More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cmaq_0897 on replicon NC_009954
Organism: Caldivirga maquilingensis IC-167



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009954  Cmaq_0897  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  100 
 
 		 553 aa  1086    Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.14778  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0271  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.5 
 
 		 536 aa  363  5.0000000000000005e-99  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1376  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.93 
 
 		 538 aa  349  9e-95  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.856839  hitchhiker  0.00160873 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0405  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  25.93 
 
 		 573 aa  185  2.0000000000000003e-45  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.00121566  decreased coverage  0.00950402 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4593  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  27.88 
 
 		 581 aa  176  9.999999999999999e-43  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.477962  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0135  hypothetical protein  25.82 
 
 		 579 aa  175  1.9999999999999998e-42  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0120  hypothetical protein  25.82 
 
 		 579 aa  175  1.9999999999999998e-42  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0165  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  26.75 
 
 		 574 aa  171  4e-41  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.336199  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0431  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  27.06 
 
 		 578 aa  169  2e-40  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1269  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  27.17 
 
 		 582 aa  166  9e-40  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1967  ABC transporter, permease protein  26.06 
 
 		 581 aa  164  3e-39  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0234  ABC transporter permease protein  25.88 
 
 		 581 aa  164  4.0000000000000004e-39  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.198469  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7462  ABC transporter permease  26.32 
 
 		 585 aa  164  5.0000000000000005e-39  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.900156 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3899  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  26.27 
 
 		 583 aa  163  6e-39  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0820586  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1129  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  25.64 
 
 		 583 aa  162  1e-38  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4605  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  25.99 
 
 		 584 aa  159  1e-37  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.242403 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7488  ABC transporter permease  26.48 
 
 		 577 aa  158  2e-37  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.124133 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3383  nitrate/sulfonate/bicarbonate ABC transporter inner membrane protein  25.09 
 
 		 583 aa  157  6e-37  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.797393  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5526  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  26.09 
 
 		 584 aa  157  7e-37  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.775381  normal  0.572944 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3610  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  26.09 
 
 		 584 aa  157  7e-37  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.77824  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4757  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  26.09 
 
 		 584 aa  157  7e-37  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.247948 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3030  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  26.52 
 
 		 584 aa  155  2e-36  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.374129  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0896  ABC transporter, permease protein  26.55 
 
 		 585 aa  154  2.9999999999999998e-36  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4140  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  25.45 
 
 		 584 aa  155  2.9999999999999998e-36  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.406581 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5551  ABC transporter, permease protein  25.51 
 
 		 584 aa  154  5e-36  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3027  ABC transporter, permease protein  26.84 
 
 		 585 aa  154  5e-36  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0469117  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0754  ABC transporter, permease protein  26.84 
 
 		 585 aa  154  5e-36  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1256  ABC transporter, permease protein  26.84 
 
 		 585 aa  154  5e-36  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2307  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  26.18 
 
 		 585 aa  154  5e-36  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.81894  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0803  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  25.43 
 
 		 576 aa  154  5e-36  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.759355 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1103  ABC transporter, permease protein  26.84 
 
 		 585 aa  154  5e-36  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.790132  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2443  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  26.18 
 
 		 585 aa  154  5e-36  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.343058  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1098  ABC transporter, permease protein  26.84 
 
 		 585 aa  154  5e-36  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1570  ABC transporter, permease protein  26.84 
 
 		 585 aa  154  5e-36  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0850001  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0997  ABC transporter, permease protein  26.84 
 
 		 585 aa  154  5e-36  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0112  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  24.91 
 
 		 578 aa  153  8e-36  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.827494  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3246  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  25.85 
 
 		 594 aa  153  8.999999999999999e-36  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5091  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  26.16 
 
 		 584 aa  152  1e-35  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0892  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  26.05 
 
 		 584 aa  152  1e-35  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0183914 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0524  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  27.72 
 
 		 579 aa  153  1e-35  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1455  ABC transporter permease  25.6 
 
 		 585 aa  152  1e-35  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.754425  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5725  nitrate/sulfonate/bicarbonate ABC transporter inner membrane protein  26.55 
 
 		 585 aa  152  2e-35  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2402  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  26.81 
 
 		 585 aa  150  6e-35  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.139086  normal  0.0182448 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1786  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  26.81 
 
 		 585 aa  150  6e-35  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3569  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  25.29 
 
 		 594 aa  150  6e-35  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2398  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  26.81 
 
 		 585 aa  150  6e-35  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0891298  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0270  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  25.77 
 
 		 582 aa  150  8e-35  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.371036  normal  0.381405 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4549  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  26.61 
 
 		 578 aa  149  1.0000000000000001e-34  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.035099  normal  0.978203 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0971  ABC anion transporter, fused inner membrane subunits  25.41 
 
 		 583 aa  149  2.0000000000000003e-34  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3371  putative transmembrane ABC transporter protein  24.91 
 
 		 586 aa  148  3e-34  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0013  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  25.64 
 
 		 497 aa  147  4.0000000000000006e-34  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2950  ABC transporter, permease protein  24.95 
 
 		 538 aa  147  6e-34  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3185  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  25.76 
 
 		 581 aa  143  7e-33  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.583197  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0692  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  24.67 
 
 		 578 aa  143  8e-33  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1757  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  25.55 
 
 		 584 aa  142  1.9999999999999998e-32  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3324  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  26.1 
 
 		 588 aa  142  1.9999999999999998e-32  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2156  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  25.27 
 
 		 584 aa  141  3e-32  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.856816  hitchhiker  0.00000224525 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1825  putative nitrate transport system permease protein  25.55 
 
 		 584 aa  140  3.9999999999999997e-32  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1616  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  26.79 
 
 		 578 aa  139  1e-31  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.294522 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0622  ABC transporter, permease protein  24.4 
 
 		 577 aa  139  1e-31  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.974314  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5498  ABC-type anion transport system, duplicated permease component  24.32 
 
 		 556 aa  139  2e-31  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.775404  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6181  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  24.04 
 
 		 577 aa  137  4e-31  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.247341  normal  0.752378 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4538  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  24.33 
 
 		 577 aa  134  5e-30  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.641004 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3466  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  24.33 
 
 		 577 aa  134  5e-30  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.222584 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5923  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  24.68 
 
 		 600 aa  132  1.0000000000000001e-29  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.904436  normal  0.911733 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1105  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  23.78 
 
 		 572 aa  131  3e-29  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.270543  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0769  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  24.18 
 
 		 570 aa  128  2.0000000000000002e-28  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0935  putative transmembrane transporter  23.37 
 
 		 576 aa  124  5e-27  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0283  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.68 
 
 		 468 aa  124  5e-27  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0759  ABC transporter, permease protein  24.11 
 
 		 577 aa  123  9.999999999999999e-27  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0770  ABC transporter, permease protein  23.93 
 
 		 577 aa  121  3.9999999999999996e-26  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4340  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  24.73 
 
 		 602 aa  115  1.0000000000000001e-24  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.170409 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0346  ABC transporter, permease protein  24.37 
 
 		 582 aa  116  1.0000000000000001e-24  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0678  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.77 
 
 		 453 aa  116  1.0000000000000001e-24  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.105704 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1259  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.88 
 
 		 459 aa  114  6e-24  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0890  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.63 
 
 		 583 aa  110  5e-23  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.807719  hitchhiker  0.00198291 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0189  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.85 
 
 		 458 aa  94  6e-18  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3497  hypothetical protein  31.22 
 
 		 671 aa  92.4  2e-17  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3546  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.35 
 
 		 575 aa  87.8  5e-16  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3819  ABC transporter, inner membrane subunit  27.75 
 
 		 579 aa  87  8e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1021  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.11 
 
 		 671 aa  85.1  0.000000000000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.32204 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1438  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  28.19 
 
 		 577 aa  82.4  0.00000000000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0109  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.11 
 
 		 671 aa  79.7  0.0000000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4556  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  28.16 
 
 		 670 aa  80.1  0.0000000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_12960  taurine ABC transporter permease  30.12 
 
 		 272 aa  62.4  0.00000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.299757  normal  0.321121 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1171  taurine ABC transporter permease  30.12 
 
 		 272 aa  62  0.00000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.104716  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0924  ABC transporter permease protein  25.27 
 
 		 258 aa  59.7  0.0000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.175022  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2621  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.58 
 
 		 281 aa  59.7  0.0000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000218671  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0208  nitrate ABC transporter, permease protein, putative  27.59 
 
 		 260 aa  58.5  0.0000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.473726 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0442  taurine transporter subunit  30.57 
 
 		 275 aa  57  0.0000009  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00317  taurine transporter subunit  29.94 
 
 		 275 aa  56.2  0.000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3240  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.94 
 
 		 275 aa  56.6  0.000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00321  hypothetical protein  29.94 
 
 		 275 aa  56.2  0.000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3526  nitrate ABC transporter, inner membrane subunit  29.61 
 
 		 280 aa  56.6  0.000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.471487 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3261  taurine transporter subunit  29.94 
 
 		 275 aa  56.2  0.000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3041  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.46 
 
 		 356 aa  55.5  0.000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0454985  normal  0.816874 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0874  nitrate transport permease  28.67 
 
 		 283 aa  55.5  0.000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00348419  hitchhiker  0.00524559 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0431  taurine transporter subunit  29.3 
 
 		 275 aa  55.1  0.000003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0817  ABC transporter related protein  30.82 
 
 		 492 aa  54.7  0.000004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.309085  normal  0.730271 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0391  taurine transporter subunit  29.3 
 
 		 275 aa  55.1  0.000004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>