More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dhaf_3901 on replicon NC_011830
Organism: Desulfitobacterium hafniense DCB-2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011830  Dhaf_3901  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  100 
 
 
255 aa  501  1e-141  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0566341  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2682  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.45 
 
 
263 aa  137  2e-31  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1806  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.99 
 
 
263 aa  136  3.0000000000000003e-31  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0565837  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0438  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.86 
 
 
251 aa  134  9.999999999999999e-31  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.865643  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1347  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  32.21 
 
 
260 aa  123  3e-27  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.000000648082  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0856  ABC-type transport system, permease component  33.33 
 
 
245 aa  119  3e-26  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.376745  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2358  nitrate/sulfonate/bicarbonate ABC transporter inner membrane protein  26.61 
 
 
269 aa  119  3e-26  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.540869 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0211  ABC transporter permease  31.42 
 
 
243 aa  117  1.9999999999999998e-25  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.0000181791  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1557  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  28.07 
 
 
260 aa  116  3.9999999999999997e-25  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  0.0000000228451  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_03220  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport system, permease component  30.46 
 
 
394 aa  112  5e-24  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal  0.0264449 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0423  abcb protein  32.59 
 
 
265 aa  112  5e-24  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1932  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  28.99 
 
 
275 aa  111  1.0000000000000001e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.498901  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1982  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  31.52 
 
 
266 aa  110  2.0000000000000002e-23  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.187248  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0735  nitrate/sulfonate/bicarbonate ABC transporter inner membrane protein  30.48 
 
 
273 aa  108  6e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.714635  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0492  sulfonate/nitrate/taurine transport system permease protein  28.84 
 
 
274 aa  108  8.000000000000001e-23  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.218596  normal  0.461447 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1147  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.5 
 
 
244 aa  107  2e-22  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.00218262  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0464  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.57 
 
 
288 aa  107  3e-22  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.349721  hitchhiker  0.00645779 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7932  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.38 
 
 
283 aa  106  3e-22  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1452  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31 
 
 
287 aa  105  9e-22  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.100021 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3058  taurine ABC transporter, permease protein  25.1 
 
 
274 aa  104  1e-21  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0114  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.68 
 
 
286 aa  103  2e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.703431 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5146  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.7 
 
 
277 aa  103  2e-21  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0887356  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4508  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.33 
 
 
277 aa  103  3e-21  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.854714  normal  0.909107 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6545  ABC transporter permease  33.1 
 
 
269 aa  102  4e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.276106 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5824  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.37 
 
 
271 aa  102  5e-21  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.371064  hitchhiker  0.00175636 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1673  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.07 
 
 
263 aa  101  1e-20  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2621  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  26.14 
 
 
281 aa  101  1e-20  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000218671  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1679  ABC transporter permease  28.42 
 
 
274 aa  100  2e-20  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.451747  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2613  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  27.8 
 
 
258 aa  100  2e-20  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.561949  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0135  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.28 
 
 
257 aa  100  2e-20  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.983442  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2894  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  28.29 
 
 
280 aa  100  2e-20  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.42556  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0355  putative ABC aliphatic sulfonates transporter, permease subunit  31.07 
 
 
264 aa  99.8  3e-20  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0423  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.07 
 
 
264 aa  99.8  3e-20  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0520  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.7 
 
 
265 aa  99.8  4e-20  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.231998 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4037  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.68 
 
 
263 aa  99  6e-20  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.0219974 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4785  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  27.69 
 
 
270 aa  99  6e-20  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.00152285  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_19510  ABC transporter permease  28.42 
 
 
274 aa  99  6e-20  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1642  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.1 
 
 
263 aa  99  7e-20  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0030  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30 
 
 
264 aa  99  7e-20  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.050552  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2638  ABC sulfonate transporter, inner membrane subunit  30.2 
 
 
279 aa  98.6  8e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0950643  hitchhiker  0.0000361652 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0340  putative sulfonate transport system permease protein  33.33 
 
 
248 aa  98.6  8e-20  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0877  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.22 
 
 
241 aa  98.2  1e-19  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.397632  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1453  alkanesulfonate transporter permease subunit  31.22 
 
 
263 aa  97.8  1e-19  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2132  ABC nitrate/sulfonate/bicarbonate transporter, inner membrane subunit  30.81 
 
 
262 aa  98.6  1e-19  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3643  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  24.24 
 
 
252 aa  97.1  2e-19  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000799696  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2846  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.97 
 
 
260 aa  97.1  3e-19  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.000143494  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3060  taurine ABC transporter, permease protein  26.07 
 
 
274 aa  96.7  3e-19  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0244271  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0687  two-component system, permease component  31.13 
 
 
258 aa  96.7  3e-19  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0143417  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1210  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  28.25 
 
 
315 aa  96.7  3e-19  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1736  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.24 
 
 
264 aa  97.1  3e-19  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.440066  normal  0.144233 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2748  sulfonate/taurine ABC transporter permease  26.07 
 
 
274 aa  96.7  3e-19  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.947189  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3295  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  28.98 
 
 
279 aa  96.7  3e-19  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4564  taurine transporter subunit  31.03 
 
 
279 aa  96.3  4e-19  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.746145 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0981  nitrate/sulfonate/bicarbonate ABC transporter inner membrane protein  29.02 
 
 
279 aa  96.3  4e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1759  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.16 
 
 
244 aa  96.7  4e-19  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.895228 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0483  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  26.29 
 
 
275 aa  95.9  5e-19  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0423  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  27.31 
 
 
297 aa  96.3  5e-19  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.283538  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1402  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  28.04 
 
 
257 aa  95.5  6e-19  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0024  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.57 
 
 
264 aa  95.9  6e-19  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0260  taurine transporter subunit  31.96 
 
 
284 aa  94.4  2e-18  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2787  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  27.4 
 
 
272 aa  94.4  2e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.334714  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3936  taurine transporter subunit  31.96 
 
 
284 aa  94.4  2e-18  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4168  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  27.78 
 
 
272 aa  94  2e-18  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.95605  normal  0.544796 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3693  taurine transporter subunit  31.96 
 
 
284 aa  94.4  2e-18  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4420  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.36 
 
 
279 aa  94.4  2e-18  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.25857  normal 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7221  ABC transporter membrane spanning protein (nitrate/sulfonates)  24.55 
 
 
282 aa  94  2e-18  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.735165  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3883  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  27.06 
 
 
262 aa  93.6  3e-18  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4330  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  28.57 
 
 
276 aa  93.6  3e-18  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.936191 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3008  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  25.36 
 
 
280 aa  93.2  4e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2583  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  25.78 
 
 
289 aa  92.8  5e-18  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2622  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  25.78 
 
 
289 aa  92.8  5e-18  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.753313  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2628  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  25.78 
 
 
289 aa  92.8  5e-18  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.128032  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1076  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.31 
 
 
269 aa  92.4  6e-18  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.406887  normal  0.454808 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1800  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  27.57 
 
 
257 aa  92.4  6e-18  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2712  sulfonate ABC transporter permease  27.4 
 
 
282 aa  92.4  7e-18  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2920  sulfonate ABC transporter permease protein  27.4 
 
 
282 aa  92.4  7e-18  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0231  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.95 
 
 
279 aa  92  8e-18  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.33405  hitchhiker  0.000710194 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1261  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.56 
 
 
273 aa  92  8e-18  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.306936 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1422  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.56 
 
 
273 aa  92  8e-18  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4981  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.89 
 
 
279 aa  92  8e-18  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.588836 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_19570  ABC transporter permease  31.22 
 
 
262 aa  92  8e-18  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1031  sulfonate ABC transporter, permease protein  25.74 
 
 
261 aa  91.7  9e-18  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0856  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.24 
 
 
291 aa  91.7  9e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.678163  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0154  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  28.93 
 
 
264 aa  91.3  1e-17  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4035  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  28.48 
 
 
287 aa  91.7  1e-17  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0678072 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2152  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  29.34 
 
 
271 aa  91.7  1e-17  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.529987 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1865  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  27.75 
 
 
256 aa  91.3  1e-17  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2553  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  26.11 
 
 
275 aa  91.3  1e-17  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3299  putative sulfonate ABC transporter, permease protein  26.67 
 
 
286 aa  91.7  1e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.201269  normal  0.262094 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2356  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.52 
 
 
260 aa  91.7  1e-17  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0332  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  26.98 
 
 
279 aa  91.3  1e-17  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.692278  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0246  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.05 
 
 
279 aa  91.7  1e-17  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0570948  normal  0.0921514 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1684  ABC transporter permease  29.41 
 
 
262 aa  90.5  2e-17  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3934  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32 
 
 
259 aa  90.5  2e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2515  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  26.83 
 
 
282 aa  90.9  2e-17  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.313862  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1929  putative sulfonate ABC transporter, permease protein  27.19 
 
 
255 aa  90.5  3e-17  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0770518  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4051  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.95 
 
 
273 aa  90.1  3e-17  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.395379 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1211  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.56 
 
 
273 aa  90.1  3e-17  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.132759  normal  0.452833 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0928  nitrate/sulfonate/bicarbonate ABC transporter inner membrane protein  23.85 
 
 
255 aa  90.1  3e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.590061  normal  0.182245 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3255  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  25.76 
 
 
294 aa  90.5  3e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.106321 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>