More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrad2831_5824 on replicon NC_010510
Organism: Methylobacterium radiotolerans JCM 2831



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010510  Mrad2831_5824  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  100 
 
 
271 aa  521  1e-147  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.371064  hitchhiker  0.00175636 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2358  nitrate/sulfonate/bicarbonate ABC transporter inner membrane protein  66.41 
 
 
269 aa  334  9e-91  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.540869 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0928  nitrate/sulfonate/bicarbonate ABC transporter inner membrane protein  32 
 
 
255 aa  127  2.0000000000000002e-28  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.590061  normal  0.182245 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0438  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.09 
 
 
251 aa  125  9e-28  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.865643  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2851  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.96 
 
 
285 aa  124  1e-27  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.328809  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1806  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.64 
 
 
263 aa  122  7e-27  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0565837  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1982  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  30 
 
 
266 aa  120  1.9999999999999998e-26  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.187248  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3901  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.52 
 
 
255 aa  120  1.9999999999999998e-26  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0566341  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1347  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  30.67 
 
 
260 aa  119  6e-26  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.000000648082  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2682  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.33 
 
 
263 aa  112  4.0000000000000004e-24  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0687  two-component system, permease component  29.36 
 
 
258 aa  112  7.000000000000001e-24  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0143417  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0426  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.03 
 
 
258 aa  111  1.0000000000000001e-23  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1557  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  28.03 
 
 
260 aa  111  2.0000000000000002e-23  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  0.0000000228451  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0856  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  28.52 
 
 
291 aa  110  2.0000000000000002e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.678163  normal 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0423  abcb protein  30.99 
 
 
265 aa  110  3e-23  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1759  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.04 
 
 
244 aa  108  1e-22  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.895228 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2553  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  28.52 
 
 
275 aa  108  1e-22  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2776  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.61 
 
 
245 aa  106  4e-22  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0898999 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4785  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.66 
 
 
270 aa  106  4e-22  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.00152285  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3934  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.22 
 
 
259 aa  104  2e-21  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1439  nitrate ABC transporter, inner membrane subunit  32.61 
 
 
310 aa  103  3e-21  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.062597  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2143  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  28.82 
 
 
244 aa  103  4e-21  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.611067  normal  0.421557 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3869  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.23 
 
 
274 aa  102  7e-21  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2935  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  28.86 
 
 
252 aa  102  9e-21  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1734  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.35 
 
 
252 aa  102  9e-21  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2732  nitrate ABC transporter, inner membrane subunit  32 
 
 
304 aa  101  2e-20  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0882865  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1542  nitrate ABC transporter, inner membrane subunit  32 
 
 
304 aa  101  2e-20  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.244375  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2803  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.9 
 
 
259 aa  100  2e-20  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00122675  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0326  nitrate transport permease  31.1 
 
 
295 aa  100  2e-20  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2104  nitrate ABC transporter, inner membrane subunit  31.16 
 
 
283 aa  100  2e-20  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0291571  normal  0.0240092 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3642  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.29 
 
 
275 aa  100  2e-20  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.142025  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2719  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  28.63 
 
 
284 aa  100  3e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1031  sulfonate ABC transporter, permease protein  27.39 
 
 
261 aa  100  3e-20  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_34320  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport system, permease component  32.52 
 
 
273 aa  100  3e-20  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1807  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  28.38 
 
 
244 aa  100  3e-20  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.5785  normal  0.739795 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2613  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.67 
 
 
258 aa  100  3e-20  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.561949  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_03220  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport system, permease component  30.04 
 
 
394 aa  100  4e-20  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal  0.0264449 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3842  nitrate ABC transporter, inner membrane subunit  30.17 
 
 
331 aa  99.8  4e-20  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1238  nitrate transport permease  30.77 
 
 
279 aa  99.4  5e-20  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1261  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  28.24 
 
 
273 aa  99.4  6e-20  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.306936 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1422  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  28.24 
 
 
273 aa  99.4  6e-20  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1575  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  26.02 
 
 
266 aa  99  7e-20  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1056  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.86 
 
 
266 aa  99  7e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.498595  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2152  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  27.17 
 
 
271 aa  99  8e-20  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.529987 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1865  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  24.58 
 
 
256 aa  99  8e-20  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0398  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.34 
 
 
278 aa  98.2  1e-19  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2496  nitrate ABC transporter, inner membrane subunit  31.61 
 
 
304 aa  98.2  1e-19  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.546285  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2132  ABC nitrate/sulfonate/bicarbonate transporter, inner membrane subunit  26.82 
 
 
262 aa  98.6  1e-19  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1432  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.86 
 
 
260 aa  97.4  2e-19  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.324199  normal  0.863766 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0397  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.24 
 
 
285 aa  97.4  2e-19  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.987071 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0380  putative nitrate transmembrane ABC transporter protein  29.34 
 
 
287 aa  96.7  3e-19  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.931268 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0797  ABC transporter, permease protein, putative  28.52 
 
 
250 aa  97.1  3e-19  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4471  nitrate ABC transporter, inner membrane subunit  31.71 
 
 
297 aa  96.7  3e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.5689 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2908  nitrate ABC transporter, inner membrane subunit  31.5 
 
 
298 aa  97.1  3e-19  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.950821  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1210  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.86 
 
 
315 aa  97.1  3e-19  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0483  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  27.81 
 
 
275 aa  96.7  4e-19  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3643  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  27.27 
 
 
252 aa  96.7  4e-19  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000799696  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2657  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  27.66 
 
 
269 aa  96.3  5e-19  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.363458 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5896  nitrate ABC transporter permease protein  29.78 
 
 
297 aa  96.3  5e-19  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.149001  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2712  sulfonate ABC transporter permease  29.35 
 
 
282 aa  95.9  6e-19  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4051  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.69 
 
 
273 aa  95.9  6e-19  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.395379 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2920  sulfonate ABC transporter permease protein  29.35 
 
 
282 aa  95.9  6e-19  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0640  nitrate ABC transporter, inner membrane subunit  30.57 
 
 
279 aa  95.9  6e-19  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4641  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  27.93 
 
 
277 aa  95.9  6e-19  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.750363  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3526  nitrate ABC transporter, inner membrane subunit  28.74 
 
 
280 aa  95.5  7e-19  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.471487 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0464  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.32 
 
 
288 aa  95.5  9e-19  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.349721  hitchhiker  0.00645779 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0735  nitrate/sulfonate/bicarbonate ABC transporter inner membrane protein  28.63 
 
 
273 aa  95.5  9e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.714635  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1998  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  25.64 
 
 
283 aa  95.1  1e-18  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.894639  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1211  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  27.89 
 
 
273 aa  94.7  1e-18  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.132759  normal  0.452833 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0831  nitrate transport permease  32.6 
 
 
312 aa  94.7  1e-18  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.0203602 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1369  ABC transporter membrane protein  30.86 
 
 
272 aa  95.1  1e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.0458182 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5801  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  29.39 
 
 
290 aa  94.7  1e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0423  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  28.63 
 
 
297 aa  94.7  1e-18  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.283538  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3058  taurine ABC transporter, permease protein  27.2 
 
 
274 aa  95.1  1e-18  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0521  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.91 
 
 
239 aa  94.7  1e-18  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0512  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  27.38 
 
 
253 aa  94.7  1e-18  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0881  putative ABC transporter, permease protein  28.12 
 
 
251 aa  94.7  1e-18  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00328051  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5126  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.47 
 
 
280 aa  94.7  1e-18  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4547  putative ABC transporter, permease protein  28.12 
 
 
251 aa  94.7  1e-18  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.113137  normal  0.441246 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1929  putative sulfonate ABC transporter, permease protein  25.11 
 
 
255 aa  94  2e-18  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0770518  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0666  nitrate ABC transporter, inner membrane subunit  32.3 
 
 
311 aa  94.4  2e-18  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0569164  decreased coverage  0.0039857 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4395  nitrate ABC transporter, inner membrane subunit  28.3 
 
 
277 aa  94.4  2e-18  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0856  ABC-type transport system, permease component  28.76 
 
 
245 aa  94.4  2e-18  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.376745  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2324  nitrate ABC transporter, inner membrane subunit  26.56 
 
 
293 aa  94.7  2e-18  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0236  nitrate ABC transporter, inner membrane subunit  28.81 
 
 
283 aa  94  2e-18  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0981  nitrate/sulfonate/bicarbonate ABC transporter inner membrane protein  28.27 
 
 
279 aa  94.4  2e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2524  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.38 
 
 
279 aa  94.4  2e-18  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.667278  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0257  nitrate ABC transporter, inner membrane subunit  28.81 
 
 
283 aa  94.4  2e-18  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.738144 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2569  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.38 
 
 
279 aa  94.4  2e-18  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.568124  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4458  nitrate ABC transporter, inner membrane subunit  28.3 
 
 
277 aa  94.4  2e-18  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.698055  normal  0.534513 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0329  nitrate transport permease  29.44 
 
 
300 aa  93.6  3e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6203  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  25.51 
 
 
284 aa  93.6  3e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.780444  normal  0.280504 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2559  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  26.69 
 
 
283 aa  93.6  3e-18  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2304  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  27.04 
 
 
278 aa  93.6  3e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.37818 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2561  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30 
 
 
279 aa  93.2  4e-18  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4214  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.5 
 
 
281 aa  93.2  4e-18  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0263  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.88 
 
 
265 aa  93.2  4e-18  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.791848  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3788  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.41 
 
 
276 aa  93.2  4e-18  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.374556  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_19510  ABC transporter permease  29.63 
 
 
274 aa  92.8  5e-18  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2356  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.65 
 
 
260 aa  92.8  5e-18  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>