More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Adeh_3819 on replicon NC_007760
Organism: Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007760  Adeh_3819  ABC transporter, inner membrane subunit  100 
 
 
579 aa  1113    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0769  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  44.08 
 
 
570 aa  479  1e-134  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4549  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  47.2 
 
 
578 aa  476  1e-133  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.035099  normal  0.978203 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0890  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  47.54 
 
 
583 aa  448  1.0000000000000001e-124  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.807719  hitchhiker  0.00198291 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0165  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  46.64 
 
 
574 aa  442  1e-123  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.336199  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4593  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  45.55 
 
 
581 aa  434  1e-120  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.477962  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0803  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  46.48 
 
 
576 aa  414  1e-114  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.759355 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7462  ABC transporter permease  46.04 
 
 
585 aa  406  1.0000000000000001e-112  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.900156 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1105  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.7 
 
 
572 aa  407  1.0000000000000001e-112  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.270543  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3371  putative transmembrane ABC transporter protein  45.23 
 
 
586 aa  404  1e-111  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3030  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  44.57 
 
 
584 aa  402  1e-111  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.374129  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4605  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  43.61 
 
 
584 aa  403  1e-111  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.242403 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4140  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  43.71 
 
 
584 aa  399  9.999999999999999e-111  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.406581 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5725  nitrate/sulfonate/bicarbonate ABC transporter inner membrane protein  44.51 
 
 
585 aa  397  1e-109  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5526  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  43.84 
 
 
584 aa  398  1e-109  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.775381  normal  0.572944 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3610  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  43.84 
 
 
584 aa  398  1e-109  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.77824  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4757  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  43.84 
 
 
584 aa  398  1e-109  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.247948 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0971  ABC anion transporter, fused inner membrane subunits  43.53 
 
 
583 aa  393  1e-108  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3466  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  44.32 
 
 
577 aa  389  1e-107  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.222584 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2307  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  43.71 
 
 
585 aa  390  1e-107  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.81894  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0892  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  44.67 
 
 
584 aa  390  1e-107  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0183914 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4538  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  44.32 
 
 
577 aa  389  1e-107  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.641004 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3899  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  44.34 
 
 
583 aa  389  1e-107  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0820586  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1786  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  43.71 
 
 
585 aa  392  1e-107  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2402  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  43.71 
 
 
585 aa  392  1e-107  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.139086  normal  0.0182448 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5498  ABC-type anion transport system, duplicated permease component  42.54 
 
 
556 aa  390  1e-107  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.775404  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2443  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  43.71 
 
 
585 aa  390  1e-107  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.343058  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2398  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  43.71 
 
 
585 aa  392  1e-107  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0891298  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0346  ABC transporter, permease protein  39.75 
 
 
582 aa  390  1e-107  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3246  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  43.85 
 
 
594 aa  386  1e-106  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0896  ABC transporter, permease protein  43.89 
 
 
585 aa  387  1e-106  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1129  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  42.94 
 
 
583 aa  387  1e-106  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3383  nitrate/sulfonate/bicarbonate ABC transporter inner membrane protein  42.94 
 
 
583 aa  386  1e-106  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.797393  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3569  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  44.74 
 
 
594 aa  387  1e-106  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1269  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  44.13 
 
 
582 aa  387  1e-106  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0692  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  43.59 
 
 
578 aa  385  1e-106  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0754  ABC transporter, permease protein  43.92 
 
 
585 aa  382  1e-105  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1256  ABC transporter, permease protein  43.92 
 
 
585 aa  382  1e-105  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1103  ABC transporter, permease protein  43.92 
 
 
585 aa  382  1e-105  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.790132  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0622  ABC transporter, permease protein  45.89 
 
 
577 aa  383  1e-105  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.974314  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1098  ABC transporter, permease protein  43.92 
 
 
585 aa  382  1e-105  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3185  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  45.74 
 
 
581 aa  384  1e-105  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.583197  normal 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1570  ABC transporter, permease protein  43.92 
 
 
585 aa  382  1e-105  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0850001  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3027  ABC transporter, permease protein  43.92 
 
 
585 aa  382  1e-105  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0469117  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0270  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  45.99 
 
 
582 aa  381  1e-104  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.371036  normal  0.381405 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2156  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  43.5 
 
 
584 aa  380  1e-104  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.856816  hitchhiker  0.00000224525 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7488  ABC transporter permease  42.38 
 
 
577 aa  380  1e-104  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.124133 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1455  ABC transporter permease  41.67 
 
 
585 aa  375  1e-103  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.754425  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0997  ABC transporter, permease protein  43.74 
 
 
585 aa  378  1e-103  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0431  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  43.07 
 
 
578 aa  375  1e-102  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2950  ABC transporter, permease protein  44.4 
 
 
538 aa  371  1e-101  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0135  hypothetical protein  39.41 
 
 
579 aa  370  1e-101  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0120  hypothetical protein  39.41 
 
 
579 aa  370  1e-101  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5091  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  43.15 
 
 
584 aa  369  1e-101  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1967  ABC transporter, permease protein  41.28 
 
 
581 aa  370  1e-101  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0234  ABC transporter permease protein  41.51 
 
 
581 aa  369  1e-101  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.198469  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6181  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  44.22 
 
 
577 aa  370  1e-101  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.247341  normal  0.752378 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1757  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  45.34 
 
 
584 aa  371  1e-101  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5551  ABC transporter, permease protein  43.1 
 
 
584 aa  366  1e-100  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1825  putative nitrate transport system permease protein  44.18 
 
 
584 aa  368  1e-100  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0524  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  43.31 
 
 
579 aa  367  1e-100  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0112  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  43.31 
 
 
578 aa  365  1e-99  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.827494  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0759  ABC transporter, permease protein  45.23 
 
 
577 aa  365  1e-99  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0770  ABC transporter, permease protein  45.22 
 
 
577 aa  363  3e-99  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0935  putative transmembrane transporter  45.28 
 
 
576 aa  363  5.0000000000000005e-99  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4340  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  43.93 
 
 
602 aa  362  1e-98  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.170409 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5923  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  43.12 
 
 
600 aa  360  4e-98  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.904436  normal  0.911733 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3324  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  43.08 
 
 
588 aa  358  1.9999999999999998e-97  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1616  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  42.11 
 
 
578 aa  357  2.9999999999999997e-97  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.294522 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0405  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  38.89 
 
 
573 aa  329  9e-89  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.00121566  decreased coverage  0.00950402 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1438  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.94 
 
 
577 aa  325  2e-87  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3546  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.4 
 
 
575 aa  317  5e-85  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0109  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  42.32 
 
 
671 aa  212  2e-53  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4556  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.2 
 
 
670 aa  204  3e-51  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3497  hypothetical protein  44.92 
 
 
671 aa  202  9.999999999999999e-51  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1021  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  46.61 
 
 
671 aa  189  1e-46  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.32204 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0283  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.92 
 
 
468 aa  177  4e-43  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1259  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  28.21 
 
 
459 aa  170  8e-41  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0189  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.56 
 
 
458 aa  161  2e-38  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0897  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  25.14 
 
 
553 aa  152  1e-35  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.14778  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1376  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  24.29 
 
 
538 aa  143  9.999999999999999e-33  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.856839  hitchhiker  0.00160873 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0013  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.56 
 
 
497 aa  137  5e-31  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0271  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  23.5 
 
 
536 aa  134  3.9999999999999996e-30  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0678  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.89 
 
 
453 aa  112  2.0000000000000002e-23  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.105704 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1557  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  26.84 
 
 
260 aa  70.9  0.00000000007  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  0.0000000228451  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1982  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  27.18 
 
 
266 aa  65.9  0.000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.187248  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3654  nitrate transport permease  24.47 
 
 
273 aa  64.7  0.000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0055  nitrate ABC transporter, inner membrane subunit  26.97 
 
 
256 aa  65.1  0.000000004  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3901  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  28.48 
 
 
255 aa  64.7  0.000000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0566341  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2337  nitrate ABC transporter, inner membrane subunit  28.48 
 
 
282 aa  65.1  0.000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1145  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  25.27 
 
 
279 aa  63.9  0.000000007  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.208956  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4508  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.33 
 
 
277 aa  63.9  0.000000008  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.854714  normal  0.909107 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2358  nitrate/sulfonate/bicarbonate ABC transporter inner membrane protein  30.49 
 
 
269 aa  63.9  0.000000008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.540869 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1347  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  25.68 
 
 
260 aa  63.5  0.000000009  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.000000648082  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1238  nitrate transport permease  26.88 
 
 
279 aa  63.2  0.00000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1704  nitrate ABC transporter, inner membrane subunit  29.8 
 
 
311 aa  63.2  0.00000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5146  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.12 
 
 
277 aa  63.5  0.00000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0887356  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1026  nitrate transport permease  26.06 
 
 
279 aa  62.4  0.00000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.174596 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1812  ABC transporter, permease protein  31.11 
 
 
257 aa  62.8  0.00000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.554956  normal  0.627316 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2103  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  27.86 
 
 
263 aa  62  0.00000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.153016  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>