More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_7462 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010681  Bphyt_1129  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  57.7 
 
 		 583 aa  643    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4340  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  63.3 
 
 		 602 aa  664    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.170409 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5526  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  57.85 
 
 		 584 aa  643    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.775381  normal  0.572944 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5551  ABC transporter, permease protein  69.34 
 
 		 584 aa  778    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5091  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  67.94 
 
 		 584 aa  784    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2402  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  58.27 
 
 		 585 aa  650    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.139086  normal  0.0182448 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1455  ABC transporter permease  60.25 
 
 		 585 aa  657    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.754425  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0892  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  57.95 
 
 		 584 aa  644    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0183914 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5725  nitrate/sulfonate/bicarbonate ABC transporter inner membrane protein  58 
 
 		 585 aa  646    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0971  ABC anion transporter, fused inner membrane subunits  57.39 
 
 		 583 aa  639    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1825  putative nitrate transport system permease protein  65.25 
 
 		 584 aa  649    Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0896  ABC transporter, permease protein  57.82 
 
 		 585 aa  638    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1757  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  65.79 
 
 		 584 aa  648    Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3383  nitrate/sulfonate/bicarbonate ABC transporter inner membrane protein  57.35 
 
 		 583 aa  641    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.797393  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7462  ABC transporter permease  100 
 
 		 585 aa  1150    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.900156 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2307  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  58.7 
 
 		 585 aa  654    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.81894  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4605  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  58.35 
 
 		 584 aa  647    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.242403 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1786  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  58.27 
 
 		 585 aa  650    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3610  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  57.85 
 
 		 584 aa  643    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.77824  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3899  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  57.57 
 
 		 583 aa  642    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0820586  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2443  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  58.7 
 
 		 585 aa  654    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.343058  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4140  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  57.75 
 
 		 584 aa  643    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.406581 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1269  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  60.98 
 
 		 582 aa  668    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7488  ABC transporter permease  59.54 
 
 		 577 aa  666    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.124133 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2398  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  58.27 
 
 		 585 aa  650    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0891298  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4757  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  57.85 
 
 		 584 aa  643    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.247948 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0270  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  67.71 
 
 		 582 aa  734    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.371036  normal  0.381405 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3466  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  59.72 
 
 		 577 aa  634  1e-180  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.222584 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4538  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  59.72 
 
 		 577 aa  634  1e-180  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.641004 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0754  ABC transporter, permease protein  58 
 
 		 585 aa  628  1e-179  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1098  ABC transporter, permease protein  58 
 
 		 585 aa  628  1e-179  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1256  ABC transporter, permease protein  58 
 
 		 585 aa  628  1e-179  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5498  ABC-type anion transport system, duplicated permease component  59.78 
 
 		 556 aa  629  1e-179  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.775404  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3027  ABC transporter, permease protein  58 
 
 		 585 aa  628  1e-179  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0469117  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1570  ABC transporter, permease protein  58 
 
 		 585 aa  628  1e-179  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0850001  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1103  ABC transporter, permease protein  58 
 
 		 585 aa  628  1e-179  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.790132  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0997  ABC transporter, permease protein  57.82 
 
 		 585 aa  624  1e-177  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2156  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  56.56 
 
 		 584 aa  619  1e-176  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.856816  hitchhiker  0.00000224525 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0692  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  56.32 
 
 		 578 aa  609  1e-173  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1616  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  57.6 
 
 		 578 aa  598  1e-170  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.294522 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0112  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  54.48 
 
 		 578 aa  592  1e-168  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.827494  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6181  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  56.67 
 
 		 577 aa  588  1e-167  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.247341  normal  0.752378 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5923  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  56.12 
 
 		 600 aa  591  1e-167  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.904436  normal  0.911733 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0622  ABC transporter, permease protein  56.8 
 
 		 577 aa  583  1.0000000000000001e-165  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.974314  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0431  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  54.69 
 
 		 578 aa  583  1.0000000000000001e-165  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0524  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  55.92 
 
 		 579 aa  581  1e-164  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0770  ABC transporter, permease protein  55.29 
 
 		 577 aa  576  1.0000000000000001e-163  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0935  putative transmembrane transporter  56.17 
 
 		 576 aa  578  1.0000000000000001e-163  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0759  ABC transporter, permease protein  55.11 
 
 		 577 aa  577  1.0000000000000001e-163  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2950  ABC transporter, permease protein  58.93 
 
 		 538 aa  570  1e-161  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3371  putative transmembrane ABC transporter protein  53.17 
 
 		 586 aa  568  1e-161  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3030  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  52.39 
 
 		 584 aa  563  1.0000000000000001e-159  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.374129  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3246  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  53.27 
 
 		 594 aa  562  1.0000000000000001e-159  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3569  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  53.45 
 
 		 594 aa  561  1e-158  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0135  hypothetical protein  49.55 
 
 		 579 aa  556  1e-157  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0120  hypothetical protein  49.55 
 
 		 579 aa  556  1e-157  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1967  ABC transporter, permease protein  52.3 
 
 		 581 aa  555  1e-156  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0234  ABC transporter permease protein  51.95 
 
 		 581 aa  550  1e-155  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.198469  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1438  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  54.59 
 
 		 577 aa  546  1e-154  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3185  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  51.77 
 
 		 581 aa  535  1e-151  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.583197  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3546  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  53.09 
 
 		 575 aa  529  1e-149  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1105  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  44.35 
 
 		 572 aa  441  9.999999999999999e-123  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.270543  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3324  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  48.38 
 
 		 588 aa  437  1e-121  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0346  ABC transporter, permease protein  42.53 
 
 		 582 aa  434  1e-120  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4593  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.58 
 
 		 581 aa  393  1e-108  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.477962  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0165  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.22 
 
 		 574 aa  389  1e-106  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.336199  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3819  ABC transporter, inner membrane subunit  45.56 
 
 		 579 aa  379  1e-104  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0890  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  42.4 
 
 		 583 aa  369  1e-101  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.807719  hitchhiker  0.00198291 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0769  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.07 
 
 		 570 aa  360  3e-98  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0803  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  42.1 
 
 		 576 aa  354  2.9999999999999997e-96  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.759355 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4549  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.65 
 
 		 578 aa  347  3e-94  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.035099  normal  0.978203 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0405  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  38.06 
 
 		 573 aa  327  5e-88  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.00121566  decreased coverage  0.00950402 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0109  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  46.93 
 
 		 671 aa  270  5e-71  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4556  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  44.95 
 
 		 670 aa  269  8e-71  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3497  hypothetical protein  50.67 
 
 		 671 aa  255  2.0000000000000002e-66  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1021  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  54.67 
 
 		 671 aa  242  2e-62  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.32204 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0897  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  26.32 
 
 		 553 aa  164  5.0000000000000005e-39  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.14778  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0678  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  28.71 
 
 		 453 aa  153  8e-36  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.105704 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0271  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  24.8 
 
 		 536 aa  132  2.0000000000000002e-29  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1259  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.68 
 
 		 459 aa  121  3e-26  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0013  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.03 
 
 		 497 aa  121  3.9999999999999996e-26  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0283  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.62 
 
 		 468 aa  119  9.999999999999999e-26  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1376  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  22.75 
 
 		 538 aa  119  1.9999999999999998e-25  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.856839  hitchhiker  0.00160873 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0189  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.83 
 
 		 458 aa  113  1.0000000000000001e-23  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_02150  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport system, permease component  30 
 
 		 244 aa  74.3  0.000000000005  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1026  nitrate transport permease  28.42 
 
 		 279 aa  70.5  0.00000000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.174596 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1489  nitrate transport permease  31.91 
 
 		 278 aa  70.1  0.0000000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3654  nitrate transport permease  26.98 
 
 		 273 aa  67.8  0.0000000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3526  nitrate ABC transporter, inner membrane subunit  25.53 
 
 		 280 aa  67  0.0000000009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.471487 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4677  nitrate ABC transporter, inner membrane subunit  28.8 
 
 		 279 aa  65.9  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4395  nitrate ABC transporter, inner membrane subunit  25.67 
 
 		 277 aa  65.5  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4458  nitrate ABC transporter, inner membrane subunit  25.67 
 
 		 277 aa  65.5  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.698055  normal  0.534513 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1982  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  28.22 
 
 		 266 aa  63.9  0.000000007  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.187248  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3295  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  29.12 
 
 		 279 aa  61.6  0.00000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0352  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  28.99 
 
 		 245 aa  62  0.00000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2520  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.35 
 
 		 383 aa  62  0.00000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8275  ABC-type transporter, permease protein  28.5 
 
 		 272 aa  61.2  0.00000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.144641 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2337  nitrate ABC transporter, inner membrane subunit  26.67 
 
 		 282 aa  61.6  0.00000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0358  ABC-type proline/glycine betaine transport system, permease component  28.83 
 
 		 571 aa  61.6  0.00000004  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.963399  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4037  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  27.57 
 
 		 276 aa  61.2  0.00000005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.960786  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>