More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PA14_34520 on replicon NC_008463
Organism: Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009656  PSPA7_2932  ABC transporter permease  99.21 
 
 
254 aa  480  1e-135  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.451747  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_34520  ABC transporter permease  100 
 
 
254 aa  483  1e-135  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.132889  normal  0.0672965 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2098  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  84.96 
 
 
251 aa  360  9e-99  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.660602 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3635  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  84.51 
 
 
251 aa  359  2e-98  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.606268  normal  0.873181 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2277  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  84.07 
 
 
251 aa  353  2e-96  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.554921 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1541  nitrate/sulfonate/bicarbonate ABC transporter inner membrane protein  61.54 
 
 
281 aa  286  2e-76  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0456  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  70.32 
 
 
285 aa  286  2.9999999999999996e-76  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0099  nitrate/nitrite/cyanate ABC transporter inner membrane protein  61.34 
 
 
277 aa  280  1e-74  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.291864  normal  0.355691 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5822  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  67.25 
 
 
241 aa  276  3e-73  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.367586  normal  0.455347 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6337  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  60.67 
 
 
275 aa  269  2e-71  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6514  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  60.67 
 
 
275 aa  268  5.9999999999999995e-71  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6748  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  60.67 
 
 
275 aa  268  5.9999999999999995e-71  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.133303 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1455  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  57.01 
 
 
269 aa  241  1e-62  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0865715  n/a   
 
 
-
 
NC_007595  Synpcc7942_B2630  sulfonate ABC transporter, permease protein, putative  54.17 
 
 
266 aa  228  8e-59  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.312135  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0145  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  48.32 
 
 
266 aa  224  1e-57  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0966  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  45.45 
 
 
279 aa  211  7e-54  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.136509 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0034  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  45.61 
 
 
276 aa  207  2e-52  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0309  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  47.37 
 
 
277 aa  200  1.9999999999999998e-50  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.409097 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3868  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  52.71 
 
 
285 aa  196  4.0000000000000005e-49  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.03471 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3794  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  52.48 
 
 
285 aa  190  2e-47  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.185627 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3486  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  52.48 
 
 
285 aa  188  8e-47  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2835  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  46.92 
 
 
276 aa  186  2e-46  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1974  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  38.08 
 
 
261 aa  146  4.0000000000000006e-34  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000000226251  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1704  nitrate ABC transporter, inner membrane subunit  40.96 
 
 
311 aa  143  3e-33  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2152  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  39.2 
 
 
271 aa  142  7e-33  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.529987 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0164  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.8 
 
 
253 aa  140  1.9999999999999998e-32  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0159  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.8 
 
 
253 aa  140  1.9999999999999998e-32  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2935  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.1 
 
 
252 aa  140  1.9999999999999998e-32  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4051  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.69 
 
 
273 aa  137  1e-31  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.395379 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4508  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.74 
 
 
277 aa  137  1e-31  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.854714  normal  0.909107 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0055  nitrate ABC transporter, inner membrane subunit  30.77 
 
 
256 aa  137  2e-31  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0640  nitrate ABC transporter, inner membrane subunit  38.42 
 
 
279 aa  135  5e-31  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3842  nitrate ABC transporter, inner membrane subunit  35.6 
 
 
331 aa  135  6.0000000000000005e-31  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2803  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.21 
 
 
259 aa  135  6.0000000000000005e-31  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00122675  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2553  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.33 
 
 
275 aa  135  9e-31  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0326  nitrate transport permease  32.46 
 
 
295 aa  134  9.999999999999999e-31  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5146  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40 
 
 
277 aa  134  9.999999999999999e-31  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0887356  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2324  nitrate ABC transporter, inner membrane subunit  36.32 
 
 
293 aa  134  9.999999999999999e-31  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2205  nitrate ABC transporter, inner membrane subunit  37.97 
 
 
280 aa  134  1.9999999999999998e-30  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1211  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.68 
 
 
273 aa  133  3e-30  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.132759  normal  0.452833 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3869  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.13 
 
 
274 aa  133  3e-30  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2588  nitrate ABC transporter, inner membrane subunit  33.46 
 
 
279 aa  133  3e-30  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00171927 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1422  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.68 
 
 
273 aa  132  3.9999999999999996e-30  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1261  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.68 
 
 
273 aa  132  3.9999999999999996e-30  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.306936 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0874  nitrate transport permease  36.51 
 
 
283 aa  132  5e-30  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00348419  hitchhiker  0.00524559 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1129  taurine transport system permease protein TauC  34.42 
 
 
241 aa  132  6e-30  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.774255  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1489  nitrate transport permease  34.94 
 
 
278 aa  132  6e-30  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1439  nitrate ABC transporter, inner membrane subunit  38.22 
 
 
310 aa  132  6.999999999999999e-30  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.062597  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0464  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.56 
 
 
288 aa  131  7.999999999999999e-30  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.349721  hitchhiker  0.00645779 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4641  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.19 
 
 
277 aa  131  1.0000000000000001e-29  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.750363  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0963  nitrate ABC transporter, inner membrane subunit  38.71 
 
 
281 aa  131  1.0000000000000001e-29  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.563275 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0236  nitrate ABC transporter, inner membrane subunit  34.54 
 
 
283 aa  130  1.0000000000000001e-29  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0257  nitrate ABC transporter, inner membrane subunit  34.54 
 
 
283 aa  131  1.0000000000000001e-29  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.738144 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0176  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.14 
 
 
330 aa  131  1.0000000000000001e-29  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.283757  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0208  nitrate ABC transporter, permease protein, putative  35.59 
 
 
260 aa  130  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.473726 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2618  nitrate ABC transporter, inner membrane subunit  37.25 
 
 
279 aa  130  2.0000000000000002e-29  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.234813 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3654  nitrate transport permease  32.21 
 
 
273 aa  130  3e-29  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03653  putative nitrate ABC transporter, permease protein  34.69 
 
 
349 aa  129  4.0000000000000003e-29  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0380  putative nitrate transmembrane ABC transporter protein  34.54 
 
 
287 aa  129  5.0000000000000004e-29  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.931268 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1391  NO3-/NO2- ABC transporter  33.68 
 
 
305 aa  129  5.0000000000000004e-29  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.36361 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0512  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.18 
 
 
253 aa  128  9.000000000000001e-29  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0276  nitrate transport permease  35.42 
 
 
303 aa  128  9.000000000000001e-29  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.21823 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1734  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.02 
 
 
252 aa  127  1.0000000000000001e-28  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_19570  ABC transporter permease  34.72 
 
 
262 aa  127  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7932  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.1 
 
 
283 aa  127  1.0000000000000001e-28  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0620  taurine transport system permease protein TauC  31.25 
 
 
245 aa  128  1.0000000000000001e-28  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  hitchhiker  0.00071484  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1684  ABC transporter permease  34.89 
 
 
262 aa  127  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2106  nitrate transport permease  36.65 
 
 
263 aa  127  2.0000000000000002e-28  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.727969  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1473  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  32.85 
 
 
306 aa  127  2.0000000000000002e-28  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0411979  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3741  nitrate transport permease  38.86 
 
 
288 aa  127  2.0000000000000002e-28  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1642  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.56 
 
 
231 aa  127  2.0000000000000002e-28  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0324285  normal  0.0160388 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2012  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.14 
 
 
280 aa  126  3e-28  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.338733  normal  0.193625 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0924  ABC transporter permease protein  30.93 
 
 
258 aa  126  3e-28  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.175022  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2404  nitrate ABC transporter, inner membrane subunit  39.89 
 
 
279 aa  126  3e-28  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.105129  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4973  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.91 
 
 
265 aa  126  3e-28  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0722896  normal  0.022026 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0254  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.91 
 
 
265 aa  126  3e-28  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.293544  normal  0.0445843 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3315  putative nitrate ABC transporter, permease protein  31.9 
 
 
315 aa  126  4.0000000000000003e-28  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.286795  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0329  nitrate transport permease  35.94 
 
 
300 aa  126  4.0000000000000003e-28  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05589  hypothetical protein  33.17 
 
 
321 aa  126  4.0000000000000003e-28  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2104  nitrate ABC transporter, inner membrane subunit  34.72 
 
 
283 aa  126  4.0000000000000003e-28  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0291571  normal  0.0240092 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3299  putative sulfonate ABC transporter, permease protein  36.54 
 
 
286 aa  126  4.0000000000000003e-28  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.201269  normal  0.262094 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0239  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.48 
 
 
265 aa  125  5e-28  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00756787 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0831  nitrate transport permease  35.36 
 
 
312 aa  125  5e-28  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.0203602 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001608  nitrate ABC transporter permease protein  33.17 
 
 
321 aa  125  5e-28  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1673  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.18 
 
 
263 aa  125  6e-28  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0263  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.91 
 
 
265 aa  125  7e-28  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.791848  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0254  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  32.94 
 
 
279 aa  125  9e-28  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.57663 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1147  nitrate ABC transporter, inner membrane subunit  37.71 
 
 
279 aa  125  9e-28  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.488584 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4677  nitrate ABC transporter, inner membrane subunit  34.67 
 
 
279 aa  124  1e-27  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2273  nitrate transport permease  33.51 
 
 
299 aa  124  1e-27  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4958  nitrate ABC transporter, inner membrane subunit  34.21 
 
 
285 aa  124  1e-27  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.413837  normal  0.165118 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4495  nitrate ABC transporter, inner membrane subunit  34.21 
 
 
285 aa  124  1e-27  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1642  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.74 
 
 
263 aa  124  1e-27  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1369  ABC transporter membrane protein  35.68 
 
 
272 aa  124  2e-27  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.0458182 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3486  nitrate ABC transporter permease protein  39.43 
 
 
295 aa  124  2e-27  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.236914  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1848  ABC transporter permease  37.5 
 
 
273 aa  124  2e-27  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1957  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.5 
 
 
273 aa  124  2e-27  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4306  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.46 
 
 
278 aa  124  2e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0649738  hitchhiker  0.00238236 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6545  ABC transporter permease  35.6 
 
 
269 aa  124  2e-27  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.276106 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4662  nitrate ABC transporter, inner membrane subunit  37.71 
 
 
279 aa  123  3e-27  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>