258 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpau_3324 on replicon NC_014158
Organism: Tsukamurella paurometabola DSM 20162



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014158  Tpau_3324  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  100 
 
 		 588 aa  1152    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0346  ABC transporter, permease protein  49.91 
 
 		 582 aa  567  1e-160  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3610  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  50.09 
 
 		 584 aa  499  1e-140  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.77824  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5526  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  50.09 
 
 		 584 aa  499  1e-140  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.775381  normal  0.572944 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4757  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  50.09 
 
 		 584 aa  499  1e-140  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.247948 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5725  nitrate/sulfonate/bicarbonate ABC transporter inner membrane protein  49.07 
 
 		 585 aa  493  9.999999999999999e-139  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4605  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  48.88 
 
 		 584 aa  494  9.999999999999999e-139  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.242403 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4140  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  49.34 
 
 		 584 aa  494  9.999999999999999e-139  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.406581 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2307  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  48.7 
 
 		 585 aa  489  1e-137  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.81894  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0971  ABC anion transporter, fused inner membrane subunits  49.15 
 
 		 583 aa  491  1e-137  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0524  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  50.66 
 
 		 579 aa  490  1e-137  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0896  ABC transporter, permease protein  49.63 
 
 		 585 aa  489  1e-137  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1786  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  49.07 
 
 		 585 aa  489  1e-137  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2443  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  48.7 
 
 		 585 aa  489  1e-137  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.343058  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2398  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  49.07 
 
 		 585 aa  489  1e-137  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0891298  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2402  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  49.07 
 
 		 585 aa  489  1e-137  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.139086  normal  0.0182448 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0892  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  49.25 
 
 		 584 aa  486  1e-136  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0183914 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1098  ABC transporter, permease protein  49.81 
 
 		 585 aa  485  1e-135  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0754  ABC transporter, permease protein  49.81 
 
 		 585 aa  485  1e-135  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1103  ABC transporter, permease protein  49.81 
 
 		 585 aa  485  1e-135  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.790132  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1570  ABC transporter, permease protein  49.81 
 
 		 585 aa  485  1e-135  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0850001  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1256  ABC transporter, permease protein  49.81 
 
 		 585 aa  485  1e-135  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3899  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  49.53 
 
 		 583 aa  483  1e-135  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0820586  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3027  ABC transporter, permease protein  49.81 
 
 		 585 aa  485  1e-135  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0469117  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0997  ABC transporter, permease protein  49.63 
 
 		 585 aa  481  1e-134  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1269  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  50.93 
 
 		 582 aa  480  1e-134  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3383  nitrate/sulfonate/bicarbonate ABC transporter inner membrane protein  48.5 
 
 		 583 aa  473  1e-132  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.797393  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2156  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  49.35 
 
 		 584 aa  473  1e-132  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.856816  hitchhiker  0.00000224525 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1129  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  48.12 
 
 		 583 aa  475  1e-132  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7488  ABC transporter permease  48.26 
 
 		 577 aa  473  1e-132  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.124133 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2950  ABC transporter, permease protein  50.47 
 
 		 538 aa  468  9.999999999999999e-131  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0135  hypothetical protein  45.05 
 
 		 579 aa  467  9.999999999999999e-131  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0120  hypothetical protein  45.05 
 
 		 579 aa  467  9.999999999999999e-131  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0431  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  48.76 
 
 		 578 aa  467  9.999999999999999e-131  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0112  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  50 
 
 		 578 aa  468  9.999999999999999e-131  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.827494  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1455  ABC transporter permease  48.38 
 
 		 585 aa  463  1e-129  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.754425  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3371  putative transmembrane ABC transporter protein  49.35 
 
 		 586 aa  464  1e-129  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5498  ABC-type anion transport system, duplicated permease component  48.06 
 
 		 556 aa  461  9.999999999999999e-129  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.775404  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3030  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  48.28 
 
 		 584 aa  455  1e-127  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.374129  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0270  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  46.4 
 
 		 582 aa  454  1.0000000000000001e-126  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.371036  normal  0.381405 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1105  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  45.15 
 
 		 572 aa  452  1e-125  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.270543  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5551  ABC transporter, permease protein  47.44 
 
 		 584 aa  449  1e-125  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5091  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  46.59 
 
 		 584 aa  449  1e-125  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3466  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  49.16 
 
 		 577 aa  451  1e-125  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.222584 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3246  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  48.31 
 
 		 594 aa  449  1e-125  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4538  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  49.16 
 
 		 577 aa  451  1e-125  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.641004 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3569  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  48.48 
 
 		 594 aa  449  1e-125  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7462  ABC transporter permease  48.73 
 
 		 585 aa  447  1.0000000000000001e-124  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.900156 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0935  putative transmembrane transporter  49.54 
 
 		 576 aa  446  1.0000000000000001e-124  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0770  ABC transporter, permease protein  50 
 
 		 577 aa  446  1.0000000000000001e-124  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0759  ABC transporter, permease protein  49.54 
 
 		 577 aa  448  1.0000000000000001e-124  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1967  ABC transporter, permease protein  46.6 
 
 		 581 aa  444  1e-123  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0622  ABC transporter, permease protein  47.8 
 
 		 577 aa  443  1e-123  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.974314  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0234  ABC transporter permease protein  46.42 
 
 		 581 aa  444  1e-123  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.198469  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1757  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  46.15 
 
 		 584 aa  437  1e-121  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0692  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  45.17 
 
 		 578 aa  435  1e-120  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1825  putative nitrate transport system permease protein  46.62 
 
 		 584 aa  435  1e-120  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3185  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  47.87 
 
 		 581 aa  429  1e-119  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.583197  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6181  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  47.82 
 
 		 577 aa  429  1e-119  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.247341  normal  0.752378 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5923  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  48.06 
 
 		 600 aa  419  1e-116  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.904436  normal  0.911733 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1616  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  46.62 
 
 		 578 aa  412  1e-114  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.294522 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1438  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  45.34 
 
 		 577 aa  412  1e-113  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4340  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  43.8 
 
 		 602 aa  404  1e-111  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.170409 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3546  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  44.79 
 
 		 575 aa  385  1e-105  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0890  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  43.83 
 
 		 583 aa  379  1e-104  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.807719  hitchhiker  0.00198291 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4593  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  42.94 
 
 		 581 aa  382  1e-104  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.477962  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0769  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.58 
 
 		 570 aa  382  1e-104  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4549  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  42.7 
 
 		 578 aa  381  1e-104  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.035099  normal  0.978203 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0803  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  42.11 
 
 		 576 aa  377  1e-103  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.759355 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0165  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  43.02 
 
 		 574 aa  373  1e-102  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.336199  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0405  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  39.12 
 
 		 573 aa  322  9.999999999999999e-87  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.00121566  decreased coverage  0.00950402 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4556  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  44.41 
 
 		 670 aa  253  6e-66  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0109  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  46.42 
 
 		 671 aa  253  7e-66  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3497  hypothetical protein  44.17 
 
 		 671 aa  247  4e-64  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1021  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  49.44 
 
 		 671 aa  226  1e-57  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.32204 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3819  ABC transporter, inner membrane subunit  44 
 
 		 579 aa  206  9e-52  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0283  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.08 
 
 		 468 aa  158  2e-37  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0897  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  26.05 
 
 		 553 aa  144  3e-33  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.14778  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1376  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  24.81 
 
 		 538 aa  137  7.000000000000001e-31  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.856839  hitchhiker  0.00160873 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0271  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  24.06 
 
 		 536 aa  135  1.9999999999999998e-30  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0678  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  44.38 
 
 		 453 aa  127  5e-28  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.105704 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1259  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  43.58 
 
 		 459 aa  127  7e-28  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0013  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.41 
 
 		 497 aa  126  1e-27  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0189  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.62 
 
 		 458 aa  112  2.0000000000000002e-23  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001608  nitrate ABC transporter permease protein  27.22 
 
 		 321 aa  65.5  0.000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05589  hypothetical protein  27.22 
 
 		 321 aa  65.5  0.000000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3315  putative nitrate ABC transporter, permease protein  26.04 
 
 		 315 aa  63.5  0.00000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.286795  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1026  nitrate transport permease  30.05 
 
 		 279 aa  63.2  0.00000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.174596 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3654  nitrate transport permease  28.74 
 
 		 273 aa  60.8  0.00000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0176  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  28.66 
 
 		 330 aa  60.5  0.00000009  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.283757  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3400  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.76 
 
 		 275 aa  58.9  0.0000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1238  nitrate transport permease  28.43 
 
 		 279 aa  58.5  0.0000003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2265  2-isopropylmalate synthase  23.65 
 
 		 337 aa  58.5  0.0000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.20736  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_02150  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport system, permease component  25 
 
 		 244 aa  58.2  0.0000004  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2818  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  28.03 
 
 		 323 aa  57  0.000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0908348  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4924  nitrate ABC transporter, inner membrane subunit  31.41 
 
 		 280 aa  57  0.000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.815767 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1078  ABC transporter, nitrate-like  30.6 
 
 		 275 aa  55.8  0.000002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.193306  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0291  nitrate transport permease  27.33 
 
 		 287 aa  55.8  0.000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3413  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  25.44 
 
 		 271 aa  56.2  0.000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0409101  normal  0.884011 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1380  binding-protein-dependent transporter inner membrane component  29.89 
 
 		 277 aa  55.5  0.000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.153307 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>