrane subunit  47.98 
 
 		 286 aa  219  3e-56  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0291  nitrate transport permease  48.85 
 
 		 287 aa  219  5e-56  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2597  nitrate ABC transporter, inner membrane subunit  45.78 
 
 		 280 aa  217  2e-55  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3520  nitrate ABC transporter, inner membrane subunit  45.78 
 
 		 280 aa  217  2e-55  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3973  nitrate ABC transporter, inner membrane subunit  46.67 
 
 		 295 aa  217  2e-55  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.930991  normal  0.148208 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3654  nitrate transport permease  43.15 
 
 		 273 aa  216  5e-55  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3741  nitrate transport permease  48.1 
 
 		 288 aa  215  9.999999999999999e-55  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4817  nitrate ABC transporter, inner membrane subunit  46.98 
 
 		 279 aa  213  2.9999999999999995e-54  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.775678  hitchhiker  0.00263828 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4541  nitrate transport permease  46.25 
 
 		 279 aa  213  3.9999999999999995e-54  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4677  nitrate ABC transporter, inner membrane subunit  41.57 
 
 		 279 aa  213  3.9999999999999995e-54  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1489  nitrate transport permease  44.35 
 
 		 278 aa  209  6e-53  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1238  nitrate transport permease  43.59 
 
 		 279 aa  206  5e-52  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4924  nitrate ABC transporter, inner membrane subunit  42.35 
 
 		 280 aa  204  2e-51  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.815767 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2106  nitrate transport permease  46.44 
 
 		 263 aa  203  3e-51  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.727969  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2265  2-isopropylmalate synthase  32.4 
 
 		 337 aa  166  5e-40  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.20736  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001608  nitrate ABC transporter permease protein  34.45 
 
 		 321 aa  165  1.0000000000000001e-39  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1116  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.08 
 
 		 320 aa  164  1.0000000000000001e-39  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05589  hypothetical protein  33.78 
 
 		 321 aa  165  1.0000000000000001e-39  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1083  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.92 
 
 		 362 aa  161  1e-38  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1664  putative ABC transporter permease protein  31.43 
 
 		 360 aa  154  2e-36  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0453487  normal  0.0661868 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3315  putative nitrate ABC transporter, permease protein  31.61 
 
 		 315 aa  151  1e-35  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.286795  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0176  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.74 
 
 		 330 aa  151  1e-35  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.283757  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03653  putative nitrate ABC transporter, permease protein  31.2 
 
 		 349 aa  150  2e-35  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3041  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.18 
 
 		 356 aa  147  2.0000000000000003e-34  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0454985  normal  0.816874 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2818  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.77 
 
 		 323 aa  145  9e-34  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0908348  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2935  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.27 
 
 		 252 aa  140  1.9999999999999998e-32  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2416  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.44 
 
 		 329 aa  139  3.9999999999999997e-32  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.941924  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1154  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  34.13 
 
 		 332 aa  137  3.0000000000000003e-31  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2085  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  28.29 
 
 		 319 aa  134  1.9999999999999998e-30  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0787698 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1473  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  28.14 
 
 		 306 aa  129  6e-29  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0411979  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0145  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.43 
 
 		 266 aa  129  8.000000000000001e-29  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0099  nitrate/nitrite/cyanate ABC transporter inner membrane protein  32.12 
 
 		 277 aa  125  1e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.291864  normal  0.355691 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4201  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  27.94 
 
 		 305 aa  125  1e-27  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0034  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  31.8 
 
 		 276 aa  124  2e-27  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_16930  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport system, permease component  29.24 
 
 		 322 aa  123  3e-27  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.327  normal  0.410158 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0464  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.8 
 
 		 288 aa  123  4e-27  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.349721  hitchhiker  0.00645779 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1642  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.25 
 
 		 231 aa  123  4e-27  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0324285  normal  0.0160388 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3612  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.4 
 
 		 276 aa  122  5e-27  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2216  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.25 
 
 		 314 aa  122  6e-27  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.82677  normal  0.484673 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>