More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mesil_3497 on replicon NC_014213
Organism: Meiothermus silvanus DSM 9946



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013946  Mrub_1021  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  85.69 
 
 
671 aa  1014    Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.32204 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3497  hypothetical protein  100 
 
 
671 aa  1322    Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0109  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  62.95 
 
 
671 aa  799    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4556  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  63.64 
 
 
670 aa  825    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3030  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  51.92 
 
 
584 aa  318  2e-85  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.374129  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3371  putative transmembrane ABC transporter protein  52.88 
 
 
586 aa  313  4.999999999999999e-84  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3383  nitrate/sulfonate/bicarbonate ABC transporter inner membrane protein  50.61 
 
 
583 aa  313  5.999999999999999e-84  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.797393  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1129  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  50 
 
 
583 aa  311  2e-83  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2156  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  49.7 
 
 
584 aa  311  2.9999999999999997e-83  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.856816  hitchhiker  0.00000224525 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0431  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  50.29 
 
 
578 aa  310  5e-83  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1455  ABC transporter permease  57.59 
 
 
585 aa  309  9e-83  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.754425  normal 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1967  ABC transporter, permease protein  49.26 
 
 
581 aa  306  9.000000000000001e-82  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7488  ABC transporter permease  55.07 
 
 
577 aa  306  9.000000000000001e-82  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.124133 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0234  ABC transporter permease protein  49.26 
 
 
581 aa  306  1.0000000000000001e-81  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.198469  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0971  ABC anion transporter, fused inner membrane subunits  53.87 
 
 
583 aa  305  3.0000000000000004e-81  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5725  nitrate/sulfonate/bicarbonate ABC transporter inner membrane protein  49.26 
 
 
585 aa  304  4.0000000000000003e-81  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5526  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  53.17 
 
 
584 aa  303  8.000000000000001e-81  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.775381  normal  0.572944 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2402  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  52.49 
 
 
585 aa  303  8.000000000000001e-81  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.139086  normal  0.0182448 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1786  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  52.49 
 
 
585 aa  303  8.000000000000001e-81  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3610  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  53.17 
 
 
584 aa  303  8.000000000000001e-81  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.77824  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2398  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  52.49 
 
 
585 aa  303  8.000000000000001e-81  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0891298  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4757  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  53.17 
 
 
584 aa  303  8.000000000000001e-81  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.247948 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0524  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  56.14 
 
 
579 aa  303  9e-81  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2443  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  52.16 
 
 
585 aa  302  1e-80  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.343058  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2307  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  52.16 
 
 
585 aa  302  1e-80  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.81894  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0892  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  47.71 
 
 
584 aa  302  1e-80  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0183914 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5498  ABC-type anion transport system, duplicated permease component  60 
 
 
556 aa  301  2e-80  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.775404  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4605  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  49.11 
 
 
584 aa  301  3e-80  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.242403 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4140  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  49.11 
 
 
584 aa  300  7e-80  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.406581 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3899  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  48.43 
 
 
583 aa  300  8e-80  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0820586  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0112  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  51.51 
 
 
578 aa  298  3e-79  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.827494  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2950  ABC transporter, permease protein  60.73 
 
 
538 aa  296  1e-78  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1269  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  60.24 
 
 
582 aa  295  2e-78  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0896  ABC transporter, permease protein  47.06 
 
 
585 aa  295  2e-78  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0692  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  52.56 
 
 
578 aa  290  5.0000000000000004e-77  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3246  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  51.75 
 
 
594 aa  290  5.0000000000000004e-77  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0135  hypothetical protein  50.69 
 
 
579 aa  289  1e-76  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0120  hypothetical protein  50.69 
 
 
579 aa  289  1e-76  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3569  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  51.75 
 
 
594 aa  289  1e-76  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5551  ABC transporter, permease protein  54.2 
 
 
584 aa  285  1.0000000000000001e-75  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0622  ABC transporter, permease protein  58.75 
 
 
577 aa  285  1.0000000000000001e-75  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.974314  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0754  ABC transporter, permease protein  45.71 
 
 
585 aa  284  4.0000000000000003e-75  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1256  ABC transporter, permease protein  45.71 
 
 
585 aa  284  4.0000000000000003e-75  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1098  ABC transporter, permease protein  45.71 
 
 
585 aa  284  4.0000000000000003e-75  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3027  ABC transporter, permease protein  45.71 
 
 
585 aa  284  4.0000000000000003e-75  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0469117  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1570  ABC transporter, permease protein  45.71 
 
 
585 aa  284  4.0000000000000003e-75  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0850001  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1103  ABC transporter, permease protein  45.71 
 
 
585 aa  284  4.0000000000000003e-75  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.790132  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3185  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  53.42 
 
 
581 aa  284  4.0000000000000003e-75  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.583197  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5091  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  49.52 
 
 
584 aa  283  6.000000000000001e-75  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4538  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  52.3 
 
 
577 aa  283  7.000000000000001e-75  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.641004 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3466  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  52.3 
 
 
577 aa  283  7.000000000000001e-75  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.222584 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0997  ABC transporter, permease protein  45.43 
 
 
585 aa  280  7e-74  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0346  ABC transporter, permease protein  44.79 
 
 
582 aa  278  2e-73  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0270  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  51.32 
 
 
582 aa  274  3e-72  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.371036  normal  0.381405 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1757  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  56.54 
 
 
584 aa  274  5.000000000000001e-72  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1825  putative nitrate transport system permease protein  56.54 
 
 
584 aa  272  1e-71  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0759  ABC transporter, permease protein  58.3 
 
 
577 aa  271  2e-71  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0770  ABC transporter, permease protein  58.3 
 
 
577 aa  271  4e-71  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0935  putative transmembrane transporter  58.3 
 
 
576 aa  270  5e-71  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1616  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  53.76 
 
 
578 aa  269  1e-70  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.294522 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5923  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  53.98 
 
 
600 aa  267  5e-70  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.904436  normal  0.911733 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7462  ABC transporter permease  55.2 
 
 
585 aa  265  2e-69  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.900156 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6181  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  53 
 
 
577 aa  260  5.0000000000000005e-68  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.247341  normal  0.752378 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4340  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  51.46 
 
 
602 aa  254  3e-66  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.170409 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3324  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  44.04 
 
 
588 aa  254  4.0000000000000004e-66  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1105  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  46.76 
 
 
572 aa  252  2e-65  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.270543  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1438  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  51.76 
 
 
577 aa  249  1e-64  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3546  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  50.53 
 
 
575 aa  239  9e-62  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0165  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  45.31 
 
 
574 aa  228  3e-58  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.336199  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0769  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.75 
 
 
570 aa  227  6e-58  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4593  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  43.6 
 
 
581 aa  214  4.9999999999999996e-54  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.477962  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4549  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  46.27 
 
 
578 aa  214  4.9999999999999996e-54  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.035099  normal  0.978203 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3819  ABC transporter, inner membrane subunit  44.92 
 
 
579 aa  208  3e-52  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0405  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  44.81 
 
 
573 aa  197  5.000000000000001e-49  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.00121566  decreased coverage  0.00950402 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0890  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  42.58 
 
 
583 aa  195  2e-48  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.807719  hitchhiker  0.00198291 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0803  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.47 
 
 
576 aa  178  2e-43  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.759355 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0013  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.47 
 
 
497 aa  110  7.000000000000001e-23  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0678  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.64 
 
 
453 aa  99  3e-19  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.105704 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0897  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.52 
 
 
553 aa  95.5  3e-18  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.14778  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1259  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.22 
 
 
459 aa  94.7  5e-18  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1376  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  24.57 
 
 
538 aa  85.5  0.000000000000003  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.856839  hitchhiker  0.00160873 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0283  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.71 
 
 
468 aa  84.3  0.000000000000007  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0189  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.44 
 
 
458 aa  84  0.000000000000009  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0271  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  27.68 
 
 
536 aa  72.4  0.00000000002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3654  nitrate transport permease  29.03 
 
 
273 aa  61.6  0.00000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0358  ABC-type proline/glycine betaine transport system, permease component  27.32 
 
 
571 aa  60.8  0.00000008  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.963399  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2503  nitrate ABC transporter, inner membrane subunit  27.4 
 
 
298 aa  60.1  0.0000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5011  nitrate ABC transporter, inner membrane subunit  24.87 
 
 
286 aa  59.7  0.0000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.312092  normal  0.320206 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0946  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  26.39 
 
 
296 aa  58.9  0.0000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  decreased coverage  0.00558212  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1194  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  26.39 
 
 
296 aa  58.9  0.0000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.987878  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4495  nitrate ABC transporter, inner membrane subunit  24.35 
 
 
285 aa  57.4  0.0000008  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4958  nitrate ABC transporter, inner membrane subunit  24.35 
 
 
285 aa  57.4  0.0000009  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.413837  normal  0.165118 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0823  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  24.49 
 
 
280 aa  56.6  0.000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.54971  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5239  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  27.14 
 
 
287 aa  56.6  0.000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.659983  normal  0.0225177 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0397  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.43 
 
 
285 aa  57  0.000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.987071 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0502  ABC glycine betaine/L-proline transporter, inner membrane subunit  25.77 
 
 
276 aa  57  0.000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.819479  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4471  nitrate ABC transporter, inner membrane subunit  26.03 
 
 
297 aa  56.2  0.000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.5689 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2377  glycine betaine/L-proline ABC transporter, permease  26.02 
 
 
274 aa  55.8  0.000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.336492 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0463  glycine/betaine/L-proline ABC transporter, permease protein  27.14 
 
 
281 aa  55.5  0.000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4710  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  27.14 
 
 
281 aa  55.5  0.000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>