More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_1813 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013595  Sros_1813  ABC transporter membrane protein  100 
 
 
256 aa  484  1e-136  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.48548  normal  0.635137 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1819  ABC-type transporter, permease protein  58.94 
 
 
262 aa  239  4e-62  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.240116 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4670  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  48.44 
 
 
259 aa  192  5e-48  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5423  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  46.99 
 
 
298 aa  190  2e-47  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_34310  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport system, permease component  44.71 
 
 
256 aa  181  1e-44  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3082  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.38 
 
 
280 aa  164  1.0000000000000001e-39  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0593827  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8275  ABC-type transporter, permease protein  34.02 
 
 
272 aa  141  9.999999999999999e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.144641 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4306  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.14 
 
 
278 aa  139  3e-32  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0649738  hitchhiker  0.00238236 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1369  ABC transporter membrane protein  33.2 
 
 
272 aa  137  2e-31  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.0458182 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4937  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.32 
 
 
287 aa  133  3e-30  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0773955  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0287  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.33 
 
 
286 aa  127  1.0000000000000001e-28  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.122201  hitchhiker  0.000327752 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2331  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.43 
 
 
261 aa  127  3e-28  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1145  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.13 
 
 
279 aa  125  5e-28  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.208956  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2012  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  28.74 
 
 
280 aa  125  8.000000000000001e-28  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.338733  normal  0.193625 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3643  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  27.24 
 
 
252 aa  119  3e-26  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000799696  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_18130  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport system, permease component  33.05 
 
 
283 aa  120  3e-26  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1692  putative ABC transporter membrane protein  35.12 
 
 
281 aa  118  7.999999999999999e-26  Thermobifida fusca YX  Bacteria  hitchhiker  0.00465779  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3869  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.29 
 
 
274 aa  117  1.9999999999999998e-25  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2478  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.53 
 
 
285 aa  117  1.9999999999999998e-25  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1211  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.34 
 
 
273 aa  117  1.9999999999999998e-25  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.132759  normal  0.452833 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2588  nitrate ABC transporter, inner membrane subunit  33.52 
 
 
279 aa  117  3e-25  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00171927 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4051  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.86 
 
 
273 aa  115  5e-25  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.395379 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0291  nitrate transport permease  35.16 
 
 
287 aa  115  6e-25  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1982  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  30.98 
 
 
266 aa  115  8.999999999999998e-25  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.187248  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2055  nitrate transport permease  35 
 
 
279 aa  114  1.0000000000000001e-24  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.562067  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3486  nitrate ABC transporter permease protein  33.48 
 
 
295 aa  114  1.0000000000000001e-24  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.236914  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2152  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  32.28 
 
 
271 aa  114  2.0000000000000002e-24  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.529987 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3875  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.58 
 
 
289 aa  114  2.0000000000000002e-24  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3035  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.81 
 
 
298 aa  113  2.0000000000000002e-24  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.30367  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1422  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.86 
 
 
273 aa  113  3e-24  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1261  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.86 
 
 
273 aa  113  3e-24  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.306936 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5414  putative nitrate ABC transporter (permease protein) (ntrB-like protein)  35.67 
 
 
279 aa  113  3e-24  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.481789  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0981  nitrate/sulfonate/bicarbonate ABC transporter inner membrane protein  32.34 
 
 
279 aa  112  4.0000000000000004e-24  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5349  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.69 
 
 
271 aa  113  4.0000000000000004e-24  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5438  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.69 
 
 
271 aa  113  4.0000000000000004e-24  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.586381 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5728  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.69 
 
 
271 aa  113  4.0000000000000004e-24  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2638  ABC sulfonate transporter, inner membrane subunit  32.1 
 
 
279 aa  112  6e-24  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0950643  hitchhiker  0.0000361652 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2205  nitrate ABC transporter, inner membrane subunit  35.54 
 
 
280 aa  112  8.000000000000001e-24  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3973  nitrate ABC transporter, inner membrane subunit  35.06 
 
 
295 aa  112  8.000000000000001e-24  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.930991  normal  0.148208 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2337  nitrate ABC transporter, inner membrane subunit  32 
 
 
282 aa  111  1.0000000000000001e-23  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3741  nitrate transport permease  33.33 
 
 
288 aa  110  2.0000000000000002e-23  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2404  nitrate ABC transporter, inner membrane subunit  32.97 
 
 
279 aa  110  2.0000000000000002e-23  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.105129  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4662  nitrate ABC transporter, inner membrane subunit  34.25 
 
 
279 aa  110  3e-23  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2618  nitrate ABC transporter, inner membrane subunit  34.27 
 
 
279 aa  110  3e-23  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.234813 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3299  putative sulfonate ABC transporter, permease protein  30.99 
 
 
286 aa  109  4.0000000000000004e-23  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.201269  normal  0.262094 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4641  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  28.81 
 
 
277 aa  109  4.0000000000000004e-23  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.750363  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0996  nitrate ABC transporter, inner membrane subunit  32.2 
 
 
286 aa  107  1e-22  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4332  ABC transporter permease  31.38 
 
 
298 aa  107  1e-22  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1171  taurine ABC transporter permease  35.22 
 
 
272 aa  108  1e-22  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.104716  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0102  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.43 
 
 
263 aa  107  2e-22  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.922239  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5729  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.38 
 
 
263 aa  107  2e-22  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1147  nitrate ABC transporter, inner membrane subunit  33.89 
 
 
279 aa  107  2e-22  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.488584 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5350  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.38 
 
 
263 aa  107  2e-22  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2819  nitrate transport permease protein (nrtB)  31.63 
 
 
304 aa  107  2e-22  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.233469  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5439  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.38 
 
 
263 aa  107  2e-22  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.56019 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2171  nitrate transport permease  32.61 
 
 
272 aa  106  3e-22  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0149943  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3540  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.51 
 
 
258 aa  106  3e-22  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.853389  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4495  nitrate ABC transporter, inner membrane subunit  31.16 
 
 
285 aa  107  3e-22  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5011  nitrate ABC transporter, inner membrane subunit  33.02 
 
 
286 aa  106  4e-22  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.312092  normal  0.320206 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1306  nitrate ABC transporter, inner membrane subunit  33.89 
 
 
279 aa  106  4e-22  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4214  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.62 
 
 
281 aa  106  4e-22  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0055  nitrate ABC transporter, inner membrane subunit  33.16 
 
 
256 aa  105  6e-22  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4958  nitrate ABC transporter, inner membrane subunit  30.7 
 
 
285 aa  105  6e-22  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.413837  normal  0.165118 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1473  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  29.95 
 
 
306 aa  105  6e-22  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0411979  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0735  nitrate/sulfonate/bicarbonate ABC transporter inner membrane protein  28.68 
 
 
273 aa  105  8e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.714635  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5422  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.95 
 
 
269 aa  105  8e-22  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5146  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.8 
 
 
277 aa  105  9e-22  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0887356  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4508  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.8 
 
 
277 aa  105  9e-22  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.854714  normal  0.909107 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5985  putative ABC transporter (permease protein)  31.84 
 
 
255 aa  104  1e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.209656 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1848  ABC transporter permease  29.76 
 
 
273 aa  104  1e-21  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0250  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.2 
 
 
280 aa  104  1e-21  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0992  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.7 
 
 
254 aa  104  1e-21  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1957  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.76 
 
 
273 aa  104  1e-21  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0846  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.14 
 
 
255 aa  104  2e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.185051 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_12960  taurine ABC transporter permease  38.39 
 
 
272 aa  104  2e-21  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.299757  normal  0.321121 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0386  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.36 
 
 
266 aa  103  2e-21  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.314921 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0963  nitrate ABC transporter, inner membrane subunit  30.46 
 
 
281 aa  103  3e-21  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.563275 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5801  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  28.12 
 
 
290 aa  103  3e-21  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3464  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.35 
 
 
294 aa  103  3e-21  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.136656  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2935  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.53 
 
 
252 aa  103  3e-21  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4571  nitrate ABC transporter, inner membrane subunit  29.82 
 
 
280 aa  102  4e-21  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3081  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  28.89 
 
 
257 aa  102  4e-21  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0826963  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1818  ABC transporter, permease protein  32.11 
 
 
263 aa  103  4e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.493092 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3526  nitrate ABC transporter, inner membrane subunit  30.34 
 
 
280 aa  103  4e-21  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.471487 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_34320  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport system, permease component  36.31 
 
 
273 aa  102  5e-21  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2566  ABC transporter, membrane subunit  28.86 
 
 
252 aa  102  5e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.345232 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5984  putative ABC transporter (permease protein)  34.87 
 
 
255 aa  102  5e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.27636 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4817  nitrate ABC transporter, inner membrane subunit  34.24 
 
 
279 aa  102  6e-21  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.775678  hitchhiker  0.00263828 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0208  nitrate ABC transporter, permease protein, putative  31.25 
 
 
260 aa  102  7e-21  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.473726 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3295  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  29.08 
 
 
279 aa  101  9e-21  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1704  nitrate ABC transporter, inner membrane subunit  30.9 
 
 
311 aa  101  9e-21  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2787  ABC transporter, permease protein  30.12 
 
 
282 aa  101  1e-20  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0328614  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2621  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  27.2 
 
 
281 aa  101  1e-20  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000218671  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0722  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.83 
 
 
272 aa  100  2e-20  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0102858  normal  0.0961586 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1489  nitrate transport permease  29.26 
 
 
278 aa  101  2e-20  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3750  ABC nitrate/sulfonate/bicarbonate transporter, inner membrane subunit  31.06 
 
 
269 aa  100  2e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3891  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.06 
 
 
269 aa  100  2e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3807  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.06 
 
 
269 aa  100  2e-20  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3058  taurine ABC transporter, permease protein  28.37 
 
 
274 aa  100  2e-20  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2803  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  26.98 
 
 
259 aa  100  2e-20  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00122675  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>