More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BTH_I0622 on replicon NC_007651
Organism: Burkholderia thailandensis E264



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010557  BamMC406_6181  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  67.82 
 
 		 577 aa  738    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.247341  normal  0.752378 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4605  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  59.23 
 
 		 584 aa  660    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.242403 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1129  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  59.4 
 
 		 583 aa  664    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0754  ABC transporter, permease protein  58.95 
 
 		 585 aa  639    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4538  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  70.36 
 
 		 577 aa  760    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.641004 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2156  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  58.7 
 
 		 584 aa  635    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.856816  hitchhiker  0.00000224525 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1455  ABC transporter permease  60.22 
 
 		 585 aa  641    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.754425  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1269  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  61.68 
 
 		 582 aa  679    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3466  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  70.36 
 
 		 577 aa  760    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.222584 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2307  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  58.77 
 
 		 585 aa  656    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.81894  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0935  putative transmembrane transporter  89.39 
 
 		 576 aa  942    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1256  ABC transporter, permease protein  58.95 
 
 		 585 aa  639    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5725  nitrate/sulfonate/bicarbonate ABC transporter inner membrane protein  58.95 
 
 		 585 aa  651    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0971  ABC anion transporter, fused inner membrane subunits  59.23 
 
 		 583 aa  655    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3899  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  59.58 
 
 		 583 aa  660    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0820586  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0622  ABC transporter, permease protein  100 
 
 		 577 aa  1114    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.974314  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0896  ABC transporter, permease protein  58.95 
 
 		 585 aa  648    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1570  ABC transporter, permease protein  58.95 
 
 		 585 aa  639    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0850001  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3383  nitrate/sulfonate/bicarbonate ABC transporter inner membrane protein  60.46 
 
 		 583 aa  669    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.797393  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5526  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  59.05 
 
 		 584 aa  664    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.775381  normal  0.572944 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0759  ABC transporter, permease protein  89.08 
 
 		 577 aa  944    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1786  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  58.42 
 
 		 585 aa  652    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3610  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  59.05 
 
 		 584 aa  664    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.77824  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2402  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  58.42 
 
 		 585 aa  652    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.139086  normal  0.0182448 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2443  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  58.77 
 
 		 585 aa  656    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.343058  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4140  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  58.88 
 
 		 584 aa  657    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.406581 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3027  ABC transporter, permease protein  58.95 
 
 		 585 aa  639    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0469117  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1103  ABC transporter, permease protein  58.95 
 
 		 585 aa  639    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.790132  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0892  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  59.72 
 
 		 584 aa  652    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0183914 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2398  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  58.42 
 
 		 585 aa  652    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0891298  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4757  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  59.05 
 
 		 584 aa  664    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.247948 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0770  ABC transporter, permease protein  88.91 
 
 		 577 aa  941    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5923  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  67.65 
 
 		 600 aa  734    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.904436  normal  0.911733 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1098  ABC transporter, permease protein  58.95 
 
 		 585 aa  639    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0997  ABC transporter, permease protein  58.77 
 
 		 585 aa  635    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7488  ABC transporter permease  58.27 
 
 		 577 aa  632  1e-180  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.124133 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5498  ABC-type anion transport system, duplicated permease component  57.27 
 
 		 556 aa  618  1e-176  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.775404  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5551  ABC transporter, permease protein  56.18 
 
 		 584 aa  595  1e-169  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5091  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  55.3 
 
 		 584 aa  596  1e-169  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0270  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  57.07 
 
 		 582 aa  593  1e-168  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.371036  normal  0.381405 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0112  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  58.48 
 
 		 578 aa  592  1e-168  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.827494  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7462  ABC transporter permease  55.54 
 
 		 585 aa  590  1e-167  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.900156 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0692  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  54.37 
 
 		 578 aa  586  1e-166  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1757  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  59.03 
 
 		 584 aa  576  1.0000000000000001e-163  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1825  putative nitrate transport system permease protein  58.84 
 
 		 584 aa  572  1.0000000000000001e-162  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3371  putative transmembrane ABC transporter protein  53.91 
 
 		 586 aa  565  1e-160  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0524  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  53.97 
 
 		 579 aa  567  1e-160  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0431  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  53.5 
 
 		 578 aa  566  1e-160  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1616  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  55.56 
 
 		 578 aa  564  1.0000000000000001e-159  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.294522 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4340  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  56.17 
 
 		 602 aa  563  1.0000000000000001e-159  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.170409 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0135  hypothetical protein  51.16 
 
 		 579 aa  557  1e-157  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0120  hypothetical protein  51.16 
 
 		 579 aa  557  1e-157  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3030  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  53.49 
 
 		 584 aa  556  1e-157  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.374129  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3246  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  54.31 
 
 		 594 aa  552  1e-156  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0234  ABC transporter permease protein  51.6 
 
 		 581 aa  552  1e-156  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.198469  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3569  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  54.31 
 
 		 594 aa  551  1e-156  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1967  ABC transporter, permease protein  51.6 
 
 		 581 aa  554  1e-156  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1438  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  55.48 
 
 		 577 aa  550  1e-155  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2950  ABC transporter, permease protein  55.98 
 
 		 538 aa  541  1e-153  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3185  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  51.75 
 
 		 581 aa  527  1e-148  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.583197  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3546  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  53.91 
 
 		 575 aa  518  1.0000000000000001e-145  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0346  ABC transporter, permease protein  44.5 
 
 		 582 aa  452  1.0000000000000001e-126  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3324  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  47.65 
 
 		 588 aa  439  9.999999999999999e-123  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1105  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  44.31 
 
 		 572 aa  436  1e-121  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.270543  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0165  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  44.01 
 
 		 574 aa  397  1e-109  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.336199  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4593  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  43.53 
 
 		 581 aa  395  1e-108  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.477962  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0890  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  43.48 
 
 		 583 aa  369  1e-101  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.807719  hitchhiker  0.00198291 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3819  ABC transporter, inner membrane subunit  44.51 
 
 		 579 aa  370  1e-101  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4549  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.48 
 
 		 578 aa  366  1e-100  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.035099  normal  0.978203 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0803  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  42.03 
 
 		 576 aa  360  5e-98  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.759355 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0769  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.17 
 
 		 570 aa  357  2.9999999999999997e-97  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0405  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  36.45 
 
 		 573 aa  303  4.0000000000000003e-81  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.00121566  decreased coverage  0.00950402 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3497  hypothetical protein  56.47 
 
 		 671 aa  274  4.0000000000000004e-72  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4556  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  48.7 
 
 		 670 aa  272  1e-71  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0109  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  49.03 
 
 		 671 aa  268  2e-70  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1021  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  58.37 
 
 		 671 aa  243  7e-63  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.32204 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0013  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.08 
 
 		 497 aa  186  1.0000000000000001e-45  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0283  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.24 
 
 		 468 aa  171  4e-41  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0897  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  25.5 
 
 		 553 aa  147  5e-34  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.14778  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1376  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  25.65 
 
 		 538 aa  140  8.999999999999999e-32  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.856839  hitchhiker  0.00160873 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0271  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  23.61 
 
 		 536 aa  127  6e-28  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0678  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  42.08 
 
 		 453 aa  125  2e-27  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.105704 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1259  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  42.03 
 
 		 459 aa  122  9.999999999999999e-27  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0189  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.75 
 
 		 458 aa  105  2e-21  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0352  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.29 
 
 		 245 aa  62.8  0.00000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0397  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.74 
 
 		 285 aa  63.2  0.00000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.987071 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_02150  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport system, permease component  26.57 
 
 		 244 aa  61.6  0.00000003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3729  nitrate ABC transporter, inner membrane subunit  24.47 
 
 		 280 aa  61.6  0.00000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0184404  normal  0.11569 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3675  nitrate ABC transporter, inner membrane subunit  24.47 
 
 		 280 aa  61.6  0.00000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1489  nitrate transport permease  30.28 
 
 		 278 aa  58.9  0.0000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1982  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  30.48 
 
 		 266 aa  59.3  0.0000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.187248  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0823  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  27.75 
 
 		 280 aa  58.9  0.0000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.54971  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1026  nitrate transport permease  25.53 
 
 		 279 aa  58.5  0.0000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.174596 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2597  nitrate ABC transporter, inner membrane subunit  26.6 
 
 		 280 aa  58.5  0.0000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3520  nitrate ABC transporter, inner membrane subunit  26.6 
 
 		 280 aa  58.5  0.0000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1664  putative ABC transporter permease protein  25.97 
 
 		 360 aa  58.2  0.0000004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0453487  normal  0.0661868 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2791  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  23.6 
 
 		 302 aa  57.8  0.0000005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4471  nitrate ABC transporter, inner membrane subunit  24.62 
 
 		 297 aa  57.4  0.0000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.5689 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0673  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  28.16 
 
 		 275 aa  57  0.000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0666321  normal  0.331074 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0466  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  25.68 
 
 		 262 aa  56.6  0.000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>