More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MADE_03653 on replicon NC_011138
Organism: Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011138  MADE_03653  putative nitrate ABC transporter, permease protein  100 
 
 		 349 aa  710    Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2416  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  80.6 
 
 		 329 aa  489  1e-137  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.941924  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2818  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  68.2 
 
 		 323 aa  442  1e-123  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0908348  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3315  putative nitrate ABC transporter, permease protein  67.75 
 
 		 315 aa  434  1e-120  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.286795  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001608  nitrate ABC transporter permease protein  66.56 
 
 		 321 aa  429  1e-119  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05589  hypothetical protein  66.56 
 
 		 321 aa  429  1e-119  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1154  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  68.56 
 
 		 332 aa  412  1e-114  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0176  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  66.55 
 
 		 330 aa  410  1e-113  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.283757  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2265  2-isopropylmalate synthase  59.88 
 
 		 337 aa  396  1e-109  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.20736  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1083  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  64.63 
 
 		 362 aa  390  1e-107  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3041  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  65.74 
 
 		 356 aa  390  1e-107  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0454985  normal  0.816874 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1116  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  63.25 
 
 		 320 aa  389  1e-107  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1664  putative ABC transporter permease protein  63.76 
 
 		 360 aa  379  1e-104  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0453487  normal  0.0661868 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1968  nitrate ABC transporter, permease component  48.51 
 
 		 377 aa  254  1.0000000000000001e-66  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.52047  normal  0.211755 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0996  nitrate ABC transporter, inner membrane subunit  43.9 
 
 		 286 aa  176  4e-43  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2205  nitrate ABC transporter, inner membrane subunit  42.86 
 
 		 280 aa  174  9.999999999999999e-43  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3486  nitrate ABC transporter permease protein  42.93 
 
 		 295 aa  173  2.9999999999999996e-42  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.236914  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1026  nitrate transport permease  33.44 
 
 		 279 aa  173  3.9999999999999995e-42  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.174596 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0874  nitrate transport permease  44.5 
 
 		 283 aa  171  2e-41  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00348419  hitchhiker  0.00524559 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2618  nitrate ABC transporter, inner membrane subunit  43.14 
 
 		 279 aa  171  2e-41  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.234813 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2171  nitrate transport permease  42.93 
 
 		 272 aa  170  3e-41  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0149943  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0640  nitrate ABC transporter, inner membrane subunit  43.48 
 
 		 279 aa  170  4e-41  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5414  putative nitrate ABC transporter (permease protein) (ntrB-like protein)  41.67 
 
 		 279 aa  167  2e-40  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.481789  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2588  nitrate ABC transporter, inner membrane subunit  38.5 
 
 		 279 aa  167  2.9999999999999998e-40  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00171927 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3675  nitrate ABC transporter, inner membrane subunit  44 
 
 		 280 aa  167  4e-40  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3729  nitrate ABC transporter, inner membrane subunit  44 
 
 		 280 aa  167  4e-40  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0184404  normal  0.11569 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3973  nitrate ABC transporter, inner membrane subunit  42.03 
 
 		 295 aa  166  4e-40  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.930991  normal  0.148208 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1704  nitrate ABC transporter, inner membrane subunit  43 
 
 		 311 aa  166  5e-40  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3654  nitrate transport permease  33.11 
 
 		 273 aa  166  5.9999999999999996e-40  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0291  nitrate transport permease  41.95 
 
 		 287 aa  164  2.0000000000000002e-39  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2055  nitrate transport permease  35.98 
 
 		 279 aa  162  5.0000000000000005e-39  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.562067  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4662  nitrate ABC transporter, inner membrane subunit  39.29 
 
 		 279 aa  162  6e-39  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3741  nitrate transport permease  40.98 
 
 		 288 aa  162  7e-39  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1147  nitrate ABC transporter, inner membrane subunit  38.84 
 
 		 279 aa  161  2e-38  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.488584 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0963  nitrate ABC transporter, inner membrane subunit  39.9 
 
 		 281 aa  160  3e-38  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.563275 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2404  nitrate ABC transporter, inner membrane subunit  39.22 
 
 		 279 aa  160  3e-38  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.105129  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3842  nitrate ABC transporter, inner membrane subunit  33.1 
 
 		 331 aa  159  6e-38  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1306  nitrate ABC transporter, inner membrane subunit  38.39 
 
 		 279 aa  159  6e-38  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4458  nitrate ABC transporter, inner membrane subunit  30.84 
 
 		 277 aa  159  8e-38  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.698055  normal  0.534513 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4395  nitrate ABC transporter, inner membrane subunit  30.84 
 
 		 277 aa  159  8e-38  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0666  nitrate ABC transporter, inner membrane subunit  31.94 
 
 		 311 aa  159  9e-38  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0569164  decreased coverage  0.0039857 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2337  nitrate ABC transporter, inner membrane subunit  40.87 
 
 		 282 aa  159  9e-38  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2819  nitrate transport permease protein (nrtB)  31.63 
 
 		 304 aa  159  1e-37  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.233469  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1391  NO3-/NO2- ABC transporter  31.97 
 
 		 305 aa  156  4e-37  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.36361 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1489  nitrate transport permease  32.89 
 
 		 278 aa  155  1e-36  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4817  nitrate ABC transporter, inner membrane subunit  35.87 
 
 		 279 aa  155  1e-36  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.775678  hitchhiker  0.00263828 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3526  nitrate ABC transporter, inner membrane subunit  30.99 
 
 		 280 aa  155  1e-36  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.471487 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2503  nitrate ABC transporter, inner membrane subunit  42.21 
 
 		 298 aa  154  2e-36  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2324  nitrate ABC transporter, inner membrane subunit  37.44 
 
 		 293 aa  154  2.9999999999999998e-36  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4924  nitrate ABC transporter, inner membrane subunit  33.02 
 
 		 280 aa  153  4e-36  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.815767 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0257  nitrate ABC transporter, inner membrane subunit  32.88 
 
 		 283 aa  153  4e-36  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.738144 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0236  nitrate ABC transporter, inner membrane subunit  32.88 
 
 		 283 aa  153  4e-36  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1238  nitrate transport permease  31.08 
 
 		 279 aa  153  5e-36  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3744  nitrate ABC transporter, inner membrane subunit  38.1 
 
 		 288 aa  153  5e-36  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.441454  normal  0.10243 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3520  nitrate ABC transporter, inner membrane subunit  31.99 
 
 		 280 aa  153  5e-36  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0380  putative nitrate transmembrane ABC transporter protein  29.55 
 
 		 287 aa  152  7e-36  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.931268 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0055  nitrate ABC transporter, inner membrane subunit  39.8 
 
 		 256 aa  152  7e-36  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5896  nitrate ABC transporter permease protein  32.49 
 
 		 297 aa  151  1e-35  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.149001  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2597  nitrate ABC transporter, inner membrane subunit  31.37 
 
 		 280 aa  151  2e-35  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4495  nitrate ABC transporter, inner membrane subunit  39.07 
 
 		 285 aa  151  2e-35  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5011  nitrate ABC transporter, inner membrane subunit  38.16 
 
 		 286 aa  151  2e-35  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.312092  normal  0.320206 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4958  nitrate ABC transporter, inner membrane subunit  39.07 
 
 		 285 aa  151  2e-35  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.413837  normal  0.165118 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4471  nitrate ABC transporter, inner membrane subunit  40.3 
 
 		 297 aa  149  8e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.5689 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6460  nitrate ABC transporter, inner membrane subunit  40 
 
 		 297 aa  148  1.0000000000000001e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.150998 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4571  nitrate ABC transporter, inner membrane subunit  37.56 
 
 		 280 aa  148  2.0000000000000003e-34  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2273  nitrate transport permease  29.97 
 
 		 299 aa  148  2.0000000000000003e-34  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2146  nitrate ABC transporter, inner membrane subunit  32.03 
 
 		 315 aa  148  2.0000000000000003e-34  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1439  nitrate ABC transporter, inner membrane subunit  34.97 
 
 		 310 aa  147  3e-34  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.062597  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0831  nitrate transport permease  31.45 
 
 		 312 aa  146  5e-34  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.0203602 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4541  nitrate transport permease  32.98 
 
 		 279 aa  146  5e-34  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2104  nitrate ABC transporter, inner membrane subunit  30.66 
 
 		 283 aa  143  4e-33  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0291571  normal  0.0240092 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0326  nitrate transport permease  37.62 
 
 		 295 aa  142  6e-33  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2555  nitrate transport permease  31.65 
 
 		 314 aa  142  7e-33  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.162104  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1413  nitrate ABC transporter, inner membrane subunit  42.77 
 
 		 311 aa  141  1.9999999999999998e-32  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2321  nitrate ABC transporter, inner membrane subunit  36.95 
 
 		 313 aa  140  3e-32  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.539996  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2832  nitrate ABC transporter, inner membrane subunit  36.95 
 
 		 313 aa  140  3.9999999999999997e-32  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.442547 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2496  nitrate ABC transporter, inner membrane subunit  42.42 
 
 		 304 aa  139  7e-32  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.546285  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2106  nitrate transport permease  43.03 
 
 		 263 aa  138  1e-31  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.727969  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1759  nitrate transport permease  35.55 
 
 		 299 aa  138  2e-31  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0568232  normal  0.0125916 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3268  nitrate transport permease  35.68 
 
 		 328 aa  138  2e-31  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.321419  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4677  nitrate ABC transporter, inner membrane subunit  35.75 
 
 		 279 aa  137  3.0000000000000003e-31  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2591  nitrate ABC transporter, inner membrane subunit  38.02 
 
 		 328 aa  137  3.0000000000000003e-31  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.0488842 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2732  nitrate ABC transporter, inner membrane subunit  40 
 
 		 304 aa  136  4e-31  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0882865  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1542  nitrate ABC transporter, inner membrane subunit  40 
 
 		 304 aa  136  4e-31  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.244375  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2908  nitrate ABC transporter, inner membrane subunit  40 
 
 		 298 aa  136  5e-31  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.950821  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0329  nitrate transport permease  37.1 
 
 		 300 aa  135  9.999999999999999e-31  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3523  nitrate ABC transporter, inner membrane subunit  38.24 
 
 		 309 aa  135  9.999999999999999e-31  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.293551  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0276  nitrate transport permease  38.38 
 
 		 303 aa  134  1.9999999999999998e-30  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.21823 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2376  nitrate ABC transporter, inner membrane subunit  41.82 
 
 		 313 aa  133  5e-30  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1455  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.89 
 
 		 269 aa  125  2e-27  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0865715  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2098  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.07 
 
 		 251 aa  124  3e-27  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.660602 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3635  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.6 
 
 		 251 aa  122  9.999999999999999e-27  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.606268  normal  0.873181 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2277  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.55 
 
 		 251 aa  122  9.999999999999999e-27  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.554921 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2935  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.86 
 
 		 252 aa  121  1.9999999999999998e-26  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1974  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  33.66 
 
 		 261 aa  120  3.9999999999999996e-26  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000000226251  normal  1 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7932  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.86 
 
 		 283 aa  118  1.9999999999999998e-25  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2085  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.78 
 
 		 319 aa  115  1.0000000000000001e-24  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0787698 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1076  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.49 
 
 		 269 aa  114  2.0000000000000002e-24  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.406887  normal  0.454808 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4641  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.58 
 
 		 277 aa  114  3e-24  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.750363  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6545  ABC transporter permease  32.06 
 
 		 269 aa  113  5e-24  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.276106 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>