More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bmul_0892 on replicon NC_010084
Organism: Burkholderia multivorans ATCC 17616



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009511  Swit_0270  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  60.64 
 
 
582 aa  665    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.371036  normal  0.381405 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7488  ABC transporter permease  61.31 
 
 
577 aa  716    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.124133 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1098  ABC transporter, permease protein  90.09 
 
 
585 aa  1055    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1455  ABC transporter permease  61.97 
 
 
585 aa  701    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.754425  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4538  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  60.95 
 
 
577 aa  664    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.641004 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4340  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  57.89 
 
 
602 aa  639    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.170409 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5551  ABC transporter, permease protein  60.96 
 
 
584 aa  649    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5526  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  85.64 
 
 
584 aa  1011    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.775381  normal  0.572944 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0754  ABC transporter, permease protein  90.09 
 
 
585 aa  1055    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1570  ABC transporter, permease protein  90.09 
 
 
585 aa  1055    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0850001  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5091  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  58.21 
 
 
584 aa  652    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1129  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  85.27 
 
 
583 aa  999    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1256  ABC transporter, permease protein  90.09 
 
 
585 aa  1055    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1269  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  64.46 
 
 
582 aa  737    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1103  ABC transporter, permease protein  90.09 
 
 
585 aa  1055    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.790132  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4605  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  85.3 
 
 
584 aa  1006    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.242403 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5725  nitrate/sulfonate/bicarbonate ABC transporter inner membrane protein  91.97 
 
 
585 aa  1088    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0971  ABC anion transporter, fused inner membrane subunits  86.13 
 
 
583 aa  1016    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5498  ABC-type anion transport system, duplicated permease component  62.39 
 
 
556 aa  695    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.775404  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2307  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  91.28 
 
 
585 aa  1076    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.81894  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0997  ABC transporter, permease protein  89.91 
 
 
585 aa  1052    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0622  ABC transporter, permease protein  61.1 
 
 
577 aa  641    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.974314  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0896  ABC transporter, permease protein  90.26 
 
 
585 aa  1070    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1616  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  57.99 
 
 
578 aa  635    Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.294522 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0892  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  100 
 
 
584 aa  1163    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0183914 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3383  nitrate/sulfonate/bicarbonate ABC transporter inner membrane protein  85.45 
 
 
583 aa  997    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.797393  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0692  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  59.89 
 
 
578 aa  676    Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1786  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  91.62 
 
 
585 aa  1083    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3610  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  85.64 
 
 
584 aa  1011    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.77824  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7462  ABC transporter permease  59.27 
 
 
585 aa  635    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.900156 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3466  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  60.95 
 
 
577 aa  664    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.222584 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2402  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  91.62 
 
 
585 aa  1083    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.139086  normal  0.0182448 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2443  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  91.28 
 
 
585 aa  1076    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.343058  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4140  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  85.98 
 
 
584 aa  1013    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.406581 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3899  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  85.96 
 
 
583 aa  1016    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0820586  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2398  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  91.62 
 
 
585 aa  1083    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0891298  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4757  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  85.64 
 
 
584 aa  1011    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.247948 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2156  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  84.62 
 
 
584 aa  975    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.856816  hitchhiker  0.00000224525 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3027  ABC transporter, permease protein  90.09 
 
 
585 aa  1055    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0469117  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1825  putative nitrate transport system permease protein  59.61 
 
 
584 aa  629  1e-179  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1757  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  59.61 
 
 
584 aa  629  1e-179  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0759  ABC transporter, permease protein  61.58 
 
 
577 aa  626  1e-178  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0770  ABC transporter, permease protein  61.4 
 
 
577 aa  622  1e-177  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0935  putative transmembrane transporter  61.4 
 
 
576 aa  623  1e-177  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6181  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  57.12 
 
 
577 aa  621  1e-176  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.247341  normal  0.752378 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0112  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  56.36 
 
 
578 aa  618  1e-175  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.827494  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0524  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  57.07 
 
 
579 aa  618  1e-175  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0431  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  54.4 
 
 
578 aa  615  1e-175  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3030  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  56.51 
 
 
584 aa  607  9.999999999999999e-173  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.374129  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5923  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  57.04 
 
 
600 aa  608  9.999999999999999e-173  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.904436  normal  0.911733 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3371  putative transmembrane ABC transporter protein  54.66 
 
 
586 aa  602  1.0000000000000001e-171  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3246  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  56.54 
 
 
594 aa  598  1e-170  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0135  hypothetical protein  50.68 
 
 
579 aa  597  1e-169  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0120  hypothetical protein  50.68 
 
 
579 aa  597  1e-169  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3569  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  56.36 
 
 
594 aa  595  1e-169  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1967  ABC transporter, permease protein  53.18 
 
 
581 aa  588  1e-167  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0234  ABC transporter permease protein  53.18 
 
 
581 aa  587  1e-166  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.198469  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2950  ABC transporter, permease protein  57.09 
 
 
538 aa  585  1.0000000000000001e-165  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3185  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  53.9 
 
 
581 aa  582  1.0000000000000001e-165  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.583197  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1438  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  55.83 
 
 
577 aa  571  1e-161  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3546  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  54.83 
 
 
575 aa  565  1e-160  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0346  ABC transporter, permease protein  46.29 
 
 
582 aa  476  1e-133  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3324  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  49.25 
 
 
588 aa  473  1e-132  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1105  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  44.06 
 
 
572 aa  463  1e-129  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.270543  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0165  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  42.33 
 
 
574 aa  398  1e-109  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.336199  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4593  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.49 
 
 
581 aa  394  1e-108  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.477962  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4549  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  42.06 
 
 
578 aa  374  1e-102  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.035099  normal  0.978203 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0890  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  43.02 
 
 
583 aa  374  1e-102  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.807719  hitchhiker  0.00198291 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0803  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.83 
 
 
576 aa  372  1e-101  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.759355 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3819  ABC transporter, inner membrane subunit  43.5 
 
 
579 aa  366  1e-100  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0769  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.1 
 
 
570 aa  352  8e-96  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0405  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  37.09 
 
 
573 aa  318  2e-85  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.00121566  decreased coverage  0.00950402 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3497  hypothetical protein  49.85 
 
 
671 aa  285  1.0000000000000001e-75  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4556  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  44.86 
 
 
670 aa  268  2.9999999999999995e-70  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0109  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  44.98 
 
 
671 aa  263  4.999999999999999e-69  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1021  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  57.92 
 
 
671 aa  257  3e-67  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.32204 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0897  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  26.05 
 
 
553 aa  152  1e-35  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.14778  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0271  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  28.06 
 
 
536 aa  147  7.0000000000000006e-34  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1376  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  23.44 
 
 
538 aa  140  6e-32  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.856839  hitchhiker  0.00160873 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0678  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.38 
 
 
453 aa  126  1e-27  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.105704 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0013  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.11 
 
 
497 aa  125  1e-27  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0283  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.88 
 
 
468 aa  120  9.999999999999999e-26  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1259  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.12 
 
 
459 aa  114  5e-24  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0189  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.99 
 
 
458 aa  105  3e-21  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3675  nitrate ABC transporter, inner membrane subunit  27.43 
 
 
280 aa  65.9  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3729  nitrate ABC transporter, inner membrane subunit  27.43 
 
 
280 aa  65.9  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0184404  normal  0.11569 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1026  nitrate transport permease  27.37 
 
 
279 aa  62.4  0.00000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.174596 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0823  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.11 
 
 
280 aa  62  0.00000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.54971  n/a   
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6172  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  25.42 
 
 
660 aa  60.5  0.00000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.445711 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_02150  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport system, permease component  27.6 
 
 
244 aa  59.7  0.0000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4395  nitrate ABC transporter, inner membrane subunit  25 
 
 
277 aa  59.3  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4458  nitrate ABC transporter, inner membrane subunit  25 
 
 
277 aa  59.3  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.698055  normal  0.534513 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5422  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  28 
 
 
269 aa  59.3  0.0000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0358  ABC-type proline/glycine betaine transport system, permease component  28.27 
 
 
571 aa  58.9  0.0000002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.963399  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1704  nitrate ABC transporter, inner membrane subunit  25.95 
 
 
311 aa  57.8  0.0000006  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8275  ABC-type transporter, permease protein  28.57 
 
 
272 aa  57.4  0.0000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.144641 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2012  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  27.94 
 
 
280 aa  57  0.0000009  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.338733  normal  0.193625 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4924  nitrate ABC transporter, inner membrane subunit  30.34 
 
 
280 aa  56.6  0.000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.815767 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0874  nitrate transport permease  26.9 
 
 
283 aa  56.6  0.000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00348419  hitchhiker  0.00524559 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1489  nitrate transport permease  26.34 
 
 
278 aa  56.6  0.000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>