More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tbis_1323 on replicon NC_014165
Organism: Thermobispora bispora DSM 43833



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014165  Tbis_1323  binding-protein-dependent transporter inner membrane component  100 
 
 		 260 aa  500  1e-140  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0560082 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1503  taurine ABC transporter, permease protein  69.96 
 
 		 288 aa  317  1e-85  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4844  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  48.33 
 
 		 288 aa  236  2e-61  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0104  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  50.74 
 
 		 286 aa  219  5e-56  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.424876  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0113  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  50.74 
 
 		 286 aa  219  5e-56  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0961261 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0094  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  50.74 
 
 		 286 aa  216  2.9999999999999998e-55  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.062918 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2535  putative taurine ABC transporter, permease protein  46.4 
 
 		 282 aa  209  3e-53  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.254862  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0724  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  54.33 
 
 		 273 aa  206  3e-52  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0121  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  53.73 
 
 		 292 aa  202  3e-51  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1371  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  50.57 
 
 		 287 aa  195  6e-49  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.530439  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00317  taurine transporter subunit  44.44 
 
 		 275 aa  193  3e-48  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3261  taurine transporter subunit  44.44 
 
 		 275 aa  193  3e-48  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00321  hypothetical protein  44.44 
 
 		 275 aa  193  3e-48  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3240  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  43.08 
 
 		 275 aa  191  1e-47  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0254  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  43.58 
 
 		 279 aa  188  5.999999999999999e-47  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.57663 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2133  taurine ABC transporter, permease protein  47.51 
 
 		 283 aa  188  7e-47  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.186654  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0620  permease component of taurine ABC transporter  47.51 
 
 		 253 aa  188  8e-47  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  decreased coverage  0.00192231  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2220  taurine ABC transporter, permease protein  47.51 
 
 		 283 aa  188  9e-47  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.215273  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1580  taurine ABC transporter, permease protein  47.73 
 
 		 253 aa  188  9e-47  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.477521  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2019  taurine ABC transporter, permease protein  47.73 
 
 		 285 aa  188  9e-47  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.484134  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0442  taurine transporter subunit  43.08 
 
 		 275 aa  187  1e-46  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0697  taurine ABC transporter, permease protein  47.73 
 
 		 283 aa  187  1e-46  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0391  taurine transporter subunit  43.08 
 
 		 275 aa  187  1e-46  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1488  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  43.21 
 
 		 280 aa  187  2e-46  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.106569  normal  0.790334 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4564  taurine transporter subunit  43.37 
 
 		 279 aa  186  2e-46  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.746145 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3138  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.68 
 
 		 286 aa  186  3e-46  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.453695  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0280  taurine transporter subunit  42.69 
 
 		 275 aa  185  7e-46  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0431  taurine transporter subunit  42.69 
 
 		 275 aa  185  7e-46  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0802  taurine ABC transporter, permease protein  45.75 
 
 		 283 aa  185  8e-46  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.207449  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3693  taurine transporter subunit  41.37 
 
 		 284 aa  184  1.0000000000000001e-45  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3936  taurine transporter subunit  41.37 
 
 		 284 aa  184  1.0000000000000001e-45  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0260  taurine transporter subunit  41.37 
 
 		 284 aa  184  1.0000000000000001e-45  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0396  taurine transporter subunit  44.05 
 
 		 275 aa  183  2.0000000000000003e-45  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0231  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  43.62 
 
 		 279 aa  179  2.9999999999999997e-44  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.33405  hitchhiker  0.000710194 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5321  taurine ABC transporter, permease protein  44.07 
 
 		 285 aa  178  8e-44  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0692  ABC taurine transporter, inner membrane subunit  40.24 
 
 		 306 aa  175  9e-43  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00000000618741  normal  0.0440204 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0840  taurine transporter subunit  43.56 
 
 		 275 aa  173  1.9999999999999998e-42  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.276647 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4371  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.24 
 
 		 306 aa  173  1.9999999999999998e-42  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.17867  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4981  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  43.46 
 
 		 279 aa  174  1.9999999999999998e-42  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.588836 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0246  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  44.2 
 
 		 279 aa  173  1.9999999999999998e-42  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0570948  normal  0.0921514 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6162  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.38 
 
 		 262 aa  172  5.999999999999999e-42  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.577279 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4861  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.96 
 
 		 275 aa  172  6.999999999999999e-42  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0877464 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3505  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.85 
 
 		 275 aa  171  1e-41  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.197989  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0255  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  43.64 
 
 		 279 aa  170  2e-41  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.796344  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0049  ABC taurine transporter, binding protein inner membrane component  40.32 
 
 		 330 aa  169  6e-41  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.0656508 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0761  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  43.75 
 
 		 412 aa  168  1e-40  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0085  taurine ABC transporter inner membrane protein  41.15 
 
 		 283 aa  166  2.9999999999999998e-40  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.664827  normal  0.135193 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1470  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  40.73 
 
 		 301 aa  166  4e-40  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6225  nitrate/sulfonate/bicarbonate ABC transporter inner membrane protein  41.57 
 
 		 320 aa  166  4e-40  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5576  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  42.98 
 
 		 284 aa  163  3e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1171  taurine ABC transporter permease  42.27 
 
 		 272 aa  162  4.0000000000000004e-39  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.104716  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3058  taurine ABC transporter, permease protein  37.97 
 
 		 274 aa  161  8.000000000000001e-39  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1108  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.52 
 
 		 255 aa  161  1e-38  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.135552 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4207  ABC taurine transporter, inner membrane subunit  41.13 
 
 		 289 aa  159  3e-38  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6203  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.52 
 
 		 284 aa  159  4e-38  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.780444  normal  0.280504 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0421  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  43.16 
 
 		 321 aa  159  6e-38  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.905374 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4284  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.89 
 
 		 272 aa  158  7e-38  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0949532  normal  1 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7166  taurine uptake ABC transporter permease protein  40.32 
 
 		 261 aa  158  8e-38  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2269  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  42.92 
 
 		 321 aa  158  9e-38  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2894  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  42.92 
 
 		 321 aa  158  9e-38  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.438311 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2884  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  42.92 
 
 		 269 aa  158  9e-38  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1763  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.84 
 
 		 282 aa  157  1e-37  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3060  taurine ABC transporter, permease protein  35.89 
 
 		 274 aa  157  2e-37  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0244271  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2748  sulfonate/taurine ABC transporter permease  35.89 
 
 		 274 aa  156  3e-37  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.947189  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0509  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.98 
 
 		 289 aa  156  4e-37  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.085274 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_12960  taurine ABC transporter permease  42.27 
 
 		 272 aa  155  9e-37  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.299757  normal  0.321121 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6082  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.24 
 
 		 296 aa  153  2.9999999999999998e-36  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.201741 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3844  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.52 
 
 		 293 aa  152  7e-36  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1402  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.6 
 
 		 257 aa  152  7e-36  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2883  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.55 
 
 		 289 aa  150  2e-35  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2477  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.55 
 
 		 289 aa  149  4e-35  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0948255  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3869  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.8 
 
 		 274 aa  147  1.0000000000000001e-34  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_21990  ABC transporter, inner membrane permease component  38.17 
 
 		 273 aa  148  1.0000000000000001e-34  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1800  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.36 
 
 		 257 aa  147  1.0000000000000001e-34  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0047  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.64 
 
 		 306 aa  146  3e-34  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1127  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.14 
 
 		 267 aa  144  1e-33  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2152  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  34.8 
 
 		 271 aa  142  5e-33  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.529987 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_21600  aliphatic sulfonates ABC transporter, inner membrane component  34.16 
 
 		 284 aa  142  5e-33  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0766  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.38 
 
 		 260 aa  142  5e-33  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3818  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.97 
 
 		 280 aa  142  6e-33  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.615395  normal  0.42897 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1380  binding-protein-dependent transporter inner membrane component  35.44 
 
 		 277 aa  142  7e-33  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.153307 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2803  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.3 
 
 		 259 aa  141  9.999999999999999e-33  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00122675  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4641  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.32 
 
 		 277 aa  140  1.9999999999999998e-32  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.750363  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2621  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.18 
 
 		 281 aa  140  3e-32  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000218671  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5517  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.82 
 
 		 256 aa  140  3e-32  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.16627  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0483  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.5 
 
 		 275 aa  139  3e-32  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1746  putative molybdenum ABC transporter, solute-binding protein  27.27 
 
 		 249 aa  139  3.9999999999999997e-32  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  hitchhiker  0.000716411  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1211  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.46 
 
 		 273 aa  139  3.9999999999999997e-32  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.132759  normal  0.452833 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5005  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.13 
 
 		 289 aa  137  1e-31  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4051  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.65 
 
 		 273 aa  137  2e-31  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.395379 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3592  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.45 
 
 		 273 aa  137  2e-31  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1422  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.06 
 
 		 273 aa  137  2e-31  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1261  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.06 
 
 		 273 aa  137  2e-31  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.306936 
 
 
-
 
NC_004311  BRA1188  taurine ABC transporter, permease protein  36.32 
 
 		 250 aa  137  3.0000000000000003e-31  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0612406  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1998  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.19 
 
 		 283 aa  136  3.0000000000000003e-31  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.894639  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3280  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.62 
 
 		 286 aa  136  3.0000000000000003e-31  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0981  nitrate/sulfonate/bicarbonate ABC transporter inner membrane protein  34.16 
 
 		 279 aa  136  4e-31  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3459  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.18 
 
 		 283 aa  135  5e-31  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.703735  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4060  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  32.92 
 
 		 256 aa  135  6.0000000000000005e-31  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3891  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.18 
 
 		 269 aa  135  7.000000000000001e-31  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>