More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smed_3150 on replicon NC_009636
Organism: Sinorhizobium medicae WSM419



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009636  Smed_3150  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  100 
 
 
273 aa  526  1e-148  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3151  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.22 
 
 
263 aa  162  7e-39  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1974  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  35.32 
 
 
261 aa  142  8e-33  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000000226251  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0355  putative ABC aliphatic sulfonates transporter, permease subunit  36.65 
 
 
264 aa  137  2e-31  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0423  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.65 
 
 
264 aa  137  2e-31  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1736  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.1 
 
 
264 aa  135  8e-31  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.440066  normal  0.144233 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5412  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  36.97 
 
 
260 aa  131  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.210037  hitchhiker  0.00191971 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1982  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  34.6 
 
 
266 aa  131  1.0000000000000001e-29  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.187248  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0263  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.69 
 
 
265 aa  131  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.791848  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4973  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.13 
 
 
265 aa  131  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0722896  normal  0.022026 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0254  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.04 
 
 
265 aa  131  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.293544  normal  0.0445843 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0239  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.62 
 
 
265 aa  130  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00756787 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1684  ABC transporter permease  36.02 
 
 
262 aa  130  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1453  alkanesulfonate transporter permease subunit  36.99 
 
 
263 aa  130  2.0000000000000002e-29  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2803  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.34 
 
 
259 aa  130  2.0000000000000002e-29  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00122675  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0213  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.61 
 
 
252 aa  129  4.0000000000000003e-29  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0030  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.1 
 
 
264 aa  129  5.0000000000000004e-29  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.050552  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3058  taurine ABC transporter, permease protein  32.96 
 
 
274 aa  129  5.0000000000000004e-29  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_19570  ABC transporter permease  34.43 
 
 
262 aa  128  8.000000000000001e-29  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0246  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.93 
 
 
279 aa  128  9.000000000000001e-29  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0570948  normal  0.0921514 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0231  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.5 
 
 
279 aa  128  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.33405  hitchhiker  0.000710194 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2748  sulfonate/taurine ABC transporter permease  35.87 
 
 
274 aa  128  1.0000000000000001e-28  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.947189  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1283  binding-protein-dependent transporter inner membrane protein  31.09 
 
 
252 aa  128  1.0000000000000001e-28  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0507526 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4981  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.61 
 
 
279 aa  127  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.588836 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3060  taurine ABC transporter, permease protein  35.43 
 
 
274 aa  127  2.0000000000000002e-28  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0244271  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1998  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.43 
 
 
283 aa  126  4.0000000000000003e-28  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.894639  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0024  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.75 
 
 
264 aa  125  6e-28  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2566  ABC transporter, membrane subunit  34.07 
 
 
252 aa  125  9e-28  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.345232 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3459  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.96 
 
 
283 aa  124  1e-27  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.703735  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0981  nitrate/sulfonate/bicarbonate ABC transporter inner membrane protein  32.88 
 
 
279 aa  124  1e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1575  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.55 
 
 
266 aa  125  1e-27  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0765  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.39 
 
 
265 aa  124  2e-27  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5321  taurine ABC transporter, permease protein  35 
 
 
285 aa  124  2e-27  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1369  ABC transporter membrane protein  31.15 
 
 
272 aa  124  2e-27  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.0458182 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0255  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.93 
 
 
279 aa  124  2e-27  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.796344  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3035  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.44 
 
 
298 aa  124  2e-27  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.30367  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3936  taurine transporter subunit  34.66 
 
 
284 aa  123  4e-27  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2882  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.19 
 
 
268 aa  122  4e-27  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.80309  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1171  taurine ABC transporter permease  36.28 
 
 
272 aa  123  4e-27  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.104716  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3693  taurine transporter subunit  34.66 
 
 
284 aa  123  4e-27  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0260  taurine transporter subunit  34.66 
 
 
284 aa  123  4e-27  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00317  taurine transporter subunit  39.07 
 
 
275 aa  122  5e-27  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3643  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.05 
 
 
252 aa  122  5e-27  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000799696  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00321  hypothetical protein  39.07 
 
 
275 aa  122  5e-27  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0233  ABC transporter, permease protein  35.48 
 
 
241 aa  122  5e-27  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3261  taurine transporter subunit  39.07 
 
 
275 aa  122  5e-27  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4564  taurine transporter subunit  34.05 
 
 
279 aa  121  9e-27  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.746145 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0254  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  35.94 
 
 
279 aa  121  9.999999999999999e-27  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.57663 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0483  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.49 
 
 
275 aa  121  9.999999999999999e-27  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0208  nitrate ABC transporter, permease protein, putative  34.36 
 
 
260 aa  120  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.473726 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1261  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.93 
 
 
273 aa  120  1.9999999999999998e-26  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.306936 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1673  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.8 
 
 
263 aa  120  1.9999999999999998e-26  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1422  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.93 
 
 
273 aa  120  1.9999999999999998e-26  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_12960  taurine ABC transporter permease  37.63 
 
 
272 aa  120  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.299757  normal  0.321121 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5005  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.15 
 
 
289 aa  121  1.9999999999999998e-26  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3612  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.61 
 
 
276 aa  120  1.9999999999999998e-26  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1211  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.1 
 
 
273 aa  120  3e-26  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.132759  normal  0.452833 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1734  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.15 
 
 
252 aa  120  3e-26  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2712  sulfonate ABC transporter permease  33.5 
 
 
282 aa  119  3.9999999999999996e-26  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0280  taurine transporter subunit  38.14 
 
 
275 aa  119  3.9999999999999996e-26  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4051  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.2 
 
 
273 aa  119  3.9999999999999996e-26  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.395379 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2920  sulfonate ABC transporter permease protein  33.5 
 
 
282 aa  119  3.9999999999999996e-26  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0442  taurine transporter subunit  38.6 
 
 
275 aa  119  3.9999999999999996e-26  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0391  taurine transporter subunit  38.14 
 
 
275 aa  119  3.9999999999999996e-26  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5315  aliphatic sulfonates ABC transporter, permease protein  35.71 
 
 
265 aa  119  6e-26  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3240  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.14 
 
 
275 aa  118  9e-26  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4875  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  35.71 
 
 
265 aa  118  9.999999999999999e-26  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.746085  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0396  taurine transporter subunit  38.6 
 
 
275 aa  118  9.999999999999999e-26  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1642  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.49 
 
 
263 aa  118  9.999999999999999e-26  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1746  putative molybdenum ABC transporter, solute-binding protein  32.92 
 
 
249 aa  118  9.999999999999999e-26  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  hitchhiker  0.000716411  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_21600  aliphatic sulfonates ABC transporter, inner membrane component  32.92 
 
 
284 aa  117  1.9999999999999998e-25  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3818  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.2 
 
 
280 aa  117  1.9999999999999998e-25  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.615395  normal  0.42897 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3159  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.91 
 
 
293 aa  117  1.9999999999999998e-25  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1108  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.78 
 
 
255 aa  117  1.9999999999999998e-25  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.135552 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2515  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  33.2 
 
 
282 aa  116  3e-25  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.313862  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2152  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  40.12 
 
 
271 aa  117  3e-25  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.529987 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2621  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.34 
 
 
281 aa  117  3e-25  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000218671  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0423  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.2 
 
 
297 aa  117  3e-25  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.283538  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0620  taurine transport system permease protein TauC  33.47 
 
 
245 aa  116  3.9999999999999997e-25  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  hitchhiker  0.00071484  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0431  taurine transporter subunit  37.67 
 
 
275 aa  116  5e-25  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2787  ABC transporter, permease protein  33.61 
 
 
282 aa  115  6e-25  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0328614  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1763  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.97 
 
 
282 aa  115  6e-25  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_19350  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport system, permease component  32.63 
 
 
293 aa  115  6e-25  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.449157  normal  0.837307 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2787  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.06 
 
 
272 aa  115  6e-25  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.334714  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4075  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.53 
 
 
285 aa  115  6.9999999999999995e-25  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.269465 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5602  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.23 
 
 
263 aa  115  8.999999999999998e-25  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3869  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.72 
 
 
274 aa  114  1.0000000000000001e-24  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3299  putative sulfonate ABC transporter, permease protein  34.42 
 
 
286 aa  114  1.0000000000000001e-24  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.201269  normal  0.262094 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5517  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.76 
 
 
256 aa  114  1.0000000000000001e-24  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.16627  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1848  ABC transporter permease  40.51 
 
 
273 aa  114  1.0000000000000001e-24  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0840  taurine transporter subunit  36.7 
 
 
275 aa  114  1.0000000000000001e-24  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.276647 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1957  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.51 
 
 
273 aa  114  1.0000000000000001e-24  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1338  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.34 
 
 
260 aa  114  1.0000000000000001e-24  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.011116 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4886  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.36 
 
 
281 aa  115  1.0000000000000001e-24  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.479856  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1140  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.05 
 
 
255 aa  114  2.0000000000000002e-24  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2638  ABC sulfonate transporter, inner membrane subunit  31.15 
 
 
279 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0950643  hitchhiker  0.0000361652 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3613  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.68 
 
 
377 aa  114  2.0000000000000002e-24  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0085  taurine ABC transporter inner membrane protein  35.29 
 
 
283 aa  113  3e-24  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.664827  normal  0.135193 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1380  binding-protein-dependent transporter inner membrane component  34.35 
 
 
277 aa  113  3e-24  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.153307 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2417  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.84 
 
 
300 aa  114  3e-24  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0833403  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>