More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aave_2968 on replicon NC_008752
Organism: Acidovorax citrulli AAC00-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008752  Aave_2968  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  100 
 
 
289 aa  562  1.0000000000000001e-159  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0761961  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0146  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  83.85 
 
 
296 aa  437  1e-121  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.159688 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2858  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  80.36 
 
 
291 aa  427  1e-118  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.582448  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3642  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  82.06 
 
 
275 aa  415  9.999999999999999e-116  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.142025  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2719  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  75.35 
 
 
284 aa  408  1e-113  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2276  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  80.39 
 
 
257 aa  399  9.999999999999999e-111  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.722283  normal  0.0991744 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1046  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  76.55 
 
 
282 aa  397  1e-109  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.12004  normal  0.278615 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0155  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  82.06 
 
 
292 aa  394  1e-108  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0326  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  77.65 
 
 
257 aa  390  1e-107  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.369486  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6456  ABC transporter permease  78.82 
 
 
258 aa  367  1e-101  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.405099  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2644  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  76.68 
 
 
282 aa  352  4e-96  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.285231  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1429  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  74.41 
 
 
257 aa  340  1e-92  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.214609  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0466  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  52.28 
 
 
262 aa  207  2e-52  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2559  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.28 
 
 
283 aa  199  6e-50  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3788  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  45.18 
 
 
276 aa  197  2.0000000000000003e-49  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.374556  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5005  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.6 
 
 
267 aa  189  4e-47  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0040  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  42.54 
 
 
259 aa  186  3e-46  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.832577  normal  0.34867 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4930  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  40.68 
 
 
267 aa  176  4e-43  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3255  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.9 
 
 
294 aa  160  2e-38  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.106321 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4887  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  38.93 
 
 
296 aa  159  5e-38  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0123695  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0058  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.07 
 
 
275 aa  157  2e-37  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0254  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  36 
 
 
279 aa  156  4e-37  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.57663 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1646  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  43.04 
 
 
259 aa  156  4e-37  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3299  putative sulfonate ABC transporter, permease protein  33.76 
 
 
286 aa  152  5.9999999999999996e-36  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.201269  normal  0.262094 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0791  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.09 
 
 
320 aa  152  5.9999999999999996e-36  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1078  ABC transporter, nitrate-like  37.83 
 
 
275 aa  149  4e-35  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.193306  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0049  ABC taurine transporter, binding protein inner membrane component  35.15 
 
 
330 aa  149  4e-35  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.0656508 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0231  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.11 
 
 
279 aa  149  6e-35  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.33405  hitchhiker  0.000710194 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5226  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.18 
 
 
323 aa  147  2.0000000000000003e-34  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.226274  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1386  nitrate/sulfonate/bicarbonate ABC transporter inner membrane protein  37.02 
 
 
323 aa  147  2.0000000000000003e-34  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.173943  normal  0.101646 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3907  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.6 
 
 
357 aa  146  3e-34  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0334046  normal  0.137928 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3729  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.24 
 
 
353 aa  146  4.0000000000000006e-34  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.19574 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4981  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.46 
 
 
279 aa  146  4.0000000000000006e-34  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.588836 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4024  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.72 
 
 
353 aa  145  6e-34  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5556  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.32 
 
 
324 aa  145  1e-33  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0488095  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5921  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.32 
 
 
324 aa  145  1e-33  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5321  taurine ABC transporter, permease protein  35.02 
 
 
285 aa  144  2e-33  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1108  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.48 
 
 
255 aa  144  2e-33  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.135552 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6428  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.32 
 
 
324 aa  144  2e-33  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0246  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.5 
 
 
279 aa  143  3e-33  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0570948  normal  0.0921514 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3082  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40 
 
 
319 aa  142  8e-33  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0255  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.83 
 
 
279 aa  142  9e-33  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.796344  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0085  taurine ABC transporter inner membrane protein  34.52 
 
 
283 aa  137  2e-31  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.664827  normal  0.135193 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1858  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.8 
 
 
321 aa  136  4e-31  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3464  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.73 
 
 
294 aa  135  8e-31  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.136656  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1787  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  36.57 
 
 
326 aa  134  1.9999999999999998e-30  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1488  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  32.23 
 
 
280 aa  133  3e-30  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.106569  normal  0.790334 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2883  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.47 
 
 
289 aa  133  3e-30  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0403  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.35 
 
 
256 aa  133  3e-30  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1575  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.25 
 
 
254 aa  132  3.9999999999999996e-30  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0747147  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4060  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  33.62 
 
 
256 aa  132  6e-30  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2621  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.97 
 
 
281 aa  132  9e-30  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000218671  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0080  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  41.54 
 
 
318 aa  132  9e-30  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2477  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.04 
 
 
289 aa  132  9e-30  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0948255  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1470  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  31.18 
 
 
301 aa  131  1.0000000000000001e-29  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4641  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.93 
 
 
277 aa  131  1.0000000000000001e-29  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.750363  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0047  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.96 
 
 
306 aa  131  1.0000000000000001e-29  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4207  ABC taurine transporter, inner membrane subunit  34.15 
 
 
289 aa  130  2.0000000000000002e-29  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3459  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.47 
 
 
283 aa  129  4.0000000000000003e-29  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.703735  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0509  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.01 
 
 
289 aa  129  4.0000000000000003e-29  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.085274 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4564  taurine transporter subunit  30.97 
 
 
279 aa  128  1.0000000000000001e-28  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.746145 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0250  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.48 
 
 
280 aa  128  1.0000000000000001e-28  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1575  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32 
 
 
266 aa  128  1.0000000000000001e-28  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1171  taurine ABC transporter permease  32.52 
 
 
272 aa  127  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.104716  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3295  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  32.23 
 
 
279 aa  127  3e-28  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1669  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.04 
 
 
273 aa  127  3e-28  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.5369  normal  0.169212 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0761  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.45 
 
 
412 aa  127  3e-28  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2304  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.86 
 
 
278 aa  127  3e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.37818 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1083  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.19 
 
 
270 aa  126  4.0000000000000003e-28  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1563  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.19 
 
 
270 aa  126  4.0000000000000003e-28  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1539  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.19 
 
 
270 aa  126  4.0000000000000003e-28  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0890555  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4108  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.42 
 
 
283 aa  126  4.0000000000000003e-28  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1763  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.13 
 
 
282 aa  126  4.0000000000000003e-28  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1957  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.01 
 
 
273 aa  126  5e-28  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4705  nitrate/sulfonate/bicarbonate ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  34.04 
 
 
270 aa  126  5e-28  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1848  ABC transporter permease  34.01 
 
 
273 aa  126  5e-28  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1464  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.19 
 
 
270 aa  126  5e-28  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0183453  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1210  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.76 
 
 
315 aa  125  6e-28  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4371  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.06 
 
 
306 aa  125  6e-28  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.17867  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5517  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.47 
 
 
256 aa  125  9e-28  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.16627  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3869  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.86 
 
 
274 aa  125  1e-27  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1822  aliphatic sulfonates ABC transporter, permease protein  33.19 
 
 
269 aa  124  1e-27  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0692  ABC taurine transporter, inner membrane subunit  33.06 
 
 
306 aa  124  1e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00000000618741  normal  0.0440204 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1485  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.75 
 
 
270 aa  124  2e-27  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1837  aliphatic sulfonates ABC transporter, permease protein  33.19 
 
 
269 aa  123  4e-27  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.669476  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0260  taurine transporter subunit  30.51 
 
 
284 aa  123  4e-27  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3936  taurine transporter subunit  30.51 
 
 
284 aa  123  4e-27  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2220  taurine ABC transporter, permease protein  33.04 
 
 
283 aa  123  4e-27  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.215273  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2492  ABC aliphatic sulfonates transporter, innermembrane subunit  32.31 
 
 
280 aa  123  4e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.773133 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3693  taurine transporter subunit  30.51 
 
 
284 aa  123  4e-27  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1238  aliphatic sulfonate ABC transporter, permease protein  33.05 
 
 
273 aa  123  5e-27  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.466833  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0780  aliphatic sulfonate ABC transporter, permease protein  33.05 
 
 
273 aa  123  5e-27  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.175921  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1990  aliphatic sulfonates ABC transporter, permease protein  33.05 
 
 
273 aa  123  5e-27  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.088895  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6225  nitrate/sulfonate/bicarbonate ABC transporter inner membrane protein  32.93 
 
 
320 aa  122  5e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0397  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.24 
 
 
285 aa  122  5e-27  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.987071 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3413  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.16 
 
 
271 aa  122  5e-27  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0409101  normal  0.884011 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1724  aliphatic sulfonate ABC transporter, permease protein  33.05 
 
 
273 aa  123  5e-27  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0381  aliphatic sulfonate ABC transporter, permease protein  33.05 
 
 
273 aa  123  5e-27  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.410212  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1673  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.02 
 
 
263 aa  122  6e-27  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0676  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.19 
 
 
279 aa  122  6e-27  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.30868 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>