More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Reut_B5801 on replicon NC_007348
Organism: Ralstonia eutropha JMP134



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007348  Reut_B5801  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  100 
 
 
290 aa  572  1.0000000000000001e-162  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0846  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  50.43 
 
 
255 aa  239  2.9999999999999997e-62  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.185051 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1145  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.75 
 
 
279 aa  170  2e-41  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.208956  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_03360  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport system, permease component  39.47 
 
 
278 aa  163  3e-39  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1108  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.03 
 
 
255 aa  160  2e-38  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.135552 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0467  taurine ABC transporter, permease protein, putative  35.06 
 
 
272 aa  159  4e-38  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0406  putative taurine ABC transporter, permease protein  35.06 
 
 
272 aa  159  4e-38  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3034  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.47 
 
 
269 aa  159  5e-38  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4332  ABC transporter permease  38.46 
 
 
298 aa  158  9e-38  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3818  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.86 
 
 
280 aa  158  9e-38  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.615395  normal  0.42897 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6360  putative sulfonate ABC transporter, permease protein  38.79 
 
 
267 aa  158  1e-37  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.821284  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4973  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.55 
 
 
265 aa  156  3e-37  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0722896  normal  0.022026 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_19570  ABC transporter permease  37.39 
 
 
262 aa  156  3e-37  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0254  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.55 
 
 
265 aa  156  4e-37  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.293544  normal  0.0445843 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3875  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.82 
 
 
289 aa  156  5.0000000000000005e-37  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1684  ABC transporter permease  37.39 
 
 
262 aa  155  9e-37  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0239  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.13 
 
 
265 aa  155  1e-36  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00756787 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3592  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.28 
 
 
273 aa  154  1e-36  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0263  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.13 
 
 
265 aa  154  2e-36  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.791848  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5412  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  35.71 
 
 
260 aa  152  7e-36  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.210037  hitchhiker  0.00191971 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3884  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.92 
 
 
258 aa  151  1e-35  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1380  binding-protein-dependent transporter inner membrane component  35.85 
 
 
277 aa  150  3e-35  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.153307 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0254  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  36.29 
 
 
279 aa  150  3e-35  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.57663 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1899  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.2 
 
 
275 aa  150  3e-35  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1385  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  42.41 
 
 
284 aa  149  6e-35  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0616622  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0464  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.55 
 
 
273 aa  149  8e-35  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5321  taurine ABC transporter, permease protein  34.74 
 
 
285 aa  148  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3299  putative sulfonate ABC transporter, permease protein  35.32 
 
 
286 aa  148  1.0000000000000001e-34  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.201269  normal  0.262094 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0666  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.25 
 
 
271 aa  148  1.0000000000000001e-34  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3240  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.62 
 
 
275 aa  147  2.0000000000000003e-34  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5315  aliphatic sulfonates ABC transporter, permease protein  37.39 
 
 
265 aa  147  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4875  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  36.97 
 
 
265 aa  147  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.746085  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4641  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.48 
 
 
277 aa  147  2.0000000000000003e-34  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.750363  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2621  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.07 
 
 
281 aa  147  2.0000000000000003e-34  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000218671  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3413  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.68 
 
 
271 aa  147  2.0000000000000003e-34  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0409101  normal  0.884011 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7502  ABC transporter permease  35.62 
 
 
256 aa  147  3e-34  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.50681 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1736  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.03 
 
 
264 aa  147  3e-34  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.440066  normal  0.144233 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1369  ABC transporter membrane protein  34.48 
 
 
272 aa  147  3e-34  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.0458182 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4564  taurine transporter subunit  34 
 
 
279 aa  146  4.0000000000000006e-34  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.746145 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2535  putative taurine ABC transporter, permease protein  35.34 
 
 
282 aa  146  4.0000000000000006e-34  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.254862  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1673  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.48 
 
 
263 aa  145  6e-34  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2787  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.56 
 
 
272 aa  145  6e-34  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.334714  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0765  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.59 
 
 
265 aa  145  8.000000000000001e-34  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1692  putative ABC transporter membrane protein  35.57 
 
 
281 aa  145  9e-34  Thermobifida fusca YX  Bacteria  hitchhiker  0.00465779  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_18130  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport system, permease component  37.87 
 
 
283 aa  145  1e-33  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1539  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.32 
 
 
270 aa  145  1e-33  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0890555  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1083  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.32 
 
 
270 aa  144  1e-33  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1563  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.32 
 
 
270 aa  144  1e-33  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0391  taurine transporter subunit  35.14 
 
 
275 aa  145  1e-33  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1642  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.5 
 
 
263 aa  144  2e-33  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1464  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.17 
 
 
270 aa  144  2e-33  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0183453  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00317  taurine transporter subunit  34.62 
 
 
275 aa  143  3e-33  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0442  taurine transporter subunit  34.62 
 
 
275 aa  143  3e-33  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3261  taurine transporter subunit  34.62 
 
 
275 aa  143  3e-33  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4705  nitrate/sulfonate/bicarbonate ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  35.74 
 
 
270 aa  143  3e-33  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3278  ABC transporter related protein  34.58 
 
 
257 aa  143  3e-33  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.000407876  normal  0.0335836 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00321  hypothetical protein  34.62 
 
 
275 aa  143  3e-33  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4981  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.33 
 
 
279 aa  143  3e-33  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.588836 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_44530  Binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.08 
 
 
259 aa  143  4e-33  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0634098  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0024  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.75 
 
 
264 aa  143  4e-33  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3058  taurine ABC transporter, permease protein  34.01 
 
 
274 aa  142  5e-33  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3869  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.15 
 
 
274 aa  142  6e-33  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1485  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.75 
 
 
270 aa  142  7e-33  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1911  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.36 
 
 
282 aa  142  7e-33  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2777  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.68 
 
 
292 aa  142  7e-33  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1211  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.12 
 
 
273 aa  142  8e-33  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.132759  normal  0.452833 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0981  nitrate/sulfonate/bicarbonate ABC transporter inner membrane protein  34.43 
 
 
279 aa  142  8e-33  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5005  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.94 
 
 
289 aa  142  8e-33  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0431  taurine transporter subunit  34.75 
 
 
275 aa  141  9.999999999999999e-33  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0280  taurine transporter subunit  34.75 
 
 
275 aa  141  9.999999999999999e-33  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0355  putative ABC aliphatic sulfonates transporter, permease subunit  33.47 
 
 
264 aa  140  1.9999999999999998e-32  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0231  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.95 
 
 
279 aa  140  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.33405  hitchhiker  0.000710194 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0030  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.9 
 
 
264 aa  140  1.9999999999999998e-32  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.050552  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1669  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.17 
 
 
273 aa  140  1.9999999999999998e-32  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.5369  normal  0.169212 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4149  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.84 
 
 
276 aa  140  1.9999999999999998e-32  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4306  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.21 
 
 
278 aa  140  1.9999999999999998e-32  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0649738  hitchhiker  0.00238236 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2882  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.92 
 
 
268 aa  140  1.9999999999999998e-32  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.80309  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4037  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.84 
 
 
276 aa  140  1.9999999999999998e-32  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.960786  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0423  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.47 
 
 
264 aa  140  1.9999999999999998e-32  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1763  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.41 
 
 
282 aa  140  1.9999999999999998e-32  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2304  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.86 
 
 
278 aa  140  3e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.37818 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0246  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.36 
 
 
279 aa  140  3e-32  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0570948  normal  0.0921514 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1453  alkanesulfonate transporter permease subunit  33.05 
 
 
263 aa  139  3.9999999999999997e-32  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1557  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.22 
 
 
272 aa  139  3.9999999999999997e-32  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  decreased coverage  0.00127239  hitchhiker  0.00240392 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6162  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.34 
 
 
262 aa  139  3.9999999999999997e-32  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.577279 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1776  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.58 
 
 
294 aa  139  4.999999999999999e-32  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2638  ABC sulfonate transporter, inner membrane subunit  32.86 
 
 
279 aa  139  6e-32  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0950643  hitchhiker  0.0000361652 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1822  aliphatic sulfonates ABC transporter, permease protein  35.32 
 
 
269 aa  139  7e-32  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0396  taurine transporter subunit  34.62 
 
 
275 aa  139  7.999999999999999e-32  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3035  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.31 
 
 
298 aa  138  8.999999999999999e-32  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.30367  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1238  aliphatic sulfonate ABC transporter, permease protein  35.32 
 
 
273 aa  138  1e-31  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.466833  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1990  aliphatic sulfonates ABC transporter, permease protein  35.32 
 
 
273 aa  138  1e-31  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.088895  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0780  aliphatic sulfonate ABC transporter, permease protein  35.32 
 
 
273 aa  138  1e-31  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.175921  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2566  ABC transporter, membrane subunit  36.05 
 
 
252 aa  138  1e-31  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.345232 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0840  taurine transporter subunit  36.44 
 
 
275 aa  138  1e-31  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.276647 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1724  aliphatic sulfonate ABC transporter, permease protein  35.32 
 
 
273 aa  138  1e-31  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0381  aliphatic sulfonate ABC transporter, permease protein  35.32 
 
 
273 aa  138  1e-31  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.410212  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0423  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.47 
 
 
297 aa  137  2e-31  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.283538  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1488  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  33.47 
 
 
280 aa  137  2e-31  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.106569  normal  0.790334 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3042  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.94 
 
 
292 aa  137  2e-31  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.780897  normal  0.0430449 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>