More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_5414 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009485  BBta_5414  putative nitrate ABC transporter (permease protein) (ntrB-like protein)  100 
 
 		 279 aa  552  1e-156  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.481789  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2055  nitrate transport permease  88.89 
 
 		 279 aa  508  1e-143  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.562067  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2404  nitrate ABC transporter, inner membrane subunit  85.66 
 
 		 279 aa  492  9.999999999999999e-139  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.105129  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4662  nitrate ABC transporter, inner membrane subunit  79.57 
 
 		 279 aa  454  1e-127  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1306  nitrate ABC transporter, inner membrane subunit  78.14 
 
 		 279 aa  434  1e-121  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1147  nitrate ABC transporter, inner membrane subunit  78.49 
 
 		 279 aa  436  1e-121  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.488584 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2618  nitrate ABC transporter, inner membrane subunit  76.9 
 
 		 279 aa  430  1e-119  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.234813 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4817  nitrate ABC transporter, inner membrane subunit  79.21 
 
 		 279 aa  423  1e-117  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.775678  hitchhiker  0.00263828 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3486  nitrate ABC transporter permease protein  69.66 
 
 		 295 aa  385  1e-106  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.236914  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2205  nitrate ABC transporter, inner membrane subunit  68.33 
 
 		 280 aa  384  1e-105  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3973  nitrate ABC transporter, inner membrane subunit  64.26 
 
 		 295 aa  368  1e-101  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.930991  normal  0.148208 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3741  nitrate transport permease  66.9 
 
 		 288 aa  366  1e-100  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0291  nitrate transport permease  63.86 
 
 		 287 aa  363  1e-99  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2171  nitrate transport permease  66.3 
 
 		 272 aa  359  3e-98  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0149943  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0996  nitrate ABC transporter, inner membrane subunit  62.32 
 
 		 286 aa  350  1e-95  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0963  nitrate ABC transporter, inner membrane subunit  60.85 
 
 		 281 aa  348  8e-95  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.563275 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2588  nitrate ABC transporter, inner membrane subunit  59.64 
 
 		 279 aa  334  9e-91  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00171927 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2321  nitrate ABC transporter, inner membrane subunit  48.5 
 
 		 313 aa  234  1.0000000000000001e-60  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.539996  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3729  nitrate ABC transporter, inner membrane subunit  51.79 
 
 		 280 aa  234  1.0000000000000001e-60  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0184404  normal  0.11569 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3675  nitrate ABC transporter, inner membrane subunit  51.79 
 
 		 280 aa  234  1.0000000000000001e-60  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2832  nitrate ABC transporter, inner membrane subunit  48.5 
 
 		 313 aa  234  1.0000000000000001e-60  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.442547 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2106  nitrate transport permease  51.53 
 
 		 263 aa  231  8.000000000000001e-60  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.727969  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1704  nitrate ABC transporter, inner membrane subunit  45.96 
 
 		 311 aa  229  3e-59  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2146  nitrate ABC transporter, inner membrane subunit  45.06 
 
 		 315 aa  227  2e-58  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1391  NO3-/NO2- ABC transporter  46.09 
 
 		 305 aa  227  2e-58  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.36361 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0874  nitrate transport permease  50.44 
 
 		 283 aa  224  8e-58  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00348419  hitchhiker  0.00524559 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0640  nitrate ABC transporter, inner membrane subunit  48.7 
 
 		 279 aa  224  1e-57  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2591  nitrate ABC transporter, inner membrane subunit  49.78 
 
 		 328 aa  224  2e-57  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.0488842 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2273  nitrate transport permease  45.15 
 
 		 299 aa  223  3e-57  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2337  nitrate ABC transporter, inner membrane subunit  49.78 
 
 		 282 aa  223  4e-57  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3842  nitrate ABC transporter, inner membrane subunit  45.58 
 
 		 331 aa  221  9.999999999999999e-57  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0666  nitrate ABC transporter, inner membrane subunit  45.22 
 
 		 311 aa  218  8.999999999999998e-56  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0569164  decreased coverage  0.0039857 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0055  nitrate ABC transporter, inner membrane subunit  46.79 
 
 		 256 aa  216  2e-55  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2104  nitrate ABC transporter, inner membrane subunit  45.54 
 
 		 283 aa  217  2e-55  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0291571  normal  0.0240092 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3526  nitrate ABC transporter, inner membrane subunit  42.49 
 
 		 280 aa  216  2e-55  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.471487 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2376  nitrate ABC transporter, inner membrane subunit  47.21 
 
 		 313 aa  216  2e-55  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2324  nitrate ABC transporter, inner membrane subunit  45.45 
 
 		 293 aa  215  5e-55  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5011  nitrate ABC transporter, inner membrane subunit  42.63 
 
 		 286 aa  214  1.9999999999999998e-54  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.312092  normal  0.320206 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0380  putative nitrate transmembrane ABC transporter protein  49.76 
 
 		 287 aa  212  3.9999999999999995e-54  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.931268 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4495  nitrate ABC transporter, inner membrane subunit  43.03 
 
 		 285 aa  212  4.9999999999999996e-54  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4958  nitrate ABC transporter, inner membrane subunit  43.03 
 
 		 285 aa  212  4.9999999999999996e-54  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.413837  normal  0.165118 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2819  nitrate transport permease protein (nrtB)  41.73 
 
 		 304 aa  212  7e-54  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.233469  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4571  nitrate ABC transporter, inner membrane subunit  45.37 
 
 		 280 aa  211  7.999999999999999e-54  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0257  nitrate ABC transporter, inner membrane subunit  49.27 
 
 		 283 aa  211  1e-53  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.738144 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1238  nitrate transport permease  38.91 
 
 		 279 aa  211  1e-53  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0236  nitrate ABC transporter, inner membrane subunit  49.27 
 
 		 283 aa  211  1e-53  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3744  nitrate ABC transporter, inner membrane subunit  44.84 
 
 		 288 aa  210  2e-53  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.441454  normal  0.10243 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1413  nitrate ABC transporter, inner membrane subunit  46.26 
 
 		 311 aa  210  2e-53  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5896  nitrate ABC transporter permease protein  40 
 
 		 297 aa  210  3e-53  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.149001  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3268  nitrate transport permease  46.02 
 
 		 328 aa  209  3e-53  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.321419  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0326  nitrate transport permease  45.05 
 
 		 295 aa  208  8e-53  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3523  nitrate ABC transporter, inner membrane subunit  45.99 
 
 		 309 aa  207  2e-52  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.293551  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0831  nitrate transport permease  46.49 
 
 		 312 aa  207  2e-52  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.0203602 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3654  nitrate transport permease  39.78 
 
 		 273 aa  206  3e-52  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2555  nitrate transport permease  45.58 
 
 		 314 aa  206  3e-52  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.162104  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1439  nitrate ABC transporter, inner membrane subunit  51.05 
 
 		 310 aa  205  6e-52  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.062597  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0276  nitrate transport permease  49.27 
 
 		 303 aa  205  6e-52  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.21823 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4471  nitrate ABC transporter, inner membrane subunit  42.41 
 
 		 297 aa  204  2e-51  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.5689 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4458  nitrate ABC transporter, inner membrane subunit  42.15 
 
 		 277 aa  202  5e-51  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.698055  normal  0.534513 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4395  nitrate ABC transporter, inner membrane subunit  42.15 
 
 		 277 aa  202  5e-51  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0329  nitrate transport permease  50.26 
 
 		 300 aa  201  9.999999999999999e-51  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6460  nitrate ABC transporter, inner membrane subunit  41.23 
 
 		 297 aa  201  9.999999999999999e-51  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.150998 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4541  nitrate transport permease  41.18 
 
 		 279 aa  199  3e-50  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1026  nitrate transport permease  43.32 
 
 		 279 aa  199  6e-50  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.174596 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2503  nitrate ABC transporter, inner membrane subunit  44.39 
 
 		 298 aa  197  1.0000000000000001e-49  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4924  nitrate ABC transporter, inner membrane subunit  39.06 
 
 		 280 aa  197  2.0000000000000003e-49  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.815767 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4677  nitrate ABC transporter, inner membrane subunit  45.89 
 
 		 279 aa  196  5.000000000000001e-49  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2496  nitrate ABC transporter, inner membrane subunit  48.29 
 
 		 304 aa  193  2e-48  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.546285  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1759  nitrate transport permease  45.65 
 
 		 299 aa  192  4e-48  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0568232  normal  0.0125916 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1542  nitrate ABC transporter, inner membrane subunit  47.32 
 
 		 304 aa  191  1e-47  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.244375  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2732  nitrate ABC transporter, inner membrane subunit  47.32 
 
 		 304 aa  189  2.9999999999999997e-47  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0882865  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2908  nitrate ABC transporter, inner membrane subunit  48.02 
 
 		 298 aa  187  2e-46  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.950821  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2597  nitrate ABC transporter, inner membrane subunit  39.91 
 
 		 280 aa  186  3e-46  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3520  nitrate ABC transporter, inner membrane subunit  36.4 
 
 		 280 aa  186  4e-46  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1489  nitrate transport permease  42.54 
 
 		 278 aa  186  5e-46  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2265  2-isopropylmalate synthase  40.87 
 
 		 337 aa  174  1.9999999999999998e-42  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.20736  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001608  nitrate ABC transporter permease protein  33.88 
 
 		 321 aa  171  1e-41  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05589  hypothetical protein  33.88 
 
 		 321 aa  171  2e-41  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03653  putative nitrate ABC transporter, permease protein  41.67 
 
 		 349 aa  167  2e-40  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2818  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.13 
 
 		 323 aa  167  2e-40  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0908348  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1664  putative ABC transporter permease protein  33.79 
 
 		 360 aa  167  2e-40  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0453487  normal  0.0661868 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0176  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.08 
 
 		 330 aa  166  4e-40  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.283757  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3315  putative nitrate ABC transporter, permease protein  35.32 
 
 		 315 aa  164  2.0000000000000002e-39  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.286795  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3041  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.22 
 
 		 356 aa  162  6e-39  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0454985  normal  0.816874 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2416  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.61 
 
 		 329 aa  162  8.000000000000001e-39  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.941924  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1083  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.84 
 
 		 362 aa  160  2e-38  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1116  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.88 
 
 		 320 aa  155  1e-36  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1968  nitrate ABC transporter, permease component  37.44 
 
 		 377 aa  145  6e-34  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.52047  normal  0.211755 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1154  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  41.75 
 
 		 332 aa  142  9e-33  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3160  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  40 
 
 		 274 aa  141  9.999999999999999e-33  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.913146  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3346  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.8 
 
 		 291 aa  136  3.0000000000000003e-31  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.252204  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1076  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.85 
 
 		 269 aa  136  4e-31  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.406887  normal  0.454808 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3671  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.8 
 
 		 287 aa  136  4e-31  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0347715  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2935  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.97 
 
 		 252 aa  135  6.0000000000000005e-31  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0397  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.36 
 
 		 285 aa  134  1.9999999999999998e-30  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.987071 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1541  nitrate/sulfonate/bicarbonate ABC transporter inner membrane protein  36.02 
 
 		 281 aa  133  3e-30  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4185  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.11 
 
 		 283 aa  133  3.9999999999999996e-30  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.321257  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4201  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.48 
 
 		 305 aa  132  3.9999999999999996e-30  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6102  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.94 
 
 		 291 aa  132  5e-30  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1975  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.94 
 
 		 291 aa  132  5e-30  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.690359  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>