More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aave_0112 on replicon NC_008752
Organism: Acidovorax citrulli AAC00-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011146  Gbem_0431  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  58.33 
 
 
578 aa  652    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3371  putative transmembrane ABC transporter protein  64.98 
 
 
586 aa  724    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3030  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  65.38 
 
 
584 aa  718    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.374129  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3246  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  64.8 
 
 
594 aa  716    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3185  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  65.12 
 
 
581 aa  706    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.583197  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0112  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  100 
 
 
578 aa  1151    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.827494  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3569  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  64.46 
 
 
594 aa  716    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0135  hypothetical protein  54.64 
 
 
579 aa  632  1e-180  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0120  hypothetical protein  54.64 
 
 
579 aa  632  1e-180  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0524  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  59.54 
 
 
579 aa  628  1e-179  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1269  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  58.44 
 
 
582 aa  621  1e-176  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3899  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  56.19 
 
 
583 aa  621  1e-176  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0820586  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0892  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  56.36 
 
 
584 aa  618  1e-175  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0183914 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3610  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  55.61 
 
 
584 aa  615  1e-175  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.77824  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5526  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  55.61 
 
 
584 aa  615  1e-175  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.775381  normal  0.572944 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4757  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  55.61 
 
 
584 aa  615  1e-175  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.247948 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5725  nitrate/sulfonate/bicarbonate ABC transporter inner membrane protein  55.59 
 
 
585 aa  612  9.999999999999999e-175  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1455  ABC transporter permease  56.49 
 
 
585 aa  612  9.999999999999999e-175  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.754425  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4140  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  55.59 
 
 
584 aa  612  9.999999999999999e-175  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.406581 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2402  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  54.73 
 
 
585 aa  609  1e-173  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.139086  normal  0.0182448 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4605  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  55.25 
 
 
584 aa  611  1e-173  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.242403 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1786  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  54.73 
 
 
585 aa  609  1e-173  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2398  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  54.73 
 
 
585 aa  609  1e-173  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0891298  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5551  ABC transporter, permease protein  58.7 
 
 
584 aa  607  9.999999999999999e-173  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2307  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  54.91 
 
 
585 aa  605  9.999999999999999e-173  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.81894  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0971  ABC anion transporter, fused inner membrane subunits  54.75 
 
 
583 aa  607  9.999999999999999e-173  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0896  ABC transporter, permease protein  54.91 
 
 
585 aa  605  9.999999999999999e-173  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2443  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  54.91 
 
 
585 aa  605  9.999999999999999e-173  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.343058  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7488  ABC transporter permease  54.44 
 
 
577 aa  605  9.999999999999999e-173  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.124133 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5498  ABC-type anion transport system, duplicated permease component  56.5 
 
 
556 aa  604  1.0000000000000001e-171  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.775404  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0270  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  55.54 
 
 
582 aa  602  1.0000000000000001e-171  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.371036  normal  0.381405 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3383  nitrate/sulfonate/bicarbonate ABC transporter inner membrane protein  56.13 
 
 
583 aa  604  1.0000000000000001e-171  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.797393  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1129  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  56.03 
 
 
583 aa  601  1e-170  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2950  ABC transporter, permease protein  59.96 
 
 
538 aa  595  1e-169  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3027  ABC transporter, permease protein  54.73 
 
 
585 aa  598  1e-169  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0469117  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0754  ABC transporter, permease protein  54.73 
 
 
585 aa  598  1e-169  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5091  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  56.28 
 
 
584 aa  595  1e-169  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1570  ABC transporter, permease protein  54.73 
 
 
585 aa  598  1e-169  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0850001  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1256  ABC transporter, permease protein  54.73 
 
 
585 aa  598  1e-169  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1098  ABC transporter, permease protein  54.73 
 
 
585 aa  598  1e-169  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1103  ABC transporter, permease protein  54.73 
 
 
585 aa  598  1e-169  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.790132  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0997  ABC transporter, permease protein  54.56 
 
 
585 aa  593  1e-168  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2156  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  56.23 
 
 
584 aa  590  1e-167  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.856816  hitchhiker  0.00000224525 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0234  ABC transporter permease protein  53.64 
 
 
581 aa  582  1.0000000000000001e-165  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.198469  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7462  ABC transporter permease  54.48 
 
 
585 aa  583  1.0000000000000001e-165  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.900156 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1967  ABC transporter, permease protein  53.82 
 
 
581 aa  583  1.0000000000000001e-165  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3466  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  56.75 
 
 
577 aa  579  1e-164  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.222584 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4538  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  56.75 
 
 
577 aa  579  1e-164  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.641004 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0692  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  53.71 
 
 
578 aa  573  1.0000000000000001e-162  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0622  ABC transporter, permease protein  58.85 
 
 
577 aa  569  1e-161  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.974314  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6181  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  55.48 
 
 
577 aa  557  1e-157  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.247341  normal  0.752378 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0770  ABC transporter, permease protein  56.62 
 
 
577 aa  554  1e-156  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0759  ABC transporter, permease protein  56.43 
 
 
577 aa  554  1e-156  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0935  putative transmembrane transporter  56.62 
 
 
576 aa  555  1e-156  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5923  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  55.17 
 
 
600 aa  550  1e-155  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.904436  normal  0.911733 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4340  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  53.03 
 
 
602 aa  550  1e-155  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.170409 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1616  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  52.93 
 
 
578 aa  538  9.999999999999999e-153  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.294522 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1757  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  55.3 
 
 
584 aa  540  9.999999999999999e-153  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1825  putative nitrate transport system permease protein  55.12 
 
 
584 aa  536  1e-151  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1438  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  52.65 
 
 
577 aa  514  1e-144  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3546  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  50.35 
 
 
575 aa  494  9.999999999999999e-139  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1105  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  44.19 
 
 
572 aa  459  9.999999999999999e-129  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.270543  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3324  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  50 
 
 
588 aa  459  9.999999999999999e-129  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0346  ABC transporter, permease protein  45.32 
 
 
582 aa  440  9.999999999999999e-123  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4593  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  43.21 
 
 
581 aa  406  1.0000000000000001e-112  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.477962  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0165  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  44.11 
 
 
574 aa  402  9.999999999999999e-111  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.336199  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0890  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  43.09 
 
 
583 aa  380  1e-104  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.807719  hitchhiker  0.00198291 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0803  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.44 
 
 
576 aa  369  1e-101  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.759355 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0769  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.66 
 
 
570 aa  367  1e-100  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4549  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40 
 
 
578 aa  352  8e-96  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.035099  normal  0.978203 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3819  ABC transporter, inner membrane subunit  41.84 
 
 
579 aa  342  8e-93  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0405  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  36.41 
 
 
573 aa  305  1.0000000000000001e-81  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.00121566  decreased coverage  0.00950402 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0109  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  51.44 
 
 
671 aa  288  2e-76  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4556  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  49.55 
 
 
670 aa  285  1.0000000000000001e-75  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3497  hypothetical protein  55.44 
 
 
671 aa  285  2.0000000000000002e-75  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1021  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  55.48 
 
 
671 aa  255  1.0000000000000001e-66  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.32204 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0013  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.43 
 
 
497 aa  202  9.999999999999999e-51  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0283  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.02 
 
 
468 aa  158  2e-37  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0897  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  24.91 
 
 
553 aa  153  8.999999999999999e-36  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.14778  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1376  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  23 
 
 
538 aa  132  2.0000000000000002e-29  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.856839  hitchhiker  0.00160873 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0271  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  22.01 
 
 
536 aa  129  2.0000000000000002e-28  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0678  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.32 
 
 
453 aa  123  9e-27  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.105704 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1259  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.62 
 
 
459 aa  115  2.0000000000000002e-24  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0189  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.04 
 
 
458 aa  102  2e-20  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4471  nitrate ABC transporter, inner membrane subunit  23.62 
 
 
297 aa  62.4  0.00000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.5689 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3351  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.76 
 
 
251 aa  61.6  0.00000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4395  nitrate ABC transporter, inner membrane subunit  24.14 
 
 
277 aa  61.2  0.00000005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4458  nitrate ABC transporter, inner membrane subunit  24.14 
 
 
277 aa  61.2  0.00000005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.698055  normal  0.534513 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2273  nitrate transport permease  25.33 
 
 
299 aa  60.8  0.00000006  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6460  nitrate ABC transporter, inner membrane subunit  23.62 
 
 
297 aa  60.8  0.00000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.150998 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0208  nitrate ABC transporter, permease protein, putative  30.2 
 
 
260 aa  60.5  0.00000009  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.473726 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_02150  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport system, permease component  26.24 
 
 
244 aa  60.1  0.0000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0397  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.5 
 
 
285 aa  58.9  0.0000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.987071 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3008  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  24.89 
 
 
280 aa  58.9  0.0000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3787  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  28.23 
 
 
314 aa  58.9  0.0000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0666  nitrate ABC transporter, inner membrane subunit  26.47 
 
 
311 aa  58.5  0.0000003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0569164  decreased coverage  0.0039857 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_21990  ABC transporter, inner membrane permease component  26.23 
 
 
273 aa  58.2  0.0000004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2503  nitrate ABC transporter, inner membrane subunit  24.12 
 
 
298 aa  58.2  0.0000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0926  nitrate ABC transporter, permease protein, putative  26.44 
 
 
274 aa  58.5  0.0000004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3654  nitrate transport permease  28.74 
 
 
273 aa  57.8  0.0000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>