More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bxe_C0099 on replicon NC_007953
Organism: Burkholderia xenovorans LB400



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007953  Bxe_C0099  nitrate/nitrite/cyanate ABC transporter inner membrane protein  100 
 
 
277 aa  531  1e-150  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.291864  normal  0.355691 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1541  nitrate/sulfonate/bicarbonate ABC transporter inner membrane protein  84.68 
 
 
281 aa  409  1e-113  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6514  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  62.64 
 
 
275 aa  320  1.9999999999999998e-86  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6748  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  62.64 
 
 
275 aa  320  1.9999999999999998e-86  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.133303 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6337  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  66.53 
 
 
275 aa  315  6e-85  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2098  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  62.73 
 
 
251 aa  255  5e-67  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.660602 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3635  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  62.27 
 
 
251 aa  254  1.0000000000000001e-66  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.606268  normal  0.873181 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5822  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  62.39 
 
 
241 aa  250  2e-65  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.367586  normal  0.455347 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2277  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  62.27 
 
 
251 aa  250  2e-65  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.554921 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0456  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  60.45 
 
 
285 aa  246  3e-64  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007595  Synpcc7942_B2630  sulfonate ABC transporter, permease protein, putative  54.17 
 
 
266 aa  227  2e-58  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.312135  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2932  ABC transporter permease  61.34 
 
 
254 aa  219  5e-56  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.451747  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_34520  ABC transporter permease  61.34 
 
 
254 aa  219  5e-56  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.132889  normal  0.0672965 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1455  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  54.3 
 
 
269 aa  215  5.9999999999999996e-55  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0865715  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0034  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  44.23 
 
 
276 aa  209  4e-53  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0966  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  45.87 
 
 
279 aa  197  1.0000000000000001e-49  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.136509 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0145  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.16 
 
 
266 aa  196  3e-49  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0309  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  43.39 
 
 
277 aa  190  2e-47  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.409097 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2835  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  42.28 
 
 
276 aa  185  5e-46  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3868  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  50 
 
 
285 aa  183  3e-45  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.03471 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3486  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  49.5 
 
 
285 aa  181  9.000000000000001e-45  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3794  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  50 
 
 
285 aa  181  1e-44  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.185627 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2935  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.31 
 
 
252 aa  148  1.0000000000000001e-34  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2803  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.54 
 
 
259 aa  142  4e-33  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00122675  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0640  nitrate ABC transporter, inner membrane subunit  33.74 
 
 
279 aa  142  9e-33  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0326  nitrate transport permease  32.1 
 
 
295 aa  138  1e-31  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3842  nitrate ABC transporter, inner membrane subunit  32.79 
 
 
331 aa  137  2e-31  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2324  nitrate ABC transporter, inner membrane subunit  37.11 
 
 
293 aa  137  2e-31  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1974  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  33.6 
 
 
261 aa  135  9.999999999999999e-31  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000000226251  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1704  nitrate ABC transporter, inner membrane subunit  36.08 
 
 
311 aa  134  1.9999999999999998e-30  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3643  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.33 
 
 
252 aa  134  1.9999999999999998e-30  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000799696  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2273  nitrate transport permease  33.85 
 
 
299 aa  133  3e-30  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0159  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.28 
 
 
253 aa  133  3.9999999999999996e-30  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0164  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.28 
 
 
253 aa  133  3.9999999999999996e-30  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1391  NO3-/NO2- ABC transporter  33.68 
 
 
305 aa  131  1.0000000000000001e-29  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.36361 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2104  nitrate ABC transporter, inner membrane subunit  35.6 
 
 
283 aa  131  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0291571  normal  0.0240092 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3486  nitrate ABC transporter permease protein  38.33 
 
 
295 aa  130  2.0000000000000002e-29  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.236914  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2171  nitrate transport permease  34.38 
 
 
272 aa  130  2.0000000000000002e-29  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0149943  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0257  nitrate ABC transporter, inner membrane subunit  35.42 
 
 
283 aa  130  2.0000000000000002e-29  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.738144 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0236  nitrate ABC transporter, inner membrane subunit  35.42 
 
 
283 aa  130  2.0000000000000002e-29  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1439  nitrate ABC transporter, inner membrane subunit  37.11 
 
 
310 aa  129  4.0000000000000003e-29  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.062597  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2055  nitrate transport permease  35.48 
 
 
279 aa  129  4.0000000000000003e-29  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.562067  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0380  putative nitrate transmembrane ABC transporter protein  34.38 
 
 
287 aa  129  6e-29  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.931268 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0291  nitrate transport permease  33 
 
 
287 aa  129  7.000000000000001e-29  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2205  nitrate ABC transporter, inner membrane subunit  33.51 
 
 
280 aa  129  7.000000000000001e-29  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0233  ABC transporter, permease protein  32.38 
 
 
241 aa  128  1.0000000000000001e-28  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5414  putative nitrate ABC transporter (permease protein) (ntrB-like protein)  33 
 
 
279 aa  127  1.0000000000000001e-28  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.481789  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3973  nitrate ABC transporter, inner membrane subunit  34.54 
 
 
295 aa  127  2.0000000000000002e-28  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.930991  normal  0.148208 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1147  nitrate ABC transporter, inner membrane subunit  35 
 
 
279 aa  127  2.0000000000000002e-28  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.488584 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3741  nitrate transport permease  32.5 
 
 
288 aa  127  2.0000000000000002e-28  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2404  nitrate ABC transporter, inner membrane subunit  34.95 
 
 
279 aa  127  3e-28  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.105129  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4662  nitrate ABC transporter, inner membrane subunit  35.56 
 
 
279 aa  126  4.0000000000000003e-28  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0831  nitrate transport permease  33.68 
 
 
312 aa  126  4.0000000000000003e-28  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.0203602 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1026  nitrate transport permease  36.7 
 
 
279 aa  126  5e-28  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.174596 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1306  nitrate ABC transporter, inner membrane subunit  35 
 
 
279 aa  125  5e-28  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1129  taurine transport system permease protein TauC  33.33 
 
 
241 aa  126  5e-28  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.774255  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2321  nitrate ABC transporter, inner membrane subunit  34.25 
 
 
313 aa  125  6e-28  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.539996  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2832  nitrate ABC transporter, inner membrane subunit  32.64 
 
 
313 aa  125  6e-28  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.442547 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2618  nitrate ABC transporter, inner membrane subunit  34 
 
 
279 aa  125  8.000000000000001e-28  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.234813 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2496  nitrate ABC transporter, inner membrane subunit  36.08 
 
 
304 aa  125  9e-28  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.546285  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0276  nitrate transport permease  32.98 
 
 
303 aa  125  9e-28  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.21823 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2146  nitrate ABC transporter, inner membrane subunit  32.12 
 
 
315 aa  124  1e-27  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0963  nitrate ABC transporter, inner membrane subunit  34.44 
 
 
281 aa  124  2e-27  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.563275 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4458  nitrate ABC transporter, inner membrane subunit  32.8 
 
 
277 aa  123  3e-27  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.698055  normal  0.534513 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4395  nitrate ABC transporter, inner membrane subunit  32.8 
 
 
277 aa  123  3e-27  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6545  ABC transporter permease  36.32 
 
 
269 aa  123  3e-27  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.276106 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0996  nitrate ABC transporter, inner membrane subunit  34.38 
 
 
286 aa  123  3e-27  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0620  taurine transport system permease protein TauC  30.28 
 
 
245 aa  123  3e-27  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  hitchhiker  0.00071484  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7932  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.3 
 
 
283 aa  123  4e-27  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2588  nitrate ABC transporter, inner membrane subunit  33.68 
 
 
279 aa  123  4e-27  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00171927 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0329  nitrate transport permease  34.02 
 
 
300 aa  122  5e-27  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4641  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.91 
 
 
277 aa  122  5e-27  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.750363  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4677  nitrate ABC transporter, inner membrane subunit  35.75 
 
 
279 aa  122  7e-27  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3869  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.59 
 
 
274 aa  122  8e-27  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0464  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.84 
 
 
288 aa  121  9.999999999999999e-27  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.349721  hitchhiker  0.00645779 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1413  nitrate ABC transporter, inner membrane subunit  33.15 
 
 
311 aa  121  9.999999999999999e-27  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2732  nitrate ABC transporter, inner membrane subunit  35.57 
 
 
304 aa  120  1.9999999999999998e-26  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0882865  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3654  nitrate transport permease  33.15 
 
 
273 aa  120  1.9999999999999998e-26  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0397  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.32 
 
 
285 aa  120  1.9999999999999998e-26  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.987071 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1489  nitrate transport permease  30.91 
 
 
278 aa  120  1.9999999999999998e-26  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1542  nitrate ABC transporter, inner membrane subunit  35.57 
 
 
304 aa  120  1.9999999999999998e-26  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.244375  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0802  taurine ABC transporter, permease protein  35.29 
 
 
283 aa  120  1.9999999999999998e-26  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.207449  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1488  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  37.37 
 
 
280 aa  120  1.9999999999999998e-26  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.106569  normal  0.790334 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3526  nitrate ABC transporter, inner membrane subunit  32.26 
 
 
280 aa  120  3.9999999999999996e-26  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.471487 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3478  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.87 
 
 
291 aa  119  4.9999999999999996e-26  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.466071  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1642  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.32 
 
 
231 aa  119  4.9999999999999996e-26  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0324285  normal  0.0160388 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5011  nitrate ABC transporter, inner membrane subunit  32.8 
 
 
286 aa  119  6e-26  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.312092  normal  0.320206 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3744  nitrate ABC transporter, inner membrane subunit  33.33 
 
 
288 aa  118  9e-26  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.441454  normal  0.10243 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0874  nitrate transport permease  34.46 
 
 
283 aa  118  9.999999999999999e-26  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00348419  hitchhiker  0.00524559 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0254  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  34.02 
 
 
279 aa  118  9.999999999999999e-26  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.57663 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2555  nitrate transport permease  32.64 
 
 
314 aa  118  9.999999999999999e-26  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.162104  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3268  nitrate transport permease  32.6 
 
 
328 aa  118  9.999999999999999e-26  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.321419  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3729  nitrate ABC transporter, inner membrane subunit  32.95 
 
 
280 aa  118  9.999999999999999e-26  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0184404  normal  0.11569 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3675  nitrate ABC transporter, inner membrane subunit  32.95 
 
 
280 aa  118  9.999999999999999e-26  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2553  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.4 
 
 
275 aa  117  9.999999999999999e-26  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4958  nitrate ABC transporter, inner membrane subunit  32.8 
 
 
285 aa  117  1.9999999999999998e-25  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.413837  normal  0.165118 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4495  nitrate ABC transporter, inner membrane subunit  32.8 
 
 
285 aa  117  1.9999999999999998e-25  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0735  nitrate/sulfonate/bicarbonate ABC transporter inner membrane protein  35.2 
 
 
273 aa  117  1.9999999999999998e-25  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.714635  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4571  nitrate ABC transporter, inner membrane subunit  32.47 
 
 
280 aa  117  1.9999999999999998e-25  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4214  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.45 
 
 
281 aa  117  1.9999999999999998e-25  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>