More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spro_2908 on replicon NC_009832
Organism: Serratia proteamaculans 568



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009832  Spro_2908  nitrate ABC transporter, inner membrane subunit  100 
 
 		 298 aa  579  1e-164  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.950821  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1542  nitrate ABC transporter, inner membrane subunit  77.12 
 
 		 304 aa  417  9.999999999999999e-116  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.244375  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2732  nitrate ABC transporter, inner membrane subunit  77.78 
 
 		 304 aa  417  9.999999999999999e-116  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0882865  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1439  nitrate ABC transporter, inner membrane subunit  78.93 
 
 		 310 aa  407  1.0000000000000001e-112  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.062597  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2324  nitrate ABC transporter, inner membrane subunit  78.12 
 
 		 293 aa  399  9.999999999999999e-111  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2496  nitrate ABC transporter, inner membrane subunit  88.56 
 
 		 304 aa  383  1e-105  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.546285  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0236  nitrate ABC transporter, inner membrane subunit  74.09 
 
 		 283 aa  369  1e-101  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0257  nitrate ABC transporter, inner membrane subunit  74.09 
 
 		 283 aa  369  1e-101  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.738144 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1391  NO3-/NO2- ABC transporter  66.2 
 
 		 305 aa  368  1e-101  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.36361 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0380  putative nitrate transmembrane ABC transporter protein  70.38 
 
 		 287 aa  367  1e-100  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.931268 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3842  nitrate ABC transporter, inner membrane subunit  73.25 
 
 		 331 aa  357  9.999999999999999e-98  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0831  nitrate transport permease  65.29 
 
 		 312 aa  357  9.999999999999999e-98  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.0203602 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2104  nitrate ABC transporter, inner membrane subunit  65.11 
 
 		 283 aa  356  1.9999999999999998e-97  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0291571  normal  0.0240092 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0276  nitrate transport permease  73.9 
 
 		 303 aa  354  1e-96  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.21823 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2146  nitrate ABC transporter, inner membrane subunit  70.33 
 
 		 315 aa  352  4e-96  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0329  nitrate transport permease  69.96 
 
 		 300 aa  350  2e-95  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2273  nitrate transport permease  64.85 
 
 		 299 aa  350  2e-95  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3523  nitrate ABC transporter, inner membrane subunit  64.89 
 
 		 309 aa  347  1e-94  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.293551  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0326  nitrate transport permease  63.87 
 
 		 295 aa  345  6e-94  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2832  nitrate ABC transporter, inner membrane subunit  72.61 
 
 		 313 aa  342  2.9999999999999997e-93  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.442547 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2321  nitrate ABC transporter, inner membrane subunit  72.61 
 
 		 313 aa  342  4e-93  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.539996  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1413  nitrate ABC transporter, inner membrane subunit  71.67 
 
 		 311 aa  336  2.9999999999999997e-91  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2555  nitrate transport permease  67.89 
 
 		 314 aa  332  4e-90  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.162104  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2376  nitrate ABC transporter, inner membrane subunit  73.5 
 
 		 313 aa  331  1e-89  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3268  nitrate transport permease  69.53 
 
 		 328 aa  322  6e-87  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.321419  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2591  nitrate ABC transporter, inner membrane subunit  71.05 
 
 		 328 aa  314  9e-85  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.0488842 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1704  nitrate ABC transporter, inner membrane subunit  49.5 
 
 		 311 aa  280  3e-74  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0055  nitrate ABC transporter, inner membrane subunit  48.57 
 
 		 256 aa  241  1e-62  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0640  nitrate ABC transporter, inner membrane subunit  52.91 
 
 		 279 aa  237  2e-61  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0874  nitrate transport permease  53.22 
 
 		 283 aa  234  2.0000000000000002e-60  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00348419  hitchhiker  0.00524559 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2205  nitrate ABC transporter, inner membrane subunit  51.09 
 
 		 280 aa  232  5e-60  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4395  nitrate ABC transporter, inner membrane subunit  46.72 
 
 		 277 aa  229  4e-59  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2337  nitrate ABC transporter, inner membrane subunit  45.45 
 
 		 282 aa  229  4e-59  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4458  nitrate ABC transporter, inner membrane subunit  46.72 
 
 		 277 aa  229  4e-59  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.698055  normal  0.534513 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4471  nitrate ABC transporter, inner membrane subunit  48.37 
 
 		 297 aa  227  2e-58  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.5689 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3729  nitrate ABC transporter, inner membrane subunit  51.34 
 
 		 280 aa  226  4e-58  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0184404  normal  0.11569 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3675  nitrate ABC transporter, inner membrane subunit  51.34 
 
 		 280 aa  226  4e-58  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2171  nitrate transport permease  46.93 
 
 		 272 aa  225  8e-58  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0149943  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5896  nitrate ABC transporter permease protein  45.77 
 
 		 297 aa  224  2e-57  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.149001  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4571  nitrate ABC transporter, inner membrane subunit  44.19 
 
 		 280 aa  223  4e-57  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2588  nitrate ABC transporter, inner membrane subunit  45.58 
 
 		 279 aa  223  4e-57  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00171927 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3486  nitrate ABC transporter permease protein  51.42 
 
 		 295 aa  223  4e-57  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.236914  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3526  nitrate ABC transporter, inner membrane subunit  47.52 
 
 		 280 aa  221  8e-57  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.471487 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1026  nitrate transport permease  46.36 
 
 		 279 aa  221  9.999999999999999e-57  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.174596 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1147  nitrate ABC transporter, inner membrane subunit  47.21 
 
 		 279 aa  221  1.9999999999999999e-56  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.488584 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2503  nitrate ABC transporter, inner membrane subunit  52.61 
 
 		 298 aa  220  1.9999999999999999e-56  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4662  nitrate ABC transporter, inner membrane subunit  46.35 
 
 		 279 aa  220  3e-56  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6460  nitrate ABC transporter, inner membrane subunit  43.69 
 
 		 297 aa  219  3.9999999999999997e-56  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.150998 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1306  nitrate ABC transporter, inner membrane subunit  47.21 
 
 		 279 aa  219  3.9999999999999997e-56  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0963  nitrate ABC transporter, inner membrane subunit  47.53 
 
 		 281 aa  219  5e-56  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.563275 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2106  nitrate transport permease  48.81 
 
 		 263 aa  218  1e-55  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.727969  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2618  nitrate ABC transporter, inner membrane subunit  50.24 
 
 		 279 aa  218  1e-55  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.234813 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2404  nitrate ABC transporter, inner membrane subunit  49.76 
 
 		 279 aa  215  5.9999999999999996e-55  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.105129  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0996  nitrate ABC transporter, inner membrane subunit  47.16 
 
 		 286 aa  215  8e-55  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3973  nitrate ABC transporter, inner membrane subunit  47.14 
 
 		 295 aa  215  8e-55  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.930991  normal  0.148208 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2819  nitrate transport permease protein (nrtB)  40.77 
 
 		 304 aa  214  9.999999999999999e-55  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.233469  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2055  nitrate transport permease  49.28 
 
 		 279 aa  214  1.9999999999999998e-54  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.562067  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3654  nitrate transport permease  40.07 
 
 		 273 aa  212  4.9999999999999996e-54  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5414  putative nitrate ABC transporter (permease protein) (ntrB-like protein)  47.34 
 
 		 279 aa  212  4.9999999999999996e-54  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.481789  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3744  nitrate ABC transporter, inner membrane subunit  45.95 
 
 		 288 aa  211  1e-53  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.441454  normal  0.10243 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3741  nitrate transport permease  47.35 
 
 		 288 aa  211  1e-53  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0666  nitrate ABC transporter, inner membrane subunit  40.28 
 
 		 311 aa  209  4e-53  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0569164  decreased coverage  0.0039857 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4958  nitrate ABC transporter, inner membrane subunit  42.26 
 
 		 285 aa  209  4e-53  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.413837  normal  0.165118 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4677  nitrate ABC transporter, inner membrane subunit  44.49 
 
 		 279 aa  208  8e-53  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4495  nitrate ABC transporter, inner membrane subunit  42.26 
 
 		 285 aa  207  1e-52  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5011  nitrate ABC transporter, inner membrane subunit  44.89 
 
 		 286 aa  206  3e-52  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.312092  normal  0.320206 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0291  nitrate transport permease  44.98 
 
 		 287 aa  206  5e-52  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1489  nitrate transport permease  45.49 
 
 		 278 aa  205  9e-52  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4924  nitrate ABC transporter, inner membrane subunit  45.83 
 
 		 280 aa  203  3e-51  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.815767 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2597  nitrate ABC transporter, inner membrane subunit  44.54 
 
 		 280 aa  202  8e-51  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4817  nitrate ABC transporter, inner membrane subunit  45.06 
 
 		 279 aa  201  9.999999999999999e-51  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.775678  hitchhiker  0.00263828 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3520  nitrate ABC transporter, inner membrane subunit  44.12 
 
 		 280 aa  201  9.999999999999999e-51  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4541  nitrate transport permease  46.8 
 
 		 279 aa  199  3.9999999999999996e-50  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1238  nitrate transport permease  42.97 
 
 		 279 aa  193  3e-48  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1759  nitrate transport permease  41.53 
 
 		 299 aa  192  5e-48  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0568232  normal  0.0125916 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1116  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.95 
 
 		 320 aa  164  2.0000000000000002e-39  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001608  nitrate ABC transporter permease protein  41.35 
 
 		 321 aa  162  8.000000000000001e-39  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05589  hypothetical protein  41.35 
 
 		 321 aa  162  9e-39  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0176  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.56 
 
 		 330 aa  157  2e-37  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.283757  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3315  putative nitrate ABC transporter, permease protein  39.61 
 
 		 315 aa  156  4e-37  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.286795  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1664  putative ABC transporter permease protein  36.32 
 
 		 360 aa  155  1e-36  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0453487  normal  0.0661868 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2818  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.71 
 
 		 323 aa  153  2.9999999999999998e-36  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0908348  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3041  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.11 
 
 		 356 aa  153  2.9999999999999998e-36  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0454985  normal  0.816874 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1154  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  35.14 
 
 		 332 aa  151  2e-35  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2265  2-isopropylmalate synthase  36.32 
 
 		 337 aa  151  2e-35  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.20736  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03653  putative nitrate ABC transporter, permease protein  39.9 
 
 		 349 aa  150  3e-35  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2935  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.83 
 
 		 252 aa  149  4e-35  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2416  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.81 
 
 		 329 aa  149  7e-35  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.941924  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1083  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.46 
 
 		 362 aa  147  2.0000000000000003e-34  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4201  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.47 
 
 		 305 aa  145  7.0000000000000006e-34  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2085  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.03 
 
 		 319 aa  145  1e-33  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0787698 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0145  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.2 
 
 		 266 aa  143  3e-33  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1473  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  31.2 
 
 		 306 aa  143  4e-33  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0411979  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6154  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.96 
 
 		 295 aa  139  6e-32  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0512  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.84 
 
 		 253 aa  137  3.0000000000000003e-31  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0099  nitrate/nitrite/cyanate ABC transporter inner membrane protein  36.08 
 
 		 277 aa  135  9.999999999999999e-31  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.291864  normal  0.355691 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0208  nitrate ABC transporter, permease protein, putative  32.33 
 
 		 260 aa  131  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.473726 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0034  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  35.08 
 
 		 276 aa  129  6e-29  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0697  taurine ABC transporter, permease protein  32.03 
 
 		 283 aa  128  1.0000000000000001e-28  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2019  taurine ABC transporter, permease protein  32.03 
 
 		 285 aa  128  1.0000000000000001e-28  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.484134  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>