More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tneu_0189 on replicon NC_010525
Organism: Thermoproteus neutrophilus V24Sta



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010525  Tneu_0189  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  100 
 
 		 458 aa  887    Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1259  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  72.05 
 
 		 459 aa  675    Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0283  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  64.71 
 
 		 468 aa  575  1.0000000000000001e-163  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0678  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  61.35 
 
 		 453 aa  504  1e-141  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.105704 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0013  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.02 
 
 		 497 aa  234  2.0000000000000002e-60  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4593  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.83 
 
 		 581 aa  181  2.9999999999999997e-44  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.477962  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3569  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.41 
 
 		 594 aa  171  3e-41  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3246  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.96 
 
 		 594 aa  171  3e-41  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5526  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.62 
 
 		 584 aa  171  3e-41  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.775381  normal  0.572944 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3610  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.62 
 
 		 584 aa  171  3e-41  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.77824  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4757  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.62 
 
 		 584 aa  171  3e-41  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.247948 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3371  putative transmembrane ABC transporter protein  29.63 
 
 		 586 aa  169  7e-41  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3466  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.24 
 
 		 577 aa  169  1e-40  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.222584 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4538  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.24 
 
 		 577 aa  169  1e-40  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.641004 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5923  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.55 
 
 		 600 aa  168  2e-40  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.904436  normal  0.911733 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4605  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.02 
 
 		 584 aa  168  2e-40  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.242403 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1786  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.74 
 
 		 585 aa  166  5.9999999999999996e-40  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2402  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.74 
 
 		 585 aa  166  5.9999999999999996e-40  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.139086  normal  0.0182448 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2398  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.74 
 
 		 585 aa  166  5.9999999999999996e-40  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0891298  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6181  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.61 
 
 		 577 aa  166  6.9999999999999995e-40  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.247341  normal  0.752378 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4140  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.62 
 
 		 584 aa  166  1.0000000000000001e-39  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.406581 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0692  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.41 
 
 		 578 aa  164  2.0000000000000002e-39  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0971  ABC anion transporter, fused inner membrane subunits  29.78 
 
 		 583 aa  164  4.0000000000000004e-39  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3899  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.9 
 
 		 583 aa  162  1e-38  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0820586  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0769  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  27.1 
 
 		 570 aa  156  8e-37  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0405  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  38.5 
 
 		 573 aa  134  3.9999999999999996e-30  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.00121566  decreased coverage  0.00950402 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0165  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.59 
 
 		 574 aa  121  1.9999999999999998e-26  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.336199  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7462  ABC transporter permease  40.68 
 
 		 585 aa  121  3e-26  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.900156 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5498  ABC-type anion transport system, duplicated permease component  41.24 
 
 		 556 aa  120  3.9999999999999996e-26  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.775404  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0890  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.11 
 
 		 583 aa  119  9.999999999999999e-26  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.807719  hitchhiker  0.00198291 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0271  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.5 
 
 		 536 aa  117  5e-25  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7488  ABC transporter permease  39.43 
 
 		 577 aa  117  5e-25  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.124133 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1455  ABC transporter permease  39.43 
 
 		 585 aa  116  6.9999999999999995e-25  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.754425  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0270  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.97 
 
 		 582 aa  116  1.0000000000000001e-24  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.371036  normal  0.381405 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4340  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.11 
 
 		 602 aa  115  2.0000000000000002e-24  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.170409 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1105  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.37 
 
 		 572 aa  114  4.0000000000000004e-24  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.270543  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0759  ABC transporter, permease protein  39.69 
 
 		 577 aa  111  3e-23  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0622  ABC transporter, permease protein  38.81 
 
 		 577 aa  110  4.0000000000000004e-23  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.974314  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5551  ABC transporter, permease protein  38.98 
 
 		 584 aa  110  7.000000000000001e-23  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0897  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.1 
 
 		 553 aa  110  7.000000000000001e-23  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.14778  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0770  ABC transporter, permease protein  39.18 
 
 		 577 aa  109  1e-22  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0935  putative transmembrane transporter  39.18 
 
 		 576 aa  109  1e-22  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1616  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.05 
 
 		 578 aa  108  1e-22  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.294522 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1269  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.01 
 
 		 582 aa  109  1e-22  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5091  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  37.71 
 
 		 584 aa  108  2e-22  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1757  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.36 
 
 		 584 aa  108  2e-22  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1825  putative nitrate transport system permease protein  40.36 
 
 		 584 aa  108  2e-22  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2950  ABC transporter, permease protein  38.86 
 
 		 538 aa  108  3e-22  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2307  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.51 
 
 		 585 aa  107  4e-22  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.81894  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2443  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.51 
 
 		 585 aa  107  4e-22  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.343058  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0892  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.97 
 
 		 584 aa  107  6e-22  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0183914 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3030  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  36.36 
 
 		 584 aa  107  6e-22  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.374129  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5725  nitrate/sulfonate/bicarbonate ABC transporter inner membrane protein  37.87 
 
 		 585 aa  107  6e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3185  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.89 
 
 		 581 aa  107  6e-22  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.583197  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0431  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.05 
 
 		 578 aa  106  7e-22  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3324  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.1 
 
 		 588 aa  105  1e-21  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0896  ABC transporter, permease protein  39.05 
 
 		 585 aa  105  1e-21  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3383  nitrate/sulfonate/bicarbonate ABC transporter inner membrane protein  38.46 
 
 		 583 aa  105  1e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.797393  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0112  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.15 
 
 		 578 aa  105  1e-21  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.827494  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0754  ABC transporter, permease protein  40.43 
 
 		 585 aa  105  3e-21  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1103  ABC transporter, permease protein  40.43 
 
 		 585 aa  105  3e-21  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.790132  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1098  ABC transporter, permease protein  40.43 
 
 		 585 aa  105  3e-21  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1256  ABC transporter, permease protein  40.43 
 
 		 585 aa  105  3e-21  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2156  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.28 
 
 		 584 aa  104  3e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.856816  hitchhiker  0.00000224525 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1570  ABC transporter, permease protein  40.43 
 
 		 585 aa  105  3e-21  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0850001  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0997  ABC transporter, permease protein  40.43 
 
 		 585 aa  104  3e-21  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1376  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.88 
 
 		 538 aa  104  3e-21  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.856839  hitchhiker  0.00160873 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3027  ABC transporter, permease protein  40.43 
 
 		 585 aa  105  3e-21  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0469117  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0524  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  37.79 
 
 		 579 aa  104  4e-21  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1129  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.28 
 
 		 583 aa  103  6e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0135  hypothetical protein  32.97 
 
 		 579 aa  103  9e-21  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0120  hypothetical protein  32.97 
 
 		 579 aa  103  9e-21  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3819  ABC transporter, inner membrane subunit  36.45 
 
 		 579 aa  102  2e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0803  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.87 
 
 		 576 aa  102  2e-20  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.759355 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4549  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.04 
 
 		 578 aa  100  4e-20  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.035099  normal  0.978203 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0109  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.59 
 
 		 671 aa  98.6  2e-19  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0346  ABC transporter, permease protein  34.27 
 
 		 582 aa  97.8  3e-19  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4556  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.59 
 
 		 670 aa  95.9  1e-18  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1967  ABC transporter, permease protein  28.44 
 
 		 581 aa  95.5  2e-18  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1438  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.37 
 
 		 577 aa  94.7  3e-18  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0234  ABC transporter permease protein  33.71 
 
 		 581 aa  94.4  4e-18  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.198469  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3546  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.38 
 
 		 575 aa  89.7  9e-17  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1021  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.33 
 
 		 671 aa  85.5  0.000000000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.32204 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3497  hypothetical protein  35.44 
 
 		 671 aa  84  0.000000000000005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3675  nitrate ABC transporter, inner membrane subunit  29.02 
 
 		 280 aa  74.7  0.000000000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3729  nitrate ABC transporter, inner membrane subunit  29.02 
 
 		 280 aa  74.7  0.000000000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0184404  normal  0.11569 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3998  ABC transporter, inner membrane subunit  29.51 
 
 		 253 aa  62  0.00000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.451031  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0831  nitrate transport permease  26.63 
 
 		 312 aa  61.2  0.00000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.0203602 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0874  nitrate transport permease  26.49 
 
 		 283 aa  60.8  0.00000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00348419  hitchhiker  0.00524559 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0352  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.55 
 
 		 245 aa  60.5  0.00000006  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1439  nitrate ABC transporter, inner membrane subunit  25.81 
 
 		 310 aa  59.7  0.0000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.062597  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1704  nitrate ABC transporter, inner membrane subunit  30.06 
 
 		 311 aa  59.3  0.0000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1982  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  26.43 
 
 		 266 aa  57.8  0.0000004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.187248  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2515  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  27.84 
 
 		 282 aa  57.4  0.0000005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.313862  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0208  nitrate ABC transporter, permease protein, putative  30.1 
 
 		 260 aa  57.4  0.0000006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.473726 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2787  ABC transporter, permease protein  28.87 
 
 		 282 aa  57  0.0000006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0328614  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3346  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  22.37 
 
 		 291 aa  56.6  0.0000009  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.252204  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3160  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  24.55 
 
 		 274 aa  56.6  0.000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.913146  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1238  nitrate transport permease  23.56 
 
 		 279 aa  56.2  0.000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0326  nitrate transport permease  26.98 
 
 		 295 aa  56.2  0.000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>