More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfum_1642 on replicon NC_008554
Organism: Syntrophobacter fumaroxidans MPOB



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008554  Sfum_1642  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  100 
 
 
231 aa  461  1e-129  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0324285  normal  0.0160388 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2935  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  50 
 
 
252 aa  212  3.9999999999999995e-54  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2803  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  43.18 
 
 
259 aa  183  2.0000000000000003e-45  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00122675  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1974  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  42.47 
 
 
261 aa  181  1e-44  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000000226251  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3869  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  44.56 
 
 
274 aa  179  2.9999999999999997e-44  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1900  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  44.7 
 
 
252 aa  179  4e-44  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.128113  hitchhiker  0.000000000000910228 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1734  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.94 
 
 
252 aa  173  1.9999999999999998e-42  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2152  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  41 
 
 
271 aa  162  4.0000000000000004e-39  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.529987 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1129  taurine transport system permease protein TauC  41.96 
 
 
241 aa  162  6e-39  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.774255  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1422  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.5 
 
 
273 aa  161  7e-39  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1261  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.5 
 
 
273 aa  161  7e-39  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.306936 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1211  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41 
 
 
273 aa  160  2e-38  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.132759  normal  0.452833 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4641  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  42.31 
 
 
277 aa  159  4e-38  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.750363  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0464  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  44.07 
 
 
288 aa  158  6e-38  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.349721  hitchhiker  0.00645779 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0233  ABC transporter, permease protein  40.65 
 
 
241 aa  158  6e-38  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0436  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  43.26 
 
 
255 aa  158  8e-38  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0448966  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0397  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  43.01 
 
 
285 aa  158  9e-38  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.987071 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0512  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.84 
 
 
253 aa  157  1e-37  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7932  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37 
 
 
283 aa  156  2e-37  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0164  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.35 
 
 
253 aa  156  2e-37  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0640  nitrate ABC transporter, inner membrane subunit  42.39 
 
 
279 aa  157  2e-37  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0159  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.35 
 
 
253 aa  156  2e-37  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4051  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.5 
 
 
273 aa  156  3e-37  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.395379 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0735  nitrate/sulfonate/bicarbonate ABC transporter inner membrane protein  36.44 
 
 
273 aa  154  8e-37  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.714635  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3807  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  43.08 
 
 
269 aa  152  2.9999999999999998e-36  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3891  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  43.08 
 
 
269 aa  152  2.9999999999999998e-36  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3750  ABC nitrate/sulfonate/bicarbonate transporter, inner membrane subunit  43.08 
 
 
269 aa  152  4e-36  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6545  ABC transporter permease  39.59 
 
 
269 aa  152  4e-36  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.276106 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5146  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.52 
 
 
277 aa  151  7e-36  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0887356  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0145  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.73 
 
 
266 aa  151  8e-36  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2404  nitrate ABC transporter, inner membrane subunit  36.12 
 
 
279 aa  150  1e-35  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.105129  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1957  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  43.9 
 
 
273 aa  150  1e-35  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1848  ABC transporter permease  43.9 
 
 
273 aa  150  1e-35  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3058  taurine ABC transporter, permease protein  35.4 
 
 
274 aa  150  2e-35  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2205  nitrate ABC transporter, inner membrane subunit  39.6 
 
 
280 aa  150  2e-35  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1076  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.91 
 
 
269 aa  150  2e-35  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.406887  normal  0.454808 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1575  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.54 
 
 
254 aa  149  3e-35  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0747147  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4508  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  42.71 
 
 
277 aa  149  4e-35  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.854714  normal  0.909107 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0291  nitrate transport permease  36.89 
 
 
287 aa  149  4e-35  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0992  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.58 
 
 
254 aa  149  4e-35  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2748  sulfonate/taurine ABC transporter permease  34.96 
 
 
274 aa  148  6e-35  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.947189  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2055  nitrate transport permease  36.12 
 
 
279 aa  148  6e-35  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.562067  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3060  taurine ABC transporter, permease protein  34.51 
 
 
274 aa  147  1.0000000000000001e-34  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0244271  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1031  sulfonate ABC transporter, permease protein  34.1 
 
 
261 aa  147  1.0000000000000001e-34  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1982  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  38.31 
 
 
266 aa  147  1.0000000000000001e-34  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.187248  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0963  nitrate ABC transporter, inner membrane subunit  38.42 
 
 
281 aa  147  1.0000000000000001e-34  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.563275 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1455  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.62 
 
 
269 aa  146  2.0000000000000003e-34  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0865715  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3486  nitrate ABC transporter permease protein  38.28 
 
 
295 aa  147  2.0000000000000003e-34  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.236914  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1147  nitrate ABC transporter, inner membrane subunit  33.92 
 
 
279 aa  146  3e-34  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.488584 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2618  nitrate ABC transporter, inner membrane subunit  35.62 
 
 
279 aa  146  3e-34  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.234813 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1575  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.78 
 
 
266 aa  145  5e-34  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5414  putative nitrate ABC transporter (permease protein) (ntrB-like protein)  35.75 
 
 
279 aa  145  5e-34  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.481789  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0966  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38 
 
 
279 aa  145  5e-34  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.136509 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3675  nitrate ABC transporter, inner membrane subunit  39.67 
 
 
280 aa  144  8.000000000000001e-34  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0874  nitrate transport permease  40.76 
 
 
283 aa  144  8.000000000000001e-34  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00348419  hitchhiker  0.00524559 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3729  nitrate ABC transporter, inner membrane subunit  39.67 
 
 
280 aa  144  8.000000000000001e-34  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0184404  normal  0.11569 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3741  nitrate transport permease  39.67 
 
 
288 aa  144  8.000000000000001e-34  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1306  nitrate ABC transporter, inner membrane subunit  33.92 
 
 
279 aa  144  9e-34  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2588  nitrate ABC transporter, inner membrane subunit  35.27 
 
 
279 aa  144  1e-33  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00171927 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3973  nitrate ABC transporter, inner membrane subunit  36.77 
 
 
295 aa  144  1e-33  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.930991  normal  0.148208 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0996  nitrate ABC transporter, inner membrane subunit  37.5 
 
 
286 aa  144  2e-33  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007595  Synpcc7942_B2630  sulfonate ABC transporter, permease protein, putative  37.25 
 
 
266 aa  143  2e-33  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.312135  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2171  nitrate transport permease  36.89 
 
 
272 aa  143  2e-33  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0149943  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1108  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.76 
 
 
255 aa  143  2e-33  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.135552 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4662  nitrate ABC transporter, inner membrane subunit  33.78 
 
 
279 aa  143  2e-33  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0326  nitrate transport permease  38.46 
 
 
295 aa  143  3e-33  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0393  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.44 
 
 
253 aa  142  4e-33  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0876322  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1704  nitrate ABC transporter, inner membrane subunit  37.19 
 
 
311 aa  142  6e-33  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_16930  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport system, permease component  37.2 
 
 
322 aa  141  8e-33  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.327  normal  0.410158 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0236  nitrate ABC transporter, inner membrane subunit  39.55 
 
 
283 aa  140  1.9999999999999998e-32  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6514  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.82 
 
 
275 aa  140  1.9999999999999998e-32  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0257  nitrate ABC transporter, inner membrane subunit  39.55 
 
 
283 aa  140  1.9999999999999998e-32  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.738144 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6748  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.82 
 
 
275 aa  140  1.9999999999999998e-32  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.133303 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0444  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.5 
 
 
253 aa  139  3e-32  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0697  taurine ABC transporter, permease protein  32.02 
 
 
283 aa  139  3e-32  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1580  taurine ABC transporter, permease protein  32.02 
 
 
253 aa  139  3e-32  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.477521  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0483  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.27 
 
 
275 aa  139  3e-32  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2324  nitrate ABC transporter, inner membrane subunit  39.55 
 
 
293 aa  139  3e-32  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1476  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.03 
 
 
253 aa  139  3e-32  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2019  taurine ABC transporter, permease protein  32.02 
 
 
285 aa  139  3e-32  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.484134  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0034  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  37.5 
 
 
276 aa  139  3.9999999999999997e-32  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0802  taurine ABC transporter, permease protein  32.46 
 
 
283 aa  139  3.9999999999999997e-32  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.207449  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0276  nitrate transport permease  40.46 
 
 
303 aa  139  3.9999999999999997e-32  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.21823 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2133  taurine ABC transporter, permease protein  32.02 
 
 
283 aa  139  4.999999999999999e-32  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.186654  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0620  permease component of taurine ABC transporter  32.57 
 
 
253 aa  139  4.999999999999999e-32  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  decreased coverage  0.00192231  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2220  taurine ABC transporter, permease protein  32.02 
 
 
283 aa  139  4.999999999999999e-32  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.215273  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6337  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.82 
 
 
275 aa  138  6e-32  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2832  nitrate ABC transporter, inner membrane subunit  40.11 
 
 
313 aa  138  6e-32  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.442547 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2321  nitrate ABC transporter, inner membrane subunit  40.11 
 
 
313 aa  138  6e-32  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.539996  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0380  putative nitrate transmembrane ABC transporter protein  39.55 
 
 
287 aa  138  7e-32  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.931268 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0329  nitrate transport permease  40.46 
 
 
300 aa  138  7e-32  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1171  taurine ABC transporter permease  37.44 
 
 
272 aa  138  7e-32  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.104716  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0099  nitrate/nitrite/cyanate ABC transporter inner membrane protein  36.32 
 
 
277 aa  138  7e-32  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.291864  normal  0.355691 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2132  ABC nitrate/sulfonate/bicarbonate transporter, inner membrane subunit  34.4 
 
 
262 aa  138  7e-32  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2146  nitrate ABC transporter, inner membrane subunit  38.46 
 
 
315 aa  138  7e-32  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0213  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35 
 
 
252 aa  138  7.999999999999999e-32  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0377  hypothetical protein  41.3 
 
 
253 aa  138  7.999999999999999e-32  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3654  nitrate transport permease  36.6 
 
 
273 aa  138  8.999999999999999e-32  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0456  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  39.56 
 
 
285 aa  137  1e-31  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2337  nitrate ABC transporter, inner membrane subunit  38.54 
 
 
282 aa  137  1e-31  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>